Genetic characterization of Carnivore Parvoviruses in Spanish wildlife reveals domestic dog and cat-related sequences

The impact of carnivore parvovirus infection on wild populations is not yet understood; disease signs are mainly developed in pups and assessing the health of litters in wild carnivores has big limitations. This study aims to shed light on the virus dynamics among wild carnivores thanks to the analysis of 213 samples collected between 1994 and 2013 in wild ecosystems from Spain. We determined the presence of carnivore parvovirus DNA by real‐time PCR and sequenced the vp2 gen from 22 positive samples to characterize the strains and to perform phylogenetic analysis. The presence of carnivore parvovirus DNA was confirmed in 18% of the samples, with a higher prevalence detected in wolves (Canis lupus signatus, 70%). Fourteen sequences belonging to nine wolves, three Eurasian badgers (Meles meles), a common genet (Genetta genetta) and a European wildcat (Felis silvestris) were classified as canine parvovirus 2c (CPV‐2c); five sequences from three wolves, a red fox (Vulpes vulpes) and a stone marten (Martes foina) as CPV‐2b; and three sequences from a badger, a genet and a stone marten as feline parvovirus (FPV). This was the first report of a wildcat infected with a canine strain. Sequences described in this study were identical or very close related to others previously found in domestic carnivores from distant countries, suggesting that cross‐species transmission takes place and that the parvovirus epidemiology in Spain, as elsewhere, could be influenced by global factors

Mortalidad postquirúrgica y sobrevida en pacientes con cáncer cervical tratadas con cirugía radical

Introducción: el cáncer de cuello uterino continúa siendo un problema de salud en todo el mundo y especialmente en los países subdesarrollados. Objetivo: describir la mortalidad postquirúrgica y sobrevida de las pacientes con diagnóstico de cáncer cervical, con estadio clínico Ia2 y Ib1 que recibieron tratamiento quirúrgico radical. Material y Método: se realizó un estudio descriptivo, retrospectivo de 27 pacientes atendidas en el Instituto Nacional de Oncología y Radiobiología (INOR) de La Habana, durante el período comprendido desde enero del 2002 hasta diciembre de 2007 con este tipo de neoplasia en estadios Ia2 y Ib1, que fueron tratadas quirúrgicamente con histerectomía total abdominal radical con linfadectomia pélvica, (Wertheim-Meigs). Se procedió a la descripción del proceder quirúrgico, determinando el intervalo libre de enfermedad y la supervivencia global a través del método de Kaplan-Meier. Resultados: el 92.6% de las pacientes estudiadas correspondió al estadio Ib1. No hubo mortalidad operatoria. La morbilidad médica estuvo ausente y la quirúrgica involucró a 4 pacientes, en las que la sepsis fue la causa determinante. La enfermedad fue recurrente en 3.7% del total de casos. Se obtuvo un intervalo libre de enfermedad (ILE) global de 96.3% y una sobrevida de 100 % a los 5 años. Conclusiones: la histerectomía radical o ampliada constituyó un método de tratamiento seguro para las pacientes con cáncer de cérvix en este estudio. Palabras clave: intervalo libre de enfermedad (ILE), cáncer de cuello uterino, histerectomía radical, cirugía. </p

Occurrence and Quantification of Antimicrobial Resistance Genes in the Gastrointestinal Microbiome of Two Wild Seabird Species With Contrasting Behaviors

Indexación ScopusAntimicrobial resistance genes (ARGs) are environmental pollutants and anthropization indicators. We evaluated human interference in the marine ecosystem through the ocurrence and quantification (real-time PCRs) of 21 plasmid-mediated ARGs in enema samples of 25 wild seabirds, upon admission into rehabilitation: kelp gull (Larus dominicanus, n = 14) and Magellanic penguin (Spheniscus magellanicus, n = 11). Overall, higher resistance values were observed in kelp gulls (non-migratory coastal synanthropic) in comparison with Magellanic penguins (migratory pelagic non-synanthropic). There were significant differences between species (respectively, kelp gull and Magellanic penguin): ARGs occurrence (blaTEM [p = 0.032]; tetM [p = 0.015]; tetA [p = 0.003]; and sulII [p = 0.007]), mean number of ARGs per sample (p = 0.031), ARGs mean load percentage (aadA [p = 0.045], tetA [p = 0.031], tetM [p = 0.016], blaTEM [p = 0.032], sulII [p = 0.008]), percentage of genes conferring resistance to an antimicrobial class (betalactams [p = 0.036] and sulfonamides [p = 0.033]), mean number of genes conferring resistance to one or more antimicrobial classes (p = 0.024]), percentage of multiresistant microbiomes (p = 0.032), and clustering (p = 0.006). These differences are likely due to these species' contrasting biology and ecology - key factors in the epidemiology of ARGs in seabirds. Additionally, this is the first report of mecA in seabirds in the Americas. Further studies are necessary to clarify the occurrence and diversity of ARGs in seabirds, and their role as potential sources of infection and dispersal within the One Health chain of ARGs. © Copyright © 2021 Ewbank, Esperón, Sacristán, Sacristán, Neves, Costa-Silva, Antonelli, Rocha Lorenço, Kolesnikovas and Catão-Dias.https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fvets.2021.651781/ful

Sistema para la detección precoz de problemas en el aprendizaje

La edad preescolar es fundamental en el desarrollo del niño por los procesos relacionados con el desarrollo de la inteligencia, la personalidad y las habilidades de comportamiento social. En términos generales, el desarrollo puede concebirse como un conjunto de fenómenos en un proceso dinámico de organización sucesiva de funciones biológicas, psicológicas y sociales en compleja interacción, cuyas estructuras se modifican de acuerdo a las experiencias vitales. Según Michelini, las experiencias vitales negativas, así como las alteraciones en la organización de funciones biológicas, psicológicas y sociales, debidas a diversos factores, podrían ejercer una influencia determinante en el fracaso escolar en etapas posteriores. Resulta importante la detección precoz de dichas alteraciones por dos razones: para compensar las deficiencias biológicas y las ligadas a los contextos sociales y familiares desfavorables; y en segundo lugar, para habilitar a los contextos educativos a llevar al niño más allá de su nivel desarrollo actual. Cuanto más temprana sea la detección, se traducirá en mayores posibilidades de acción. La propuesta de este proyecto, se basa en el estudio de algunos factores que inciden en este proceso. Si bien son múltiples los agentes intervinientes, el presente constituye un primer paso para la formalización a través de un sistema informático de su tratamiento en edades entre los 3 y los 6 años, y por lo tanto es de esperar el progresivo refinamiento del mismo. El resto de este trabajo se organiza como sigue: secc. II, describe los factores intervinientes en el aprendizaje; secc. III los factores contemplados en el proyecto; secc. IV describe el estado del software en la materia, la secc. V el objetivo y la propuesta, la secc VI. el resultado de los estudios preliminares y la última sección las conclusiones y trabajo a futuro.Eje: Agentes y Sistemas InteligentesRed de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI

Sistema para la detección precoz de problemas en el aprendizaje

La edad preescolar es fundamental en el desarrollo del niño por los procesos relacionados con el desarrollo de la inteligencia, la personalidad y las habilidades de comportamiento social. En términos generales, el desarrollo puede concebirse como un conjunto de fenómenos en un proceso dinámico de organización sucesiva de funciones biológicas, psicológicas y sociales en compleja interacción, cuyas estructuras se modifican de acuerdo a las experiencias vitales. Según Michelini, las experiencias vitales negativas, así como las alteraciones en la organización de funciones biológicas, psicológicas y sociales, debidas a diversos factores, podrían ejercer una influencia determinante en el fracaso escolar en etapas posteriores. Resulta importante la detección precoz de dichas alteraciones por dos razones: para compensar las deficiencias biológicas y las ligadas a los contextos sociales y familiares desfavorables; y en segundo lugar, para habilitar a los contextos educativos a llevar al niño más allá de su nivel desarrollo actual. Cuanto más temprana sea la detección, se traducirá en mayores posibilidades de acción. La propuesta de este proyecto, se basa en el estudio de algunos factores que inciden en este proceso. Si bien son múltiples los agentes intervinientes, el presente constituye un primer paso para la formalización a través de un sistema informático de su tratamiento en edades entre los 3 y los 6 años, y por lo tanto es de esperar el progresivo refinamiento del mismo. El resto de este trabajo se organiza como sigue: secc. II, describe los factores intervinientes en el aprendizaje; secc. III los factores contemplados en el proyecto; secc. IV describe el estado del software en la materia, la secc. V el objetivo y la propuesta, la secc VI. el resultado de los estudios preliminares y la última sección las conclusiones y trabajo a futuro.Eje: Agentes y Sistemas InteligentesRed de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI

Health care and societal costs of the management of children and adolescents with attention-deficit/hyperactivity disorder in Spain: a descriptive analysis

Background: Attention-deficit/hyperactivity disorder (ADHD) is a common neurodevelopmental condition in childhood (5.3% to 7.1% worldwide prevalence), with substantial overall financial burden to children/adolescents, their families, and society. The aims of this study were to describe the clinical characteristics of children and adolescents with ADHD in Spain, estimate the associated direct/indirect costs of the disorder, and assess whether the characteristics and financial costs differed between children/adolescents adequately responding to currently available pharmacotherapies compared with children/adolescents for whom pharmacotherapies failed. Methods: This was a multicenter, cross-sectional, descriptive analysis conducted in 15 health units representative of the overall Spanish population. Data on demographic characteristics, socio-occupational status, social relationships, clinical variables of the disease, and pharmacological and non-pharmacological treatments received were collected in 321 children and adolescents with ADHD. Direct and indirect costs were estimated over one year from both a health care system and a societal perspective. Results: The estimated average cost of ADHD per year per child/adolescent was €5733 in 2012 prices; direct costs accounted for 60.2% of the total costs (€3450). Support from a psychologist/educational psychologist represented 45.2% of direct costs and 27.2% of total costs. Pharmacotherapy accounted for 25.8% of direct costs and 15.5% of total costs. Among indirect costs (€2283), 65.2% was due to caregiver expenses. The total annual costs were significantly higher for children/adolescents who responded poorly to pharmacological treatment (€7654 versus €5517; P = 0.024), the difference being mainly due to significantly higher direct costs, particularly with larger expenses for non-pharmacological treatment (P = 0.012). Conclusions: ADHD has a significant personal, familial, and financial impact on the Spanish health system and society. Successful pharmacological intervention was associated with lower overall expenses in the management of the disorde

Un examen actualizado de la percepción de las barreras para la implementación de la farmacogenómica y la utilidad de los pares fármaco/gen en América Latina y el Caribe

La farmacogenómica (PGx) se considera un campo emergente en los países en desarrollo. La investigación sobre PGx en la región de América Latina y el Caribe (ALC) sigue siendo escasa, con información limitada en algunas poblaciones. Por lo tanto, las extrapolaciones son complicadas, especialmente en poblaciones mixtas. En este trabajo, revisamos y analizamos el conocimiento farmacogenómico entre la comunidad científica y clínica de ALC y examinamos las barreras para la aplicación clínica. Realizamos una búsqueda de publicaciones y ensayos clínicos en este campo en todo el mundo y evaluamos la contribución de ALC. A continuación, realizamos una encuesta regional estructurada que evaluó una lista de 14 barreras potenciales para la aplicación clínica de biomarcadores en función de su importancia. Además, se analizó una lista emparejada de 54 genes/fármacos para determinar una asociación entre los biomarcadores y la respuesta a la medicina genómica. Esta encuesta se comparó con una encuesta anterior realizada en 2014 para evaluar el progreso en la región. Los resultados de la búsqueda indicaron que los países de América Latina y el Caribe han contribuido con el 3,44% del total de publicaciones y el 2,45% de los ensayos clínicos relacionados con PGx en todo el mundo hasta el momento. Un total de 106 profesionales de 17 países respondieron a la encuesta. Se identificaron seis grandes grupos de obstáculos. A pesar de los continuos esfuerzos de la región en la última década, la principal barrera para la implementación de PGx en ALC sigue siendo la misma, la "necesidad de directrices, procesos y protocolos para la aplicación clínica de la farmacogenética/farmacogenómica". Las cuestiones de coste-eficacia se consideran factores críticos en la región. Los puntos relacionados con la reticencia de los clínicos son actualmente menos relevantes. Según los resultados de la encuesta, los pares gen/fármaco mejor clasificados (96%-99%) y percibidos como importantes fueron CYP2D6/tamoxifeno, CYP3A5/tacrolimus, CYP2D6/opioides, DPYD/fluoropirimidinas, TMPT/tiopurinas, CYP2D6/antidepresivos tricíclicos, CYP2C19/antidepresivos tricíclicos, NUDT15/tiopurinas, CYP2B6/efavirenz y CYP2C19/clopidogrel. En conclusión, aunque la contribución global de los países de ALC sigue siendo baja en el campo del PGx, se ha observado una mejora relevante en la región. La percepción de la utilidad de las pruebas PGx en la comunidad biomédica ha cambiado drásticamente, aumentando la concienciación entre los médicos, lo que sugiere un futuro prometedor en las aplicaciones clínicas de PGx en ALC.Pharmacogenomics (PGx) is considered an emergent field in developing countries. Research on PGx in the Latin American and the Caribbean (LAC) region remains scarce, with limited information in some populations. Thus, extrapolations are complicated, especially in mixed populations. In this paper, we reviewed and analyzed pharmacogenomic knowledge among the LAC scientific and clinical community and examined barriers to clinical application. We performed a search for publications and clinical trials in the field worldwide and evaluated the contribution of LAC. Next, we conducted a regional structured survey that evaluated a list of 14 potential barriers to the clinical implementation of biomarkers based on their importance. In addition, a paired list of 54 genes/drugs was analyzed to determine an association between biomarkers and response to genomic medicine. This survey was compared to a previous survey performed in 2014 to assess progress in the region. The search results indicated that Latin American and Caribbean countries have contributed 3.44% of the total publications and 2.45% of the PGx-related clinical trials worldwide thus far. A total of 106 professionals from 17 countries answered the survey. Six major groups of barriers were identified. Despite the region’s continuous efforts in the last decade, the primary barrier to PGx implementation in LAC remains the same, the “need for guidelines, processes, and protocols for the clinical application of pharmacogenetics/pharmacogenomics”. Cost-effectiveness issues are considered critical factors in the region. Items related to the reluctance of clinicians are currently less relevant. Based on the survey results, the highest ranked (96%–99%) gene/drug pairs perceived as important were CYP2D6/tamoxifen, CYP3A5/tacrolimus, CYP2D6/opioids, DPYD/fluoropyrimidines, TMPT/thiopurines, CYP2D6/tricyclic antidepressants, CYP2C19/tricyclic antidepressants, NUDT15/thiopurines, CYP2B6/efavirenz, and CYP2C19/clopidogrel. In conclusion, although the global contribution of LAC countries remains low in the PGx field, a relevant improvement has been observed in the region. The perception of the usefulness of PGx tests in biomedical community has drastically changed, raising awareness among physicians, which suggests a promising future in the clinical applications of PGx in LAC

Molecular identification and microscopic characterization of poxvirus in a Guiana dolphin and a common bottlenose dolphin, Brazil

The poxviruses identified in cetaceans are associated with characteristic tattoo or ring skin lesions. However, little is known regarding the prevalence and progression of these lesions and the molecular characterization of cetacean poxviruses in the Southern Hemisphere. This manuscript describes the progression of poxvirus-like skin lesions in 5 free-ranging Guiana dolphins Sotalia guianensis. Additionally, 151 skin samples from 113 free-ranging cetaceans from Brazil, including 4 animals with tattoo skin lesions, were selected for poxvirus testing. Poxviral DNA polymerase gene PCR amplification was used to detect the virus in β-actin-positive samples (145/151). DNA topoisomerase I gene PCR was then used in Cetaceanpoxvirus (CePV)-positive cases (n = 2), which were further evaluated by histopathology and electron microscopy. Based on photo-identification, adult Guiana dolphins presented regressing or healed poxvirus-like lesions (2/2), while juveniles presented persistent (2/3) or healed and progressive lesions (1/3). CePV DNA was amplified in a common bottlenose dolphin Tursiops truncatus and in a Guiana dolphin. Intracytoplasmic inclusion bodies and viral particles consistent with poxvirus were identified by histology and electron microscopy, respectively. CePV-specific amino acid motifs were identified through phylogenetic analysis. Our findings corroborate previous studies that suggest the placement of poxviruses from cetaceans within the novel CePV genus. This is the first molecular identification of poxvirus in South American odontocetes

Sterility and Gene Expression in Hybrid Males of Xenopus laevis and X. muelleri

BACKGROUND: Reproductive isolation is a defining characteristic of populations that represent unique biological species, yet we know very little about the gene expression basis for reproductive isolation. The advent of powerful molecular biology tools provides the ability to identify genes involved in reproductive isolation and focuses attention on the molecular mechanisms that separate biological species. Herein we quantify the sterility pattern of hybrid males in African Clawed Frogs (Xenopus) and apply microarray analysis of the expression pattern found in testes to identify genes that are misexpressed in hybrid males relative to their two parental species (Xenopus laevis and X. muelleri). METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS: Phenotypic characteristics of spermatogenesis in sterile male hybrids (X. laevis x X. muelleri) were examined using a novel sperm assay that allowed quantification of live, dead, and undifferentiated sperm cells, the number of motile vs. immotile sperm, and sperm morphology. Hybrids exhibited a dramatically lower abundance of mature sperm relative to the parental species. Hybrid spermatozoa were larger in size and accompanied by numerous undifferentiated sperm cells. Microarray analysis of gene expression in testes was combined with a correction for sequence divergence derived from genomic hybridizations to identify candidate genes involved in the sterility phenotype. Analysis of the transcriptome revealed a striking asymmetric pattern of misexpression. There were only about 140 genes misexpressed in hybrids compared to X. laevis but nearly 4,000 genes misexpressed in hybrids compared to X. muelleri. CONCLUSIONS/SIGNIFICANCE: Our results provide an important correlation between phenotypic characteristics of sperm and gene expression in sterile hybrid males. The broad pattern of gene misexpression suggests intriguing mechanisms creating the dominance pattern of the X. laevis genome in hybrids. These findings significantly contribute to growing evidence for allelic dominance in hybrids and have implications for the mechanism of species differentiation at the transcriptome level