La investigación biográfica en la formación inicial de magisterio: las historias de vida como temática del trabajo fin de grado de educación infantil y primaria

Planteamos el Trabajo de Fin del Grado de Educación Infantil y Primaria como nueva plataforma para indagar en la profesión docente a través de las historias de vida de maestras. Este modelo de trabajo en la formación inicial obliga a indagar en la experiencia, en el testimonio y en el relato con una mirada propia, capaz de contar, desde lo particular, los cambios colectivos, las condiciones socioculturales de una época, las conductas de los géneros, las expectativas de futuro, etc. Las historias de vida ofrecen tres vertientes académicas - metodología de investigación, testimonio socio-histórico e instrumento de formación de maestras y maestros-. El intercambio simbólico entre generaciones, es además, fuente de aceptación, respecto y convivencia democrática, y por ende, de cohesión socialWe propose the Final Grade and Primary Education as a new platform for probing the teaching profession through the life stories of teachers. This working model requires initial training to look into the experience, in the testimony and in the story with a look of its own, able to tell from the particular, collective changes, the sociocultural conditions of an era, the behavior of the genres, future expectations, etc. Life stories offer three-pronged research methodology academic, socio-historical testimony and instrument teachers and teacher training. Symbolic exchange between generations is also a source of acceptance, respect and democratic coexistence, and therefore social cohesio

La apertura del Parlamento: una vía de (re)conexión con la soberanía popular

Vivim immers en una crisi de civilització, que es veu aprofundida per la crisi de la democràcia representativa heretada del segle XX. Aquest treball proposa revisar el model de "parlamentarisme racionalitzat", pel fet que és necessari enfortir els Parlaments com a institució democràtica. Precisament, cal reforçar el seu paper de legitimació de les decisions públiques, de control del poder real i de col·laboració entre institucions, en un marc de governança multinivell. Per això, es proposa utilitzar mecanismes d'obertura parlamentària. Els mecanismes d'obertura parlamentària són una forma eficaç de (re)connectar la democràcia representativa amb la sobirania popular. Se suggereix aprofundir en els mecanismes de deliberació participativa, i articular vies perquè els ciutadans participin directament en els processos de presa de decisions públiques que tenen lloc dins de la cambra parlamentària. Així mateix, com connectar aquests processos de decisió pública amb els debats que tenen lloc en la societatNowadays there is a crisis of civilization, which is deepened by the crisis of representative democracy inherited from the 20th century. In this regard, this paper proposes to revise the model of rationalised parliamentarism, in order to strengthen parliaments as democratic institutions. In particular, three aspects that need to be addressed and reinforced are firstly the parliament’s role in legitimising public decisions; secondly, its capacity in controlling real power, and third and lastly, the collaboration between institutions in a framework of multilevel governance. In order to do so, it is proposed to use mechanisms of opening parliament, as an effective way of (re)connecting representative democracy with popular sovereignty, specifically mechanisms of participatory deliberation. Thanks to these mechanisms, citizens could participate directly in the public decision-making processes that take place within the parliamentary chamber. In addition, they can connect with the debates that take place in society.En un momento de crisis civilizatoria, acompañada de la crisis de la democracia representativa heredada del siglo XX, este trabajo propone revisar el modelo de parlamentarismo racionalizado y reforzar la institución parlamentaria en su función de legitimación de las decisiones públicas, control del poder real y de colaboración institucional en un marco de gobernanza multinivel, mediante mecanismos de apertura parlamentaria. Dichos mecanismos constituyen una vía eficaz para la (re)conexión de la democracia representativa con la soberanía popular. Se propone centrarse en mecanismos de deliberación participativa, articulando canales de participación directa de la ciudadanía en los procesos de decisión pública

Proteogenómica y splicing alternativo

Tesis Doctoral inédita leída en la Universidad Autónoma de Madrid, Facultad de Ciencias, Departamento de Biología Molecular. Fecha de lectura: 08 de febrero de 2016La anotación manual de los genes codificantes de proteína requiere diversas fuentes de evidencia. Conseguir evidencia experimental de la expresión de las proteínas sigue siendo un reto técnico complicado. La mayoría de métodos se basan en predicciones computacionales y evidencia experimental a nivel de transcrito. La tecnología de espectrometría de masas ha avanzado considerablemente en las dos últimas décadas, situándola como una herramienta puntera para proyectos de anotación genómica. La espectrometría de masas permite la depuración y validación de genes codificantes y transcritos alternativos, así como la detección de nuevas regiones codificantes. La proteogenómica, una disciplina entre la genómica y la proteómica, requiere el desarrollo de métodos y estrategias computacionales para el análisis de datos a gran escala. El objetivo principal de esta tesis es desarrollar métodos computacionales para el proceso y análisis de datos proteómicos y genómicos. Para ello se han diseñado varias estrategias de análisis de datos proteómicos a gran escala. En la primera parte se aplican los flujos de trabajo diseñado para la búsqueda, validación y curación de resultados proteómicos, a partir de diversas fuentes de datos genómicos. La caracterización de isoformas alternativas y eventos de splicing en humano y ratón muestra tres grupos sobrerrepresentados. En concreto, las ribonucleoproteínas nucleares, las isoformas alternativas generadas a partir de exones homólogos, y las creadas a partir de deleciones pequeñas. El estudio se amplía utilizando una base de datos experimentales proteómicos mayor, y con ello se corrobora que la mayoría de genes expresa una proteína dominante. Se demuestra que los eventos de splicing detectados a nivel de proteína conservan los dominios funcionales. Finalmente, se ratifica que más del 20% de las isoformas de splicing están generadas por exones homólogos, que estas son específicas de tejido, y que están notablemente conservadas, advirtiéndose su posible relevancia a nivel celular. En la última parte se utilizan los péptidos de ocho experimentos proteómicos a gran escala para caracterizar la isoforma más expresada del gen. La comparativa de la isoforma proteómica más expresada coincide con la de dos métodos ortólogos analizados. Uno basado en la conservación de función y estructura, y el otro basado en anotaciones genómicas corregidas por expertos. Los resultados muestran la tendencia hacia la expresión de una sola isoforma, independientemente del tejido, y confirman la idoneidad de APPRIS para la predicción de isoformas principales.The manual annotation of protein-coding genes is based on many diverse sources of evidence. Most support comes from computational predictions, genomic evidence and experimental expression at transcript level. Finding experimental evidence for the expression of proteins remains a difficult technical challenge, but mass spectrometry technology has advanced considerably in the past two decades, becoming an important tool for genomic annotation projects. Mass spectrometry also enables the refining and validation coding genes and alternative transcripts and detection of novel coding regions. Proteogenomics, a discipline that unites genomics and proteomics requires the development of computational methods and strategies for data analysis on a large scale. The main objective of this thesis was to develop computational methods for processing and analyzing genomic and proteomic data. Several strategies to analyze large-scale proteomic data have been designed to achieve this goal. In the first part workflows designed to search, validate and curate results from a variety of sources of proteomic data were applied as part of a pilot study. The characterization of alternative splice isoforms in human and mouse experiments highlighted three overrepresented groups; specifically, ribonucleoproteins, alternative isoforms generated from homologous exons and those generated from small indels. The pilot study was later extended using a larger experimental proteomic data set. This second analysis confirmed that most genes express a dominant protein and demonstrated that splicing events detected at the protein level rarely break conserved functional domains. The large-scale study confirmed that more than 20% of splice isoforms are generated from homologous exons. Many of these alternative homologous exons are tissue specific and all are remarkably conserved, highlighting their relevance at the cellular level. Finally peptides from eight large-scale proteomic experiments are used to characterize a main experimental isoform. This main proteomics isoform matches those selected by two orthogonal methods, one predicted from conservation and protein functional and structure features, and the other annotated by manual annotators based on genomic evidence. The results show clearly that almost all genes have a principal protein isoform regardless of tissue

Consequences of the pathogenic T9176C mutation of human mitochondrial DNA on yeast mitochondrial ATP synthase

Several human neurological disorders have been associated with various mutations affecting mitochondrial enzymes involved in cellular ATP production. One of these mutations, T9176C in the mitochondrial DNA (mtDNA), changes a highly conserved leucine residue into proline at position 217 of the mitochondrially encoded Atp6p (or a) subunit of the F1FO-ATP synthase. The consequences of this mutation on the mitochondrial ATP synthase are still poorly defined. To gain insight into the primary pathogenic mechanisms induced by T9176C, we have investigated the consequences of this mutation on the ATP synthase of yeast where Atp6p is also encoded by the mtDNA. In vitro, yeast atp6-T9176C mitochondria showed a 30% decrease in the rate of ATP synthesis. When forcing the F1FO complex to work in the reverse mode, i.e. F1-catalyzed hydrolysis of ATP coupled to proton transport out of the mitochondrial matrix, the mutant showed a normal proton-pumping activity and this activity was fully sensitive to oligomycin, an inhibitor of the ATP synthase proton channel. However, under conditions of maximal ATP hydrolytic activity, using non-osmotically protected mitochondria, the mutant ATPase activity was less efficiently inhibited by oligomycin (60% inhibition versus 85% for the wild type control). Blue Native Polyacrylamide Gel Electrophoresis analyses revealed that atp6-T9176C yeast accumulated rather good levels of fully assembled ATP synthase complexes. However, a number of sub-complexes (F1, Atp9p-ring, unassembled alpha-F1 subunits) could be detected as well, presumably because of a decreased stability of Atp6p within the ATP synthase. Although the oxidative phosphorylation capacity was reduced in atp6-T9176C yeast, the number of ATP molecules synthesized per electron transferred to oxygen was similar compared with wild type yeast. It can therefore be inferred that the coupling efficiency within the ATP synthase was mostly unaffected and that the T9176C mutation did not increase the proton permeability of the mitochondrial inner membrane

La Galera: análisis de su influencia en la renovación pedagógica en el País Vasco

Comunicación presentada en las VII Jornadas Científicas de la SEPHE (Sociedad Española para el Estudio del Patrimonio Histórico–Educativo) y el V Simposium de la Rede Iberoamericano para a Investigação e a Difusão do Patrimônio Histórico Educativo – RIDPHE-L, celebradas en Donostia-San Sebastián del 29 de junio a 1 de julio de 2016.Este trabajo pretende dar a conocer la influencia ejercida por los libros escolares de lectura de la editorial catalana La Galera, en el proceso de renovación y difusión de las metodologías innovadoras en el movimiento de las ikastolas de los años sesenta. Los libros publicados por esta editorial diseminaron los métodos de lectura y escritura propuestos por la pedagoga Marta Mata, a través de los cursos de verano impartidos por la Asociación de maestros “Rosa Sensat”. Se analiza el material publicado en euskera durante el periodo 1965-1980 para su uso en las ikastolas del País Vasco, en cuya adaptación y traducción interviene como coordinador el colectivo de profesores Gordailu, ayudado para su producción por varias editoriales locales. La muestra pertenece al material publicado en las colecciones Lehen irudiak-lehen hitzak, Urrezko sorta, Oyal zabal, Apurrak, Eguneroko gauzak y Eguzki ibiltaria. El análisis del contenido textual e iconográfico indica un cambio cualitativo en la transmisión de valores al alumnado, en comparación a los legitimados en la enseñanza en vigor. El uso escolar de estos materiales infunde un giro significativo a los métodos para el aprendizaje de la lectura y escritura, y funciona como agente socializador para la transferencia del nuevo conocimiento pedagógico creado por el profesorado en su práctica diaria.UPV/EHUko Hezkuntzaren Museoa; SEPHE; RIDPHE; MEC; UPV/EHU; UNICAMP; HKG, Garaian; Lenbur Fundazuia; UPV/EHUko Udako Ikastaroak

EcID. A database for the inference of functional interactions in E. coli

The EcID database (Escherichia coli Interaction Database) provides a framework for the integration of information on functional interactions extracted from the following sources: EcoCyc (metabolic pathways, protein complexes and regulatory information), KEGG (metabolic pathways), MINT and IntAct (protein interactions). It also includes information on protein complexes from the two E. coli high-throughput pull-down experiments and potential interactions extracted from the literature using the web services associated to the iHOP text-mining system. Additionally, EcID incorporates results of various prediction methods, including two protein interaction prediction methods based on genomic information (Phylogenetic Profiles and Gene Neighbourhoods) and three methods based on the analysis of co-evolution (Mirror Tree, In Silico 2 Hybrid and Context Mirror). EcID associates to each prediction a specifically developed confidence score. The two main features that make EcID different from other systems are the combination of co-evolution-based predictions with the experimental data, and the introduction of E. coli-specific information, such as gene regulation information from EcoCyc. The possibilities offered by the combination of the EcID database information are illustrated with a prediction of potential functions for a group of poorly characterized genes related to yeaG. EcID is available online at http://ecid.bioinfo.cnio.es