Using sea-level data to constrain a finite-element primitive-equation ocean model with a local SEIK filter

Inspired by the pioneering work of Christian Le Provost on finiteelement ocean modeling a new ocean circulation model was developedover the last few years. It applies a surface triangulation and finiteelements for an accurate description of coasts and bathymetry and theirsteering effect on the ocean circulation. A novel feature is the meshdesign which allows a vertical structure in geopotential (z)coordinates without loss of flexibility and avoids pressure gradienterrors everywhere except for the lowest layer of abyssal ocean. Themodel is combined with sea level measurements and data assimilation,another major research topic of Christian Le Provost. We apply the SEIKfilter which was developed in Grenoble while Christian was teachingthere. The addition of a local analysis scheme improves the filterperformance first of all in its variance estimates but also in its meansolution

A Comparison of Error Subspace Kalman Filters

Three advanced filter algorithms based on the Kalman filter arereviewed and presented in a unified notation. They are the wellknown Ensemble Kalman filter (EnKF), the Singular EvolutiveExtended Kalman (SEEK) filter, and the less common SingularEvolutive Interpolated Kalman (SEIK) filter.For comparison, the mathematical formulations of the filters arereviewed in relation to the extended Kalman filter as errorsubspace Kalman filters. The algorithms are presented in theiroriginal form and possible variations are discussed. The comparisonof the algorithms shows their theoretical capabilities forefficient data assimilation with large-scale nonlinear systems. Inparticular, problems of the analysis equations are apparent in theoriginal EnKF algorithm due to the Monte Carlo sampling ofensembles. Theoretically, the SEIK filter appears to be anumerically very efficient algorithm with high potential for usewith nonlinear models.The superiority of the SEIK filter is demonstrated on the basis ofidentical twin experiments using a shallow water model with nonlinearevolution. Identical initial conditions for all three filters allowfor a consistent comparison of the data assimilation results. Theseshow how choices of particular state ensembles and assimilationschemes lead to significant variations of the filterperformance. This is related to different qualities of thepredicted error subspaces as is demonstrated in a examination ofthe predicted state covariance matrices

Ny teknologi for overvåking av oppdrettsmiljø og fiskevelferd i oppdrettsmerder. Sluttrapport for FHF prosjekt 900085

Det er kjent at oppdrettsfisk som trives er god butikk, da de vil vokse fortere, være mindre utsatt for sykdom og gi bedre produktkvalitet. Samtidig stiller markedene økende krav til etisk produksjon, inklusiv dokumentasjon på at oppdrettsfiskene har det bra. Dessverre mangler vi gode løsninger for å overvåke fiskens velferd i oppdrett. Hensikten med dette prosjektet var å utvikle ny teknologi for overvåkning og dokumentasjon av fiskevelferd i oppdrettsmerder. Prosjektet innebærer en videreutvikling av to komplementære teknologiløsninger: Den ene løsningen (Velferdsmeteret) innebærer måling av en rekke parametre i vannmiljøet som så kommuniseres mot et ekspert- og databasesystem. Målingene og resultatene fra ekspertanalysen vises på en nettside som forteller oppdretterne hvor gode betingelser oppdrettsfiskene har. Den andre tilnærmingen (SmartTag-systemet) innebærer at et utvalg fisk i merden utstyres med et elektronisk merke som forteller oppdretteren hvorvidt fiskene puster normalt eller om de er stresset. Prosjektresultatene inkluderer en miniatyrisering og digitalisering av SmartTag-systemet og en utvikling av en flytende målestasjon for Velferdsmetersystemet. Gjennom denne teknologiutviklingen er Havforskningsinstituttets Velferdsmeter-system for måling og analyse av merdmiljø og NOFIMAs SmartTag-system for å måle velferd og stress hos frittsvømmende enkeltfisk videreutviklet, slik at de nå er klare for innledende uttesting som et totalsystem for overvåking og dokumentasjon av oppdrettsmiljø og fiskevelferd i et kommersielt oppdrettsanlegg. Denne uttestingen samt videre grunnleggende forskningsarbeid vil følges opp i det NFR- og FHF-finansierte prosjektet WELFARE TOOLS (NFR # 190475/S40) i løpet av 2010.Ny teknologi for overvåking av oppdrettsmiljø og fiskevelferd i oppdrettsmerder. Sluttrapport for FHF prosjekt 900085publishedVersio

Ny teknologi for overvåking av oppdrettsmiljø og fiskevelferd i oppdrettsmerder. Sluttrapport for FHF prosjekt 900085

Det er kjent at oppdrettsfisk som trives er god butikk, da de vil vokse fortere, være mindre utsatt for sykdom og gi bedre produktkvalitet. Samtidig stiller markedene økende krav til etisk produksjon, inklusiv dokumentasjon på at oppdrettsfiskene har det bra. Dessverre mangler vi gode løsninger for å overvåke fiskens velferd i oppdrett. Hensikten med dette prosjektet var å utvikle ny teknologi for overvåkning og dokumentasjon av fiskevelferd i oppdrettsmerder. Prosjektet innebærer en videreutvikling av to komplementære teknologiløsninger: Den ene løsningen (Velferdsmeteret) innebærer måling av en rekke parametre i vannmiljøet som så kommuniseres mot et ekspert- og databasesystem. Målingene og resultatene fra ekspertanalysen vises på en nettside som forteller oppdretterne hvor gode betingelser oppdrettsfiskene har. Den andre tilnærmingen (SmartTag-systemet) innebærer at et utvalg fisk i merden utstyres med et elektronisk merke som forteller oppdretteren hvorvidt fiskene puster normalt eller om de er stresset. Prosjektresultatene inkluderer en miniatyrisering og digitalisering av SmartTag-systemet og en utvikling av en flytende målestasjon for Velferdsmetersystemet. Gjennom denne teknologiutviklingen er Havforskningsinstituttets Velferdsmeter-system for måling og analyse av merdmiljø og NOFIMAs SmartTag-system for å måle velferd og stress hos frittsvømmende enkeltfisk videreutviklet, slik at de nå er klare for innledende uttesting som et totalsystem for overvåking og dokumentasjon av oppdrettsmiljø og fiskevelferd i et kommersielt oppdrettsanlegg. Denne uttestingen samt videre grunnleggende forskningsarbeid vil følges opp i det NFR- og FHF-finansierte prosjektet WELFARE TOOLS (NFR # 190475/S40) i løpet av 2010

Ny teknologi for overvåking av oppdrettsmiljø og fiskevelferd i oppdrettsmerder. Sluttrapport for FHF prosjekt 900085

Det er kjent at oppdrettsfisk som trives er god butikk, da de vil vokse fortere, være mindre utsatt for sykdom og gi bedre produktkvalitet. Samtidig stiller markedene økende krav til etisk produksjon, inklusiv dokumentasjon på at oppdrettsfiskene har det bra. Dessverre mangler vi gode løsninger for å overvåke fiskens velferd i oppdrett. Hensikten med dette prosjektet var å utvikle ny teknologi for overvåkning og dokumentasjon av fiskevelferd i oppdrettsmerder. Prosjektet innebærer en videreutvikling av to komplementære teknologiløsninger: Den ene løsningen (Velferdsmeteret) innebærer måling av en rekke parametre i vannmiljøet som så kommuniseres mot et ekspert- og databasesystem. Målingene og resultatene fra ekspertanalysen vises på en nettside som forteller oppdretterne hvor gode betingelser oppdrettsfiskene har. Den andre tilnærmingen (SmartTag-systemet) innebærer at et utvalg fisk i merden utstyres med et elektronisk merke som forteller oppdretteren hvorvidt fiskene puster normalt eller om de er stresset. Prosjektresultatene inkluderer en miniatyrisering og digitalisering av SmartTag-systemet og en utvikling av en flytende målestasjon for Velferdsmetersystemet. Gjennom denne teknologiutviklingen er Havforskningsinstituttets Velferdsmeter-system for måling og analyse av merdmiljø og NOFIMAs SmartTag-system for å måle velferd og stress hos frittsvømmende enkeltfisk videreutviklet, slik at de nå er klare for innledende uttesting som et totalsystem for overvåking og dokumentasjon av oppdrettsmiljø og fiskevelferd i et kommersielt oppdrettsanlegg. Denne uttestingen samt videre grunnleggende forskningsarbeid vil følges opp i det NFR- og FHF-finansierte prosjektet WELFARE TOOLS (NFR # 190475/S40) i løpet av 2010.Ny teknologi for overvåking av oppdrettsmiljø og fiskevelferd i oppdrettsmerder. Sluttrapport for FHF prosjekt 900085publishedVersio

Investigating survival, quality of life and cognition in PROton versus photon therapy for IDH-mutated diffuse grade 2 and 3 GLIOmas (PRO-GLIO): a randomised controlled trial in Norway and Sweden

Introduction The use of proton therapy increases globally despite a lack of randomised controlled trials demonstrating its efficacy and safety. Proton therapy enables sparing of non-neoplastic tissue from radiation. This is principally beneficial and holds promise of reduced long-term side effects. However, the sparing of seemingly non-cancerous tissue is not necessarily positive for isocitrate dehydrogenase (IDH)-mutated diffuse gliomas grade 2–3, which have a diffuse growth pattern. With their relatively good prognosis, yet incurable nature, therapy needs to be delicately balanced to achieve a maximal survival benefit combined with an optimised quality of life.Methods and analysis PRO-GLIO (PROton versus photon therapy in IDH-mutated diffuse grade 2 and 3 GLIOmas) is an open-label, multicentre, randomised phase III non-inferiority study. 224 patients aged 18–65 years with IDH-mutated diffuse gliomas grade 2–3 from Norway and Sweden will be randomised 1:1 to radiotherapy delivered with protons (experimental arm) or photons (standard arm). First intervention-free survival at 2 years is the primary endpoint. Key secondary endpoints are fatigue and cognitive impairment, both at 2 years. Additional secondary outcomes include several survival measures, health-related quality of life parameters and health economy endpoints.Ethics and dissemination To implement proton therapy as part of standard of care for patients with IDH-mutated diffuse gliomas grade 2–3, it should be deemed safe. With its randomised controlled design testing proton versus photon therapy, PRO-GLIO will provide important information for this patient population concerning safety, cognition, fatigue and other quality of life parameters. As proton therapy is considerably more costly than its photon counterpart, cost-effectiveness will also be evaluated. PRO-GLIO is approved by ethical committees in Norway (Regional Committee for Medical & Health Research Ethics) and Sweden (The Swedish Ethical Review Authority) and patient inclusion has commenced. Trial results will be published in international peer-reviewed journals, relevant conferences, national and international meetings and expert forums.Trial registration number ClinicalTrials.gov Registry (NCT05190172)