Expression profiling in ovarian cancer reveals coordinated regulation of BRCA1/2 and homologous recombination genes

© 2022 by the authors. Licensee MDPI, Basel, Switzerland. This article is an open access article distributed under the terms and conditions of the Creative Commons Attribution (CC BY) license (https://creativecommons.org/licenses/by/4.0/).Predictive biomarkers are crucial in clarifying the best strategy to use poly(ADP-ribose) polymerase inhibitors (PARPi) for the greatest benefit to ovarian cancer patients. PARPi are specifically lethal to cancer cells that cannot repair DNA damage by homologous recombination (HR), and HR deficiency is frequently associated with BRCA1/2 mutations. Genetic tests for BRCA1/2 mutations are currently used in the clinic, but results can be inconclusive due to the high prevalence of rare DNA sequence variants of unknown significance. Most tests also fail to detect epigenetic modifications and mutations located deep within introns that may alter the mRNA. The aim of this study was to investigate whether quantitation of BRCA1/2 mRNAs in ovarian cancer can provide information beyond the DNA tests. Using the nCounter assay from NanoString Technologies, we analyzed RNA isolated from 38 ovarian cancer specimens and 11 normal fallopian tube samples. We found that BRCA1/2 expression was highly variable among tumors. We further observed that tumors with lower levels of BRCA1/2 mRNA showed downregulated expression of 12 additional HR genes. Analysis of 299 ovarian cancer samples from The Cancer Genome Atlas (TCGA) confirmed the coordinated expression of BRCA1/2 and HR genes. To facilitate the routine analysis of BRCA1/2 mRNA in the clinical setting, we developed a targeted droplet digital PCR approach that can be used with FFPE samples. In conclusion, this study underscores the potential clinical benefit of measuring mRNA levels in tumors when BRCA1/2 DNA tests are negative or inconclusive.This research was funded by the Fundação para a Ciência e a Tecnologia, Portugal (PTDC/MED-ONC/29469/2017) and an unrestricted grant from AstraZeneca to M.C.-F. R.S. was a recipient of an EMBO Long-Term Fellowship (EMBO ALTF 101-2019). This project has received funding from the European Union’s Horizon 2020 research and innovation programme under the Marie Skłodowska-Curie grant agreement No. 842695.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Percepção dos futuros enfermeiros em relação à Língua Brasileira de Sinais – LIBRAS e sua futura atuação profissional na perspectiva de atendimento aos pacientes com surdez

A Língua Brasileira de Sinais – LIBRAS é um instrumento de comunicação importante na vida do surdo e de especial relevância quando se trata de usufruir seus direitos como cidadão, em especial, o acesso à saúde. Apesar da importância, a LIBRAS ainda não faz parte da formação do profissional da área de saúde de forma que seja garantido nível de fluência necessária para essa comunicação. Como a extensa maioria dos profissionais de saúde, por não ter fluência ou mesmo conhecer libras, os profissionais de enfermagem usam como estratégia de comunicação: a) gestos, o que dificulta o processo de assistência e socorro imediato; e/ou b) conversa com um familiar ou acompanhante, o que contraria a pauta ética quanto ao sigilo inerente a todo ser humano. O atendimento médico à pessoa surda acaba por tornar-se um desafio, tanto para o profissional de saúde quanto para o próprio surdo, uma vez que o uso de linguagem verbal não existe e precisa ser substituído por outro mecanismo de comunicação. Além disso, a LIBRAS não apresenta diversos sinais na área médica, fazendo com que, mesmo com a presença de um intérprete ou familiar fluente nessa língua, parte da mensagem não seja decodificada a contento, o que resulta em consequências negativas no atendimento dessa população. A proposta deste estudo pauta-se na investigação da percepção dos futuros enfermeiros em relação ao conhecimento e uso da LIBRAS em sua futura profissão. Ainda que existindo uma lei sancionada que orienta a inclusão de libras em alguns cursos, inclusive no curso participante do estudo, os dados obtidos neste trabalho permitem observar a reflexão dos alunos sobre as dificuldades enfrentadas no ambiente profissional do enfermeiro no atendimento do surdo, especialmente quanto às informações prestadas pelo paciente e o entendimento por parte do profissional. Este estudo estimulou a identificação de problemas na comunicação entre o enfermeiro e o paciente surdo pelos alunos de enfermagem, apontando ainda para a necessidade da elaboração de novas diretrizes curriculares essenciais à formação do enfermeiro, do ponto de vista da inclusão social e melhoria da assistência na perspectiva da surdez

Resultados académicos em tempos de pandemia no Politécnico de Lisboa

A pandemia provocada pelo SARS-CoV-2 e as conseguentes medidas de confinamento decretadas em Portugal originaram uma reconfiguração e uma reorganização dos processos de ensino e aprendizagem nos vários níveis de ensino, do qual o ensino superior não é exceção. A alternância entre o ensino presencial e o ensino remoto de emergência - envolvendo formas distintas de ensinar, de aprender e avaliar, que se sucederam nos anos letivos de 2019/2020 e 2020/2021 - conduziram-nos à necessidade de refletir e avaliar os efeitos destas realidades distintas nos resultados e no (in)sucesso académico dos estudantes. A presente comunicação tem como principal objetivo efetuar uma análise comparativa entre os resultados académicos obtidos pelos estudantes que compõem o universo das oito Unidades Orgânicas do Politécnico de Lisboa, no priomeiro semestre do ano letivo de 2019/2020 (período em que as avaliações foram realizadas presencialmente) e o seu período homólogo do ano letivo de 2020/2021 (período em que as avaliações foram realizadas online).info:eu-repo/semantics/publishedVersio

O ensino à distância no Politécnico de Lisboa: diagnóstico de necessidades de formação

No contexto da situação pandémica associada à COVID-19, o Politécnico de Lisboa criou a Unidade de Ensino à Distância, que tem como principal objetivo promover a inovação pedagógica e a competência digital, em permanente sintonia com os avanços da ciência e da tecnologia da comunicação. Decorrente da sua missão, em abril de 2021 foi aplicado um inquérito por questionário online aos docentes do IPL que visava identificar as necessidades de formação no domínio do ensino à distância.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Satisfaction with remote teaching and the return to in-person teaching: perception of higher education students

Several studies have sought to evaluate how students experienced remote emergency experience due to the pandemic scenario caused by the spread of coronavirus SARS-CoV-2. This article aims to analyze the perception of students of higher education Portuguese, and their satisfaction with the remote emergency experience and the return to face-to-face classes. For this, an online questionnaire was applied to students, from the 1st year of the 1st cycle, of courses in the areas of education, communication sciences and business sciences of polytechnic higher education (n=307). For data analysis, a quantitative approach is adopted, using descriptive statistic and correlation analysis. The results show that 59.3% of the interviewees consider themselves extremely satisfied with returning to face-to-face classes. With regard to satisfaction with online classes, it shows that the majority (46.9%) are at the intermediate level (level 3, on a Likert scale from 1 to 5). Finally, when asked about the teaching regime they prefer, most opt for face-to-face teaching (68.4%), followed by mixed (b-learning) (29.6%) and distance (e-learning) (2.0%). The results are presented taking into account the gender, the course, the fact of being a worker or not and the period in which they study. The results allow us to conclude that remote emergency teaching was not satisfactory, in the perception of these students, and that the return to face-to-face teaching was accepted with great satisfaction. These results contribute to the discussion about the needs of a planned remote teaching, with methodologies and equipment suitable for online teaching.info:eu-repo/semantics/publishedVersio

Gene Panel Tumor Testing in Ovarian Cancer Patients Significantly Increases the Yield of Clinically Actionable Germline Variants beyond BRCA1/BRCA2

Since the approval of PARP inhibitors for the treatment of high-grade serous ovarian cancer, in addition to cancer risk assessment, BRCA1 and BRCA2 genetic testing also has therapeutic implications (germline and somatic variants) and should be offered to these patients at diagnosis, irrespective of family history. However, variants in other genes besides BRCA1 and BRCA2 are associated with ovarian cancer predisposition, which would be missed by a genetic testing aimed only at indication for PARP inhibitor treatment. In this study, we aimed to evaluate the yield of clinically actionable germline variants using next-generation sequencing of a customized panel of 10 genes for the analysis of formalin-fixed paraffin-embedded samples from 96 ovarian carcinomas, a strategy that allows the detection of both somatic and germline variants in a single test. In addition to 13.7% of deleterious germline BRCA1/BRCA2 carriers, we identified 7.4% additional patients with pathogenic germline variants in other genes predisposing for ovarian cancer, namely RAD51C, RAD51D, and MSH6, representing 35% of all pathogenic germline variants. We conclude that the strategy of reflex gene-panel tumor testing enables the identification of clinically actionable germline variants in a significantly higher proportion of ovarian cancer patients, which may be valuable information in patients with advanced disease that have run out of approved therapeutic options. Furthermore, this approach increases the chance to make available genetic counseling, presymptomatic genetic testing, and gynecological cancer prophylaxis to female relatives who turn out to be healthy carriers of deleterious germline variants

O percurso de vida do primeiro MOOC do Politécnico de Lisboa na Plataforma NAU

Comunicação em ConferênciaA educação tem vindo a passar nos últimos tempos por mudanças significativas sobretudo no que diz respeito ao crescimento exponencial das modalidades de Educação a Distância. Entre essas mudanças, destaca-se a criação de MOOC (Massive Open Online Course), aulas massivas, abertas, online que visam fornecer um formato educacional abrangente.info:eu-repo/semantics/publishedVersio