Hot spots for diversity of Magnaporthe oryzae physiological races in irrigated rice fields in Brazil

O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade de patótipos de Magnaporthe oryzae em novas áreas comerciais de arroz irrigado instaladas no Vale do Rio Araguaia, Estado do Tocantins, Brasil. A produção de arroz nessa região vem sendo significativamente afetada pelo agente causal da brusone do arroz. Apesar dos esforços de programas de melhoramento genético, a ocorrência de quebra de resistência tem sido registrada logo após o lançamento de novas cultivares desenvolvidas para a região. Entre as causas de quebra de resistência está incluída a capacidade do fungo de desenvolver novos patótipos rapidamente. Uma amostra de 479 isolados monospóricos de M. oryzae foi obtida e testada no conjunto internacional de cultivares diferenciadoras de raças de brusone. As coletas de isolados foram feitas em pequenos viveiros usados como armadilhas de brusone e em locais ao acaso de campos vizinhos. A análise de 250 isolados de M. oryzae obtidos em três viveiros armadilha detectou a presença de 45 raças internacionais pertencentes a sete grupos de patótipos (IA-IG). Nos isolados testados, 61 patótipos de M. oryzae pertencentes a todos os grupos exceto o grupo IH foram detectados. As novas áreas de arroz irrigado do Vale do Rio Araguaia apresentam a maior diversidade de patótipos de M. oryzae descrita até o momento no Brasil.The objective of this work was to evaluate the Magnaporthe oryzae pathotype diversity in new commercial irrigated rice fields in the Araguaia River Valley, state of Tocantins, Brazil. The causal agent of rice blast has heavily affected rice production in the region. Despite the efforts of breeding programs, blast resistance breakdown has been recorded shortly after the release of new resistant cultivars developed for the region. Among the causes of resistance breakage is the capacity of the fungus to rapidly develop new pathotypes. A sample of 479 M. oryzae monosporic isolates was obtained and tested using the international rice blast differential set. Isolate collections were made in small areas designed as trap nurseries and in scattered sites in their vicinity. Analysis of 250 M. oryzae isolates from three trap nurseries indicated the presence of 45 international M. oryzae races belonging to seven pathotype groups (IA-IG). In the isolates tested, 61 M. oryzae pathotypes belonging to all but the IH group were detected. The new areas of irrigated rice in the Araguaia River Valley have the highest diversity of M. oryzae pathotypes reported so far in Brazil

Seasonal dynamics of ticks (Acari:Ixodidae) in an endemic area for spotted fever in the Campinas region, state of São Paulo, Brazil

Spotted fever is recognized worldwide as a reemerging public health problem. In Campinas region, state of São Paulo, the transmission area has expanded and the number of positive cases has increased in the lastest years. In these region most cases are usually related to the increased number of capybaras, which are one of the main primary hosts for the tick Amblyomma cajennense. The main objective of this study was to determine the seasonal dynamic of larvaes, nymphs and adults of Amblyomma species in a gallery forest. From November 2000 to October 2002 free-living ticks were collected using carbon dioxid traps. Larvae of Amblyomma spp were abundant during almost all months. Nymphs of Amblyomma spp occurred during the whole year and were more abundants from July to December. Adults of A.cajennense were more abundants during the spring-summer months. Adults of A. dubitatum showed higher populational peaks from August to February.A febre maculosa é mundialmente reconhecida como um problema reemergente de saúde pública. Na região de Campinas-SP, observam-se uma ampliação da área de transmissão do agente da doença e a ocorrência de um maior número de casos confirmados nos últimos anos. Nesta região, a maioria dos casos desta doença está quase sempre relacionada com o aumento populacional de capivaras, que são um dos principais hospedeiros primários do estádio adulto do carrapato Amblyomma cajennense. O principal objetivo deste estudo foi determinar o comportamento populacional de larvas, ninfas e adultos de Amblyomma spp no habitat de mata ciliar de uma área endêmica. De novembro de 2000 a outubro de 2002, carrapatos de vida livre foram coletados com armadilhas de CO2. Picos populacionais de larvas do gênero Amblyomma se estenderam por praticamente todos os meses do ano. Ninfas do gênero Amblyomma ocorreram o ano todo na mata ciliar, sendo mais abundantes de julho a dezembro. Adultos de A. cajennense foram mais abundantes na estação de primavera e verão. Adultos de A. dubitatum (=Amblyomma cooperi) apresentaram um padrão sazonal diferenciado, com os maiores picos populacionais ocorrendo de agosto a fevereiro.88789

Desenvolvimento de tecnologia para estimativa da recarga hídrica sob diferentes condições de cobertura vegetal

A influência da cobertura vegetal sobre o balanço hídrico do solo tem sido estudada com mais rigor diante da necessidade de resiliência do ambiente a eventos extremos de precipitação e estiagem. A Região Hidrográfica IX-RJ sofre um intenso processo de degradação do solo em áreas de morro com pastagem degradada. Os planos de recuperação de mananciais e produção de água necessitam de estudos mais precisos sobre essa influência com dados regionais visando à eficiência no uso do recurso público. Neste contexto, o objetivo desta pesquisa é avaliar o efeito da cobertura vegetal sobre a recarga hídrica do subsolo com base em uma simulação hidrológica com parâmetros de modelagem calibrados e validados em campo. Para isso foi desenvolvido um dispositivo eletrônico para monitoramento da umidade do solo e da precipitação. Estão sendo estudadas as coberturas vegetais predominantes da RH-IX: pastagem degradada, pastagem manejada e floresta. Os resultados podem embasar os planos de recuperação de manancial para abastecimento público e ações de redução da pegada hídrica

Hot spots for diversity of Magnaporthe oryzae physiological races in irrigated rice fields in Brazil

The objective of this work was to evaluate the Magnaporthe oryzae pathotype diversity in new commercial irrigated rice fields in the Araguaia River Valley, state of Tocantins, Brazil. The causal agent of rice blast has heavily affected rice production in the region. Despite the efforts of breeding programs, blast resistance breakdown has been recorded shortly after the release of new resistant cultivars developed for the region. Among the causes of resistance breakage is the capacity of the fungus to rapidly develop new pathotypes. A sample of 479 M. oryzae monosporic isolates was obtained and tested using the international rice blast differential set. Isolate collections were made in small areas designed as trap nurseries and in scattered sites in their vicinity. Analysis of 250 M. oryzae isolates from three trap nurseries indicated the presence of 45 international M. oryzae races belonging to seven pathotype groups (IA-IG). In the isolates tested, 61 M. oryzae pathotypes belonging to all but the IH group were detected. The new areas of irrigated rice in the Araguaia River Valley have the highest diversity of M. oryzae pathotypes reported so far in Brazil

Genome of the Avirulent Human-Infective Trypanosome—Trypanosoma rangeli

Background: Trypanosoma rangeli is a hemoflagellate protozoan parasite infecting humans and other wild and domestic mammals across Central and South America. It does not cause human disease, but it can be mistaken for the etiologic agent of Chagas disease, Trypanosoma cruzi. We have sequenced the T. rangeli genome to provide new tools for elucidating the distinct and intriguing biology of this species and the key pathways related to interaction with its arthropod and mammalian hosts.  Methodology/Principal Findings: The T. rangeli haploid genome is ,24 Mb in length, and is the smallest and least repetitive trypanosomatid genome sequenced thus far. This parasite genome has shorter subtelomeric sequences compared to those of T. cruzi and T. brucei; displays intraspecific karyotype variability and lacks minichromosomes. Of the predicted 7,613 protein coding sequences, functional annotations could be determined for 2,415, while 5,043 are hypothetical proteins, some with evidence of protein expression. 7,101 genes (93%) are shared with other trypanosomatids that infect humans. An ortholog of the dcl2 gene involved in the T. brucei RNAi pathway was found in T. rangeli, but the RNAi machinery is non-functional since the other genes in this pathway are pseudogenized. T. rangeli is highly susceptible to oxidative stress, a phenotype that may be explained by a smaller number of anti-oxidant defense enzymes and heatshock proteins.  Conclusions/Significance: Phylogenetic comparison of nuclear and mitochondrial genes indicates that T. rangeli and T. cruzi are equidistant from T. brucei. In addition to revealing new aspects of trypanosome co-evolution within the vertebrate and invertebrate hosts, comparative genomic analysis with pathogenic trypanosomatids provides valuable new information that can be further explored with the aim of developing better diagnostic tools and/or therapeutic targets