Análisis molecular de la subunidad alfa del receptor de la interleucina 5 como posible biomarcador farmacogenético en el asma

[ES]La interleucina 5 desempeña un papel importante en la etiopatogenia del asma y ejerce su función a través de la unión a su receptor, expresado principalmente en la superficie de los eosinófilos. Se han desarrollado nuevas terapias biológicas que actúan contra la subunidad alfa del receptor de la interleucina 5, codificada por el gen IL5RA. Por otro lado, no se dispone de biomarcadores adecuados para la selección y la evaluación de los fármacos biológicos en el asma. Considerando estas premisas, la hipótesis principal sobre la que se asienta este trabajo es que podría existir una asociación entre los niveles de expresión de IL5RA en sangre periférica y la enfermedad asmática. Además, como hipótesis secundaria se postula que IL5RA podría constituir un posible biomarcador de la enfermedad asmática en relación a su implicación en el proceso inflamatorio subyacente, contribuyendo a una mejor caracterización de los pacientes, así como de la respuesta al tratamiento. Los principales objetivos que se plantean son los siguientes: 1. Analizar la expresión transcriptómica de genes asociados con la patología asmática en sangre periférica. 2. Determinar los niveles de expresión de IL5RA en sangre periférica en una población de pacientes asmáticos para su posible caracterización como biomarcador de la enfermedad. 3. Estudiar la posible correlación de los niveles de expresión de IL5RA y el recuento de eosinófilos en los distintos grupos de pacientes asmáticos. 4. Determinar los niveles de expresión de IL5RA antes y después del tratamiento con benralizumab en pacientes con asma eosinofílica grave para su posible caracterización como biomarcador de la respuesta al tratamiento

Análisis molecular de la subunidad alfa del receptor de la interleucina 5 como posible biomarcador farmacogenético en el asma

[ES] La interleucina 5 desempeña un papel importante en la etiopatogenia del asma y ejerce su función a través de la unión a su receptor, expresado principalmente en la superficie de los eosinófilos. Se han desarrollado nuevas terapias biológicas que actúan contra la subunidad alfa del receptor de la interleucina 5, codificada por el gen IL5RA. Por otro lado, no se dispone de biomarcadores adecuados para la selección y la evaluación de los fármacos biológicos en el asma. Considerando estas premisas, la hipótesis principal sobre la que se asienta este trabajo es que podría existir una asociación entre los niveles de expresión de IL5RA en sangre periférica y la enfermedad asmática. Además, como hipótesis secundaria se postula que IL5RA podría constituir un posible biomarcador de la enfermedad asmática en relación a su implicación en el proceso inflamatorio subyacente, contribuyendo a una mejor caracterización de los pacientes, así como de la respuesta al tratamiento. Los principales objetivos que se plantean son los siguientes: 1. Analizar la expresión transcriptómica de genes asociados con la patología asmática en sangre periférica. 2. Determinar los niveles de expresión de IL5RA en sangre periférica en una población de pacientes asmáticos para su posible caracterización como biomarcador de la enfermedad. 3. Estudiar la posible correlación de los niveles de expresión de IL5RA y el recuento de eosinófilos en los distintos grupos de pacientes asmáticos. 4. Determinar los niveles de expresión de IL5RA antes y después del tratamiento con benralizumab en pacientes con asma eosinofílica grave para su posible caracterización como biomarcador de la respuesta al tratamiento

Large scale semi-automatic detection of forest roads from low density LiDAR data on steep terrain in Northern Spain

[EN] While forest roads are important to forest managers in terms of facilitating the exploitation of wood and timber, their role is far more multifunctional. They permit access to emergency services in the case of forest fires as well as acting as fire breaks, enhance biodiversity, and provide access to the public to enjoy recreational activities. Detailed maps of forest roads are an essential tool for better and more timely forest management and automatic/semi-auto-matic tools allow not only the creation of forest road databases, but also enable these to be updated. In Spain, LiDAR data for the entire national territory is freely available, and the capture of higher density data is planned in the next few years. As such, the development of a forest road detection methodology based on LiDAR data would allow maps of all forest roads to be developed and regularly updated. The general objective of this work was to establish a low density LiDAR data-based methodology for the semi-automatic detection of the centerline of forest roads on steep terrain with various types of canopy cover. Intensity and slope images were generated using the currently available LiDAR data of the study area (0.5 points m-2). Two image classification approaches were evaluated: pixel-based and object-oriented classification (OBIA). The LiDAR-derived centerlines obtained with the two approaches were compared with the real centerlines which had previously been digitized in the field. The road width, type of surface and type of vegetation cover were also recorded. The effectiveness of the two approaches was evaluated through three quality indicators: correctness, completeness and quality. In addition, the accuracy of the LiDAR-derived centerlines was also evaluated by combining GIS analysis and statistical methods. The pixel-based approach obtained higher values than OBIA for two of the three quality measures (correctness: 93% compared to 90%; and quality: 60% compared to 56%) as well as in terms of positional accuracy (± 5.5 m vs. ± 6.8 for OBIA). The results obtained in this study demonstrate that producing road maps is among the most valuable and easily attainable products of LiDAR data analysis.SIThis study was funded by the SCALyFOR project (R&D Projects “Research Challenges”, Spanish Ministry of Economy and Competitivenes

Reafirmación de la cultura patriarcal y naturalización de la violencia contra la mujer a través de la percepción dualista de la realidad en las mujeres de la Asociación Municipal de Mujeres Unidas por el Progreso de Nechí, Antioquia.

Identificar de qué manera la construcción del dualismo masculino/femenino en las mujeres de la Asociación municipal de mujeres unidas por el progreso de Nechí - ASMUNE, en Antioquia, reafirma la cultura patriarcal y naturaliza la violencia que se ejerce contra ellas.En la presente investigación cualitativa se utilizó como herramienta la entrevista semiestructurada, la que nos permitió encontrar lo que es importante y significativo en la memoria de las mujeres participantes y tiene que ver con la reproducción de condiciones desiguales para ellas. Para lograr este objetivo buscamos comprender e identificar los factores que posibilitan la reproducción de la violencia contra las mujeres, por lo tanto, da cuenta de cómo algunas mujeres de la Asociación Municipal de Mujeres Unidas por el Progreso de Nechí (ASMUNE), en su cotidianidad replican y refuerzan los estereotipos patriarcales y los roles asignados a hombres y mujeres. De esta forma la violencia física se hace inconcebible, pero la violencia desde lo simbólico y los estereotipos se continúa trasmitiendo. Reconociendo la labor realizada por las integrantes de la asociación, el camino recorrido y todos los logros obtenidos, es innegable el hecho de que la violencia contra la mujer está tan naturalizada en la sociedad, que aún en este grupo de mujeres se encuentran implícitas acciones y narrativas que reproducen, recrean, transmiten y materializan la violencia. Es allí donde se buscan alternativas para revindicar su lucha y la solución ante una situación de vulnerabilidad, para sensibilizar y empoderar a las mujeres, esto con el fin de que tengan la capacidad de percibir las manifestaciones de violencia que son invisibilizadas y normalizadas por la incidencia de la cultura dominante

Reafirmación de la cultura patriarcal y naturalización de la violencia contra la mujer a través de la percepción dualista de la realidad en las mujeres de la Asociación Municipal de Mujeres Unidas por el Progreso de Nechí, Antioquia.

Identificar de qué manera la construcción del dualismo masculino/femenino en las mujeres de la Asociación municipal de mujeres unidas por el progreso de Nechí - ASMUNE, en Antioquia, reafirma la cultura patriarcal y naturaliza la violencia que se ejerce contra ellas.En la presente investigación cualitativa se utilizó como herramienta la entrevista semiestructurada, la que nos permitió encontrar lo que es importante y significativo en la memoria de las mujeres participantes y tiene que ver con la reproducción de condiciones desiguales para ellas. Para lograr este objetivo buscamos comprender e identificar los factores que posibilitan la reproducción de la violencia contra las mujeres, por lo tanto, da cuenta de cómo algunas mujeres de la Asociación Municipal de Mujeres Unidas por el Progreso de Nechí (ASMUNE), en su cotidianidad replican y refuerzan los estereotipos patriarcales y los roles asignados a hombres y mujeres. De esta forma la violencia física se hace inconcebible, pero la violencia desde lo simbólico y los estereotipos se continúa trasmitiendo. Reconociendo la labor realizada por las integrantes de la asociación, el camino recorrido y todos los logros obtenidos, es innegable el hecho de que la violencia contra la mujer está tan naturalizada en la sociedad, que aún en este grupo de mujeres se encuentran implícitas acciones y narrativas que reproducen, recrean, transmiten y materializan la violencia. Es allí donde se buscan alternativas para revindicar su lucha y la solución ante una situación de vulnerabilidad, para sensibilizar y empoderar a las mujeres, esto con el fin de que tengan la capacidad de percibir las manifestaciones de violencia que son invisibilizadas y normalizadas por la incidencia de la cultura dominante

Validação intercultural em português de um questionário para avaliar a síndrome visual do computador em trabalhadores expostos a dispositivos digitais

Purpose: As digital devices are increasingly used at work, valid and reliable tools are needed to assess their effect on visual health. This study aimed to translate, cross-culturally adapt, and validate the Computer Vision Syndrome Questionnaire (CVS-Q©) into Portuguese. Methods: A 5-phase process was followed: direct translation, synthesis of translation, back-translation, consolidation by an expert committee, and pretest. To run the pretest, a cross-sectional pilot study was conducted with 26 participants who completed the prefinal Portuguese version of the CVS-Q© and were asked about difficulties, comprehensibility, and suggestions to improve the questionnaire. To evaluate the reliability and validity of the Portuguese version of the CVS-Q©, a cross-sectional validation study was performed in a different sample (280 workers). Results: In the pretest, 96.2% had no difficulty in completing it, and 84.0% valued it as clear and understandable. CVS-Q© in Portuguese (Questionário da Síndrome Visual do Computador, CVS-Q PT©) was then obtained. Validation revealed the scale’s good internal consistency (Cronbach’s alpha=0.793), good temporal stability (intraclass correlation coefficient=0.847; 95% CI 0.764-0.902, kappa=0.839), adequate sensitivity and specificity (78.5% and 70.7%, respectively), good discriminant capacity (area under the curve=0.832; 95% CI 0.784-0.879), and adequate convergent validity with the ocular surface disease index (Spearman correlation coefficient=0.728, p<0.001). The factor analysis provided a single factor accounting for 37.7% of the explained common variance. A worker who scored ≥7 points would have computer vision syndrome. Conclusions: CVS-Q PT© can be considered an intuitive and easy-to-understand tool with good psychometric properties to measure computer vision syndrome in Portuguese workers exposed to digital devices. This questionnaire will assist in making decisions on preventive measures, interventions, and treatment and comparing exposed populations in different Portuguese-speaking countries.Objetivos: À medida que a utilização de equipamentos digitais no emprego aumenta, a avaliação do seu efeito na saúde visual necessita de ferramentas válidas e robustas. Este estudo teve como objetivo traduzir, adaptar culturalmente e validar para português o Questionário da Síndrome Visual do Computador (CVS-Q©). Métodos: O procedimento foi realizado em 5 fases: tradução direta, síntese da tradução, tradução inversa, consolidação por um painel de especialistas, e pré-teste. Para fazer o pré-teste foi realizado um estudo piloto transversal aplicado a uma amostra de 26 participantes que completaram a versão pré-final da versão portuguesa do CVS-Q©, questionando por dificuldades, compreensão e sugestões de melhoria do questionário. Para avaliar a confiança e validade da versão portuguesa do CVS-Q© foi realizado um estudo transversal de validação em uma amostra diferente (280 funcionários). Resultados: No préteste, 96.2% dos participantes não apresentaram dificuldades no preenchimento do questionário, enquanto 84.0% indicaram que era claro e compreensível. Obteve-se, então, o CVS-Q© em português (Questionário da Síndrome Visual do Computador, CVS-Q PT©). A sua validação revelou uma boa consistência interna da sua escala (Cronbach’s alpha=0.793), boa estabilidade tem poral (coeficiente de correlação interclasse=0.847; 95% CI 0.764-0.902, kappa=0.839), sensibilidades e especificidades adequadas (78.5% e 70.7%, respetivamente), boa capacidade de discriminação (área abaixo da curva=0.832; 95% CI 0.784-0.879), e uma adequada validade da convergência com o índice de doença da superfície ocular (ocular surface disease index - OSDI; coeficiente de correlação de Spearman=0.728, p<0.001). A análise fatorial revelou um único fator responsável por explicar a variância comum em 37.7%. Um funcionário com uma pontuação ≥7 pontos sofria de síndrome visual do computador. Conclusão: O CVS-Q PT© pode ser considerada uma ferramenta intuitiva, de fácil interpretação e com boas pro priedades psicométricas para avaliar a síndrome visual do computador em funcionários portugueses expostos a ecrãs digitais. Este questionário facilitará as decisões sobre medidas preventivas, intervenções e tratamento, e a comparação entre as populações expostas em diferentes países de língua portuguesa.This work was supported by the Portuguese Foundation for Science and Technology in the framework of the Strategic Funding UIDB/04650/2020. The authors thank the Vice-Rectorate of Research of the University of Alicante for the pre-doctoral training contract for the first author (UAFPU2019-08). This article will form part of the first author’s doctoral thesis

The RNA-binding protein RBP33 dampens non-productive transcription in trypanosomes

In-depth analysis of the transcriptomes of several model organisms has revealed that genomes are pervasively transcribed, giving rise to an abundance of non-canonical and mainly antisense RNA polymerase II-derived transcripts that are produced from almost any genomic context. Pervasive RNAs are degraded by surveillance mechanisms, but the repertoire of proteins that control the fate of these non-productive transcripts is still incomplete. Trypanosomes are single-celled eukaryotes that show constitutive RNA polymerase II transcription and in which initiation and termination of transcription occur at a limited number of sites per chromosome. It is not known whether pervasive transcription exists in organisms with unregulated RNA polymerase II activity, and which factors could be involved in the process. We show here that depletion of RBP33 results in overexpression of similar to 40% of all annotated genes in the genome, with a marked accumulation of sense and antisense transcripts derived from silenced regions. RBP33 loss does not result in a significant increase in chromatin accessibility. Finally, we have found that transcripts that increase in abundance upon RBP33 knockdown are significantly more stable in RBP33-depleted trypanosomes, and that the exosome complex is responsible for their degradation. Our results provide strong evidence that RBP33 dampens non-productive transcription in trypanosomes

Detección automática de pistas forestales y evaluación de la precisión a partir de datos LiDAR de baja densidad en Asturias

[ES] Las pistas forestales son infraestructuras esenciales para la gestión sostenible de montes puesto que posibilitan el acceso a las masas forestales para su aprovechamiento o ejecución de tratamientos selvícolas, conectan distintas áreas, sirven de acceso para actividades recreativas y para la lucha contra incendios. Por ello, es imprescindible disponer de una cartografía actualizada de pistas, que permita conocer al menos su localización y longitud. El objetivo general de este estudio fue establecer una metodología para la detección automática del eje de las pistas forestales en un monte de Asturias, con rodales de pino marítimo, pino insigne, roble, castaño y otras frondosas. Para ello, se generaron distintas capas de información partiendo de los datos lidar de la zona de estudio (PNOA). A partir de ellas se evaluaron dos metodologías de clasificación de imágenes: la clasificación basada en píxeles y la orientada a objetos. Los resultados obtenidos se compararon con la cartografía real de las pistas del monte mediante indicadores de Corrección, Integridad y Calidad. Además también se evaluó la precisión del eje de las pistas combinando análisis GIS y métodos estadísticos. La clasificación basada en píxeles obtuvo valores más altos en los tres indicadores evaluados así como en la precisión posiciona

The effectiveness of manual therapy on pain, physical function, and nerve conduction studies in carpal tunnel syndrome patients: a systematic review and meta-analysis

Producción CientíficaAim of the study Systematic review and meta-analysis to assess the effectiveness of manual therapy in improving carpal tunnel syndrome (CTS) symptoms, physical function, and nerve conduction studies. Method MEDLINE, Web of Science, SCOPUS, Cochrane Library, TRIP database, and PEDro databases were searched from the inception to September 2021. PICO search strategy was used to identify randomized controlled trials applying manual therapy on patients with CTS. Eligible studies and data extraction were conducted independently by two reviewers. Methodology quality and risk of bias were assessed by PEDro scale. Outcomes assessed were pain intensity, physical func- tion, and nerve conduction studies. Results Eighty-one potential studies were identified and six studies involving 401 patients were finally included. Pain inten- sity immediately after treatment showed a pooled standard mean difference (SMD) of − 2.13 with 95% confidence interval (CI) (− 2.39, − 1.86). Physical function with Boston Carpal Tunnel Syndrome Questionnaire (BCTS-Q) showed a pooled SMD of − 1.67 with 95% CI (− 1.92, − 1.43) on symptoms severity, and a SMD of − 0.89 with 95% CI (− 1.08, − 0.70) on functional status. Nerve conduction studies showed a SMD of− 0.19 with 95% CI (−0.40, − 0.02) on motor conduction and a SMD of − 1.15 with 95% CI (− 1.36, − 0.93) on sensory conduction. Conclusions This study highlights the effectiveness of manual therapy techniques based on soft tissue and neurodynamic mobilizations, in isolation, on pain, physical function, and nerve conduction studies in patients with CTS.Publicación en abierto financiada por el Consorcio de Bibliotecas Universitarias de Castilla y León (BUCLE), con cargo al Programa Operativo 2014ES16RFOP009 FEDER 2014-2020 DE CASTILLA Y LEÓN, Actuación:20007-CL - Apoyo Consorcio BUCL

CRISPR-ERA for Switching Off (Onco) Genes

Genome-editing nucleases like the popular CRISPR/Cas9 enable the generation of knockout cell lines and null zygotes by inducing site-specific double-stranded breaks (DSBs) within a genome. In most cases, when a DNA template is not present, the DSB is repaired by nonhomologous end joining (NHEJ), resulting in small nucleotide insertions or deletions that can be used to construct knockout alleles. However, for several reasons, these mutations do not produce the desired null result in all cases, instead generating a similar protein with functional activity. This undesirable effect could limit the therapeutic efficiency of gene therapy strategies focused on abrogating oncogene expression by CRISPR/Cas9 and should be taken into account. This chapter reviews the irruption of CRISPR technology for gene silencing and its application in gene therapy