Marine gregarine genomes reveal the breadth of apicomplexan diversity with a partially conserved glideosome machinery

Our current view of the evolutionary history, coding and adaptive capacities of Apicomplexa, protozoan parasites of a wide range of metazoan, is currently strongly biased toward species infecting humans, as data on early diverging apicomplexan lineages infecting invertebrates is extremely limited. Here, we characterized the genome of the marine eugregarine Porospora gigantea, intestinal parasite of Lobsters, remarkable for the macroscopic size of its vegetative feeding forms (trophozoites) and its gliding speed, the fastest so far recorded for Apicomplexa. Two highly syntenic genomes named A and B were assembled. Similar in size (~ 9 Mb) and coding capacity (~ 5300 genes), A and B genomes are 10.8% divergent at the nucleotide level, corresponding to 16–38 My in divergent time. Orthogroup analysis across 25 (proto)Apicomplexa species, including Gregarina niphandrodes, showed that A and B are highly divergent from all other known apicomplexan species, revealing an unexpected breadth of diversity. Phylogenetically these two species branch sisters to Cephaloidophoroidea, and thus expand the known crustacean gregarine superfamily. The genomes were mined for genes encoding proteins necessary for gliding, a key feature of apicomplexans parasites, currently studied through the molecular model called glideosome. Sequence analysis shows that actin-related proteins and regulatory factors are strongly conserved within apicomplexans. In contrast, the predicted protein sequences of core glideosome proteins and adhesion proteins are highly variable among apicomplexan lineages, especially in gregarines. These results confirm the importance of studying gregarines to widen our biological and evolutionary view of apicomplexan species diversity, and to deepen our understanding of the molecular bases of key functions such as gliding, well known to allow access to the intracellular parasitic lifestyle in Apicomplexa

Projet collectif de recherche : Au fil du plomb de la Seine. Origine, circulation et techniques de fabrication des objets en plomb d’époque romaine dans l’estuaire (2020-...)

Peu étudié par le passé, le mobilier en plomb romain découvert dans l’estuaire de la Seine possède un vaste potentiel de recherche. Les problématiques liées à la compréhension des pratiques artisanales, de la circulation du métal dans la région et des pratiques funéraires calètes et véliocasses touchent ici des collections archéologiques anciennes et récentes. Une approche pluridisciplinaire mêlant archéologie et archéométallurgie est susceptible de répondre à ces questions, qui s’inscrivent dans une dynamique de recherche commune à plusieurs laboratoires français et allemands.Coordination du PCR : Malina Robert (Université de Nantes & Caux Seine Agglo)

PCR Au fil du plomb de la Seine. Rapport 2020 (année probatoire)

Au cours du XIXe siècle, de nombreux contenants funéraires en plomb d’époque romaine sont découverts dans l’estuaire de la Seine : des vases ossuaires mis au jour à Lillebonne (Seine-Maritime) et ses alentours aux cercueils des environs de Rouen (Seine-Maritime), ils intriguent les érudits locaux et moins locaux, qui relient rapidement la présence de ce métal en grande quantité, dans une région où aucune mine antique n’est connue, à la richesse plombifère de la province proche de Britannia. Trois axes de recherche ont été identifiés les concernant :- Échanges et pratiques commerciales autour du plomb dans l’estuaire.- L'artisanat du plomb estuarien, de la mine au produit fini.- Le plomb dans les pratiques funéraires calètes et véliocasses.Le présent rapport correspond à un bilan des activités de recherches au cours de l’année probatoire 2020, ainsi qu’à la présentation de la campagne triennale envisagée à son issue

PCR Au fil du plomb de la Seine. Rapport 2020 (année probatoire)

Au cours du XIXe siècle, de nombreux contenants funéraires en plomb d’époque romaine sont découverts dans l’estuaire de la Seine : des vases ossuaires mis au jour à Lillebonne (Seine-Maritime) et ses alentours aux cercueils des environs de Rouen (Seine-Maritime), ils intriguent les érudits locaux et moins locaux, qui relient rapidement la présence de ce métal en grande quantité, dans une région où aucune mine antique n’est connue, à la richesse plombifère de la province proche de Britannia. Trois axes de recherche ont été identifiés les concernant :- Échanges et pratiques commerciales autour du plomb dans l’estuaire.- L'artisanat du plomb estuarien, de la mine au produit fini.- Le plomb dans les pratiques funéraires calètes et véliocasses.Le présent rapport correspond à un bilan des activités de recherches au cours de l’année probatoire 2020, ainsi qu’à la présentation de la campagne triennale envisagée à son issue

PCR Au fil du plomb de la Seine. Rapport 2020 (année probatoire)

Au cours du XIXe siècle, de nombreux contenants funéraires en plomb d’époque romaine sont découverts dans l’estuaire de la Seine : des vases ossuaires mis au jour à Lillebonne (Seine-Maritime) et ses alentours aux cercueils des environs de Rouen (Seine-Maritime), ils intriguent les érudits locaux et moins locaux, qui relient rapidement la présence de ce métal en grande quantité, dans une région où aucune mine antique n’est connue, à la richesse plombifère de la province proche de Britannia. Trois axes de recherche ont été identifiés les concernant :- Échanges et pratiques commerciales autour du plomb dans l’estuaire.- L'artisanat du plomb estuarien, de la mine au produit fini.- Le plomb dans les pratiques funéraires calètes et véliocasses.Le présent rapport correspond à un bilan des activités de recherches au cours de l’année probatoire 2020, ainsi qu’à la présentation de la campagne triennale envisagée à son issue

PCR Au fil du plomb de la Seine. Rapport 2020 (année probatoire)

Au cours du XIXe siècle, de nombreux contenants funéraires en plomb d’époque romaine sont découverts dans l’estuaire de la Seine : des vases ossuaires mis au jour à Lillebonne (Seine-Maritime) et ses alentours aux cercueils des environs de Rouen (Seine-Maritime), ils intriguent les érudits locaux et moins locaux, qui relient rapidement la présence de ce métal en grande quantité, dans une région où aucune mine antique n’est connue, à la richesse plombifère de la province proche de Britannia. Trois axes de recherche ont été identifiés les concernant :- Échanges et pratiques commerciales autour du plomb dans l’estuaire.- L'artisanat du plomb estuarien, de la mine au produit fini.- Le plomb dans les pratiques funéraires calètes et véliocasses.Le présent rapport correspond à un bilan des activités de recherches au cours de l’année probatoire 2020, ainsi qu’à la présentation de la campagne triennale envisagée à son issue

PCR Au fil du plomb de la Seine. Rapport 2020 (année probatoire)

Au cours du XIXe siècle, de nombreux contenants funéraires en plomb d’époque romaine sont découverts dans l’estuaire de la Seine : des vases ossuaires mis au jour à Lillebonne (Seine-Maritime) et ses alentours aux cercueils des environs de Rouen (Seine-Maritime), ils intriguent les érudits locaux et moins locaux, qui relient rapidement la présence de ce métal en grande quantité, dans une région où aucune mine antique n’est connue, à la richesse plombifère de la province proche de Britannia. Trois axes de recherche ont été identifiés les concernant :- Échanges et pratiques commerciales autour du plomb dans l’estuaire.- L'artisanat du plomb estuarien, de la mine au produit fini.- Le plomb dans les pratiques funéraires calètes et véliocasses.Le présent rapport correspond à un bilan des activités de recherches au cours de l’année probatoire 2020, ainsi qu’à la présentation de la campagne triennale envisagée à son issue

PCR Au fil du plomb de la Seine. Rapport 2021 (coord. M. Robert)

Au cours du XIXe siècle, de nombreux contenants funéraires en plomb d’époque romaine sont découverts dans l’estuaire de la Seine : des vases ossuaires mis au jour à Lillebonne (Seine-Maritime) et ses alentours aux cercueils des environs de Rouen (Seine-Maritime), ils intriguent les érudits locaux et moins locaux, qui relient rapidement la présence de ce métal en grande quantité, dans une région où aucune mine antique n’est connue, à la richesse plombifère de la province proche de Britannia. Trois axes de recherche ont été identifiés les concernant :- Échanges et pratiques commerciales autour du plomb dans l’estuaire.- L'artisanat du plomb estuarien, de la mine au produit fini.- Le plomb dans les pratiques funéraires calètes et véliocasses.À la suite de ces échanges et au regard des premières données rassemblées au cours de l'année probatoire 2020, une réflexion collective a été menée afin de planifier les poursuites de la recherche sur les productions manufacturées en plomb d’époque romaine dans l’estuaire de la Seine. Un programme de recherche triennale a donc débuté en 2021, afin d’étendre la réflexion initiée dans le cadre des axes de recherche du PCR : les différentes enquêtes portant sur la composition et la provenance du métal, tout comme l’étude de la diffusion des contenants en plomb vers et au sein de la région d’étude, ainsi que leur vocation funéraire ne font, en effet, que débuter. Le présent rapport correspond à un bilan des activités de recherches au cours de l’année 2021, première année de la campagne triennale