Characterization of a Natural Arabidopsis thaliana – Pseudomonas viridiflava Pathosystem

Disease in plants can be caused by a variety of microorganisms, including bacteria. To fight infection, plants are equipped with an immune system that recognizes pathogens and activates a defense response mediated by the hormones salicylic acid and/or jasmonic acid and ethylene. One of the most important bacterial plant pathogens are strains from the Pseudomonas genus, able to infect crops and wild plants. The Pseudomonas syringae complex comprises most of the phytopathogens of this genus, including the model strain P. syringae pv. tomato DC3000 (DC3000), widely used in pathogenicity studies. P. viridiflava, a globally-distributed natural pathogen of the model plant Arabidopsis thaliana, also belongs to the P. syringae complex but is genetically and phenotypically distinct from well-characterized DC3000. Despite P. viridiflava being the most abundant Pseudomonas species in A. thaliana populations, little is known about the mechanisms of bacterial virulence and plant resistance in this pathosystem. In this thesis, I characterized the natural A. thaliana - P. viridiflava pathosystem by combining genetics, transcriptomics and metabolomics to identify resistance mechanisms in the host. I also used a computational framework to identify virulence-related specialized metabolites in the pathogen. In the first chapter, I investigated how P. viridiflava interacts with A. thaliana, and contrasted this with the model pathogen DC3000. I uncovered that the jasmonic acid/ethylene pathway is involved in defense against P. viridiflava, likely through an increase in jasmonic acid levels. Infection elicited a similar response in resistant and susceptible hosts, but the timing was different: changes occurred faster in the resistant host. In the second chapter, I explored how potential specialized metabolites encoded by P. viridiflava might be associated with differences in their virulence. I described the large biosynthetic potential of a collection of Pseudomonas genomes from the A. thaliana phyllosphere, and found that this biosynthetic potential is dominated by non-ribosomal peptide synthetases. I then identified gene cluster families with a putative role in P. viridiflava virulence, one of them related to the siderophore pyoverdine. Overall, this thesis presents an integrative approach to the study of plant-microbe interactions, and provides the baseline for further studies on the interactions between A. thaliana and P. viridiflava. This pathosystem better represents the interaction dynamics in natural populations and has the potential to address ecologically-relevant questions about adaptation and co-evolution of host and pathogen

Aplicación de la transformada de hilbert-huang en la detección de modos de variabilidad hidroclimática en colombia.

Se estudia la aplicación de la transformada de Hilbert-Huang en series de precipitación, caudal y temperatura de diferentes resoluciones temporales, para detectar los principales modos de variabilidad hidroclimática en Colombia. Se comparan los resultados con las metodologías tradicionales de análisis espectral: Transformada de Fourier y Transformada en Onditas. En las variables con resolución mensual (precipitación, caudal y temperatura) se detectan modos se oscilación asociados con períodos de 3, 6 y 12 meses, 2-3 años y 3.5-6 años. En los registros diarios, además de los períodos ya mencionados se encuentran frecuencias asociadas a períodos de 3.5-5 días y 69-78 días. En las series horarias se identifican frecuencias asociadas a períodos de 12 y 24 horas, seguidas de una frecuencia de 0.017 h-1 equivalente a 59 horas (2.5 días). Se evidencia la potencia y superioridad de la transformada de Hilbert-Huang, especialmente para señales con ciclos marcados y series con datos atípicos

Identificación de modos principales de variabilidad hidroclimática en Colombia mediante la transformada de Hilbert-Huang

Se estudian los principales modos de variabilidad hidro-climática en series de precipitación, caudales y temperatura de variada resolución temporal en Colombia mediante tres metodologías: la transformada de Hilbert-Huang, la transformada de Fourier y la transformada en Onditas. Los resultados obtenidos indican que los principales modos de oscilación hidro-climática en las variables con resolución mensual (precipitación, caudal y temperatura) están asociadas con períodos de 3, 6 y 12 meses, 2-3 años y 3, 5-6 años

Variabilidad interdiaria de la precipitación en Medellín (Colombia) asociada con las ondas tropicales del este y su comportamiento durante las fases del ENSO.

El sistema ENSO y las Ondas Tropicales del Este se encuentran entre los factores que ayudan a explicar las anomalías hidrológicas en Colombia. En el presente trabajo se implementan la Transformada en Onditas y la Transformada de Hilbert-Huang al estudio de series de lluvia diaria en los Andes Tropicales de Colombia con el fin de estudiar la influencia de las Ondas Tropicales del Este en la precipitación para diferentes fases del ENSO. Se analizan los dos años más fuertes de cada fase del sistema ENSO (El Niño y La Niña) basados en los índices ONI y MEI, y la información disponible de precipitación. Los resultados muestran que todas las estaciones presentan frecuencias predominantes con periodos asociados a 3-7 días y porcentajes de potencia superiores al 65% que se pueden asociar con las características de las Ondas Tropicales del Este. Dichas frecuencias disminuyen para los años El Niño. Los espectros de potencias en Onditas y de Hilbert-Huang exhiben mayor variabilidad para los meses Junio-Noviembre de los años La Niña y Normal que para los años El Niño, lo que contribuye a explicar la reducción drástica de la precipitación en Colombia en la fase cálida del ENSO

Sobrepeso en el periodo post confinamiento por la pandemia covid-19

The research was carried out at the José Chiriboga Grijalva Higher Technological Institute, in Ibarra, Ecuador, on a sample of students to monitor anthropometric measurements, weight and height in the context of COVID-19. For the diagnosis of nutritional status, the Body Mass Index was used; users whose Body Mass Index was between the 85th and <95th percentiles were diagnosed as overweight and those with a value equal to or greater than the 95th percentile, with obesity. The results show that 75% of the students participating in the study who suffer from obesity and 73.4% of those who are overweight live in urban areas. The highest percentage of students who are overweight are in a medium-low socioeconomic level, while the highest percentage of those who are obese are in a high socioeconomic level. Confinement as a sanitary measure for the prevention of COVID-19 infections was related to the increase in the Institute's student index.La investigación se realizó en el Instituto Superior Tecnológico José Chiriboga Grijalva, en Ibarra, Ecuador a una muestra de estudiantes para el seguimiento de medidas antropométricas, peso y talla en el contexto del COVID-19.  Para el diagnóstico del estado nutricional se utilizó el Índice de Masa Corporal; los usuarios, cuyo Índice de Masa Corporal estuvo entre los percentiles 85 y <95 se diagnosticaron con sobrepeso y aquellos con un valor igual o mayor que el percentil 95, con obesidad. Los resultados demuestran que el 75% de los estudiantes, participantes en el estudio, que padecen obesidad y el 73,4% de los que tienen sobrepeso habitan en zonas urbanas. El mayor porcentaje de los estudiantes que tienen sobrepeso se encuentran en nivel socioeconómico medio-bajo, mientras que el mayor porcentaje de los que padecen obesidad se encuentran en un nivel socioeconómico alto. El confinamiento como medida sanitaria para la prevención de contagios de COVID-19 estuvo relacionado con el incremento del Índice de los estudiantes del instituto

Polimorfismos en los genes de la enzima alcohol deshidrogenasa (ADH1) y la citocromo P450 2E1 (CYP2E1) en pacientes con cirrosis y carcinoma hepatocelular

Introducción. Uno de los principales factores de riesgo del carcinoma hepatocelular es el consumo crónico de alcohol. En estudios en diferentes poblaciones, se sugiere que las variantes genéticas de las enzimas que participan en el metabolismo del alcohol, como la alcohol deshidrogenasa (ADH) y la citocromo P450 (CYP2E1), estarían asociadas con riesgo de enfermedades hepáticas terminales. Objetivo. Identificar y caracterizar las variantes alélicas de los genes ADH1B, ADH1C y CYP2E1 en pacientes colombianos con diagnóstico de cirrosis y carcinoma hepatocelular. Materiales y métodos. Se incluyeron muestras de pacientes atendidos entre el 2005 y el 2007, y entre el 2014 y el 2016, en la unidad de hepatología de un hospital de Medellín. La genotipificación de las muestras se hizo mediante reacción en cadena de la polimerasa (Polymerase Chain Reaction, PCR) con análisis de los polimorfismos en la longitud de los fragmentos de restricción (Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP). Los resultados se compararon con los de dos grupos de control y con lo reportado en la base de datos del 1000 Genomes Project. Resultados. Se recolectaron 97 muestras de pacientes con diagnóstico de cirrosis y carcinoma hepatocelular. Los dos factores de riesgo más frecuentes fueron el consumo crónico de alcohol (18,6 %) y las colangiopatías (17,5 %). Los genotipos más frecuentes en la población de estudio fueron el ADH1B*1/1 (82 %), el ADH1C*1/1 (59 %) y el CYP2E1*C/C (84 %). Conclusiones. En este primer estudio de los polimorfismos en pacientes colombianos con diagnóstico de cirrosis y carcinoma hepatocelular, los genotipos más frecuentes fueron el ADH1B*1/1, el ADH1C*1/1 y el CYP2E1*C/C. No se observaron diferencias estadísticamente significativas en la frecuencia de los genotipos entre los casos y los controles. Se requieren estudios adicionales en población colombiana para evaluar el riesgo de la enfermedad hepática terminal por consumo crónico de alcohol y la asociación con los polimorfismos

Comunidades educativas saludables : prácticas pedagógicas en Colombia y México

134 páginas : imágenes ; 28 cm.Los Objetivos de Desarrollo Sostenible 2030 (ODS) tienen como propósito reconocer que las intervenciones en un área, afectarán los resultados de otras y el desarrollo debe equilibrar la sostenibilidad medioambiental, económica y social. Una de esas áreas es la Educación, cuyo objetivo es el de “Garantizar una educación inclusiva, equitativa y de calidad y promover oportunidades de aprendizaje durante toda la vida para todos”. En este sentido, el Gobierno de Colombia, establece una serie de programas y políticas para los próximos años como una oportunidad clave para generar transformaciones y dar impulso político a temas de interés local, regional nacional e internacional que permitan mejorar la calidad de vida de todos los colombianos. En concordancia, la Fundación Universitaria del Área Andina como una institución educativa de carácter humanista y social, refleja en sus prácticas académicas, la cultura institucional, el énfasis formativo y el compromiso con el entorno, mediante la transformación de su contexto, el aprendizaje constante y en coherencia con su misión institucional.Introducción. -- Higienización de manos en comunidades escolares: educación para la salud. -- Educomunicación para la prevención de enfermedades zoonóticas en primarias de Yucatán, México. -- Propuesta didáctica dirigida a la promoción de educación para la salud en adolescentes. -- Educación para la salud: experiencias de intervención en Yucatán, México

Detection of climate change and climate variability signals in Colombia and the Amazon River basin through empirical mode decomposition.

Se identifican los principales modos de variabilidad hidro-climática en series de precipitación, caudales y temperatura en Colombia y en la cuenca Amazónica, de varias resoluciones temporales, comparando los resultados obtenidos mediante las transformadas de Fourier, Onditas y Hilbert-Huang, así como identificando señales de cambio climático y variabilidad hidro-climática de largo plazo a través de la metodología de la Descomposición en Modos Empíricos.The hydro-climatology of Colombia exhibits significant signatures of climatic change and also strong natural climate variability at a broad range of time scales from interdecadal and interannual all the way through intradiurnal. Signals of long-term trends and of natural climate variability are detected in Colombia and the Amazon River basin using long series of monthly rainfall (100 stations), average river discharges (42 stations) and mean and minimum temperature records (37 stations) in Colombia. In the Amazon basin 29 monthly rainfall stations were studied. Stations with more than 25 years of data and well spatially distributed across Colombia and the Amazon were selected. Also, time series of average monthly river discharges were selected on 10 Colombian river basins with gauging stations along their path. For estimation, the Empirical Mode Decomposition (EMD), is used as a filtering process whereby a time series is decomposed into a finite number of intrinsic mode functions (IMFs), assuming that at any given time, many simple oscillatory modes of different frequencies coexist in a time series, where the residual represents the general trend of the series over time. The statistical significance of the trend in the EMD residuals are tested through the Mann-Kendall test for autocorrelated series and the magnitude of the trends are quantified by the Sen test. Results show that most monthly river discharges series exhibit decreasing trends, whereas the minimum temperature series show increasing trends. Results on precipitation are inconclusive as monthly records exhibit a mixed pattern of increasing and decreasing trends. However, it was established that the maximum trend magnitudes in rainfall series are located in the Colombian Pacific region (increasing trends), whereas towards the rest of the country no clear spatial pattern could be recognized. Also a consistent result between trends in rainfall and discharges in the Pacific region was found. These series exhibit increasing trends coinciding with a rising trend estimated in the Choco Low level Jet series which represents moisture advection into this particular area. In the Amazon basin the maximum trend magnitudes were found in the basin's central and south-eastern region. (Tomado de la fuente)58th International Statistics Institute (ISI) World Statistics Congres