The Functions of Auxilin and Rab11 in Drosophila Suggest That the Fundamental Role of Ligand Endocytosis in Notch Signaling Cells Is Not Recycling

Notch signaling requires ligand internalization by the signal sending cells. Two endocytic proteins, epsin and auxilin, are essential for ligand internalization and signaling. Epsin promotes clathrin-coated vesicle formation, and auxilin uncoats clathrin from newly internalized vesicles. Two hypotheses have been advanced to explain the requirement for ligand endocytosis. One idea is that after ligand/receptor binding, ligand endocytosis leads to receptor activation by pulling on the receptor, which either exposes a cleavage site on the extracellular domain, or dissociates two receptor subunits. Alternatively, ligand internalization prior to receptor binding, followed by trafficking through an endosomal pathway and recycling to the plasma membrane may enable ligand activation. Activation could mean ligand modification or ligand transcytosis to a membrane environment conducive to signaling. A key piece of evidence supporting the recycling model is the requirement in signaling cells for Rab11, which encodes a GTPase critical for endosomal recycling. Here, we use Drosophila Rab11 and auxilin mutants to test the ligand recycling hypothesis. First, we find that Rab11 is dispensable for several Notch signaling events in the eye disc. Second, we find that Drosophila female germline cells, the one cell type known to signal without clathrin, also do not require auxilin to signal. Third, we find that much of the requirement for auxilin in Notch signaling was bypassed by overexpression of both clathrin heavy chain and epsin. Thus, the main role of auxilin in Notch signaling is not to produce uncoated ligand-containing vesicles, but to maintain the pool of free clathrin. Taken together, these results argue strongly that at least in some cell types, the primary function of Notch ligand endocytosis is not for ligand recycling

The Functions of Auxilin and Rab11 in Drosophila Suggest That the Fundamental Role of Ligand Endocytosis in Notch Signaling Cells Is Not Recycling

Notch signaling requires ligand internalization by the signal sending cells. Two endocytic proteins, epsin and auxilin, are essential for ligand internalization and signaling. Epsin promotes clathrin-coated vesicle formation, and auxilin uncoats clathrin from newly internalized vesicles. Two hypotheses have been advanced to explain the requirement for ligand endocytosis. One idea is that after ligand/receptor binding, ligand endocytosis leads to receptor activation by pulling on the receptor, which either exposes a cleavage site on the extracellular domain, or dissociates two receptor subunits. Alternatively, ligand internalization prior to receptor binding, followed by trafficking through an endosomal pathway and recycling to the plasma membrane may enable ligand activation. Activation could mean ligand modification or ligand transcytosis to a membrane environment conducive to signaling. A key piece of evidence supporting the recycling model is the requirement in signaling cells for Rab11, which encodes a GTPase critical for endosomal recycling. Here, we use Drosophila Rab11 and auxilin mutants to test the ligand recycling hypothesis. First, we find that Rab11 is dispensable for several Notch signaling events in the eye disc. Second, we find that Drosophila female germline cells, the one cell type known to signal without clathrin, also do not require auxilin to signal. Third, we find that much of the requirement for auxilin in Notch signaling was bypassed by overexpression of both clathrin heavy chain and epsin. Thus, the main role of auxilin in Notch signaling is not to produce uncoated ligand-containing vesicles, but to maintain the pool of free clathrin. Taken together, these results argue strongly that at least in some cell types, the primary function of Notch ligand endocytosis is not for ligand recycling

SCFSlimb ubiquitin ligase suppresses condensin II-mediated nuclear reorganization by degrading Cap-H2

Condensin complexes play vital roles in chromosome condensation during mitosis and meiosis. Condensin II uniquely localizes to chromatin throughout the cell cycle and, in addition to its mitotic duties, modulates chromosome organization and gene expression during interphase. Mitotic condensin activity is regulated by phosphorylation, but mechanisms that regulate condensin II during interphase are unclear. Here, we report that condensin II is inactivated when its subunit Cap-H2 is targeted for degradation by the SCF ubiquitin ligase complex and that disruption of this process dramatically changed interphase chromatin organization. Inhibition of SCF function reorganized interphase chromosomes into dense, compact domains and disrupted homologue pairing in both cultured Drosophila cells and in vivo, but these effects were rescued by condensin II inactivation. Furthermore, Cap-H2 stabilization distorted nuclear envelopes and dispersed Cid/CENP-A on interphase chromosomes. Therefore, SCF mediated down-regulation of condensin II is required to maintain proper organization and morphology of the interphase nucleus

Mobile Performance - Implementation neuer statistischer Auswertungsmöglichkeiten und Überprüfung der Aussagekraft von Netztest-Kampagnen

Mobile Provider, wie Swisscom, Sunrise und Salt, lassen sich regelmässig von Testorganisationen bewerten, um mit den Ergebnisse zu werben. Ziel dieser Bachelorarbeit war es, die Einflüsse verschiedener Parameter auf die Rangierungen aufzuzeigen und mittels automatischer Klassierungen der Speedtest-Messungen aussagekräftigere Ranglisten zu ermöglichen Anhand der Analyse bekannter Netztests (connect, Ookla und weitere Anbieter) wurden deren Vor- und Nachteile aufgezeigt. Für Speedtest-Apps wurden Möglichkeiten zur automatischen Klassierung von Messorten und Bewegungsart untersucht. Es entstand ein Web API, welches mittels Lokationsangaben von mindestens drei zusammengehörenden Messpunkten eine Klassierung von Messungen ermöglicht. Abschliessend wurde aufgezeigt, wie die Klassierung zu aussagekräftigeren Ranglisten führt bzw. unter welchen Bedingungen die Rangierungen bei Netztest-Kampagnen nicht mehr zufällig sind. Der entwickelte Algorithmus leitet aus den bestehenden Messdaten der cnlab AG, dem freien Kartenmaterial von OpenStreetMap sowie aus Geographie- und Raumdaten des Bundes die folgenden Klassierungen ab: - Messort (Schiene, Strasse, Gebäude) - Fortbewegungsart (stationär bis sehr schnell fahrend) - Bevölkerungsdichte und Gemeindetyp - Geografische Umgebung (Wald, Wiese, Wohngegend) Die Klassierung basiert auf einer Kombination der Abstände von Messorten zu Objekten, der Genauigkeit der Lokationsangaben und der Fortbewegungsgeschwindigkeit während einer Messung. Mit dem Algorithmus konnten 82% der Messungen mit einer Ortsauflösung von besser als 200 Meter korrekt klassiert werden. Die statistischen Auswertungen ergaben, dass bei Gegenüberstellung des 50ten Perzentils aller Messungen eines Providers zu den 50ten Perzentilen der einzelnen Monate Abweichungen von bis zu -40,53% auftreten

Mobile Quiz - Weiterentwicklung einer Online Quiz- Plattform

Mobile Quiz ist eine Online-Quiz Plattform für Computer und Smartphones, welche in verschiedenen HSR-Modulen (Computernetze, Informations- und Codierungstheorie, Informationssicherheit) und Weiterbildungskursen regelmässig eingesetzt wird. Mobile Quiz entstand 2012 aus einer Bachelorarbeit und wurde seither mehrmals erweitert. Die zu Beginn der Arbeit vorliegende Mobile Quiz Version umfasste zwar viele praktische Funktionen und Einstellungs-möglichkeiten, es mangelte aber an der Bedienbarkeit. Im Rahmen dieser Studienarbeit sollten einerseits die Benutzerfreundlichkeit erhöht und andererseits neue Funktionen hinzugefügt werden. In einem ersten Schritt wurde Mobile Quiz gründlich untersucht. Mit einem Usability Test wurden Optimierungsmöglichkeiten für Quizteilnehmer bestimmt. Anhand der Behebung von kleinen Fehlern machte man sich mit dem Code und den eingesetzten Technologien vertraut. Diese umfassen PHP, HTML, CSS, Javascript, JQuery und Bootstrap. Im Rahmen einer Umfeldanalyse wurden ähnliche Online Quiz-Plattformen gesucht, getestet und bewertet. Die aus dieser Projektphase gewonnenen Erkenntnisse halfen bei der Neugestaltung der Seiteninhalte sowie bei der Festlegung von neuen Funktionen. Beim Design wurden die angezeigten Informationen bewusst auf das Nötigste beschränkt. Zur Verbesserung der Benutzerführung wurden Symbole durch textuelle Menus ersetzt. Die Implementierung erfolgte während fünf Wochen. Abgeschlossen wurde die Arbeit mit einem Usability Test. Die Bedienbarkeit von Mobile Quiz wurde durch diese Studienarbeit sowohl für Quiz-Ersteller, als auch für Teilnehmer wesentlich verbessert. Die Schritt-für-Schritt Benutzerführung erleichtert die Erstellung von Quiz, Fragen und Durchführungen. Dank der neuen Excel-Import Funktion lassen sich Quiz und Fragen einfacher erstellen. Durch die Erweiterung \glqq Fragen mit Bildern\grqq sind attraktivere Fragestellungen möglich. Die Konzeptänderung, welche pro Quiz mehrere Durchführungen möglich macht, erleichtert den Einsatz von Mobile Quiz im Unterricht mit mehreren Übungsgruppen. Dank dem neuen Design sollten sich die Quizteilnehmer schneller zurechtfinden. Dies belegt der Vergleich der Ergebnisse der beiden Usability-Tests vor und nach der Überarbeitung des Mobile Quiz. Die jetzt vorliegende Mobile Quiz Version wird ab dem nächsten Semester produktiv eingesetzt. Die Umsetzung der in der Analysephase ausgearbeiteten statistischen Auswertungen könnte im Rahmen einer weiteren Studienarbeit erfolgen

The F-box protein Slmb restricts the activity of aPKC to polarize epithelial cells.

The Par-3/Par-6/aPKC complex is the primary determinant of apical polarity in epithelia across animal species, but how the activity of this complex is restricted to allow polarization of the basolateral domain is less well understood. In Drosophila, several multiprotein modules antagonize the Par complex through a variety of means. Here we identify a new mechanism involving regulated protein degradation. Strong mutations in supernumerary limbs (slmb), which encodes the substrate adaptor of an SCF-class E3 ubiquitin ligase, cause dramatic loss of polarity in imaginal discs accompanied by tumorous proliferation defects. Slmb function is required to restrain apical aPKC activity in a manner that is independent of endolysosomal trafficking and parallel to the Scribble module of junctional scaffolding proteins. The involvement of the Slmb E3 ligase in epithelial polarity, specifically limiting Par complex activity to distinguish the basolateral domain, points to parallels with polarization of the C. elegans zygote

The F-box protein Slmb restricts the activity of aPKC to polarize epithelial cells.

The Par-3/Par-6/aPKC complex is the primary determinant of apical polarity in epithelia across animal species, but how the activity of this complex is restricted to allow polarization of the basolateral domain is less well understood. In Drosophila, several multiprotein modules antagonize the Par complex through a variety of means. Here we identify a new mechanism involving regulated protein degradation. Strong mutations in supernumerary limbs (slmb), which encodes the substrate adaptor of an SCF-class E3 ubiquitin ligase, cause dramatic loss of polarity in imaginal discs accompanied by tumorous proliferation defects. Slmb function is required to restrain apical aPKC activity in a manner that is independent of endolysosomal trafficking and parallel to the Scribble module of junctional scaffolding proteins. The involvement of the Slmb E3 ligase in epithelial polarity, specifically limiting Par complex activity to distinguish the basolateral domain, points to parallels with polarization of the C. elegans zygote