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A non-syndromic intellectual disability associated with a de novo microdeletion at 7q and 18p, microduplication at Xp, and 18q partial trisomy detected using chromosomal microarray analysis approach
BACKGROUND: Chromosome abnormalities that segregate with a disease phenotype can facilitate the identification of disease loci and genes. The relationship between chromosome 18 anomalies with severe intellectual disability has attracted the attention of cytogeneticists worldwide. Duplications of the X chromosome can cause intellectual disability in females with variable phenotypic effects, due in part to variations in X-inactivation patterns. Additionally, deletions of the 7qter region are associated with a range of phenotypes. RESULTS: We report the first case of de novo microdeletion at 7q and 18p, 18q partial trisomy, microduplication at Xp associated to intellectual disability in a Brazilian child, presenting a normal karyotype. Karyotyping showed any chromosome alteration. Chromosomal microarray analysis detected a de novo microdeletion at 18p11.32 and 18q partial trisomy, an inherited microdeletion at 7q31.1 and a de novo microduplication at Xp22.33p21.3. CONCLUSIONS: Our report illustrates a case that presents complex genomic imbalances which may contribute to a severe clinical phenotypes. The rare and complex phenotypes have to be investigated to define the subsets and allow the phenotypes classification
Diagnosis of de novo 17p11.2 microduplication - potocki-lupski syndrome identified by chromosomal microarray analysis: a case report / Diagnóstico de novo 17p11.2 microduplicação - potocki-lupski síndrome identificada por análise de microarray chromosomal: um relatório de caso
Potocki-Lupski Syndrome is a continuous gene syndrome caused by the microduplication of 3.7 Mb segment at 17p11.2 characterized by developmental delay, intellectual disability, the developmental deficit for psychomotor and expressive speech, autistic features, obsessive-compulsive behaviors, and attention deficit. Using CMA, we detected the first de novo 3.7 Mb microduplication at 17p11.2 in a boy with an intellectual disability from Central Brazil
Diagnostic of Chormosome 7Q11,23 Duplication Syndrome - a case report
Resumo: a Síndrome da Duplicação do Cromossomo 7q11.23, também
conhecida como Síndrome da duplicação de WBS, é uma desordem rara causada pela duplicação de um segmento de 1.5 Mb e caracterizada por deficiência intelectual, dificuldade na fala e anomalias craniofaciais moderadas. Ao realizar a técnica de CMA em amostras de uma família que tem uma criança com deficiência intelectual, foi observado uma microduplicação de novo de 1.428,9 Kbp no cromossomo 7q11.3.
Palavras-chave: CNV. Deficiência Intelectual. Microarranjo. Síndrome
da Duplicação de Williams-Beuren
A Materialização do Aconselhamento Genético num Relato de Caso
Resumo: um casal de primos procurou aconselhamento
genético por terem gerado um natimorto com seqüência
Potter. O casal realizou o cariótipo com bandas G, o qual
demonstrou uma deleção terminal do cromossomo 9 na
mulher. Nesse caso, o aconselhamento genético foi extremamente
importante para a percepção e compreensão do
casal quanto aos riscos de (re) aparecimento de doenças
genéticas.
Palavras-chave: Consanguinidade. Genética. Sequência
de Potter. Deleção terminal
Discutindo a educação ambiental no cotidiano escolar: desenvolvimento de projetos na escola formação inicial e continuada de professores
A presente pesquisa buscou discutir como a Educação Ambiental (EA) vem sendo trabalhada, no Ensino Fundamental e como os docentes desta escola compreendem e vem inserindo a EA no cotidiano escolar., em uma escola estadual do município de Tangará da Serra/MT, Brasil. Para tanto, realizou-se entrevistas com os professores que fazem parte de um projeto interdisciplinar de EA na escola pesquisada. Verificou-se que o projeto da escola não vem conseguindo alcançar os objetivos propostos por: desconhecimento do mesmo, pelos professores; formação deficiente dos professores, não entendimento da EA como processo de ensino-aprendizagem, falta de recursos didáticos, planejamento inadequado das atividades. A partir dessa constatação, procurou-se debater a impossibilidade de tratar do tema fora do trabalho interdisciplinar, bem como, e principalmente, a importância de um estudo mais aprofundado de EA, vinculando teoria e prática, tanto na formação docente, como em projetos escolares, a fim de fugir do tradicional vínculo “EA e ecologia, lixo e horta”.Facultad de Humanidades y Ciencias de la Educació
Análise cromossômica por microarranjos em probandos com indicação clínica de Síndrome de Down sem alterações cariotípicas.
Made available in DSpace on 2016-08-10T10:39:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Damiana Mirian da Cruz e Cunha.pdf: 2264368 bytes, checksum: 62f85b5e1f20e0397e3b33bbbe7b4f00 (MD5)
Previous issue date: 2015-03-16Genetically determined conditions affect millions of families worldwide. More than 40% of
cases of severe Intellectual Disability (ID) are caused by monogenic diseases or
chromosomal abnormalities. In Brazil, a country with 185 million people, some disability is
expected to affect about 25 million (14%) people, and of these, approximately 17 million
(68%) would have ID. Downs Syndrome (DS) was recognized and first described by John
Langdon Down in 1866. DS is the most common autosomal genetic abnormality, contributing
with approximately 18% of all cases of DI. The average prevalence rate is 1:650 live births,
which increases with advancing maternal age. DS aetiology is related to the excess of genetic
material from an extra chromosome 21. DS could also results from chromosomal
translocation resulting in trisomy 21 and post-zygotic mosaicism. The phenotype associated
with DS varies in signs and intensity. However, ID is a highly conserved feature on those who
are affected by the trisomy 21 and has a major impact on public health and individual quality
of life. Despite the phenotypic pathognomonic characteristics of DS, there is still a challenge
in the clinical diagnosis. The current study reported the laboratory investigation of 6
probands with complex phenotypes, which had features in common with the SD. However,
while the physical examination generated the clinical hypothesis, the cytogenetic laboratory
tests were not useful for diagnostic resolution. In this context, Chromosomal Microarray
Analysis (CMA) was used to support the laboratory diagnosis of cases with clinical indication
of SD whose karyotypes showed up without apparent numerical or structural chromosome
changes. In our study, laboratory diagnosis using CMA was not possible for 83.3% (5-6) of
the cases. For those, higher-resolution methods such as exon sequencing or new generation
sequencing must be used to assist elucidating the underlying genomic alteration behind the
observed the rare variant phenotypes. As discussed by Howell et al (2013), despite major
advances in diagnosis using neuroimaging, molecular, and metabolic strategies a significant
proportion of children with global developmental delay, with or without dysmorphic signs
will remain without a conclusive diagnosis of the underlying cause clinically recognized
phenotype. In our study, although there were no genomic changes suggestive of DS, the
analyzed cases showed a gain and losses of genomic material identified by the CMA that have
potential to explain the phenotype of probands and guide decision-making on the part of
families and the health care providers. The results presented and discussed in this
dissertation showed a detection rate of ~17%. However, no patient had DS, as suggested by
the clinical hypothesis, as there was no involvement of the critical region of Down Syndrome
on chromosome 21 in any case. The laboratory diagnosis rate for the DS was 78.5% in line
with expectations and trends in the diagnosis of this syndrome worldwide. The CMA allowed
establishing the genotype-phenotype correlation for one case, for which it was observed a
proximal deletion of SHANK3 gene whose haploinsufficiency is responsible for Phelan-
McDermid Syndrome. In this study we identified four genes that could be contribute to the
phenotypes of probands, namely: AGL12, MAGEA8, IL1RAPL1, and CNTNAP2, located in
22p13, Xq28, Xp21 and 7q35, respectively. This set of genes should be highlighted in
structural and functional genomic studies to pinpoint candidate genes correlated to rare
phenotypes.Condições geneticamente determinadas acometem milhões de famílias no mundo. Mais de
40% dos casos de Deficiência Intelectual (DI) grave são causados por doenças monogênicas
ou anomalias cromossômicas. Com relação à DI, no Brasil, com 185 milhões de habitantes,
cerca de 25 milhões (14%) apresentam alguma deficiência. Desses, aproximadamente 17
milhões (68%) apresentam DI. A Síndrome de Down (SD) foi reconhecida e descrita pela
primeira vez por John Langdon Down em 1866, sendo a mais frequente anomalia genética
autossômica, contribuindo por aproximadamente 18% de todos os casos de DI. A incidência
média é de 1 em cada 650 nascimentos, que aumenta com avanço da idade materna. Sua
etiologia está relacionada ao excesso de material genético proveniente do cromossomo 21.
Em geral, há ainda possibilidade de ocorrer trissomia 21 por translocação cromossômica e
casos de mosaicismo pós-zigóticos. O fenótipo associado à SD seja variável em sinais e em
intensidade. Porém, a DI é a característica altamente conservada ente os afetados e tem um
grande impacto na saúde pública e na qualidade de vida individual. Apesar das características
fenotípicas da SD ser patognomónicas, ainda persiste na comunidade médica o desafio do
diagnóstico clínico. O presente estudo relatou a experiência da avaliação de 6 probandos com
fenótipos complexos, que apresentavam características em comum com a SD. No entanto,
embora o exame físico tenha gerado a hipótese clínica, os testes laboratoriais de citogenéticas
não foram úteis para a resolução diagnóstica. Neste contexto, foi aplicada a Análise
Cromossômica por Microarranjos (CMA) para a elucidação diagnóstica dos casos com
indicação clínica para SD cujos cariótipos apresentaram-se sem alterações cromossômicas
numéricas ou estruturais aparentes. Para cerca de 83,3% (5-6) dos casos apresentados no
presente estudo, ainda se faz necessário o uso de metodologias de maior resolução como o
sequenciamento de exomas ou o sequenciamento e nova geração para tentar elucidar a
alteração genômica subjacente aos achados fenótipos dos pacientes, que devem ser,
subsequentemente, confirmados com estudos funcionais e epidemiológicos para estes
fenótipos variantes raros. Conforme discutido por Howell e colaboradores (2013), apesar dos
grandes avanços no diagnóstico usando estratégias de neuroimagem, moleculares e
metabólicas, uma proporção significante de crianças com atraso global do desenvolvimento,
com ou sem sinais dismórficos, permanecerão sem um diagnóstico conclusivo da causa
subjacente ao fenótipo clinicamente reconhecido. No presente estudo, mesmo não
apresentando alterações sugestivas para SD, os casos analisados apresentaram diversas
alterações identificadas pelo CMA que em conjunto possuem potencial para explicar os
fenótipos dos probandos e orientar as tomadas de decisões por parte famílias e dos
profissionais de saúde que as assistem. Os resultados apresentados e discutidos nesta
dissertação permitiram concluir que a taxa de detecção de alterações genômicas para o
diagnóstico dos casos apresentados foi de ~17%. No entanto, nenhum paciente apresentou a
SD, conforme sugerido pela indicação clínica, pois em nenhum caso houve o envolvimento da
região crítica da Síndrome de Down no cromossomo 21. A taxa de diagnóstico laboratorial
para a SD foi de 78,5%, em consonância com o esperado para as tendências de diagnóstico
desta síndrome no mundo. A CMA permitiu estabelecer a correlação genótipo-fenótipo para
um caso, para o qual foi observado deleção proximal do gene SHANK3, cuja
haploinsuficiência é responsável pela Síndrome de Phelan-McDermid. No presente estudo
foram identificados 4 genes que poderiam estar contribuindo com os fenótipos dos probandos,
a saber: AGL12, MAGEA8, IL1RAPL1 e CNTNAP2, localizados em 22p13, Xq28, Xp21 e
7q35, respectivamente. Este conjunto de genes merecem destaque em estudos detalhados de
genômica estrutural e funcional para apontar genes candidatos corelacionados aos fenótipos
raros
Avaliação do Potencial Mutagênico de Bauhinia L. SP.
Resumo: plantas do gênero Bauhinia L. têm sido empregadas empiricamente na sociedade humana para fins terapêuticos, não se examinado a existência de eventos de toxicidade. Este trabalho teve como objetivo a avaliação do possível potencial mutagênico e citotóxico de Bauhinia L. sp. pelo biomonitor Poecilia reticulata. Os resultados deste estudo não apresentaram significância nas variáveis, micronúcleo e alterações eritrocíticas totais testadas.
Palavras-chave: Planta medicinal. Micronúcleo. Pata-de-vaca.
Citotoxicidade
The Identification of Microdeletion and Reciprocal Microduplication in 22q11.2 Using High-Resolution CMA Technology
The chromosome 22q11.2 region has long been implicated in genomic diseases. Some genomic regions exhibit numerous low copy repeats with high identity in which they provide increased genomic instability and mediate deletions and duplications in many disorders. DiGeorge Syndrome is the most common deletion syndrome and reciprocal duplications could be occurring in half of the frequency of microdeletions. We described five patients with phenotypic variability that carries deletions or reciprocal duplications at 22q11.2 detected by Chromosomal Microarray Analysis. The CytoScan HD technology was used to detect changes in the genome copy number variation of patients who had clinical indication to global developmental delay and a normal karyotype. We observed in our study three microdeletions and two microduplications in 22q11.2 region with variable intervals containing known genes and unstudied transcripts as well as the LCRs that are often flanking and within this genomic rearrangement. The identification of these variants is of particular interest because it may provide insight into genes or genomic regions that are crucial for specific phenotypic manifestations and are useful to assist in the quest for understanding the mechanisms subjacent to genomic deletions and duplications
O Teste de Micronúcleo como Ferramenta Qualitativa de Dano Genético: aspectos citotécnicos
A freqüência de micronúcleos em células esfoliadas humanas pode ser utilizada como uma ferramenta endógena potente, que reflete o efeito de agentes genotóxicos e carcinogênicos sobre os tecidos alvos, nos quais os carcinomas podem se desenvolver. Caso não haja um rígido controle na confecção das lâminas, o citogeneticista incorrereria em erros que poderiam subestimar a freqüência de lesões nucleares e levar a uma avaliação quantitativa errônea dos dados. Realizou-se então um teste qualitativo da técnica de coloração de micronúcleo, que possibilitou a identificação e controle dos diversos fatores interferentes que poderiam atuar sinergisticamente, prejudicando a qualidade das lâminas a serem analizadas
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