La carte Vitale permet de prédire l'antibiorésistance à l'échelon individuel

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fbl-Typing of Staphylococcus lugdunensis: A Frontline Tool for Epidemiological Studies, but Not Predictive of Fibrinogen Binding Ability

Staphylococcus lugdunensis is increasingly recognized as a potent pathogen, responsible for severe infections with an outcome resembling that of Staphylococcus aureus. Here, we developed and evaluated a tool for S. lugdunensis typing, using DNA sequence analysis of the repeat-encoding region (R-domain) in the gene encoding the fibrinogen (Fg)-binding protein Fbl (fbl-typing). We typed 240 S. lugdunensis isolates from various clinical and geographical origins. The length of the R-domain ranged from 9 to 52 repeats. fbl-typing identified 54 unique 18-bp repeat sequences and 92 distinct fbl-types. The discriminatory power of fbl-typing was higher than that of multilocus sequence typing (MLST) and equivalent to that of tandem repeat sequence typing. fbl-types could assign isolates to MLST clonal complexes with excellent predictive power. The ability to promote adherence to immobilized human Fg was evaluated for 55 isolates chosen to reflect the genetic diversity of the fbl gene. We observed no direct correlation between Fg binding ability and fbl-types. However, the lowest percentage of Fg binding was observed for isolates carrying a 5′-end frameshift mutation of the fbl gene and for those harboring fewer than 43 repeats in the R-domain. qRT-PCR assays for some isolates revealed no correlation between fbl gene expression and Fg binding capacity. In conclusion, this study shows that fbl-typing is a useful tool in S. lugdunensis epidemiology, especially because it is an easy, cost-effective, rapid and portable method (http://fbl-typing.univ-rouen.fr/). The impact of fbl polymorphism on the structure of the protein, its expression on the cell surface and in virulence remains to be determined

Contribution à la compréhension des mécanismes moléculaires impliqués dans la virulence de Staphylococcus lugdunensis.

Our work has sought to better understand mechanisms involved in Staphylococcus lugdunensis virulence, a species whose pathogenicity is close to that of Staphylococcus aureus. We performed the first functional characterization of a two-component regulatory system, LytSR, in this species. This system has been shown to be involved in the control of major metabolic processes and in virulence. It is indeed involved in biofilm formation, probably in connection with the control of cell death. LytSR is furthermore implicated in the pathogenesis of S. lugdunensis infections, as demonstrated in the infection model of the nematode Caenorhabditis elegans. To better characterize and monitor the diffusion of predominant clones in this species, we have in a second part developed three new typing methods (MLVA, TRST and fbl-typing), based on the polymorphism of variable number of tandem repeats. These methods were highly discriminant, allowing the definition of new genotypes in this clonal species. These tools are very promising for micro- and macro-epidemiological studies in S. lugdunensis, fbl-typing appearing in many ways as the frontline tool (http://fbl-typing.univ-rouen.fr/). Finally, we have shown that the variability of the binding of S. lugdunensis to fibrinogen in vitro can be partly explained by some fbl genetic variations.Nos travaux ont cherché à mieux comprendre les mécanismes à l’origine de la virulence de Staphylococcus lugdunensis, espèce au pouvoir pathogène proche de celui de Staphylococcus aureus. Nous avons procédé à la première caractérisation fonctionnelle chez cette espèce d’un système à deux composants, LytSR. Ce système s’est révélé impliqué dans le contrôle de processus métaboliques majeurs et dans la virulence. Il est en effet impliqué dans la formation de biofilm, probablement en lien avec le contrôle exercé sur la mort cellulaire. LytSR est de plus impliqué dans la pathogenèse des infections à S. lugdunensis, comme démontré dans le modèle d’infection du nématode Caenorhabditis elegans. Pour mieux caractériser et suivre la diffusion de clones prédominants chez cette espèce, nous avons dans un deuxième volet développé trois nouvelles méthodes de typage (MLVA, TRST et fbl-typing), reposant sur le polymorphisme de séquences répétées en tandem. Ces méthodes se sont révélées très discriminantes, permettant la définition de nouveaux génotypes chez cette espèce clonale. Ces outils sont à ce titre très prometteurs pour des études micro- comme macro-épidémiologiques chez S. lugdunensis, le fbl-typing apparaissant à bien des égards comme l’outil utilisable en première ligne (http://fbl-typing.univ-rouen.fr/). Enfin, nous avons montré que la variabilité de la liaison de S. lugdunensis au fibrinogène in vitro peut être en partie expliquée par des variations génétiques de fbl

Expression de la résistance aux macrolides chez des souches de Streptococcus agalactiae possédant le gène erm(A)

Entre octobre 2011 et avril 2012, 114 souches de Streptococcus agalactiae, ou streptocoque du groupe B (SGB), ont été isolées au CHU de Caen entre octobre 2011 et avril 2012. Parmi elles, 32% étaient résistantes à l érythromycine (E), et les gènes erm(B), erm(A) [erm(TR)], erm(C), et mef(A) étaient présents chez respectivement 59%, 24%, 0% et 13,5% des souches. Les souches possédant le gène erm(B) présentaient un phénotype de résistance de haut niveau croisée entre E, la spiramycine et la clindamycine (C). Celles possédant le gène erm(TR) présentaient un phénotype MLSB inductible, sauf UCN83, résistante de haut niveau à C (CMI>256 mg/L), mais de bas niveau à E (CMI=4 mg/L). La souche MAR, isolée du CH du Pays d Aix, présentait un phénotype identique. Ces 2 souches avaient une expression constitutive de la résistance à E, et le clonage a confirmé que le phénotype observé était dû à l expression constitutive de la méthylase. Le séquençage a mis en évidence respectivement chez UCN83 et MAR deux mutations ponctuelles et l insertion d une IS1381 dans l atténuateur contrôlant l expression du gène erm(TR). Les modélisations prédisent un effet des mutations sur la conformation des structures secondaires impliquées dans l induction. Des mutants hautement résistants à la lincomycine, et présentant des altérations dans l atténuateur, ont été obtenus in vitro avec une fréquence de 10-8, appelant à la prudence quant au traitement par lincosamide des infections à SGB de phénotype MLSB inductible. Le phénotype constitutif conféré par erm(TR) apparaît lié à des modifications dans la régulation, et son expression particulière pourrait être liée à une monométhylation de l ARN ribosomal, qui reste à démontrer.CAEN-BU Médecine pharmacie (141182102) / SudocSudocFranceF

Performance evaluation of UF-4000 body fluid mode for automated body fluid cell counting

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Microdialysis as a way to measure antibiotics concentration in tissues

International audienceAs for all other drugs, antibiotics must reach their pharmacodynamic target in order to exert their effect, but because infection may occur in various tissues the distribution of antibiotics has always been of particular concern. In this article, we will first critically review the various methodologies available to study antibiotics tissue distribution, including microdialysis, secondly we will show how basic pharmacokinetic concepts may help to predict or interpret antibiotics tissue distribution and third we will address the question of linking antibiotics tissue distribution with their antimicrobial effect, using modern pharmacokinetic-pharmacodynamic methods

Microdialysis Study of Imipenem Distribution in Skeletal Muscle and Lung Extracellular Fluids of Noninfected Rats

The aim of this study was to investigate the imipenem distribution in muscle and lung interstitial fluids by microdialysis in rats and to compare the free concentrations in tissue with the free concentrations in blood. Microdialysis probes were inserted into the jugular vein, hind leg muscle, and lung. Imipenem recoveries in these three media were determined in each rat by retrodialysis by drug period before drug administration. Imipenem was infused intravenously at a dose of 120 mg · kg(−1) over 30 min, and microdialysis samples were collected for 150 min. The whole study was conducted with nonhydrated rats (n = 4) and hydrated rats (n = 6) while the animals were under isoflurane anesthesia. The decay of free concentrations in blood, muscle, and lung with time were monoexponential; and the concentration profiles in these three media were virtually superimposed in both groups. Accordingly, the ratios of the area under the curve (AUC) for tissue (muscle or lung) to the AUC for blood were always virtually equal to 1. Compared to values previously determined with awake rats, clearance was reduced by 2 and 1.5 in nonhydrated and hydrated rats, respectively, but the volume of distribution was unchanged. By combining microdialysis in blood and tissues, it was possible to demonstrate that free imipenem concentrations were virtually identical in blood, muscle, and lung