Gain of DNA methylation is enhanced in the absence of CTCF at the human retinoblastoma gene promoter

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Long-term gene silencing throughout cell division is generally achieved by DNA methylation and other epigenetic processes. Aberrant DNA methylation is now widely recognized to be associated with cancer and other human diseases. Here we addressed the contribution of the multifunctional nuclear factor CTCF to the epigenetic regulation of the human <it>retinoblastoma </it>(<it>Rb</it>) gene promoter in different tumoral cell lines.</p> <p>Methods</p> <p>To assess the DNA methylation status of the <it>Rb </it>promoter, genomic DNA from stably transfected human erythroleukemic K562 cells expressing a <it>GFP </it>reporter transgene was transformed with sodium bisulfite, and then PCR-amplified with modified primers and sequenced. Single- and multi-copy integrants with the CTCF binding site mutated were isolated and characterized by Southern blotting. Silenced transgenes were reactivated using 5-aza-2'-deoxycytidine and Trichostatin-A, and their expression was monitored by fluorescent cytometry. <it>Rb </it>gene expression and protein abundance were assessed by RT-PCR and Western blotting in three different glioma cell lines, and DNA methylation of the promoter region was determined by sodium bisulfite sequencing, together with CTCF dissociation and methyl-CpG-binding protein incorporation by chromatin immunoprecipitation assays.</p> <p>Results</p> <p>We found that the inability of CTCF to bind to the <it>Rb </it>promoter causes a dramatic loss of gene expression and a progressive gain of DNA methylation.</p> <p>Conclusions</p> <p>This study indicates that CTCF plays an important role in maintaining the <it>Rb </it>promoter in an optimal chromatin configuration. The absence of CTCF induces a rapid epigenetic silencing through a progressive gain of DNA methylation. Consequently, CTCF can now be seen as one of the epigenetic components that allows the proper configuration of tumor suppressor gene promoters. Its aberrant dissociation can then predispose key genes in cancer cells to acquire DNA methylation and epigenetic silencing.</p

POR UNA CULTURA DE PAZ: UNA MIRADA DESDE LAS CIENCIAS DE LA CONDUCTA

En
 virtud
 de
 lo
 anterior,
 los
 estudiosos
 de
 las
 ciencias
 de
 la
 conducta
 
de
 la
 Universidad
Autónoma 
del
 Estado 
de 
México,

ante 
la
persistencia
 y 
proliferación
 de
 estos 
hechos
 en
 diversas
 partes
 del
Mundo
 y
 de
 nuestro 
país 
en 
particular, se
 convocó
 a
 los
 estudiosos
 interesados
 y
 a
 la
 sociedad
 en
 general
 a
 presentar
 trabajos
 para
 analizar,
 debatir
 y
 proponer
 estrategias
 de
 acción
 y
 dirección,
 que
 fortalezcan
 una
 convivencia y bienestar con sentido humanista para una cultura de paz. El
 presente
 texto
 es
 producto
 de 
esta convocatoria 
que
 recoge 
los
trabajos 
de 

los
 interesados 
en 
la
 temática,

 de
 diferentes 
países
(España,
Argentina,
Cuba,
Brasil,
Costa
 Rica
 y
 México)
 retomando
 con
 ello
 sus
 experiencias
 relativas
 al
 estudio,
 análisis,
 comprensión
 e
 instrumentación
 de
 la
 cultura
 de
 paz
 en
 los
 distintos
 ámbitos
 institucionales
 en
 los
 que
 participan:
 educativo,
 salud,
 penitenciario,
 social,
laboral,
familia,
alimentario,
psicológico,
por 
mencionar 
algunos.
 El
 presente
 libro,
 propicia
 un
 espacio
 de
 reflexión,
 diálogo
 y
 posicionamiento
 de
 las 
ciencias 
de 
la 
conducta
 para 
la 
apropiación,
análisis,
debate
 y 
propuestas 
que
 fortalezcan 
una
 cultura
 de 
paz
 a
través
 de 
la
 convivencia 
y
 el 
bienestar
 social 
con
 sentido 
humanista.
El
 sistema 
económico
 neoliberal
 y 
el 
proceso
 de 
globalización 
han
 contribuido
al
 logro
 de
 avances
 significativos
 en
 la
 ciencia
 y
 la
 tecnología,
 pero
 también
 han
 propiciado
 la
 polarización
 de
 las
 sociedades
 lo
 que
 ha
 impactado
 de
 manera
 negativa
 a
 la
 sociedad
 en
 su
 conjunto,
 pero
 en
 mayor
 medida
 a
 los grupos
 vulnerables. Dicha
 polarización
 ha
 traído
 consigo
 un
 desarrollo
 desigual
 del
 mundo
 que
 se
 expresa
 de
 diferentes
 maneras
 tanto
 en
 países
 desarrollados
 como
 en
 los
 llamados
 del
 tercer
 mundo,
 en
 donde
 no
 están
 satisfechas
 las
 necesidades
 humanas 
elementales
 de
 todos 
los
sectores 
de 
la 
población,
siempre 
falta 
algo. 
Si 
a
 esto 
le
 sumamos 
los
conflictos
 internacionales por
 diferentes
 motivos
 que
 enfrentan
 algunas
 naciones,
 una
 insuficiente
 cobertura
 educativa
 y
 de
 salud,

 desempleo
 y
 pobreza 
extrema,
 entre 
otras
 cosas; 
estamos
 frente
 a
retos 
de
 gran
 envergadura
 para
 los
 gobiernos,
 para
 los
 estudiosos
 y
 para
 la
 sociedad
 civil
 en
 general. Uno 
de 
los
 intentos
 para
 frenar 
y prevenir 
la
 agudización
 de 
estas 
problemáticas
 es
 la
 cultura 
de 
paz,
cuyo
 estudio
y propuestas 
han 
ido 
avanzando 
en 
diferentes
 sentidos 
y 
de 
manera 
favorable,
el 
tema 
está 
presente 
en 
diferentes 
Organismos
 Internacionales
 como
 la
 ONU,
 la
 UNESCO,
 la
 OCDE,
 El
 Banco
 Mundial,
 entre
 otros.
 Pero
 falta 
mucho 
por 
hacer.Universidad Autónoma del Estado de Méxic

una mirada desde las Ciencias de la Conducta

Este libro es el resultado de los trabajos presentados en el 1er Congreso Internacional "Convivencia y bienestar con sentido humanista para una cultura de paz"

LA VÍA RB/E2F Y LA FAMILIA DE PROTEÍNAS REPRESORAS POLYCOMB EN EL DESARROLLO DE CÁNCER

El control adecuado del ciclo celular mediante la acción coordinada de la familia de factores de transcripción E2F resulta ser clave para la homeostasis celular. El entender su modo de acción desde una perspectiva epigenética resulta ser un tema de gran actualidad y cambia la visión de cómo es regulado el ciclo celular. Uno de los principales reguladores epigenéticos está conformado por el grupo de proteínas Polycomb (PcG), relacionadas con procesos patológicos como el cáncer, a través de la desregulación a nivel epigenético de genes supresores de tumores como BRCA1, p16 y p53, entre otros. Con relación a lo anterior, la regulación del gen supresor Retinoblastoma (Rb) ha sido ampliamente estudiado dada su importante participación como regulador negativo del ciclo celular, pero más reciente se ha demostrado que su modo de acción está relacionado con el grupo de proteínas PcG. Cada uno de los procesos que involucran a componentes de la familia de factores E2F, los miembros de Polycomb y la familia de proteína Rb, parecen ser en cierta medida independientes y, por ende, poco relacionados. Sin embargo, existen evidencias de una convergencia a nivel epigenético en la acción de estos conjuntos de moléculas reguladoras de la progresión del ciclo celular y su desregulación nos puede llevar a entender mejor su contribución al desarrollo de procesos patológicos como el cáncer

La vía Rb/E2F y la familia de proteínas represoras Polycomb en el desarrollo de cáncer

The coordinated contribution of the E2F-family of transcription factors is critical for the proper control of the cell cycle with consequences in the cellular homeostasis. Such kind of regulation requires a renewed vision of the control of the cell cycle through the basis of epigenetic mechanisms. One of such regulatory components is the Polycomb Group (PcG) of proteins which have been involved in cancer development through the anomalous regulation, at an epigenetic level, of tumour suppressor genes such as BRC1, p16, and p53, among others. In particular, the tumour suppressor gene Retinoblastoma (Rb) plays a central role in the regulation of the cell cycle and is regulated by PcG proteins. The relationship among E2F members, PcG and Rb has not been examined in detail. Here, we describe the epigenetic interaction among these proteins, their association with epigenetic processes and their contribution to cancer development.El control adecuado del ciclo celular mediante la acción coordinada de la familia de factores de transcripción E2F resulta ser clave para la homeostasis celular. El entender su modo de acción desde una perspectiva epigenética resulta ser un tema de gran actualidad y cambia la visión de cómo es regulado el ciclo celular. Uno de los principales reguladores epigenéticos está conformado por el grupo de proteínas Polycomb (PcG), relacionadas con procesos patológicos como el cáncer, a través de la desregulación a nivel epigenético de genes supresores de tumores como BRCA1, p16 y p53, entre otros. Con relación a lo anterior, la regulación del gen supresor Retinoblastoma (Rb) ha sido ampliamente estudiado dada su importante participación como regulador negativo del ciclo celular, pero más reciente se ha demostrado que su modo de acción está relacionado con el grupo de proteínas PcG. Cada uno de los procesos que involucran a componentes de la familia de factores E2F, los miembros de Polycomb y la familia de proteína Rb, parecen ser en cierta medida independientes y, por ende, poco relacionados. Sin embargo, existen evidencias de una convergencia a nivel epigenético en la acción de estos conjuntos de moléculas reguladoras de la progresión del ciclo celular y su desregulación nos puede llevar a entender mejor su contribución al desarrollo de procesos patológicos como el cáncer

Author Correction : DUSP5 is methylated in CIMP-high colorectal cancer but is not a major regulator of intestinal cell proliferation and tumorigenesis

The Original Article was published on 29 January 201

DUSP5 is methylated in CIMP-high colorectal cancer but is not a major regulator of intestinal cell proliferation and tumorigenesis

Abstract The ERK signalling pathway regulates key cell fate decisions in the intestinal epithelium and is frequently dysregulated in colorectal cancers (CRCs). Variations in the dynamics of ERK activation can induce different biological outcomes and are regulated by multiple mechanisms, including activation of negative feedback loops involving transcriptional induction of dual-specificity phosphatases (DUSPs). We have found that the nuclear ERK-selective phosphatase DUSP5 is downregulated in colorectal tumours and cell lines, as previously observed in gastric and prostate cancer. The DUSP5 promoter is methylated in a subset of CRC cell lines and primary tumours, particularly those with a CpG island methylator phenotype (CIMP). However, this epigenetic change alone could not account for reduced DUSP5 expression in CRC cells. Functionally, DUSP5 depletion failed to alter ERK signalling or proliferation in CRC cell lines, and its transgenic overexpression in the mouse intestine had minimal impact on normal intestinal homeostasis or tumour development. Our results suggest that DUSP5 plays a limited role in regulating ERK signalling associated with the growth of colorectal tumours, but that methylation the DUSP5 gene promoter can serve as an additional means of identifying CIMP-high colorectal cancers

Por una cultura de paz, una mirada desde las Ciencias de la Conducta

Este libro es el resultado de los trabajos presentados en el 1er Congreso Internacional "Convivencia y bienestar con sentido humanista para una cultura de paz"