Application of microbial risk assessment in Brazil: opportunities from the industry to the government

To investigate the public health risks of microbial in food, quantitative microbial risk assessment (QMRA) is a useful approach and a good alternative when surveillance data are sparse, and for management decisions. The goal of QMRA is assess the probability of the disease occurrence given the ingestion of a contaminated food and its consequences, and when the risk is estimated, control measures can be applied and its impact on disease assessed. Consequently, this method supports the promotion of public health by the authorities

Efeito de diferentes cenários tróficos e ambientais no ciclo de vida de camarões palaemonídeos (Macrobrachium E Palaemon)

Os impactos causados pelas alterações globais promovidas por ação antrópica são cada vez mais notórios e intensos. Uma forma de investigar as consequências deste impacto na natureza é por meio de testes experimentais utilizando animais como organismos modelo de estudo, avaliando a sua tolerância a condições menos favoráveis ao seu desenvolvimento nos ecossistemas que ocupam. Os camarões carídeos são um ótimo exemplo de organismos que podem ser utilizados no estudo destes impactos, pois algumas espécies possuem características particularmente interessantes do ponto de vista experimental, tais como um curto ciclo de vida, uma elevada plasticidade fenotípica e os seus protocolo de cultivo ex situ estarem já estabelecidos. Contudo, o grau de domínio das técnicas de cultivo ex situ não é homogéneo interespecificamente, sendo necessário uma mairo contribuição científica para avançar o estado da arte nesta temática. A presente tese teve por objetivo avaliar a influência dos efeitos tróficos e ambientais no desenvolvimento de três espécies de camarões palaemonídeos: Macrobrachium pantanalense, M. amazonicum e Palaemon varians. Para M. pantanalense foi avaliado o efeito de níveis variáveis de proteína e energia bruta na dieta de reprodutores, tendo-se observado que um nível de 30% de proteína e 4200 Kcal/Kg de energia promoviam uma fertilidade e produção larval mais elevada. Adicionalmente, as larvas oriundas de reprodutores alimentados com esta dieta apresentaram uma sobrevivência média de 8 dias, alcançando o estágio larval de zoea 3, quando submetidas a inanição. Quando cultivadas até a metamorfose, as larvas que apresentaram uma maior sobrevivência e um mais elevado sincronismo de metamofose foram aquelas obtidas a partir de reprodutores alimentados com uma dieta com 40% de proteína e 3600 Kcal/Kg de energia bruta (PB:EB), os maiores valores de crescimento foram registrados no grupo de larvas obtidas de reprodutores alimentados com uma dieta apresentando um valor de 30% de proteína e 4200 Kcal/Kg. Avaliou-se também o desenvolvimento larval de M. amazonicum submetidos a reduções graduais de salinidade até a metamorfose, tendo sido possível observar que uma redução gradual de salinidade 10 para 8, no 10º dia,e posteriormente para salinidade 5 no 15º dia de de cultivo promoveram uma maior sobrevivência, maior percentual e precocidade de metamorfose, e um crescimento médio semelhante ao obtido a uma salinidade de 10, comumente utilizada no cultivo comercial desta espécie. Relativamente a Palaemon varians, foi avaliado o efeito de variações tróficas qualitativas e quantitativas no regime alimentar de reprodutores através do acompanhamento do desempenho larvar e pós larvar de organismos expostos ao mesmo cenário trófico dos seus reprodutores e a um cenário trófico alternativo excelente do ponto de vista qualitativo e quantitativo. Do ponto de vista do desempenho dos reprodutores, observou-se que embora a qualidade alimentar não tenha sido determinante, a variação quantitativa (privação alimentar em dias alternados) promoveu uma produção de larvas com menor peso, metamorfose retardada e menor percentual de metamorfose no fim do cultivo. No caso dos organismos juvenis, os resultados foram similares, não tendo havido uma recuperação evidente nos grupos expostos a cenários tróficos caracterizados por uma escassez alimentar. Importa salientar que mesmo quando submetidos a cenários tróficos ótimos, os juvenis obtidos a partir de larvas que experienciaram cenários tróficos quantitativamente sub-ótimos não foram capazes de superar este déficit na fase seguinte do seu ciclo de vida (pós-metamorfose). Em síntese, a presente tese contribui para a otimização dos protocolos de cultivo de camarões carídeos como organismos modelo, em especial os palaemonideos, permitindo que estes possam vir a ser utilizados de forma crescente em estudos científicos que visem uma melhor compreensão dos efeitos das alterações globais nos ecossistemas aquáticos.The impacts of global changes caused by anthropic action are increasingly noticeable and more intense. A way to investigate these impacts is by using controlled experiments where target animals act as study models to evaluate their tolerance to less favourable conditions to their overall development in their home ecosystems. Carideans shrimp are a good example of such model organisms, as some species have peculiarly interesting features, from an experimental point of view, such as a short life-cycles, high phenotypical plasticity and the fact of their breeding protocols ex situ being well-established. However, ex situ breeding protocols are not homogenous inter-species and a greater scientific contribution is needed to advance the state of the art. The present thesis aimed to evaluate the influence of trophic and environmental effects on the development of three palaemonid shrimp species: Macrobrachium pantanalense, M. amazonicum and Palaemon varians. For M. pantanalense, variable protein and energy crude levels were evaluated in breeders’ diet, being found that 30% protein level and 4200 Kcal/Kg of energy promoted a higher fertility and larval production. Moreover, larvae resulting from breeders fed on this diet exhibited a mean survival of 8 days when starved, even being abole to reach the third zoeal stage under this condition. When cultured to metamorphosis, larvae that exhibited higher survival and a higher metamorphosis synchronism were the ones obtained from breeders fed with a 40% protein level and 3600 Kcal/Kg energy crude level (PB:EB); the highest growth values were obtained from whose parental broodstock was fed with a 30% protein level and 4200 Kcal/Kg diet. The larval development of M. amazonicum submitted to progressively lower salinity levels, up to metamorphosis was evaluated, with a higher survival being obtained through a gradual reduction of salinity from 10 to 8 on the 10th day of larviculture and, afterwards, to a salinity of 5 by the 15th day of larvivulture; similar growth performances and a higher percentage of precocious metamorphosis was recorded for this larviculture approach, when compared to that commonly employed cultured in commercial hatcheries (the use of a salinity of 10 throughout larviculture. The effect of trophic qualitative and quantitative shifts in the dietary regime of P. varians broodstock was also evualated in the present thesis, with the larval and post-larval performance of these species being investigated when these life stages were exposed to the same trophic scenario of their breeders and to an alternative optimal trophic scenario (both qualitatively and quantitatively). The quantitative variation in the trophic regime of breeders (food deprivation on alternate days) resulted in the production of larvae with a lower weight, a delayed metamorphosis and a smaller percentage of metamorphosed decapodits by the end of larviculture. The most significant finding recorded was that even when exposed to optimal trophic scenarios, juveniles obtained from larvae that experienced quantitative sub-optimal trophic scenarios were unable to overcome that previous trophic deficit in the next phase of their lifecycle (post-metamorphosis). In summary, the present thesis contributes to the optimization of breeding protocols of palaemonid shrimp that can be successfully employed as model organisms, allowing for their increased use in scientific studies to better understand the effects of global climate changes on aquatic ecosystems.Apoio financeiro da UEMS e FUNDECT – Universidade Estadual de Mato Grosso do Sul e da Fundação de Apoio ao Desenvolvimento do Ensino, Ciência e Tecnologia do Estado de Mato Grosso do Sul, respectivamente, por meio da atribuição da bolsa de Doutoramento e auxílio a pesquisa, com processo: 23/200.755/2014Programa Doutoral em Biologia e Ecologia das Alterações Globai

Application of qualitative risk assessment to prioritize hazards in pork products in Brazil

The main objective of carcass and meat inspection is to promote animal and public health by controlling and detecting pathogens. Procedures of inspection of pig carcasses in Brazil are based on macroscopic examinations (incisions and palpations) attempting to identify potential hazards to animal and human health, mainly related to classic zoonotic diseases. This inspection structure is based on evidence related to the high relevance of parasites in which transmission and maintenance are strictly linked to the low level of biosecurity measures applied in the farms

Avaliação da sobrevivência de Salmonella enterica inoculada em salame de carne suína

Pork salami is an embedded, cured and ripened product commonly consumed in Brazil, and the presence of Salmonella enterica has already been reported in this product. During its preparation, the microbiological safety depends on the meat quality, addition of ingredients with antimicrobial activity, hygiene during processing, pH and water activity (Aw) reduction during maturation. In Brazil, the maturation protocol has not been determined in food regulation; therefore, the objectives of this study were (a) to identify the fermentation and drying phases during salami maturation; (b) to test the survival of S. enterica during salami processing; and (c) to compare xylose lysine deoxycholate (XLD) and thin agar layer (TAL) agar for recovering Salmonella. The salami samples were prepared with a cocktail of S. enterica strains, fermented at 30°C and dried at 20°C with controlled relative humidity (RH). Periodic sampling for S. enterica quantification and Aw and pH analyses were performed during maturation, and curves were constructed. Fermentation occurred during the first 66 hours, and the pH decreased while the population of S. enterica increased over the first 21 hours. The drying step was able to reduce the bacterial population by approximately 5 log CFU after 875 hours, reaching an Aw of less than 0.78. However, elimination of S. enterica was not achieved. For Salmonella recovery, TAL agar was more efficient than XLD agar.O salame de carne suína é um produto embutido, curado e maturado comumente consumido no Brasil no qual a presença de Salmonella enterica tem sido relatada. Durante a sua elaboração, a segurança microbiológica depende da qualidade da carne, adição de ingredientes com atividade antimicrobiana, higiene durante a produção, redução de pH e atividade de água (Aw) durante a sua maturação. O protocolo de maturação ainda não está determinado na legislação brasileira; portanto o estudo objetivou: (a) identificar as fases de fermentação e dessecação durante a maturação de salame; (b) testar a sobrevivência de S. enterica durante o processamento de salame e (c) comparar os meios de cultura xilose lisina dextrose (XLD) e thin agar layer (TAL) para recuperação de células do referido micro-organismo. Os salames foram elaborados com um coquetel de S. enterica e submetidos à fermentação em 30ºC e secagem a 20ºC com umidade relativa (UR) controlada. Amostragens periódicas para quantificação de S. enterica, análises de Aw e pH foram realizadas durante a maturação e as curvas foram construídas. A fermentação ocorreu nas primeiras 66 horas, quando houve queda do pH do salame; entretanto S. enterica aumentou sua população nas primeiras 21 horas. A etapa de dessecação foi capaz de reduzir aproximadamente 5 log UFC da população bacteriana em 875 horas, alcançando Aw menor que 0,78, mas não foi capaz de eliminar o micro-organismo do alimento. Para enumeração do micro-organismo, o meio sólido TAL foi mais eficiente na recuperação das células submetidas à maturação quando comparado ao ágar XLD comumente utilizado

Qualidade microbiológica de queijos coloniais comercializados em Porto Alegre-RS

Colonial cheese is a traditional dairy product in southern Brazil and is commonly purchased by the citizens of Porto Alegre. However, there is still a lack of technical regulation of colonial cheese, and there is little information about the microbiological quality of this product at the retail level. Thus, the objectives of this study were to (i) evaluate compliance with the legal microbiological standards of colonial cheese sampled from street fairs and the central market of the city of Porto Alegre; (ii) statistically test the hypothesis of an association between noncompliance with the standards and local purchasing (street fairs or central market); (iii) estimate the number of Listeria spp. and Listeria monocytogenes in the positive samples; and (iv) characterize the L. monocytogenes strains by serotyping and macrorestriction (PFGE). For this purpose, 205 cheese samples belonging to 17 different brands were analyzed. The microbiological analyses were conducted according to ISO standardized protocols for the detection of L. monocytogenes and Salmonella spp. or by enumeration of coagulase-positive Staphylococcus and coliforms at 45°C. Among the samples, 47.31% did not comply with at least one of the microbiological standards established by the Brazilian legislation and were thus unsuitable for human consumption. Regarding the coliforms at 45ºC and coagulase-positive Staphylococcus, 10.73% and 40.48% of the samples presented higher counts than the legal parameter, respectively. There was no association between the frequency of samples with coagulase-positive Staphylococcus counts above the legal parameter and local of purchasing; however, the commercial brand influenced the frequency of unsuitable samples This may indicate failures of hygiene during cheese production. Salmonella spp. were not detected. Listeria monocytogenes was isolated from 2.9% of the samples. The estimated average populations of Listeria spp. and L. monocytogenes were low in the positive cheese samples at -3.3 log CFU g‾1 and -2.26 log CFU g‾¹, respectively. The strains of L. monocytogenes belonged to serovars 1/2a, 1/2b and 1/2c and could be grouped into five pulsotypes with no evident epidemiological relation among them. The results demonstrate the need to improve the hygiene procedures during colonial cheese production and to strengthen monitoring at the dairy plants and retail levels.O queijo colonial é um derivado lácteo típico do sul do Brasil, e amplamente adquirido pela população da cidade de Porto Alegre. Porém, esse produto lácteo ainda não conta com regulamento técnico específico e ainda há poucos dados sobre a qualidade microbiológica dos queijos ofertados à população. Sendo assim, os objetivos do estudo foram: (i) avaliar os parâmetros microbiológicos previstos na legislação em queijos coloniais comercializados em Feiras Modelo e Mercado Público de Porto Alegre; (ii) testar hipóteses estatísticas de associação entre violação do padrão microbiológico estabelecido na legislação com o ponto de comercialização; (iii) estimar a distribuição de contagem de Listeria sp. e L. monocytogenes nos queijos em que esta bactéria foi detectada e (iv) caracterizar as cepas de L. monocytogenes por sorotipificação e macro-restrição. Para tanto, foram analisadas 205 amostras de queijo, compreendendo 17 marcas distintas. As análises microbiológicas foram conduzidas conforme protocolos padronizados de análise de alimentos e evidenciaram que 47,31% dos queijos estavam não conformes com pelo menos um dos parâmetros microbiológicos estabelecidos na RDC nº12/2001, portanto impróprios ao consumo humano. Com relação à quantificação de coliformes a 45ºC e Staphylococcus coagulase positiva, respectivamente, 10,73% e 40,48% das amostras apresentaram contagens superiores ao estabelecido na legislação A distribuição das amostras não conformes com o parâmetro Staphylococcus coagulase positiva não esteve associada ao ponto de comercialização, mas foi influenciada pela marca comercial do queijo, indicando possíveis falhas na elaboração dos mesmos. Não houve detecção de Salmonella sp. e em 2,9% das amostras havia presença de L. monocytogenes. A população média estimada nos queijos positivos para Listeria sp. e L. monocytogenes foi baixa, respectivamente, -3,3 log UFC g-1 e -2,26 log UFC g-1. As cepas de L. monocytogenes pertenciam aos sorovares 1/2a, 1/2b e 1/2c e a macro-restrição demonstrou a presença de cinco pulsotipos sem relação epidemiológica evidente. Os resultados demonstram a necessidade de melhorar a qualidade higiênica da elaboração do queijo colonial e aumentar a fiscalização sanitária desse produto

Correlação dos achados clínicos com os parâmetros funcionais em idosos portadores de asma

AbstractIntroduction: Advanced age is a risk factor for a blunted perception of the symptoms, severity and mortality of asthma. There are only a few studies in the literature on the relationship between respiratory symptoms and pulmonary function in elderly asthmatics.Aims: To evaluate the divergence between clinical and functional classification of asthma in the elderly and to characterise subgroups of patients at greater risk of clinico-functional divergence.Material and methods: A cross-sectional study evaluating 41 elderly asthmatics (60years old or over; 33 female; mean age 68.2years old). Data on age, gender, educational level, smoking, time since diagnosis of the disease and weight were obtained. Clinical classification, peak expiratory flow measurement and spirometry were performed.Results: We found that forced expiratory volume in one second (FEV1) correlated positively with the other functional parameters, and FEV1 correlated negatively with time since diagnosis of the disease. The percentage of clinico-functional divergence was 73.2%. Female patients and those with lower levels of schooling had an 8.6 and 9.3 risk of clinico-functional divergence respectively.Conclusion: The great clinico-functional divergence in elderly asthmatics shows the need to establish functional measurements as markers of asthma severity.Rev Port Pneumol 2009; XV (6): 1029-104

Zero-inflated-censored Weibull and gamma regression models to estimate wild boar population dispersal distance

The dynamics of the wild boar population has become a pressing issue not only for ecological purposes, but also for agricultural and livestock production. The data related to the wild boar dispersal distance can have a complex structure, including excess of zeros and right-censored observations, thus being challenging for modeling. In this sense, we propose two different zero-inflated-right-censored regression models, assuming Weibull and gamma distributions. First, we present the construction of the likelihood function, and then, we apply both models to simulated datasets, demonstrating that both regression models behave well. The simulation results point to the consistency and asymptotic unbiasedness of the developed methods. Afterwards, we adjusted both models to a simulated dataset of wild boar dispersal, including excess of zeros, right-censored observations, and two covariates: age and sex. We showed that the models were useful to extract inferences about the wild boar dispersal, correctly describing the data mimicking a situation where males disperse more than females, and age has a positive effect on the dispersal of the wild boars. These results are useful to overcome some limitations regarding inferences in zero-inflated-right-censored datasets, especially concerning the wild boar’s population. Users will be provided with an R function to run the proposed models

Sex, income and level of education associated with physical activity level among workers

OBJETIVO: Analisar fatores socioeconômicos e demográfi cos associados ao nível de atividade física de trabalhadores. MÉTODOS: Estudo transversal realizado no Distrito Federal, de 2000 a 2001, com amostra representativa de trabalhadores de ambos os sexos, vinculados ao Programa de Alimentação do Trabalhador, envolvendo 1.044 trabalhadores. Utilizou-se a regressão logística binária para determinação dos possíveis fatores de risco associados ao nível de atividade física e selecionados pelo processo de “backward elimination”. Efeitos interativos das variáveis foram verifi cados no modelo fi nal por meio da razão de chances, para nível de atividade física >1,4. RESULTADOS: O modelo fi nal incluiu o sexo, a renda e a escolaridade. Indivíduos do sexo masculino que cursaram apenas o primeiro grau e ganhavam menos de quatro salários mínimos eram os que tinham mais chances de apresentar nível de atividade física >1,4. A estimativa das razões de chances indicou que os homens tinham cinco vezes mais chances de apresentar nível de atividade física >1,4, níveis inferiores aos das mulheres. Indivíduos que cursaram apenas o primeiro grau e com renda igual ou inferior a quatro salários mínimos tinham duas vezes mais chances de nível de atividade física ≥1,4 do que indivíduos com renda superior a quatro salários mínimos e curso superior ou pós-graduação. CONCLUSÕES: Os resultados indicam que os fatores associados ao nível de atividade física de trabalhadores são: sexo masculino, escolaridade primeiro grau e renda menor que quatro salários mínimos.OBJECTIVE: To analyze socioeconomic and demographic factors associated with physical activity level among workers. METHODS: Cross-sectional study conducted in Brazil’s Federal District, from 2000 to 2001, with a representative sample of 1,044 workers from both sexes, who are covered by the Programa de Alimentação do Trabalhador (Workers’ Food Program). Binary logistic regression was used to determine possible risk factors associated with physical activity level and selected by the backward elimination process. Interactive effects of the variables were verifi ed in the fi nal model by means of the odds ratio for physical activity level >1.4. RESULTS: The fi nal model included sex, income and level of education. Male individuals who only fi nished elementary school and earned less than four Brazilian minimum wages per month were the most likely to show physical activity level ≥1.4. The odds ratio estimate indicated that men were fi ve times more likely to show physical activity level ≥1.4 than women. Individuals who only fi nished elementary school and had an income equal to or below four minimum wages were two times more likely to show physical activity level ≥1.4 than individuals who earned more than four minimum wages and had a university degree or higher. CONCLUSIONS: Results indicate that the factors associated with physical activity level among workers are the following: male, elementary school level, and income below four Brazilian minimum wages per month

Pâncreas Anular no período neonatal

Objetivo: Evidenciar que, apesar de condição rara, o pâncreas anular deve se firmar como diagnóstico diferencial das obstruções intestinais no período neonatal. Descrição do caso: Este relato aborda o caso de uma paciente de 13 dias de vida admitida no pronto atendimento com queixa de volumosos vômitos pós-prandiais e perda de peso progressiva desde a alta da maternidade. Apesar das medidas iniciais, com ressuscitação volêmica, antibioticoterapia e passagem de sonda nasogástrica para descompressão, a paciente evolui sem melhora. Exame contrastado de esôfago-estômago-duodeno detectou estreitamento luminal da segunda porção duodenal. Paciente submetida à laparotomia exploradora, que evidenciou anel de tecido pancreático estreitando o trânsito intestinal na região. Comentários: O pâncreas anular é uma anomalia congênita rara na qual um anel de tecido pancreático envolve a porção descendente do duodeno, causando graus variados de obstrução intestinal extrínseca.  Objective: Reinforce that, despite being a rare condition, annular pancreas must be considered as a differential diagnosis for intestinal obstructions in the newborn period. Case description: This case report refers to a 13-days newborn admitted to the emergency room presenting with postprandial vomiting and progressive weight loss since maternity discharge. The patient did not respond to initial interventions that included IV antibiotics and insertion of a nasogastric tube. A contrasted study of the upper digestive tract (esophagus, stomach and duodenum) found a luminal narrowing on the second duodenal portion. The patient was submitted to an exploratory laparotomy which found a pancreatic-tissue ring involving the second part of the duodenum. Despite rare, we reinforce that annular pancreas must be considered as a differential diagnosis for intestinal obstructions in the newborn period. Comments: Annular pancreas is a rare congenital defect in which a ring of pancreatic tissue encircles the duodenum, causing different degrees of intestinal obstruction