Transcriptome analyses throughout chili pepper fruit development reveal novel insights into the domestication process

Chili pepper (Capsicum spp.) is an important crop, as well as a model for fruit development studies and domestication. Here, we performed a time-course experiment to estimate standardized gene expression profiles with respect to fruit development for six domesticated and four wild chili pepper ancestors. We sampled the transcriptomes every 10 days from flowering to fruit maturity, and found that the mean standardized expression profiles for domesticated and wild accessions significantly differed. The mean standardized expression was higher and peaked earlier for domesticated vs. wild genotypes, particularly for genes involved in the cell cycle that ultimately control fruit size. We postulate that these gene expression changes are driven by selection pressures during domestication and show a robust network of cell cycle genes with a time shift in expression, which explains some of the differences between domesticated and wild phenotypes

Radiografía de la televisión en la zona metropolitana de Guadalajara

Con el propósito de conocer las características básicas de la oferta de televisión abierta en la zona metropolitana de Guadalajara, en el otoño de 2010, se llevó a cabo un proyecto de investigación sobre la parrilla programática semanal de ocho de los nueve canales de televisión abierta que llega a los hogares tapatíos. Los resultados de ese esfuerzo es lo que se presenta en este trabajo.ITESO, A.C

Consultoría integral en una residencia de descanso para adultos mayores en el municipio de Guadalajara

El presente documento “Consultoría integral en una residencia de descanso para adultos mayores en el municipio de Guadalajara”, fue elaborado por Ana Carmen Cabrera Flores, Daniela Ochoa Ríos, Andrés Hernández Jiménez, Rafael Cervantes Pinedo, Vanessa Campos Oñate, y Héctor Fabián García López, con el acompañamiento de la Maestra Laura Tiburcio Silver. Este documento contiene una introducción, la descripción general del proyecto, las reflexiones y aprendizajes de los alumnos a lo largo de la consultoría, las conclusiones, las fuentes consultadas y la lista de los anexos correspondientes. El documento fue elaborado de acuerdo con la metodología de la consultoría en MYPE del Centro Universidad Empresa. Se usaron fuentes primarias tales como información documental de la empresa, entrevistas, encuestas y observaciones del trabajo interno. Las fuentes secundarias que se usaron fueron en su mayoría páginas web. Entre sus contenidos principales se encuentran, las generalidades y el contexto en el que vive la empresa, el diagnóstico, el planteamiento estratégico, la propuesta de mejora, la implementación, y las recomendaciones finales. En este documento se llega a la conclusión de la importancia de las MYPE en la economía de nuestro país y de la importancia que tiene el acompañamiento a las mismas, se llega a la conclusión de que la consultoría es una alternativa muy buena para que las MYPE puedan continuar creciendo y no se estanquen o, en el peor de los casos, cierren sus puertas.ITESO, A.C

Non-L\'evy mobility patterns of Mexican Me'Phaa peasants searching for fuelwood

We measured mobility patterns that describe walking trajectories of individual Me'Phaa peasants searching and collecting fuelwood in the forests of "La Monta\~na de Guerrero" in Mexico. These one-day excursions typically follow a mixed pattern of nearly-constant steps when individuals displace from their homes towards potential collecting sites and a mixed pattern of steps of different lengths when actually searching for fallen wood in the forest. Displacements in the searching phase seem not to be compatible with L\'evy flights described by power-laws with optimal scaling exponents. These findings however can be interpreted in the light of deterministic searching on heavily degraded landscapes where the interaction of the individuals with their scarce environment produces alternative searching strategies than the expected L\'evy flights. These results have important implications for future management and restoration of degraded forests and the improvement of the ecological services they may provide to their inhabitants.Comment: 15 pages, 4 figures. First version submitted to Human Ecology. The final publication will be available at http://www.springerlink.co

Exploring the interactions between Helicobacter pylori (Hp) infection and other risk factors of gastric cancer: A pooled analysis in the Stomach cancer Pooling (StoP) Project

Helicobacter pylori (Hp) is crucial in gastric carcinogenesis, but infection alone is not a sufficient cause, and the interaction between Hp infection and other risk factors has not been adequately studied. We conducted a pooled analysis of seven case-control studies from the Stomach cancer Pooling (StoP) Project, comprising 1377 cases and 2470 controls, to explore the interaction among Hp infection and tobacco smoking, alcohol drinking, socioeconomic status (SES) and dietary salt intake on the risk of gastric cancer. We estimated summary odds ratios (ORs) and the corresponding 95% confidence intervals (CIs) by multivariate unconditional logistic regression. The analysis showed no consistent interaction between Hp infection and cigarette smoking, while interaction was more than multiplicative for alcohol drinking (OR = 1.38, 95% CI: 1.07-1.77, P-interaction 0.02) and high intake of salt (OR = 2.62, 95% CI: 1.88-3.65, P-interaction = 0.04). The interaction with SES followed the multiplicative model (P = 0.49), resulting in a weakening among infected individuals of the protective effect of high SES among observed Hp-negative individuals. The interactions found were more pronounced in subjects with history of peptic ulcer. The interactions with Hp infection were stronger for cigarette smoking and dietary salt in the case of noncardia cancer, and for alcohol and SES in the case of cardia cancer. No differences were found when stratifying for histologic type. This large-scale study aimed to quantify the interaction between Hp infection and other modifiable risk factors of gastric cancer revealed that the benefit of combined Hp eradication and lifestyle modification on gastric cancer prevention may be larger than commonly appreciated.This study was supported by the Associazione Italiana per la Ricerca sul Cancro (AIRC), Project no. 21378 (Investigator Grant), and by the Italian League for the Fight Against Cancer (LILT). The authors thank the European Cancer Prevention (ECP) Organization for providing support for the StoP meetings

Search for low-mass WIMPs in a 0.6 kg day exposure of the DAMIC experiment at SNOLAB

We present results of a dark matter search performed with a 0.6 kg day exposure of the DAMIC experiment at the SNOLAB underground laboratory. We measure the energy spectrum of ionization events in the bulk silicon of charge-coupled devices down to a signal of 60 eV electron equivalent. The data are consistent with radiogenic backgrounds, and constraints on the spin-independent WIMP-nucleon elastic-scattering cross section are accordingly placed. A region of parameter space relevant to the potential signal from the CDMS-II Si experiment is excluded using the same target for the first time. This result obtained with a limited exposure demonstrates the potential to explore the low-mass WIMP region (<10 GeV/$c^{2}$) of the upcoming DAMIC100, a 100 g detector currently being installed in SNOLAB.Comment: 11 pages, 11 figure

Ayotzinapa y la crisis del estado neoliberal mexicano

¿Qué pasó en Ayotzinapa? Es la pregunta que surgió el 26 de septiembre de 2014, que no encuentra una respuesta satisfactoria pese a la intervención de actores de distintas instancias, niveles y nacionalidades, y al esbozo de múltiples hipótesis sobre los enfrentamientos registrados en Iguala, Guerrero, que derivaron en la muerte de varias personas y la desaparición de 43 estudiantes de la Normal Rural “Isidro Burgos”, en una tragedia que evidenció la crisis que atraviesa el estado mexicano y que afecta a todo el país. A partir de lo acontecido en Ayotzinapa y con base en la teoría general de los campos de Pierre Bourdieu y su propuesta de análisis teórico metodológico sobre el estado, en esta obra se realiza un análisis de la práctica sistemática y generalizada de las desapariciones forzadas en México, con el fin de ofrecer otra manera de comprender el entretejido político–económico–social que hace posible este grave fenómeno, que desgarra tanto a familias como a la comunidad. La herida abierta por Ayotzinapa sangra y el objetivo último de este libro es contribuir a evitar que se cierre en tanto no se responda la interrogante de qué pasó ahí y que crímenes de lesa humanidad como este sigan aconteciendo en México.ITESO, A.C

Quid: observatorio de medios

El informe está dividido en cuatro apartados: “Derecho a la información y transparencia”, “La televisión mexicana”, “Empresas y prácticas periodísticas” y “Los que se fueron”. En el primero de ellos se presenta un texto que ayuda a entender cuál es el momento en el que se encuentran las propuestas legislativas para regular a los medios y las telecomunicaciones en México, y una evaluación de los primeros cinco años del Instituto de Transparencia e Información Pública de Jalisco. El segundo apartado del informe es ecléctico, pues se compone de artículos que trabajan distintas temáticas de la televisión:la estructura y oferta de la televisión en nuestro país (en particular en la ciudad de Guadalajara), la televisión por cable (enfatizando el caso de Megacable), un recuento de cómo se gestó el Canal 44 y de sus prospectivas en 2011, y los mundiales de futbol. La tercera parte del informe documenta algunas de las situaciones más importantes que se viven en el periodismo local: estos trabajos presentan sistemas en crisis (alta vulnerabilidad de los periodistas mexicanos ante un clima de violencia que lejos de disminuir va en aumento, y la participación, por acción u omisión, del Estado mexicano en la sistemática violación de los derechos de quienes dedican su vida al trabajo periodístico. Los siguientes artículos tratan sobre las transformaciones de las empresas periodísticas, particularmente las del sector de la prensa escrita: la rápida e inexorable desaparición de los suplementos culturales, y una radiografía sobre las formas de producción de algunas secciones internacionales de los periódicos tapatíos. Al final se presentan las semblanzas de José Galindo, Raúl Mora Lomelí, S.J., Tomás Eloy Martínez y Juan Pablo Rosell.ITESO, A.C

Associations between whole peripheral blood fatty acids and DNA methylation in humans

Fatty acids (FA) modify DNA methylation in vitro, but limited information is available on whether corresponding associations exist in vivo and reflect any short-term effect of the diet. Associations between global DNA methylation and FAs were sought in blood from lactating infants (LI; n = 49) and adult males (AMM; n = 12) equally distributed across the three conventional BMI classes. AMM provided multiple samples at 2-hour intervals during 8 hours after either a single Western diet-representative meal (post-prandial samples) or no meal (fasting samples). Lipid/glucose profile, HDAC4 promoter and PDK4 5'UTR methylation were determined in AMM. Multiple regression analysis revealed that global (in LI) and both global and PDK4-specific DNA methylation (in AMM) were positively associated with eicosapentaenoic and arachidonic acid. HDAC4 methylation was inversely associated with arachidonic acid post-prandially in AMM. Global DNA methylation did not show any defined within-day pattern that would suggest a short-term response to the diet. Nonetheless, global DNA methylation was higher in normal weight subjects both post-prandially and in fasting and coincided with higher polyunsaturated relative to monounsaturated and saturated FAs. We show for the first time strong associations of DNA methylation with specific FAs in two human cohorts of distinct age, diet and postnatal development stage