Effects of bihemispheric motor cortex transcranial direct current stimulation (tDCS) on dual-task motor performance in chronic stroke: case study

Stroke is the leading cause of acquired adult disability. It can cause multiple impairments and affect multiple domains. These deficits are usually more evident and impairing when performing dual tasks. Dual task is defined as the performance of two or more concurrent tasks simultaneously that require motor and cognitive skills. Recently, tDCS has acquired a growing interest on stroke rehabilitation given its potential to modulate cortical excitability. Evaluate the effects of 9 bihemispheric tDCS sessions over the primary motor cortex in individuals with chronic stroke on dual-task motor performance. In this study case, subject participated in 9 sessions of 20 minutes of bihemispheric tDCS, followed by his traditional rehabilitation activities. Participant was submitted to 4 evaluation moments. The following assessment tools were used: sociodemographic and clinical questionnaire, Mini Mental State Examination, Fugl-Meyer Assessment of Motor Recovery after Stroke, Verbal Fluency Test, Digit Span, Jamar Hydraulic Hand Dynamometer, Timed Up and Go (TUG), Functional Reach Test (FRT), Box and Block Test (BBT) e Stroke Upper Limb Capacity Scale (SULCS). When compared baseline and final assessment results, the participant showed better results under dual task in the BBT, with an improvement of 100% of blocks transferred with the paretic hand and 125% in the non-paretic hand. In TUG, the participant showed better results under dual task, reducing the time to complete the task in 28,69%. No FRT, results improved in single task, 71,41%, with slight changes in dual task. In the Jamar Hydraulic Hand Dynamometer, a slight reduction was registered in both single and dual task. This reduction was smaller under dual task, -0,42%. Results show that combining bihemispheric tDCS with conventional rehabilitation techniques may have a positive effect in dual-task motor performance

The impact of the financial crisis on the financial constraints of portuguese small and medium enterprises

Dissertação de mestrado em FinançasWith the Portuguese financial crisis, companies had to struggle to be able to overcome the difficulties. Some were able to manage those difficulties, but others did not have the possibility to maintain their activity and had to close the doors. But how were their financial constraints affected? What was the impact that the crisis had on small and medium enterprises (SMEs)? To answer these questions, this study analyses the impact of the recent financial crisis and the sovereign credit rating downgrade of 2011 on the financial constraints of Portuguese SMEs, in a way to understand the difficulties that they faced (or still face) after the crisis. In this dissertation is used the Erel, Jang and Weisbach (2015) approach since their analysis also focus only private firms. According to their methodology, three hypotheses should be tested based on the cash flow sensitivity of cash, the cash flow sensitivity of investment and cash holdings. If a firm is financially constrained, these factors should increase. In this case, the results obtained are not the expected because the three hypothesis purposed are all rejected, indicating that private firms and, more specifically, SMEs were not financially constrained after the financial crisis and the Portuguese sovereign credit rating downgrade in 2011. However, this may not mean that companies were well, but instead that they were even worse than expected, since they did not have the possibility to save cash to finance future investments, nor to retain the cash obtained from the cash inflows or even were not able to use their cash flows to invest.Com a crise financeira Portuguesa, as empresas tiveram de batalhar para ultrapassar as dificuldades. Algumas foram capazes de lidar com essas dificuldades, mas outras não tiveram a possibilidade de manter a sua atividade e tiveram de fechar as portas. Mas como é que foram afectadas as suas restrições financeiras? Qual o impacto que a crise teve nas pequenas e medias empresas (PMEs)? Para responder a estas questões, este estudo analisa o impacto da recente crise financeira e da descida do rating soberano em 2011 nas restrições financeiras das PMEs Portuguesas, de forma a perceber as dificuldades que estas enfrentaram (ou que ainda enfrentam) depois da crise. Nesta dissertação é utilizada a abordagem de Erel, Jang and Weisbach (2015), uma vez que estes autores também focam o seu estudo em empresas privadas. De acordo com a sua metodologia, três hipóteses devem ser testadas com base na sensibilidade de caixa ao cash flow, sensibilidade do investimento ao cash flow e acumulação de liquidez. Se uma empresa está financeiramente restringida, estes fatores devem aumentar. Neste caso, os resultados obtidos não são os esperados, pois as três hipóteses propostas são todas rejeitadas indicando que as empresas privadas e, mais especificamente, as PMEs não estavam restringidas financeiramente depois da crise financeira e da descida do rating soberano Português em 2011. Contudo, isto pode não significar que as empresas estavam bem, mas sim que elas estavam ainda piores do que se esperava, uma vez que não tinham possibilidade de poupar dinheiro para financiar futuros investimentos, nem para reter dinheiro proveniente dos cash inflows ou nem foram capazes de utilizar os cash flows para investir

Effect of virtual reality rehabilitation on motor function in patients with stroke : a narrative review

Trabalho Final do Curso de Mestrado Integrado em Medicina, Faculdade de Medicina, Universidade de Lisboa, 2021Introdução: O acidente vascular cerebral é uma das principais causas de morte e incapacidade no mundo, sendo descrita como uma epidemia global. Défices motores causados por esta etiologia, afetam as tarefas diárias, bem como, a atividade profissional destas pessoas, resultando num dia-a-dia repleto de obstáculos. Desta forma, a reabilitação tem um papel fulcral, na melhoria destas queixas e consequentemente na qualidade de vida. A realidade virtual é uma ferramenta, que nos recentes anos tem vindo a ganhar um papel cada vez de maior importância para estes doentes. Nesta revisão narrativa, pretendemos comparar a reabilitação convencional com a reabilitação baseada na realidade virtual e perceber, desta forma, se existe benefício na combinação de ambas. Métodos: A nossa estratégia de pesquisa consistiu na pesquisa de ensaios clínicos randomizados em três diferentes plataformas (PubMed, sci-Elo e medRxiv), publicados nos últimos 10 anos cujo objetivo primário se focasse na função motora dos membros superiores. Usamos as seguintes palavras-chave como ponto de partida para a pesquisa de artigos: “Virtual Reality”, “rehabilitation”, “stroke”. Após ser aplicada a estratégia de pesquisa acima mencionada, obtivemos um total de 100 artigos. Após análise destes mesmos 100 artigos, somente 26 tinham os critérios necessários para a sua utilização na revisão, com uma amostra total de 1382 pacientes envolvidos nesta revisão de narrativa. Resultados: Como referido previamente, dos 100 artigos, somente 26 foram utilizados para a construção desta revisão narrativa. Os 74 artigos foram excluídos por não preencherem os critérios necessários para a sua inclusão. O facto do artigo não se focar na função motora do membro superior, foi a principal causa de exclusão de artigos. Outras razões como duplicados, não ter acesso livre, não focar o seu estudo na reabilitação do acidente vascular cerebral e não focar no estudo da realidade virtual também foram motivos para exclusão. Conclusão: Devido a inúmeras variáveis entre os diferentes ensaios, é impossível a conclusão de possíveis conexões entre a intervenção e os resultados obtidos. Sugere-se a realização de estudos em que certas variáveis como a intervenção realizada ao grupo de intervenção, o número de sessões, a duração das mesmas, sejam homogeneizados.Introduction: Stroke is one of the leading causes of death and disability and has been described as a worldwide epidemic. Motor function deficits due to stroke affect the patients' performance in daily tasks as well as in their jobs, which results in an increased difficulty in their everyday life. This way, rehabilitation in these patients plays an important role trying to improve their motor function and therefore their quality of life. Virtual reality, in recent years, has been increasingly more popular in this type of patients. In this narrative review, we aim to compare conventional therapy versus virtual reality-based therapy and find out if there is any kind of benefit in combining conventional therapy with virtual reality-based therapy. Methods: Our search strategy consisted in searching for randomized controlled trials published in the last 10 years with the primary outcome focusing on upper limb motor function, in three different platforms (PubMed, sci-Elo and medRxiv) using the following keywords: “virtual reality”, “rehabilitation”, “stroke”. After applied our search strategy we ended up with a total of 100 articles. After analyzing the 100 trials, only 26 of them met the necessary criteria to take part of this review, with a total sample of 1382 patients involved in the narrative review. Results: As previously mentioned, of the 100 articles, only 26 were used to build this narrative review. 74 articles excluded for not meeting the necessary criteria to make part of this review. The fact that the article did not focus on the motor function of the upper limb was the main reason for the exclusion of articles. Other reasons such as duplicates, not having open access, not focusing their study on stroke rehabilitation and not focusing on the study on virtual reality were also reasons for exclusion. Conclusion: Due to numerous variables between the different trials, it is impossible to conclude possible connections between the intervention and the results obtained. It is suggested that studies should be carried out with certain variables, such as the intervention carried out in the intervention group, the number of sessions, the duration of the sessions, homogenized

Supporting software processes analysis and decision-making using provenance data

Data provenance can be defined as the description of the origins of a piece of data and the process by which it arrived in a database. Provenance has been successfully used in health sciences, chemical industries, and scientific computing, considering that these areas require a comprehensive traceability mechanism. Moreover, companies have been increasing the amount of data they collect from their systems and processes, considering the dropping cost of memory and storage technologies in the last years. Thus, this thesis investigates if the use of provenance models and techniques can support software processes execution analysis and data-driven decision-making, considering the increasing availability of process data provided by companies. A provenance model for software processes was developed and evaluated by experts in process and provenance area, in addition to an approach for capturing, storing, inferencing of implicit information, and visualization to software process provenance data. In addition, a case study using data from industry’s processes was conducted to evaluate the approach, with a discussion about several specific analysis and data-driven decision-making possibilities.Proveniência de dados é definida como a descrição da origem de um dado e o processo pelo qual este passou até chegar ao seu estado atual. Proveniência de dados tem sido usada com sucesso em domínios como ciências da saúde, indústrias químicas e computação científica, considerando que essas áreas exigem um mecanismo abrangente de rastreabilidade. Por outro lado, as empresas vêm aumentando a quantidade de dados que coletam de seus sistemas e processos, considerando a diminuição no custo das tecnologias de memória e armazenamento nos últimos anos. Assim, esta tese investiga se o uso de modelos e técnicas de proveniência é capaz de apoiar a análise da execução de processos de software e a tomada de decisões baseada em dados, considerando a disponibilização cada vez maior de dados relativos a processos pelas empresas. Um modelo de proveniência para processos de software foi desenvolvido e avaliado por especialistas em processos e proveniência, além de uma abordagem e ferramental de apoio para captura, armazenamento, inferência de novas informações e posterior análise e visualização dos dados de proveniência de processos. Um estudo de caso utilizando dados de processos da indústria foi conduzido para avaliação da abordagem e discussão de possibilidades distintas para análise e tomada de decisão orientada por estes dados

Activity schedule and foraging in Protopolybia sedula (Hymenoptera, Vespidae)

Protopolybia sedula is a social swarming wasp, widely spread throughout many countries in the Americas, including most of Brazil. Despite its distribution, studies of its behavioral ecology are scarce. This study aimed to describe its foraging activity and relation to climatic variables in the city of Juiz de Fora in southeastern Brazil. Three colonies were under observation between 07:00 and 18:00 during April 2012, January 2013, and March 2013. Every 30 minutes, the number of foragers leaving and returning to the colony was registered along with air temperature and relative humidity. Activity began around 07:30¸ increased between 10:30 and 14:30, and ended around 18:30. A mean of 52.7 exits and 54 returns were measured every 30 minutes. The daily mean values were 1,107 ± 510.6 exits and 1,135 ± 854.8 returns. Only one colony showed a significant correlation between forager exits and temperature (rs = 0.8055; P \u3c 0.0001) and between exits and relative humidity (rs = -0.7441; P = 0.0001). This paper shows that climatic variables are likely to have little control on the foraging rhythm of P. sedula when compared to other species, suggesting the interaction of other external and internal factors as stimuli of species foraging behavio

Comparative genomic analyses of cyanobacteria

Tese de mestrado em Biologia Evolutiva e do Desenvolvimento, apresentada à Universidade de Lisboa, através da Faculdade de Ciências, 2017O presente trabalho teve como objectivo estudar o genoma de 6 (seis) estirpes de cianobactérias recolhidas de locais distintos de Portugal continental. Durante a duração do projecto, propusemo-nos a extrair e quantificar DNA genómico das estirpes mencionadas para, então, procedermos à sua sequenciação. A posterior análise dos dados obtidos focou-se em procurar genes conhecidos de resistência a antibióticos bem como outros elementos genómicos que possam conferir fenótipos de resistência a substâncias antimicrobianas. As cianobactérias são um grupo de procariotas muito estudado quanto à sua prevalência em reservatórios de água para consumo humano e animal. A sua importância prende-se no facto de diversas linhagens de cianobactérias produzirem compostos tóxicos, nomeadamente microcistinas. Estes compostos são nocivos para células eucarióticas, podendo mesmo conduzir à morte dos indivíduos que as ingerem. Para além disto, este grupo de organismos apresenta capacidade de fotossíntese oxigénica, contribuindo para a produção de oxigénio a partir de compostos orgânicos. Mais recentemente, o papel das cianobactérias como parte integrante das comunidades de microorganismos que habitam ambientes aquáticos foi repensado. Estas bactérias proliferam tanto em ´agua doce como em água salgada e contribuem para o pool genético das comunidades em que se encontram. As cianobactérias são capazes de adquirir e partilhar tanto genes como outros elementos genómicos, nomeadamente através de transferência horizontal. A fluidez dos genomas bacterianos sugere que, tal como os restantes genes, os genes de resistência a antibióticos são partilhados pela comunidade microbiana. Este pool de genes de resistência denomina-se resistoma. Na medida em que as cianobactérias apresentam fenótipos de resistência a antibióticos, o seu papel no resistoma destas comunidades começa a ser alvo de estudo. De forma a caracterizar o resistoma de uma comunidade microbiana, é necessário conhecer todos os genes que possam conferir resistência a determinados antibióticos. Para tal, é essencial sequenciar o genoma completo dos indivíduos recolhidos. A Estela Sousa e Silva Algae Culture Collection (ESSACC), actualmente localizada no Instituto de Saúde Doutor Ricardo Jorge, e a Blue Biotechnology and Ecotoxicology Culture Collection (LEGE), localizada no Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental (CIIMAR), permitem-nos iniciar um estudo de caracterização do resistoma de microorganismos de água doce em Portugal. Estas coleções incluem amostras de reservatórios naturais, estações de tratamento de águas residuais e barragens. As amostras caracterizam-se por pertencer a diversas espécies com fenótipos distintos, nomeadamente no que diz respeito a coloração, forma e produção de colónias. Após um estudo prévio de caracterização dos fenótipos de resistência a antibióticos de numerosas amostras, 6 estirpes foram escolhidas para este trabalho. Esta seleção teve em conta fenótipos de resistência contrastantes, ou seja, a escolha teve por base estirpes que apresentassem susceptibilidades diferentes para dados grupos de antibióticos. Ainda assim, todas as estirpes apresentaram resistência ao trimetoprim e ao ácido nalidíxico. Duas estirpes pertencem à espécie Microcystis aeruginosa (LMECYA7 e LMECYA167), outras duas são classificadas como Plantothrix agardhii (LMECYA269 e LMECYA280) e as restantes duas como Planktothrix mougeotii (LEGE06226 e LEGE06233). Quanto à sequenciação, optámos por utilizar o método de terceira geração MinION (Oxford Nanopore Technologies, ONT, UK). O pequeno aparelho de sequenciação funciona através de uma ligação USB 3.0 a qualquer computador portátil ou desktop. A sequenciação dá-se através de um poro que está ligado a um transdutor de sinal elétrico. A molécula de DNA passa através do poro e a corrente medida é transformada numa sequência de bases. Este método tem inúmeras vantagens, nomeadamente: - Permite obter reads longas, na ordem dos milhares de pares de bases (base pairs, bp), o que não é possível através dos métodos convencionais de segunda geração; - Permite obter sequências a partir de DNA não amplificado, ou seja, reduz-se a necessidade aumentar a quantidade de DNA através de PCR; - Permite visualizar o processo de sequenciação em tempo real, no que diz respeito ao rendimento de cada corrida. Para além das vantagens supra referidas, uma das modalidades deste método permite preparar a biblioteca genómica para sequenciação em apenas alguns minutos. Contudo, o processo de obtenção do DNA constitui o passo limitante no que diz respeito a uma sequenciação bem sucedida. A qualidade e quantidade de DNA utilizado para a preparação da biblioteca têm de obeceder a critérios rigorosos. O tamanho dos fragmentos que constituem a biblioteca é um outro factor limitante, no sentido em que, quanto mais fragmentado estiver o DNA, mais pequenas serão as reads obtidas. Portanto, menor será a resolução do genoma que os dados vão permitir. Em suma, realizámos duas rondas de sequenciação com MinION. Na primeira, procedemos a uma corrida de teste, na qual sequenciámos DNA de fago lambda, fornecido pela ONT. Sequenciámos ainda duas bibliotecas de DNA de cianobactérias, pertencentes `as estirpes LMECYA167 e LEGE06233. O DNA genómico de ambas as estirpes foi obtido através da utilização de um kit de extração. Relativamente à segunda ronda de sequenciação, extraímos o DNA das 6 estirpes já mencionadas através da realização de um protocolo de fenol-clorofórmio. Este protocolo tem como objectivo a obtenção de material genético de elevado peso molecular. No final de ambas as rondas de sequenciação, conseguimos obter scaffolds dos genomas das duas estirpes de M. aeruginosa em estudo, isto é, das estirpes LMECYA7 e LMECYA167. Os dados obtidos para as restantes estirpes ficaram aquém das expectativas, no sentido em que não permitiram obter cobertura significativa de nenhum dos genomas. A análise dos dados de todas as sequenciações revelou que a qualidade das reads obtidas foi baixa. Os dados foram, então, filtrados para que apenas as reads de melhor qualidade fossem assembladas e alinhadas aos respectivos genomas de referˆencia. Porém, para todas as estirpes do género Planktothrix, a quantidade de reads mapeada contra a referência e, consequentemente, a cobertura obtida foram irrisórias. Quanto aos scaffolds dos genomas das estirpes de M. aeruginosa, ambas produziram uma sequência consensus maior que metade do genoma de referência. Assim sendo, procedemos à análise dos potenciais genes de resistência a antibióticos presentes nas sequências referidas. Tanto em LMECYA7 como em LMECYA167, foram encontrados potenciais homólogos de genes associados a resistências. Na maioria dos casos, estes genes pertencem a componentes proteicos de bombas de efluxo. Alguns dos outros possíveis genes homólogos encontrados surgem associados a resistência a beta-lactâmicos, quinolonas e sulfonamidas. Genes de resistência a tetraciclina também estão presentes na lista de resultados. Finalmente, a anotação dos scaffolds obtidos parece ter permitido entender a base genética da resistência ao trimetoprim. Foram encontrados, nas sequências de ambas as estirpes, genes para um enzima alternativo da via metabólica dos folatos. Esta via é essencial à sobrevivência destes microorganismos e o trimetoprim actua de forma a inibir um dos enzimas da via. Com a presença de um enzima alternativo, a resistência ao antibiótico é assegurada. Em conclusão, os dados obtidos através de sequenciação de terceira geração permitiram obter scaffolds de dois genomas de cianobactérias. O processo de sequenciação foi simples, mas limitado pelo relativo sucesso do processo de extração. A análise dos dados também foi limitada pela actualização constante dos softwares em actual desenvolvimento. Em última análise, foi possível detectar sinais de adaptação no que diz respeito à evolução de fenótipos de resistência a antibióticos nas estirpes em estudo.Cyanobacteria are photosynthetic organisms that can be found in water bodies worldwide. Cyanobacterial lineage evolution resulted in numerous color, shape and colony-forming phenotypes. Most cyanobacteria produce several toxins, but only a few are capable of nitrogen (N2) fixation. Most interestingly, these bacteria exhibit antimicrobial activity, as well as antibiotic resistance phenotypes. Therefore, it has been suggested that cyanobacteria might harbor several antibiotic resistance (AR) genes. Consequently, it has been hypothesized that these bacteria might play a major role in the dissemination of antibiotic resistance phenotypes in microbial communities. Whole-genome sequencing is necessary to fully characterize the genetic basis of such AR phenotypes. In particular, long-read third-generation sequencing methods might help resolve the genomic structure of AR gene containing regions. Horizontally transferred AR genes are often flanked by highly repetitive sequences, not completely resolved by high-throughput next generation sequencing technologies. Here, we report the use of the portable MinION (Oxford Nanopore Technologies, UK) sequencing device to obtain the genome sequences of six strains of cyanobacteria. Said biological isolates were collected at different time points in freshwater bodies across Portugal. We obtained genome scaffolds for two Microcystis aeruginosa strains. The LMECYA7 scaffold resulted from a hybrid assembly using not only MinION data but also Illumina paired-end reads. The LMECYA167 genome scaffold represented more than 68% of the reference genome and was entirely built from MinION 1D reads. For both strains, more than one hundred homologous AR gene sequences were found. Among these, fluoroquinolone, beta-lactam and sulfonamide resistance-associated genes were present. Moreover, genome annotation might have unveiled the genetic basis of trimethoprim resistance in the aforementioned cyanobacterial strains. The presence of an alternative folate pathway enzyme (thymidylate synthase, thyX) could fully account for such trimethoprim resistance phenotype. In summary, MinION sequencing allowed us to not only find several homologous AR genes, but also pinpoint the genetic mechanism that is responsible for trimethoprim resistance in two strains of cyanobacteria. Lastly, the process of gDNA extraction requires further optimization, in order to obtain maximum MinION sequencing yield

Infestação de ácaro branco em algodoeiros tratados com retardadores de crescimento

The effects of growth retardants on infestation by Potyphagotarsonemus tatus (broad mite) on cotton (Gossypium hirsutum L. cv. IAC-17) plants was studied. Cotton plants were sprayed with (2-ch1oroethy1) trimethylammonium chloride (CCC) 250, 350 and 450 ppm, and with 1,1-dimethyl-piperidinium chloride (Pix) at concentrations of 84, 167 and 250 ppm. Growth retardants did not give effective control of Potyphagotarsone mus tatus but application of Pix 167 ppm showed a tendency to reduce mite attack.Para se estudar o efeito de retardadores de crescimento de infestação de ácaro branco (Polyphagotapsonemus tatus) em algodoeiro (Gossypium hirsutum L. cv. IAC-17) efetuou-se o plantio da cultura em 20/11/78, no campo experimental do setor de Agricultura da Escola Superior de Agricultura "Luiz de Queiroz", em Piracicaba (SP) . Em 17/01/79 foram realizadas as aplicações de Pix (cloreto-1, 1-dimetilpiperidinio) nas concentrações de 84, 167 e 250 ppm, sendo que em 01/02/79 efetuaram-se as pulverizações com cloreto (2-cloroetil) trimetilamonío (CCC) 250, 350 e 450 ppm. Realizaram-se os tratos culturais normais recomendados para o algodoeiro, mas não se efetuou aplicação de produtos acaricidas. Após a constatação da ocorrência natural do icaro branco na cultura, foram con feridos, em 08/03/79, valores numéricos is plantas, correspondentes ao nível de infestação apresentada. Observou-se que a aplicação de retardadores de crescimento não afetou a ocorrência do ácaro. Verificou-se porém uma tendência de redução no ataque do ácaro em plantas tratadas com Pix 167 ppm