Metabolic and mitochondria alterations induced by SARS-CoV-2 accessory proteins ORF3a, ORF9b, ORF9c and ORF10

1 p.Antiviral signaling, immune response and cell metabolism in human body are dysregulated by SARS-CoV-2, the causative agent of COVID-19. However, the impacts of individual accessory proteins on host cell metabolic pathways are unknown.Here, SARS-CoV-2 accessory proteins ORF3a, ORF9b, ORF9c and ORF10 were individually transduced into A549 lung carcinoma cells. Furthermore, by combining transcriptomic analysis with functional and metabolic data in accessory protein-specific GSMMs, several alterations were identified that may point to a putative target for investigating novel therapies. In this study, we showed that these accessory proteins induced a significant mitochondrial and metabolic reprogramming in A549 lung epithelial cells. ORF9b, ORF9c and ORF10 induced largely overlapping transcriptomes. In contrast, ORF3a induced a distinct transcriptome, including the downregulation of numerous genes with critical role in mitochondria function and morphology. On the other hand, while all four ORFs altered mitochondrial dynamics and function, only ORF3a and ORF9c induced a marked structural alteration in mitochondrial cristae. Genome-Scale Metabolic Models identified both metabolic flux reprogramming features shared across all accessory proteins and specific ones for each accessory protein. Notably, a downregulated amino acid metabolism was observed in ORF9b, ORF9c and ORF10, while an upregulated lipid metabolism was distinctly induced by ORF3a. Next, qMTA identified gene knock downs (KDs) that would have the potential to revert the metabolic reprogramming induced by each individual accessory protein, especially in ORF3a and ORF10. These findings reveal metabolic dependencies and vulnerabilities prompted by SARS-CoV-2 accessory proteins that may be exploited to identify new targets for intervention.Peer reviewe

Metabolic and mitochondria alterations induced by SARS-CoV-2 accessory proteins ORF3a, ORF9b, ORF9c and ORF10

Antiviral signaling, immune response and cell metabolism in human body are dysregulated by SARS-CoV-2, the causative agent of the COVID-19. Here, we show that SARS-CoV-2 accessory proteins ORF3a, ORF9b, ORF9c and ORF10 induce a significant mitochondrial and metabolic reprogramming in A549 lung epithelial cells. While all four ORFs caused mitochondrial fragmentation and altered mitochondrial function, only ORF3a and ORF9c induced a marked structural alteration in mitochondrial cristae. ORF9b, ORF9c and ORF10 induced largely overlapping transcriptomes. In contrast, ORF3a induced a distinct transcriptome, including the downregulation of numerous genes for proteins with critical mitochondrial functions and morphology. Genome-Scale Metabolic Models predicted common and private metabolic flux reprogramming, notably a depressed amino acid metabolism, and an enhanced metabolism of specific lipids distinctly induced by ORF3a. These findings reveal metabolic dependencies and vulnerabilities prompted by SARS-CoV-2 accessory proteins that may be exploited to identify new targets for intervention.This research work was funded by the European Commission – NextGenerationEU (Regulation EU 2020/2094), through CSIC's Global Health Platform (PTI+ Salud Global) (COVID-19-117 and SGL2103015), Junta de Andalucía (CV20-20089), Spanish Ministry of Science project (PID2021-123399OB-I00), the Agency for Management of University and Research Grants from Generalitat de Catalunya-AGAUR (2020PANDE00048 and 2021SGR00350) and ICREA foundation (ICREA-Academia-2021 to MC) of Generalitat de Catalunya, and an AESi grant of the Instituto de Salud Carlos III (PI20CIII-00014). TGG is recipient of a Ramón y Cajal contract funded by MCIN/AEU/10.13039/501100011033 and NextGeneration EU/PRTR.N

Maslinic Acid, a Natural Triterpene, Induces a Death Receptor-Mediated Apoptotic Mechanism in Caco-2 p53-Deficient Colon Adenocarcinoma Cells

Maslinic acid (MA) is a natural triterpene present in high concentrations in the waxy skin of olives. We have previously reported that MA induces apoptotic cell death via the mitochondrial apoptotic pathway in HT29 colon cancer cells. Here, we show that MA induces apoptosis in Caco-2 colon cancer cells via the extrinsic apoptotic pathway in a dose-dependent manner. MA triggered a series of effects associated with apoptosis, including the cleavage of caspases -8 and -3, and increased the levels of t-Bid within a few hours of its addition to the culture medium. MA had no effect on the expression of the Bax protein, release of cytochrome-c or on the mitochondrial membrane potential. This suggests that MA triggered the extrinsic apoptotic pathway in this cell type, as opposed to the intrinsic pathway found in the HT29 colon-cancer cell line. Our results suggest that the apoptotic mechanism induced in Caco-2 may be different from that found in HT29 colon-cancer cells, and that in Caco-2 cells MA seems to work independently of p53. Natural antitumoral agents capable of activating both the extrinsic and intrinsic apoptotic pathways could be of great use in treating colon-cancer of whatever origin.This study was supported by grants Group BIO 157 from the Technology and Innovation Council of the Andalucian regional government and AGL2006-12210-C03-02/ALI, SAF2005-01627, ISCIII-RTICC (RD06/0020/0046) from the Spanish government and European Union FEDER funds

Los estudios transfronterizos : un enfoque desde las Relaciones Internacionales

Los trabajos contenidos en este libro constituyen algunas ponencias presentadas en el I Encuentro Mesoamericano de Estudios Transfronterizos y de Desarrollo de Capaci¬dades Humanas, realizado los días 8 y 9 de noviembre de 2012, en la ciudad de Liberia, Costa Rica, por la Universidad Nacional. Dicho evento fue organizado por dos unidades académicas de esa institución universitaria: la Escuela de Relaciones Interna¬cionales y la Sede Región Chorotega.The works contained in this book constitute some papers presented at the I Mesoamerican Encounter of Cross-Border Studies and Development of Human Capacities, held on November 8 and 9, 2012, in the city of Liberia, Costa Rica, by the University National. This event was organized by two academic units of that university: the School of International Relations and the Chorotega Region Headquarters.Universidad Nacional, Costa RicaEscuela de Relaciones Internacionale

Metabolic and mitochondria alterations induced by SARS‐CoV‐2 accessory proteins ORF3a, ORF9b, ORF9c and ORF10

Publication status: PublishedFunder: ICREA foundation (ICREA‐Academia‐2021 to MC) of Generalitat de CatalunyaFunder: Serra Húnter FellowFunder: Ramón y Cajal contractAbstractAntiviral signaling, immune response and cell metabolism are dysregulated by SARS‐CoV‐2, the causative agent of COVID‐19. Here, we show that SARS‐CoV‐2 accessory proteins ORF3a, ORF9b, ORF9c and ORF10 induce a significant mitochondrial and metabolic reprogramming in A549 lung epithelial cells. While ORF9b, ORF9c and ORF10 induced largely overlapping transcriptomes, ORF3a induced a distinct transcriptome, including the downregulation of numerous genes with critical roles in mitochondrial function and morphology. On the other hand, all four ORFs altered mitochondrial dynamics and function, but only ORF3a and ORF9c induced a marked alteration in mitochondrial cristae structure. Genome‐Scale Metabolic Models identified both metabolic flux reprogramming features both shared across all accessory proteins and specific for each accessory protein. Notably, a downregulated amino acid metabolism was observed in ORF9b, ORF9c and ORF10, while an upregulated lipid metabolism was distinctly induced by ORF3a. These findings reveal metabolic dependencies and vulnerabilities prompted by SARS‐CoV‐2 accessory proteins that may be exploited to identify new targets for intervention.</jats:p

Territorios y espacios transfronterizos : una visión desde Centroamérica

Este libro es un esfuerzo conjunto de tres unidades académicas de la Universidad Nacional, Costa Rica: Escuela de Relaciones Internacionales, Instituto de Estudios Sociales en Población (IDESPO), y Sede Regional Chorotega, que le ofrecen a usted, lector un intento por re-pensar los espacios transfronterizos como unidades territoriales con una dinámica propia, que transcienden las divisiones fronterizas entre Estados.This book is a joint effort of three academic units of the National University, Costa Rica: School of International Relations, Institute of Social Studies in Population (IDESPO), and Chorotega Regional Headquarters, which offer you, the reader, an attempt to re- think of cross-border spaces as territorial units with their own dynamics, which transcend border divisions between States.Universidad Nacional, Costa RicaEscuela de Relaciones InternacionalesInstituto de Estudios Sociales en Población (IDESPO

Planes viales quinquenales de conservación y desarrollo: guía para la formulación y seguimiento

La presente Guía para la Formulación y Seguimiento del Plan Vial Quinquenal de Conservación y Desarrollo (PVQCD), es una contribución conceptual y metodológica del Ministerio de Obras Públicas y Transportes al sector municipal y al país. Constituye una nueva manera de planificar la gestión vial bajo la metodología de aprender haciendo, de modo que los equipos técnicos municipales adquieran los conocimientos y las herramientas que requieren para darle continuidad y sostenibilidad a este importante proceso, sin depender de agentes externos y promoviendo el empoderamiento y el aprendizaje local. También es una nueva forma de hacer planificación vial porque incorpora la participación comunal como un mecanismo para nutrir el proceso favoreciendo la transparencia y la rendición de cuentas que sólo es real cuando las comunidades tienen acceso a la información de manera ágil y oportuna. Además, pone a disposición un conjunto de procedimientos, herramientas y recomendaciones necesarias para realizar un plan de gestión vial incluyendo los componentes de desarrollo, conservación y Prólogo seguridad, con estrategias e indicadores para el seguimiento y evaluación. Esta Guía es producto de la formulación, validación, experiencia y lecciones aprendidas por parte de 40 municipalidades de todo el país, en el marco de la contratación del Primer Programa Red Vial Cantonal PRVC-I MOPT/BID, con la Escuela de Planificación y Promoción Social (EPPS) de la Universidad Nacional y en alianza con el Laboratorio Nacional de Materiales y Modelos Estructurales de la Universidad de Costa Rica (LanammeUCR), ejecutada con muy buena disposición, interés y solidaridad por parte de estas instituciones. En síntesis, esta Guía permite mirar al futuro con una visión de desarrollo del cantón, e involucra estrategias ambientales, participación ciudadana, priorización en las intervenciones, gestión del riesgo ante emergencias, seguimiento y evaluación, lo que favorece la consolidación de un modelo de gestión vial transparente y orientado a satisfacer las necesidades de los usuarios en el mediano y largo plazo. Ing. Germán Valverde González Ministro. Ministerio de Obras Públicas y Transportes.This Guide for the Formulation and Monitoring of the Five-Year Conservation and Development Road Plan (PVQCD) is a conceptual and methodological contribution of the Ministry of Public Works and Transportation to the municipal sector and the country. It constitutes a new way of planning road management under the methodology of learning by doing, so that municipal technical teams acquire the knowledge and tools they require to give continuity and sustainability to this important process, without depending on external agents and promoting empowerment. and local learning. It is also a new way of doing road planning because it incorporates community participation as a mechanism to nurture the process, favoring transparency and accountability that is only real when communities have access to information in an agile and timely manner. In addition, it makes available a set of procedures, tools and recommendations necessary to carry out a road management plan, including the components of development, conservation and safety, with strategies and indicators for monitoring and evaluation. This Guide is the product of the formulation, validation, experience and lessons learned by 40 municipalities throughout the country, within the framework of the contracting of the First Cantonal Road Network Program PRVC-I MOPT/IDB, with the School of Planning and Promotion Social (EPPS) of the National University and in alliance with the National Laboratory of Materials and Structural Models of the University of Costa Rica (LanammeUCR), executed with great willingness, interest and solidarity on the part of these institutions. In summary, this Guide allows looking to the future with a vision of development of the canton, and involves environmental strategies, citizen participation, prioritization of interventions, risk management in emergencies, monitoring and evaluation, which favors the consolidation of a management model transparent road and oriented to satisfy the needs of the users in the medium and long term. Ing. Germán Valverde González Minister. Ministry of Public Works and Transportation.Universidad Nacional de Costa RicaEscuela de Planificación y Promoción Socia

Caracterización de los sistemas de captación de agua de los cantones de Hojancha y Nicoya, en Guanacaste, Costa Rica

Capítulo 2 del libro digital: Clima, agua y producción sostenible: Aportes desde la acción académica CEMEDE - HIDROCECEn esta investigación se caracterizaron los sistemas de captación de agua en los cantones de Hojancha y Nicoya, en Guanacaste, Costa Rica. Específicamente, se documentaron las razones que incentivaron a los agricultores a construir estos sistemas. Adicionalmente, se analizó la percepción de los agricultores acerca del estado actual del funcionamiento de estos sistemas, así como, de los beneficios obtenidos durante los meses de aridez estacional. La información fue obtenida por medio de visitas a las fincas, registrando la ubicación espacial de los sistemas, tomando fotografías del estado actual de la infraestructura de los sistemas. Además, se utilizaron encuestas que fueron aplicadas en finca, a los once dueños de sistemas de captación de agua. El diseño colaborativo de la metodología, así como el trabajo de campo, la transcripción de las encuestas y el análisis de la información fue realizada por los estudiantes y académicos de la Universidad Nacional (UNA). Los productores encuestados establecieron que el principal beneficio de los sistemas de captación es que pueden proporcionar el agua necesaria para desarrollar actividades agropecuarias durante la aridez estacional (seis meses). Esta es la temporada más difícil para el desarrollo de la ganadería y la agricultura en estos cantones. Los sistemas de captación de agua les permiten adaptarse a los problemas de escasez hídrica que se han agravado en los últimos diez años. A partir del análisis de los resultados, se identificaron oportunidades para mejorar el diseño técnico de los sistemas, así como, la necesidad de continuar investigando, a fin de, evaluar la eficiencia de la tecnología y las implicaciones de implementar los sistemas de captación de agua, para solventar la disponibilidad hídrica en la región.Centro Mesoamericano de Desarrollo Sostenible del Trópico Seco (CEMEDE-UNA)Universidad Nacional, Costa RicaUniversidad Nacional, Sede Regional Chorotega, Costa RicaCentro Mesoamericano de Desarrollo Sostenible del Trópico Seco (CEMEDE-UNA