Transcriptional responses of Leishmania (Leishmania) amazonensis in the presence of trivalent sodium stibogluconate

Background: In the last decade, resistance to antimonials has become a serious problem due to the emergence of drug-resistant strains. Therefore, understanding the mechanisms used by Leishmania parasites to survive under drug pressure is essential, particularly for species of medical-veterinary importance such as L. amazonensis. Methods: Here, we used RNA-seq technology to analyse transcriptome profiles and identify global changes in gene expression between antimony-resistant and -sensitive L. amazonensis promastigotes. Results: A total of 723 differentially expressed genes were identified between resistant and sensitive lines. Comparative transcriptomic analysis revealed that genes encoding proteins involved in metabolism (fatty acids) and stress response, as well as those associated with antimony resistance in other Leishmania species, were upregulated in the antimony-resistant line. Most importantly, we observed upregulation of genes encoding autophagy proteins, suggesting that in the presence of trivalent stibogluconate (SbIII) L. amazonensis can activate these genes either as a survival strategy or to induce cell death, as has been observed in other parasites. Conclusions: This work identified global transcriptomic changes in an in vitro-adapted strain in response to SbIII. Our results provide relevant information to continue understanding the mechanism used by parasites of the subgenus Leishmania (L. amazonensis) to generate an antimony-resistant phenotype. © 2019 The Author(s)

Riesgos en el proceso de importación ordinaria: identificación del mapa de riesgos de la importación de bienes de capital en Colombia

En Colombia, durante el proceso de importación se presentan diversos riesgos, que pueden implicar desde sobrecostos hasta la pérdida de la mercancía -- Considerando que las importaciones son necesarias en las empresas, en la presente investigación se elabora un mapa de riesgos del proceso de importación ordinaria de bienes de capital en el país, con el fin de identificarlos, de tal manera que los importadores estén informados y puedan aplicar los métodos de control pertinentes para la administración de dichos riesgos -- Para llevar a cabo el presente trabajo se utiliza el Método Risicar para identificación de riesgos y medidas de tratamiento de los mismos, el cual se valida mediante entrevistas a expertos en el tem

CONSECUENCIAS JURÍDICO LABORALES DE LA EMPRESA USUARIA, EN LA DECLARATORIA DE EXISTENCIA DEL CONTRATO REALIDAD

La constitución de Colombia establece en su artículo 53 ciertas prerrogativas a favor de los trabajadores, las cuales garantizan sus derechos en materia laboral, sin embargo, tales estipulaciones son desconocidas en muchas relaciones de trabajo, en especial cuando la misma se materializa a través de la tercerización o intermediación laboral. Entre esa formas de contratación encontramos la figura de la empresa de servicios temporales, visible a partir del artículo 71 de la ley 50 de 1990, la cual permite el suministro de trabajadores en misión para la prestación del servicio a una empresa usuaria. Esa normatividad indica que es la empresa de servicio temporal quien debe asumir el pago de salarios y prestaciones y por ende será siempre su empleador.No obstante a ello, esa responsabilidad en cuanto a las acreencias laborales muchas veces se desplaza a la empresa usuaria, cuando se configurar cualquiera de la hipótesis que plantea el artículo 77 de la ley 50 de 1990. Acaecida tal situación, producto de la realidad sobre la formalidad, la empresa usuaria se convierte en el verdadero empleador y le corresponde asumir el pago de las obligaciones laborales al trabajador.Esta obra ofrece un compendio sobre la responsabilidad de la empresa usuaria dentro de la contratación bajo la figura de la empresa de servicios temporales, su marco legal y las responsabilidades que le asiste en caso de incumplimiento a lo que ilustra la ley 50 de 1990 al declararse la existencia de un contrato realidad

Detección de blancos moleculares en la ruta de señalización del fosfatidil-inositol en Leishmania spp. mediante herramientas bioinformáticas y de modelado matemático

Introduction: Leishmaniasis is a disease of high impact on public health. Research on drugs for its treatment is considered a priority by the World Health Organization. The phosphatidyl-inositol signaling pathway is interesting to explore because it is involved in the survival of the parasite, by controlling osmoregulation, transport through membranes, and activation of transcription factors.Objective: To propose drug targets against the disease through bioinformatic analysis and mathematical modeling of this signaling pathway.Materials and methods: The phosphatidyl-inositol pathway proteins were characterized through Pfam and TriTrypDB databases. Subsequently, a similarity analysis with human proteins was performed using the OrthoMCL and InParanoid7 tools. Finally, a boolean model of the pathway was proposed using PROMOT and CellNetAnalyzer softwares.Results: The phosphatidyl-inositol signaling pathway in Leishmania spp. was reconstructed and described. The similarity analysis determined the feasibility of the phosphatidyl-inositol pathway proteins as molecular targets. Mathematical models allowed integrating the elements of the path and predicted an inhibitor effect. The following were proposed as drug targets: inositol-3-phosphate-5-phosphatase, phosphatidylinositol-4-kinase, phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and Inositol-1P-polyphosphate phosphatase.Conclusion: The phosphatidyl-inositol signaling pathway is robust from the point of view of the qualitative model and the proteins found. Thus, potential drug targets against leishmaniasis were identified. Subsequently we will seek to detect drugs against this set of proteins and validate them experimentally.Introducción. La leishmaniasis es una enfermedad de gran impacto en la salud pública. La Organización Mundial de la Salud considera prioritaria la investigación orientada al desarrollo de medicamentos para su tratamiento. La exploración de la ruta del fosfatidil-inositol es interesante, ya que está implicada en la supervivencia del parásito mediante el control de la osmorregulación, el transporte a través de las membranas y la activación de diversos factores de transcripción.Objetivo. Proponer blancos para el desarrollo de medicamentos contra la leishmaniasis mediante el análisis bioinformático y el modelado matemático de esta ruta.Materiales y métodos. Se caracterizaron las proteínas pertenecientes a la ruta del fosfatidil-inositol en las bases de datos TriTrypDB y Pfam. Posteriormente, se hizo un análisis de similitud con las proteínas humanas mediante las herramientas InParanoid7 y OrthoMCL. Finalmente, se propuso un modelo booleano de la ruta, utilizando los programas PROMOT y CellNetAnalyzer.Resultados. Se reconstruyó y se describió la ruta de señalización del fosfatidil-inositol en Leishmania spp. El análisis de similitud con proteínas humanas determinó la viabilidad de las proteínas pertenecientes a la ruta del fosfatidil-inositol como potenciales blancos moleculares. Los modelos matemáticos permitieron integrar los elementos de la ruta y predecir un efecto inhibidor. Se propusieron los siguientes blancos para el desarrollo de medicamentos: inositol-3-fosfato-5-fosfatasa, fosfatidil-inositol-4-cinasa, fosfatidil-inositol-3,4,5-trisfosfato-3-fosfatasa, e inositol-polifosfato1P-fosfatasa.Conclusiones. La ruta de señalización del fosfatidil-inositol aparece como una alternativa sólida desde el punto de vista del modelo cualitativo y a partir de las proteínas encontradas. Se identificaron posibles blancos de medicamentos contra la leishmaniasis. Posteriormente, se buscarán medicamentos contra las proteínas detectadas y se hará la validación experimental

Intraspecific genomic divergence and minor structural variations in leishmania (Viannia) panamensis

Leishmania (Viannia) panamensis is one of the most important Leishmania species associated with cutaneous leishmaniasis (CL) in Latin America. Despite its wide geographic distribution and pathogenic potential in humans and animals, the genomic variability of this species is low compared with other Leishmania species circulating in the same geographical area. No studies have reported a detailed analysis of the whole genome of L. panamensis from clinical isolates using DNA highthroughput sequencing to clarify its intraspecific genomic variability or plausible divergence. Therefore, this study aimed to evaluate the intraspecific genomic variability of L. panamensis from Colombia and Panama. A total of 22 genomes were analyzed, 19 from Colombian patients with CL and three genomes from Panama obtained from public databases. The phylogenomic analysis revealed the potential existence of three well-supported clades as evidence of intraspecific divergence. Additionally, the whole-genome analysis showed low structural variations in terms of ploidy, copy number variations, and single-nucleotide polymorphisms (SNPs). SNPs shared among all clades were identified, revealing their importance in different biological processes of L. panamensis. The findings not only expand our knowledge of intraspecific genomic variability of one of the most important Leishmania species in South America but also highlights the possible existence of different clades/lineages/subpopulations across a geographic scale. © 2020 by the authors. Licensee MDPI, Basel, Switzerland

Metaciclogénesis: un proceso fundamental en la biología de Leishmania

Metacyclogenesis is a process whereby Leishmania transforms from poorly infective procyclic promastigotes into highly infective metacyclic promastigotes. In nature, metacyclogenesis occurs in the insect vector. This transformation is accompanied by an increased ability to infect and survive in the vertebrate host, where the parasite is attacked by the host's immune system. Metacyclogenesis has also been shown to occur in axenic cultures of promastigotes. Morphological changes in size and shape, and length of flagellum were first associated with differentiation in the insect gut and in different phases of growth in culture. Later, the expression of molecules such as LPG and the surface protease gp63 were associated with this process. These two molecules were observed to undergo qualitative and quantitative modifications as the promastigotes differentiated from procyclic to metacyclic forms. Using cDNA subtractive hybridization-based methods or differential amplification, previously unknown genes tightly linked to metacyclogenesis have been identified. Gene products exclusively expresed in metacyclic promastigotes included a gene B product and Mat-1 -a gene associated with metacyclogenesis. Other proteins, Meta-1, SHERP and HASP, were up-regulated during the metacyclic stage. The function and stage-regulated expression of these molecules and their relationship with infectivity are now under investigation.La metaciclogénesis es un proceso que experimentan naturalmente los promastigotes de Leishmania en el tracto digestivo del insecto vector y cuya finalidad es transformar los promastigotes en formas altamente infectivas y capaces de sobrevivir en el hospedero vertebrado, donde es sometido a los ataques por parte del sistema inmune. Se ha demostrado que este fenómeno ocurre también en promastigotes en crecimiento en cultivos axénicos in vitro. El proceso de metaciclogénesis se asoció inicialmente con cambios morfológicos, observándose que los promastigotes cambiaban su forma y tamaño con incremento en la longitud del flagelo. Luego, se logró asociar con este fenómeno la expresión de ciertas moléculas implicadas en virulencia, como el lipofosfoglicano (LPG) y una proteasa de superficie, la gp63. Se demostró que estas moléculas experimentaban cambios tanto cuantitativos como cualitativos a medida que los promastigotes se diferencian de promastigotes procíclicos no infectivos a metacíclicos o infectivos. Hoy en día, mediante técnicas de hibridización substractiva con cADN o de amplificación diferencial, se han logrado identificar genes cuyo patrón de expresión está íntimamente ligado al proceso de metaciclogénesis. Se han identificado moléculas como el producto del gen B y una proteína asociada con la metaciclogénesis (Mat-1), las cuales se expresan exclusivamente en promastigotes metacíclicos, mientras que otras como las proteínas Meta-1, SHERP y HASP se sobrexpresan en los promastigotes metacíclicos. Sin embargo, la función y asociación de estas proteínas con este patrón particular de expresión y virulencia se está empezando a evaluar

Application of the Eco-Epidemiological Method in the Study of Leishmaniasis Transmission Foci

The study of transmission foci involves the clinical characterization of disease within a focus using active surveillance of human cases, characterization of the population group that is most frequently infected or at highest risk of becoming infected, diagnosis and treatment of infected people and identification of the conceptions, attitudes, beliefs and practices related to the disease. An entomological survey is necessary to determine the geographical distribution of species and incrimination of vector species, the ecological characteristics of the zone (macro-focus), times of the year and day of highest biting activity and places in homes in which the most frequent contact between the people and the vectors occurs. A survey of peri-domestic and wild mammals in the area is advisable to try to identify potential reservoir hosts. Using this information, it is feasible to design specific and accurate prevention and effective, rational and economic control measures and define the times of the year and locations in which these measures must be applied. In this chapter, a description of the application of the eco-epidemiological method to the study of leishmaniasis transmission foci is provided. A special emphasis is placed on the methodology, multidisciplinary work and analysis of findings

Identificación de Brucella canis Grupo 2 en criaderos de perros en Colombia

ABSTRACT: recently, isolates of Brucella canis (B. canis) were classified into two groups, Group 1 and Group 2, based on a 794 bp deletion in the polysaccharide deacetylase gene in Group 1, or absence of this deletion in Group 2. In Colombia, B. canis was first isolated from sick or clinically healthy seropositive dogs in 2005. Objective: to determine Brucella canis genotype in isolates from Medellín Metropolitan Area. Methods: 49 isolates from a study involving 193 dogs in 10 kennels were analyzed by Polymerase Chain Reaction (PCR) using three primer pairs of eight previously reported. Results: all isolates were positive for 152, 272, and 794 bp fragments, indicating that they belong to Group 2. Conclusion: this article presents strong evidence based on the new molecular marker used to classify B. canis isolates from Medellín (Colombia) into Group 2. This is a pioneer molecular study on the presence of B. canis in Colombia and it would be interesting to apply this method to characterize the infection epidemiology and explore its domestic clinical dynamics.RESUMEN: recientemente, las cepas de Brucella canis (B. canis) fueron clasificadas dentro de dos grupos, Grupo 1 y Grupo 2, de acuerdo a la presencia o ausencia de una deleción de 794 bp en el gen de la polisacárido deacetilasa, respectivamente. En Colombia Brucella canis se aisló por primera vez en 2005 de perros seropositivos, enfermos o clínicamente sanos. Objetivo: determinar el genotipo de aislamientos de Brucella canis provenientes del Area Metropolitana de Medellín. Método: 49 aislamientos de un estudio con 193 perros en 10 criaderos fueron sometidos a tres Reacciones en Cadena de la Polimerasa (PCR) simple, empleando 3 pares de cebadores de 8 previamente reportados. Resultados: todos los aislamientos amplificaron los fragmentos de 152, 272 y 794 bp, indicando que pertenecen al Grupo 2. Conclusiones: este artículo presenta evidencia sólida para clasificar las cepas de Brucella canis aisladas en Medellín (Colombia) en el Grupo 2, basado en el uso del nuevo marcador molecular. Este es un estudio molecular pionero de B. canis en Colombia y sería interesante aplicar este método para caracterizar la dinámica epidemiológica y clínica de la infección en el país

Diversidad genética de Plasmodium falciparum y sus implicaciones en la epidemiología de la malaria.

Genetic diversity provides Plasmodium falciparum with the potential capacity of avoiding the immune response, and possibly supporting the selection of drug or vaccine resistant parasites. These genetic characters play key roles in the selection of appropriate malaria control measures. Diverse clones of Plasmodium falciparum, often denoted as strains, has been documented, and the degree of genetic diversity supported by several kinds of PCR (polymerase chain reaction) assays. Many studies in different endemic regions with differences in their level of disease transmission have clarified the interactions between the parasite populations and malaria epidemiology. This paper describes recombination events of the malaria parasite life cycle that originate such genetic diversity in P. falciparum, reviewing different studies on this aspect and its implications in the immunity and development of control measures in regions with different degrees of endemicity.La diversidad genética le confiere a Plasmodium falciparum la capacidad de evadir la respuesta inmune del hospedero y producir variantes resistentes a medicamentos y a vacunas, aspectos que juegan un papel importante en el establecimiento de medidas de control contra la malaria. Diferentes autores han documentado la existencia de diversas cepas o clones de P. falciparum, cuya diversidad genética se ha confirmado a través de distintos ensayos de PCR (reacción en cadena de la polimerasa). Numerosas investigaciones realizadas en poblaciones con diferente grado de transmisión de malaria han mostrado la relación existente entre la estructura de la población de P. falciparum y la epidemiología de la enfermedad. En este artículo se describen las fases del ciclo de vida en las que los eventos de recombinación originan la diversidad genética de P. falciparum, se revisan los estudios realizados sobre este aspecto en regiones con diferentes grados de endemicidad, así como sobre sus implicaciones en la adquisición de inmunidad y en el desarrollo de medidas de control