Characterization of tomato accessions for resistance to early blight

The purpose of this study was to characterize 50 tomato genotypes of the Vegetable Genebank of the FederalUniversity of Viçosa. They were evaluated together with the controls Débora, Fanny and Santa Clara, in a randomized block designwith two replications. The experiment was conducted in a research field of the UFV, from February to May 2007. We evaluated thedisease severity, which is the percentage of diseased leaf area. The severity values were transformed into area under the diseaseprogress curve (AUDPC), improving the result visualization. The analysis of variance and grouping of AUDPC means by the Scott-Knott test at 5 % significance were performed. The accessions BGH-2081, BGH-2034, BGH-700, BGH-2057, BGH-2035, BGH-2054, BGH-2018, BGH-2065, BGH-2008, and BGH-2032 had a lower mean AUDPC than the controls and are therefore indicatedfor future breeding programs

Crop breeding and applied biotechnology

The purpose of this study was to characterize 50 tomato genotypes of the Vegetable Genebank of the Federal University of Viçosa. They were evaluated together with the controls Débora, Fanny and Santa Clara, in a randomized block design with two replications. The experiment was conducted in a research field of the UFV, from February to May 2007. We evaluated the disease severity, which is the percentage of diseased leaf area. The severity values were transformed into area under the disease progress curve (AUDPC), improving the result visualization. The analysis of variance and grouping of AUDPC means by the Scott-Knott test at 5 % significance were performed. The accessions BGH-2081, BGH-2034, BGH-700, BGH-2057, BGH-2035, BGH-2054, BGH-2018, BGH-2065, BGH-2008, and BGH-2032 had a lower mean AUDPC than the controls and are therefore indicated for future breeding programs.O objetivo deste trabalho foi caracterizar 50 subamostras de tomateiro do Banco de Germoplasma de Hortaliças da Universidade Federal de Viçosa (BGH-UFV). Foram avaliadas juntamente com as testemunhas Débora, Fanny e Santa Clara, em experimento em blocos ao acaso, com duas repetições. O experimento ocorreu na Horta de Pesquisas da UFV, no período de fevereiro a maio de 2007. Avaliou-se a severidade da doença, que é a porcentagem da área foliar lesionada. Os valores de severidade foram transformados em área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD), possibilitando uma melhor visualização dos resultados. Foi realizada a análise de variância, seguido do agrupamento das médias de AACPD pelo teste de Scott-Knott, a 5% de significância. As subamostras BGH-2081, BGH-2034, BGH-700, BGH-2057, BGH-2035, BGH-2054, BGH-2018, BGH-2065, BGH-2008 e BGH-2032 apresentaram menor média de AACPD em relação às testemunhas, podendo ser utilizadas em futuros programas de melhoramento

Geoestatística aplicada na geração de Modelos Numéricos de Elevação

Estudos de características do relevo, geomorfológicos, os quais abarcam amplas áreas do conhecimento, tais como agrimensura, cartografia, mineração, hidrologia, geologia, sensoriamento remoto, ciência do solo, ecologia e ciências ambientais, utilizam-se os modelos digitais de elevação (MDEs), baseado em processos numéricos essa é a técnica mais comum de derivação de atributos morfológicos de relevo em ambiente digital e tem contribuído na potencialização (rapidez e precisão) da obtenção de dados e informação.  Diante disso, tem-se como objetivo avaliar se através do método de krigagem é possível melhorar a resolução espacial do SRTM referente a folha folha SF-23-X-B, que contempla a cidade e Viçosa dos valores de altitude, originalmente espaçados em 90 metros. Foram utilizados os softwares Quantum GIS 1.7, Microsoft® Office Excel 2007 e GS+ 7.0. Palavras chaves: SRTM, MNE, Geoestatística, Krigagem, Variograma. DOI: 10.5902/22364994785

Relação entre Vivência Acadêmica e Ansiedade em Estudantes Universitários

Researches have evaluated the anxiety and college students adaptation to academic life, but few Brazilian studies investigated the relation between these variables. This study aimed to evaluate the student’s degree of academic adaptation and its relation to anxiety and sociodemographic and academic variables. This is a cross-sectional Survey research, part of a multicentric study. Participated 316 students from three institutions: Universidade Federal de São João del-Rei, Universidade Federal de Ouro Preto e Universidade Federal do Triângulo Mineiro. Subjects answered online instruments: Questionário de Vivências Acadêmicas (QVA-r); Escala de Depressão, Ansiedade e Estresse (DASS-21) and sociodemografic/academic questionnaire. Results showed moderate degree of academic adaptation, stronger for the dimensions Carrier, Personal and Interpessonal and moderate levels of anxiety. Multiple regression indicated that higher levels of anxiety were predictor of lower degree of academic adaptation, for Carrier, Study and Institucional. For Carrier, being in a medical course was predictor of lower degree of adaptation. For anxiety, the predictors were being female, being in Nursing course and low age. This research can be considered an advance in this area due to the lack of studies on this issue. Future studies should include others universities and parts of the country.Estudos têm investigado a ansiedade e a adaptação acadêmica em estudantes universitários, mas poucas pesquisas nacionais avaliaram a relação entre estas variáveis. O objetivo deste estudo foi avaliar o grau de adaptação acadêmica dos estudantes e suas relações com ansiedade e variáveis sociodemográficas e acadêmicas. Trata-se de Pesquisa de Levantamento (Survey), de corte transversal, parte de um estudo multicêntrico. Participaram 316 alunos da Universidade Federal de São João del-Rei, Universidade Federal de Ouro Preto e Universidade Federal do Triângulo Mineiro. Foram aplicados os seguintes instrumentos online: Questionário de Vivências Acadêmicas (QVA-r); Escala de Depressão, Ansiedade e Estresse (DASS-21) e Questionário sociodemográfico/acadêmico. Os resultados mostraram grau moderado de adaptação acadêmica, com maiores escores nas dimensões Carreira, Pessoal e Interpessoal e níveis moderados de ansiedade. Na regressão múltipla, maior nível de ansiedade foi preditor de menor adaptação acadêmica, nas dimensões Carreira, Estudo e Institucional. Para a dimensão Carreira, cursar Medicina também foi um fator preditor de menor adaptação. Para ansiedade, os fatores preditores foram: sexo feminino, cursar Enfermagem e ter menor idade. Esta pesquisa pode ser considerada um avanço na área, devido à carência de estudos nesta temática. Estudos futuros deverão incluir outras universidades e regiões do país

Aggressiveness of Alternaria tomatophila, A. grandis and A. solani in potato and tomato

A pinta preta é uma das principais doenças da batateira e do tomateiro. No Brasil, a doença foi reportada ser causada por Alternaria solani, no entanto, recentemente, constataram-se as espécies A. grandis e A. tomatophila associadas à pinta preta em batateira e em tomateiro, respectivamente. Por se tratarem de espécies recentemente relatadas no Brasil, estudos relativos à especificidade por hospedeiro e requerimentos ecológicos ainda não foram realizados. Em outros países, há evidência de especificidade em populações de Alternaria spp., principalmente de A. solani, possivelmente em decorrência de diferenças de agressividade de indivíduos. No presente estudo quantificaram-se os efeitos de variáveis climáticas nos componentes epidemiológicos: área da lesão (AL), área abaixo da curva de crescimento micelial (AACCM), frequência de infecção (FI) e período de incubação (PI) associadas aos isolados de Alternaria spp. Estudaram-se 11 isolados de Alternaria spp.: 6 isolados de A. grandis, 4 de A tomatophila e 1 de A. solani, inoculados em batateira e tomateiro. Quantificaram-se os efeitos da temperatura sobre o crescimento micelial (15, 22, 25, 30 e 35 oC) e AL (18, 22, 25 e 30 oC) e os efeitos da duração do período de molhamento foliar (PMF) (2, 4, 8, 12, 24 h) sobre a FI e PI causados por Alternaria spp. Maiores valores de AL, FI e menores valores de PI foram observados em batateira, independentemente dos isolados inoculados. A alta suscetibilidade da cultivar de batata Opaline e o estádio fenológico o qual as plantas foram inoculadas, interferiram no resultado. A temperatura influenciou a AL de forma diferenciada conforme a combinação espécie - hospedeiro. Os isolados de A. grandis, A. solani e A. tomatophila, causaram maior AL em seus hospedeiros de origem; A. grandis foi mais agressivo que A. solani em batateira. Em batateira, maior AL associada a A. grandis e A. solani ocorreu tanto em temperaturas baixas como a 30 °C, mas 25 °C foi a temperatura ótima para AL associada a todas as espécies. A temperatura afetou o crescimento micelial de Alternaria spp. Maior crescimento foi constatado para isolados de A. grandis. A temperatura ótima para crescimento micelial de A. grandis, A. solani e A. tomatophila foi 24, 24 e 26 oC, respectivamente. A FI foi afetada pelo PMF, porém o efeito variou conforme a combinação espécie - hospedeiro. Os valores de FI foram semelhantes para todas as espécies, porém sob condições limitantes de 2 h de PMF, maiores valores de FI foram verificados para A. grandis em batateira. Em tomateiro, os valores de FI foram semelhantes para todos os isolados de Alternaria spp. No experimento realizado durante o inverno, não foram observados sintomas da doença em tomateiros inoculados com A. solani e houve desenvolvimento mais lento da pinta preta. Poucas diferenças foram verificadas em relação ao PI dos isolados de Alternaria spp., em ambos os hospedeiros, sob diferentes PMF. Há evidências de preferência ao hospedeiro em populações brasileiras de Alternaria spp. associadas à pinta preta em batateira e tomateiro apesar de A. grandis e A. tomatophila poderem causar doença em ambos hospedeiros.Early Blight is an important disease of potato and tomato crops worldwide. In Brazil, Alternaria solani was considered the only causal agent of early blight. Recently, A. grandis and A. tomatophila were found to be the main species associated with early blight in potato and tomato, respectively. Due to the novelty of these findings no studies about host specificity and ecological requirements were conducted yet. In other countries, there is evidence of host specificity in populations of Alternaria spp., including of A. solani, caused or largely influenced by differences in aggressiveness. In the current study, we quantified the effects of the main climatic variables on the following epidemiological variables: lesion area (LA), area under the curve of mycelial growth (AUCMG), infection frequency (IF), and incubation period (IP). Eleven isolates of Alternaria spp were studied: 6 isolates of A. grandis, 4 of A tomatophila and 1 of A. solani were inoculated in potato and tomato plants. The effects of temperature on mycelial growth (15, 22, 25 30, and 35 oC) and LA (18, 22, 25, and 30 oC) and the effects of duration of leaf wetness period (DLW) (2, 4, 8, 12, and 24 h) on IF and IP of Alternaria spp were assessed. Higher values of LA, IF and lower values of IP were observed in potato, regardless of the isolates. The higher susceptibility of potato 'Opaline' and the phenological stage at which the plants were inoculated influenced this result. Temperature differentially affected LA depending on the species x host combination. A. grandis, A. solani and A. tomatophila, caused higher LA in the original hosts. A. grandis was more aggressive than A. solani in potato and caused higher LA at low temperature and at 30ºC, but the optimum temperature for LA for all species was 25ºC. Mycelial growth of Alternaria spp. was affected by temperature. The highest growth was found for A. grandis. The optimum temperature for A. grandis, A. solani, and A. tomatophila was 24, 24, and 26 oC, respectively. The FI was affected by the DLW, but the effect varied according to the species x host combination. The values of IF were similar for all species in most DLW. However, under limiting conditions of 2 h of DLW in potato, A. grandis had higher IF values than A. solani and A. tomatophila. In tomato, similar IF values were recorded for all isolate of Alternaria spp. In the fall experiment no symptoms were observed in tomato plants inoculated with A. solani and the development of early blight was slower than in the summer experiment. There is evidence of host preference in the Brazilian populations of Alternaria spp. associated with early blight in potato and tomato, even though A. grandis and A. tomatophila can cause disease in both hosts.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superio

Pinta preta da batateira e do tomateiro: Identificação molecular das espécies de Alternaria gama de hospedeiro e epidemia

A pinta preta, doença comum em Solanum tuberosum L. e S. lycopersicum L. tem como agente causal Alternaria spp. Em 2000, algumas novas espécies associadas a pinta preta foram descritas. Alternaria grandis e A. tomatophila são as predominantes no Brasil. A identificação das espécies de Alternaria tem sido realizada principalmente pela caracterização morfológica. Neste estudo utilizou-se abordagem filogenética usando um conjunto de dados multilocos concatenados (gliceraldeído 3 fosfato desidrogenase, actina, ATPase e calmodulina) e análise de high-resolution melting (HRM) baseada nas regiões RPB2 e MCM7. A diferenciação de A. solani, A. grandis e A. tomatophila foi suportada pela filogenia. O ensaio baseado na análise de HRM permitiu a separação rápida e eficiente destas espécies. Alternaria spp. que causam pinta preta podem apresentar diferenças com relação a agressividade e em diferentes regiões do Brasil, produtores têm relatado maiores perdas de produtividade em função das epidemias. A disponibilidade de inóculo pode estar associada com a maior gama de hospedeiros dessas novas espécies. O método centrífugo-filogenético foi utilizado para determinar a gama de hospedeiros de A. solani, A. grandis, e A. tomatophila. Foram realizados testes de patogenicidade em 54 espécies de plantas. Das 28 espécies Solanaceae, 13 foram suscetíveis a espécies de Alternaria. Da família Asteraceae, Ageratumconyzoides e Erigeronbonariensis foram suscetíveis e da família Polygonaceae, Rumex acetosa,plantas até então não descritas como hospedeira de Alternaria spp. O desenvolvimento da pinta preta em pimentão e pimenta variou de acordo com a espécie do patógeno.Quando A. solani foi inoculado, o período de incubação (PI) foi de 14 dias em pimentão e 30 dias em pimenta. O PI para A. tomatophila foi de 30 dias em pimentão e de 14 dias em pimenta. Para A. grandis o PI foi de 7 dias, em ambos os hospedeiros. Aparentemente, a reação após a inoculação das diferentes espécies nestes dois hospedeiros pode ser usada para complementar os procedimentos de identificação de A. solani, A. grandis, e A. tomatophila. Estudou-se o progresso da pinta preta em batateira e tomateiro cultivados em Coimbra (720 m altitude) e Rio Paranaíba (1073m), Minas Gerais. Adicionalmente, avaliou-se a severidade das epidemias iniciadas por inoculação, em diferentes concentrações, de isolados de A. solani e A. grandis em parcelas pulverizadas com fungicida clorotalonil, em diferentes intervalos de tempo, em batateira. O progresso da pinta preta em Coimbra e Rio Paranaíba foi avaliado no verão e no inverno e em ambas as épocas, maiores valores de área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD), taxa de progresso da doença e severidade aos 24 dias de epidemia ocorreram em Rio Paranaíba e para a cultura do tomate. Nesse estudo, A. tomatophilainfectoubatataemCoimbra,masA.grandisnão foi encontradoassociado compinta-pretaem tomateiroem nenhuma dasregiões pesquisadas. Em RioParanaíba, epidemias de pinta-pretaembatateiraforam causadas porA.grandise, em tomateiro, porA. tomatophila. A especificidade por hospedeironão é absoluta ea preferênciapode ocorrerpor diferenças naagressividadedas espécies. Diferenças de agressividade também foram observadas entre A. grandis e A. solani, as variáveis epidemiológicas taxa deprogresso da doença, AACPD e severidadeno finalda epidemia suportaram a existência de diferenças de agressividade entre as espécies. Epidemiadepinta pretacausada porA.grandis foimuito severa até mesmo em condiçõesnão favoráveis, comobaixa umidade, o que corrobora os relatos deprodutores de batata sobre oaumento daintensidade dapinta-pretaem qualquerépoca do ano.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorEarly blight, a common disease in Solanumtuberosum L. and S. lycopersicum L. is caused by Alternaria spp. New species associated with early blight, A. grandis and A. tomatophila, predominate in Brazil. The identification of Alternaria species commonly associated with early blight of potato and tomato has been mainly carried out by morphological characterization. In this study a phylogenetic approach was used combining a multilocus dataset (glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, actin, plasma membrane ATPase and calmodulin) and analysis of high-resolution melting (HRM) analysis based on the RPB2 and MCM7 regions was also carried out. The differentiation of A. solani, A. grandis and A. tomatophila was supported by phylogeny. The HRM analysis allowed rapid and efficient separation of these species. Alternaria spp. causing early blight may differ with respect to aggressiveness. In different regions of Brazil tomato and potato growers have reported increased yield losses due to early blight epidemics, concomitantly with reports of new species of Alternaria. The availability of inoculum may be associated with the wider host range of these new species. The centrifugal phylogenetic method was used to determine the host range of A. solani, A. grandis, and A. tomatophila. Pathogenicity tests were conducted on 54 plant species, 28 of which were species of Solanaceae. Thirteen Solanaceae species were susceptible to Alternaria. Ageratum conyzoides and Erigeron bonariensis in Asteraceae and Rumex acetosa in Polygonaceae were also susceptible and had not been previously described as hosts of Alternaria spp. The development of early blight in bell pepper and pepper varied according to the species of the pathogen. For A. solani, the incubation period (IP) was 14 days in bell peppers and 30 days in peppers. The IP for A. tomatophila in bell peppers and in pepper was 30 and 14 days, respectively. For A. grandis the IP was 7 days in both hosts. Apparently, the reaction after the inoculation of the different species in the two hosts can be used for identification purposes. Disease progression of early blight was studied in potato and tomato grown in Coimbra (altitude720m.a.s.l.) and Rio Paranaíba (1073 m.a.s.l.), Minas Gerais. In addition, we evaluated disease severity in potato plots inoculated with different spore concentrations of A. solani and A. grandis and sprayed with chlorothalonil at various time intervals. The progress of early blight in Coimbra and Rio Paranaíba has been studied in summer and winter in two experiments. Higher values of area under the disease progress curve (AUDPC), rate of disease progress and severity at 24 days occurred in Rio Paranaíba and for tomato, with greater severity in the summer crops. In this study, A. tomatophila infected potato in Coimbra, but A. grandis was not associated with early blight on tomato in neither region. In Rio Paranaíba, epidemics of early blight in potatoes were caused by A. grandis whereas A. tomatophila was the causal agent in tomato, so it is possible to conclude at the field level, the host specificity is not absolute and that the preference for host occurs by differences in species aggressiveness. Differences in aggressiveness were also observed between A. grandis and A. solani. Collectively, the epidemiological variables, rate of disease progression, AUDPC and the severity at the end of the epidemic support the existence of differences in aggressiveness between A. grandis and A. solani. Epidemics of early blight caused by A. grandis were very severe, even in unfavorable conditions such as low humidity, the epidemic of early blight caused by A. grandis showed greater aggressiveness than A. solani, which corroborates reports of potato growers of increased intensity of early blight in any planting season

Transient hepatic elastography has the best performance to evaluate liver fibrosis in non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD)

Introduction and aim: The gold-standard for fibrosis diagnosis in non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD) is liver biopsy, despite its invasive approach, sampling limitations and variability among observers. The objective was to validate the performance of non-invasive methods (Fibroscan™; APRI, FIB4 and NAFLD score) comparing with liver biopsy in the evaluation of liver fibrosis in patients with NAFLD. Material and methods: NAFLD patients ≥18 years of age who were submitted to liver biopsy were included and evaluated at two reference tertiary hospitals in Brazil with transient hepatic elastography (THE) assessment through Fibroscan™, APRI, FIB4 and NAFLD scores were determined. Sensitivity, specificity, positive (PPV) and negative (NPV) predictive values for the diagnosis of advanced fibrosis were calculated to evaluate the performance of these non-invasive methods in NAFLD patients, adopting liver biopsy as the gold standard. Results: A total of 104 patients were studied. At three different cutoff values (7.9, 8.7 and 9.6 kPa) THE presented the highest sensitivity values (95%, 90% and 85% respectively), and the highest NPV (98%, 96.4% and 95.1% respectively) for the diagnosis of advanced fibrosis. It also presented the highest AUROC (0.87; CI 95% 0.78–0.97). Conclusion: When compared to the gold standard, transient hepatic elastography presented the best performance for the diagnosis and exclusion of advanced fibrosis in patients with NAFLD, overcoming APRI, FIB4 and NAFLD score