47 research outputs found

    Mapping autophagosome contents identifies interleukin-7 receptor-α as a key cargo modulating CD4+ T cell proliferation

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    CD4+ T cells are pivotal cells playing roles in the orchestration of humoral and cytotoxic immune responses. It is known that CD4+ T cell proliferation relies on autophagy, but identification of the autophagosomal cargo involved is missing. Here we create a transgenic mouse model, to enable direct mapping of the proteinaceous content of autophagosomes in primary cells by LC3 proximity labelling. Interleukin-7 receptor-α, a cytokine receptor mostly found in naïve and memory T cells, is reproducibly detected in autophagosomes of activated CD4+ T cells. Consistently, CD4+ T cells lacking autophagy show increased interleukin-7 receptor-α surface expression, while no defect in internalisation is observed. Mechanistically, excessive surface interleukin-7 receptor-α sequestrates the common gamma chain, impairing the interleukin-2 receptor assembly and downstream signalling crucial for T cell proliferation. This study shows that key autophagy substrates can be reliably identified in this mouse model and help mechanistically unravel autophagy's contribution to healthy physiology and disease

    Mimicking human neuronal pathways in silico: an emergent model on the effective connectivity

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    International audienceWe present a novel computational model that detects temporal configurations of a given human neuronal pathway and constructs its artificial replication. This poses a great challenge since direct recordings from individual neurons are impossible in the human central nervous system and therefore the underlying neuronal pathway has to be considered as a black box. For tackling this challenge, we used a branch of complex systems modeling called artificial self-organization in which large sets of software entities interacting locally give rise to bottom-up collective behaviors. The result is an emergent model where each software entity represents an integrate-and-fire neuron. We then applied the model to the reflex responses of single motor units obtained from conscious human subjects. Experimental results show that the model recovers functionality of real human neuronal pathways by comparing it to appropriate surrogate data. What makes the model promising is the fact that, to the best of our knowledge, it is the first realistic model to self-wire an artificial neuronal network by efficiently combining neuroscience with artificial self-organization. Although there is no evidence yet of the model's connectivity mapping onto the human connectivity, we anticipate this model will help neuroscientists to learn much more about human neuronal networks, and could also be used for predicting hypotheses to lead future experiments

    L’indagine macrosismica: metodologia, parametri del terremoto, questioni aperte

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    Subito dopo l’evento del 6 aprile 2009, come di consueto è stata realizzata una lunga e complessa indagine macrosismica, promossa dal gruppo operativo QUEST, che ha avuto inizialmente l’obiettivo di delimitare l’area di danneggiamento, a supporto delle attività di pronto intervento della Protezione Civile, e successivamente quello di classificare nel modo più accurato e capillare possibile, gli effetti prodotti dall’evento, particolarmente nelle aree danneggiate. A questo scopo è stata prodotta una stima utilizzando la scala MCS (Sieberg, 1930); in un secondo momento è stata rifinita l’indagine per una cinquantina di località dell’area maggiormente danneggiata (Is MCS>VII), raccogliendo ed elaborando i dati in termini di scala macrosismica EMS98 (Grünthal, 1998). Per la complessità e la dimensione dei problemi affrontati, questo terremoto ha costituito un banco di prova di grande importanza per la macrosismologia italiana. In questo testo viene descritto il lavoro realizzato, discutendo in particolare alcuni aspetti che hanno messo alla prova le metodologie di indagine tradizionali (sistematiche irregolarità degli insediamenti monitorati, forti divergenze degli scenari di danno rispetto a quelli previsti dalle scale, difficile comparabilità con scenari storici, ecc.) e presentandone i risultati, in relazione ai parametri epicentrali che ne risultano e il loro contributo più diretto alla comprensione complessiva della sismicità dell’area

    Non-Standard Errors

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    In statistics, samples are drawn from a population in a data-generating process (DGP). Standard errors measure the uncertainty in estimates of population parameters. In science, evidence is generated to test hypotheses in an evidence-generating process (EGP). We claim that EGP variation across researchers adds uncertainty: Non-standard errors (NSEs). We study NSEs by letting 164 teams test the same hypotheses on the same data. NSEs turn out to be sizable, but smaller for better reproducible or higher rated research. Adding peer-review stages reduces NSEs. We further find that this type of uncertainty is underestimated by participants

    L’indagine macrosismica: metodologia, parametri del terremoto, questioni aperte

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    Subito dopo l’evento del 6 aprile 2009, come di consueto è stata realizzata una lunga e complessa indagine macrosismica, promossa dal gruppo operativo QUEST, che ha avuto inizialmente l’obiettivo di delimitare l’area di danneggiamento, a supporto delle attività di pronto intervento della Protezione Civile, e successivamente quello di classificare nel modo più accurato e capillare possibile, gli effetti prodotti dall’evento, particolarmente nelle aree danneggiate. A questo scopo è stata prodotta una stima utilizzando la scala MCS (Sieberg, 1930); in un secondo momento è stata rifinita l’indagine per una cinquantina di località dell’area maggiormente danneggiata (Is MCS>VII), raccogliendo ed elaborando i dati in termini di scala macrosismica EMS98 (Grünthal, 1998). Per la complessità e la dimensione dei problemi affrontati, questo terremoto ha costituito un banco di prova di grande importanza per la macrosismologia italiana. In questo testo viene descritto il lavoro realizzato, discutendo in particolare alcuni aspetti che hanno messo alla prova le metodologie di indagine tradizionali (sistematiche irregolarità degli insediamenti monitorati, forti divergenze degli scenari di danno rispetto a quelli previsti dalle scale, difficile comparabilità con scenari storici, ecc.) e presentandone i risultati, in relazione ai parametri epicentrali che ne risultano e il loro contributo più diretto alla comprensione complessiva della sismicità dell’area.Published49-551.11. TTC - Osservazioni e monitoraggio macrosismico del territorio nazionaleN/A or not JCRope

    Aggiornamento relazioni fra l'intensità macrosismica e PGA. Progetto INGV-DPC S1, Deliverable D11.

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    Empirical relationships between macroseismic intensity and PGA are useful for comparing the macroseismic observations to recorded peak ground motions and for comparing seismic hazard assessment in terms of intensity with those in PGA. In literature is observed that despite the intensity correlate fairly well with PGA, the relationships I-PGA is the only mathematical instrumental to convert seismic hazard assessment in terms of intensity to PGA. Not many studies deal with the relationship between intensity and PGA and the majority have been published for the western USA and Japan. In Italy, relationships between the intensity data and PGA records have been proposed among others by Margottini et al. (1987, 1992) and by Faccioli and Cauzzi (2006), which used data from earthquakes of the Mediterranean area (Italy, Turkey, Algeria, France and Slovenia). In the present study a probabilistic I-PGA relationship is proposed, based on the datasets from Margottini et. al and from Faccioli and Cauzzi, and adopting a generalized orthogonal regression.Istituto Nazionale di Geofisica e VulcanologiaPublished4.2. TTC - Scenari e mappe di pericolosità sismicaope
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