L’Indice de Biodiversité Potentielle (IBP) dans les SLDF. Synthèse de 12 projets

Les 7 et 8 avril 2015 à Paris, le ministère de l'Ecologie a organisé, avec l'appui de la Fédération nationale des Communes forestières et en lien avec la Fédération des Parcs naturels régionaux, le séminaire de clôture de l'appel à projet sur « la prise en compte de la biodiversité dans les Stratégies locales de développement forestier (SLDF) ». Les SLDF désignent des outils de développement tels que les Chartes forestières de territoires (CFT) et les Plans de Développement de Massif (PDM). Animatrice du réseau des CFT, la Fédération nationale des Communes forestières a suivi l'appel à projet depuis son lancement en 2012, dans le cadre de la Stratégie nationale de la Biodiversité (SNB). En présence des ministères en charge de la biodiversité (MEDDE) et de la forêt (MAAF), ce séminaire a d'abord présenté un panorama des projets réalisés. Les objectifs: évaluer les résultats, les facteurs de réussites et les difficultés rencontrées, valoriser les expériences menées et en tirer des enseignements pour une diffusion des méthodes et des pratiques pour d'autres territoires. Ont ainsi témoigné des porteurs de démarches territoriales forêt-bois, des élus et des acteurs de l'environnement et de la recherche. La qualité des projets en termes de partenariat, de sensibilisation sur le terrain et de dialogue entre les différents acteurs a été unanimement soulignée. Les collectivités locales ont été identifiées comme cheffes de file de ces initiatives pionnières. L'accent a été mis la première journée sur les moyens de connaissance de la biodiversité et sa prise en compte dans la gestion forestière : production de données, d'informations et appropriation par les acteurs concernés. Mais aussi la diffusion de cette connaissance, notamment auprès des professionnels de la filière comme les Entrepreneurs de Travaux forestiers (ETF) et sa concrétisation dans les documents de gestion forestière: plans simples de gestion, documents d'aménagement. Pour poursuivre ces démarches, un lien plus fort doit être créé entre les territoires forestiers et la recherche qui dispose de méthodes et de connaissances approfondies, notamment sur les questions climatiques. Les retours d'expériences ont confirmé la nécessité d'intégrer la biodiversité dans des démarches plus transversales. Elle ne doit pas être "sacralisée" en forêt mais "socialisée", ont rappelé plusieurs intervenants. De plus, ces démarches doivent être incitatives plutôt que prescriptives et règlementaires. Il faut "donner envie" et même proposer des outils "ludiques", adaptés à un public large de propriétaires. Les projets ont aussi montré que la biodiversité apporte une vraie plus-value économique sur les territoires: résilience des forêts, respect des sols et qualité de l'eau, meilleure adaptation aux changements climatiques. Un bon exemple : les Projets Sylvicoles Territoriaux (PST) de la région Rhône-Alpes vise, au-delà de la production de bois d'œuvre, à optimiser les services écosystémiques rendus par la forêt et à décloisonner les approches : prise en compte dans les actions sylvicoles du carbone, de l'eau, de la biodiversité, des paysages ou encore des besoins économiques de la filière locale. La dernière journée était consacrée à la présentation des outils et des financements européens ainsi que les politiques publiques menées en France en faveur de la biodiversité. Les participants ont souligné que les actions pionnières menées sur le terrain nécessitent une animation importante et demande des moyens. Dans ce domaine, les Régions apparaissent comme les pilotes des futures politiques publiques de la biodiversité en cohérence attendue avec la politique nationale. Michaël Weber, vice-président de la Fédération des Parcs Naturels Régionaux et président de l'association des Communes forestières de Moselle, a ajouté que "les communes forestières, en tant que propriétaires de forêts et acteur indispensable des territoires, étaient au carrefour de ces préoccupations et force de concertation"

The multiproxy analysis of a lacustrine-palustrine sediment core from Lebanon reveals four climate cycles

International audienc

Following Pathogen Development and Gene Expression in a Food Ecosystem: the Case of a Staphylococcus aureus Isolate in Cheese

Human intoxication or infection due to bacterial food contamination constitutes an economic challenge and a public health problem. Information on the in situ distribution and expression of pathogens responsible for this risk is to date lacking, largely because of technical bottlenecks in detecting signals from minority bacterial populations within a complex microbial and physicochemical ecosystem. We simulated the contamination of a real high-risk cheese with a natural food isolate of Staphylococcus aureus, an enterotoxin-producing pathogen responsible for food poisoning. To overcome the problem of a detection limit in a solid matrix, we chose to work with a fluorescent reporter (superfolder green fluorescent protein) that would allow spatiotemporal monitoring of S. aureus populations and targeted gene expression. The combination of complementary techniques revealed that S. aureus localizes preferentially on the cheese surface during ripening. Immunochemistry and confocal laser scanning microscopy enabled us to visualize, in a single image, dairy bacteria and pathogen populations, virulence gene expression, and the toxin produced. This procedure is readily applicable to other genes of interest, other bacteria, and different types of food matrices

Tool for Quantification of Staphylococcal Enterotoxin Gene Expression in Cheese▿

Cheese is a complex and dynamic microbial ecosystem characterized by the presence of a large variety of bacteria, yeasts, and molds. Some microorganisms, including species of lactobacilli or lactococci, are known to contribute to the organoleptic quality of cheeses, whereas the presence of other microorganisms may lead to spoilage or constitute a health risk. Staphylococcus aureus is recognized worldwide as an important food-borne pathogen, owing to the production of enterotoxins in food matrices. In order to study enterotoxin gene expression during cheese manufacture, we developed an efficient procedure to recover total RNA from cheese and applied a robust strategy to study gene expression by reverse transcription-quantitative PCR (RT-qPCR). This method yielded pure preparations of undegraded RNA suitable for RT-qPCR. To normalize RT-qPCR data, expression of 10 potential reference genes was investigated during S. aureus growth in milk and in cheese. The three most stably expressed reference genes during cheese manufacture were ftsZ, pta, and gyrB, and these were used as internal controls for RT-qPCR of the genes sea and sed, encoding staphylococcal enterotoxins A and D, respectively. Expression of these staphylococcal enterotoxin genes was monitored during the first 72 h of the cheese-making process, and mRNA data were correlated with enterotoxin production

Biome reconstruction from pollen and plant macrofossil data for Africa and the Arabian peninsula at 0 and 6000 years

Biome reconstruction from pollen and plant macrofossil data provides an objective method to reconstruct past vegetation. Biomes for Africa and the Arabian peninsula have been mapped for 6000 years sp and provide a new standard for the evaluation of simulated palaeovegetation distributions. A test using modern pollen data shows the robustness of the biomization method, which is able to predict the major vegetation types with a high confidence level. The application of the procedure to the 6000 years data set (pollen and plant macrofossil analyses) shows systematic differences from the present that are consistent with the numerous previous regional and continental interpretations, while providing a more extensive and more objective basis for such interpretations. Madagascar, eastern, southern and central Africa show only minor changes in terms of biomes, compared to present. Major changes in biome distributions occur north of 15 degrees N, with steppe in many low-elevation sites that are now desert, and temperate xerophytic woods/scrub and warm mixed forest in the Saharan mountains. These shifts in biome distributions, imply significant changes in climate, especially precipitation, between 6000 years and present, reflecting a change in monsoon extent combined with a southward expansion of Mediterranean influence. [References: 170

African pollen database inventory of tree and shrub pollen types

African pollen data have been used in many empirical or quantitative palaeoenvironmental reconstructions. However, the pollen types used in these studies were not controlled and standardised, preventing the precise understanding of pollen-plant and pollen-climate relation that is necessary for the accurate quantification of continental scale climate change or ecological processes in the past. This paper presents a summary of the progress made with the African Pollen Database (APD) inventory of plant diversity from pollen data extracted from 276 fossil sites and more than 1500 modem samples, with a focus on tropical tree pollen types. This inventory (1145 taxa) gives, for each pollen taxon whose nomenclature is discussed, information on the habit, habitat and phytogeographical distribution of the plants they come from. Special attention has been paid to pollen types with similar morphology, which include several plant species or genera, whose biological or environmental parameters can differ considerably