Building an Organization to Last: Reflections and Lessons Learned From SeaChange

Shares an important case study of best practices of grantmaking and organizational effectiveness. Contains lessons about leadership, governance, management and accountability

Configurations of polymers attached to probes

We study polymers attached to spherical (circular) or paraboloidal (parabolic) probes in three (two) dimensions. Both self-avoiding and random walks are examined numerically. The behavior of a polymer of size R[subscript 0] attached to the tip of a probe with radius of curvature R, differs qualitatively for large and small values of the ratio s=R[subscript 0]/R. We demonstrate that the scaled compliance (inverse force constant) S/R[2 over 0], and scaled mean position of the polymer end-point (x[subscript ⊥])/R can be expressed as a function of s. Scaled compliance is anisotropic, and quite large in the direction parallel to the surface when R[subscript 0]~R. The exponent γ, characterizing the number of polymer configurations, crosses over from a value of γ[subscript 1] – characteristic of a planar boundary – at small s to one reflecting the overall shape of the probe at large s. For a spherical probe the crossover is to an unencumbered polymer, while for a parabolic probe we cannot rule out a new exponent.National Science Foundation (U.S.) (Grant DMR-08-03315

Funktionelle Analyse des Ependymzell-Marker-Proteins Wdr16

Wdr16 is a protein that is abundantly expressed in kinocilia-bearing tissues such as ependyma and testis and that was linked to ciliary function and hydrocephalus (Hirschner et al., 2007). The aim of the present PhD thesis was a molecular biological approach to contribute to the understanding of the molecular function and spatial structure of this protein. In order to achieve this goal, it was highly desirable to perform experiments by which the expression of the Wdr16 protein could be abolished or reduced in kinocilia-bearing cells and tissues. One method that was used for this purpose is the “knockdown” of wdr16 gene expression in EPCs using lentiviral gene transfer (Stewart et al., 2003). Another method employed is the generation of a transgenic Wdr16 “knockout” mice strain (Walinski, 2004). To achieve such an ambitious objective, it is important to establish basic techniques, e.g the cloning of a targeting vector, ES cell culture and the procedures for electroporation, and screening of the ES cells. A further objective of this PhD thesis was to study the cellular and subcellular location of Wdr16. This can be carried out by using immunohistochemical stainings as well as by expressing GFP- or Flag-tagged fusions of Wdr16 in EPCs or cell lines. Finally, another aim of this PhD thesis was the expression of Wdr16 in insect cells as a prerequisite for the purification of the protein by affinity chromoatography. The purified protein then has to be subjected to CD analysis in order to determine its secondary structure. The availability of a purified protein would also facilitate, among other things, the determination of the crystal structure of Wdr16, production of a new polyclonal antibody, and the search for protein interaction partners using “pull down” assays. The search for binding partners of Wdr16 (using Co-IP) was also a topic of this thesis since the identification of a binding partner can instantly provide valuable information about the molecular function of a gene product.Wdr16 ist ein Eiweißkörper, welcher in Kinozilien-tragenden Geweben wie dem Ependym und den Hoden hergestellt wird und welcher mit der Funktion von Kinozilien und der Entstehung des Wasserkopfes (Hydrocephalus) in Verbindung gebracht wird (Hirschner et al., 2007). Das Ziel der vorliegenden Doktorarbeit war ein molekularbiologischer Ansatz, welcher zum Verständnis der molekularen Funktion und räumlichen Struktur dieses Proteins beiträgt. Um dieses Ziel zu erreichen war es notwendig Experimente durchzuführen, durch welche die Herstellung von Wdr16 in Kinozilien-tragenden Zellen und Geweben gänzlich abgeschaltet oder reduziert wird. Eine dafür eingesetzte Methode ist der „Knockdown“ von Wdr16 in EPCs mittels lentiviralem Gentransfer (Stewart et al., 2003). Eine andere verwendete Methode ist die Herstellung einer transgenen Wdr16 „knockout“-Mauslinie. Um dieses Ziel zu erreichen ist es wichtig, grundlegende Techniken zu etablieren, z.B. die Klonierung eines „Targeting“-Vektors sowie Kultur, Elektroporation und Screening von embryonalen Maus-Stammzellen. Ein weiteres Ziel der Doktorarbeit war es die zelluläre und subzelluläre Verteilung von Wdr16 zu untersuchen. Dies kann entweder direkt durch immunohistochemische Färbungen oder auch durch die Expression von GFP- oder Flag-markierten Fusionsproteinen in EPCs oder verschiedenen Zelllinien erreicht werden. Schließlich war es Ziel der Dissertation Wdr16 in Insektenzellen herzustellen, um es danach mittels Affinitätschromatographie isolieren zu können. Das isolierte Protein kann dann mittels CD-Spektroskopie analysiert werden, um seine Sekundärstruktur zu bestimmen. Das Vorliegen des isolierten Proteins würde unter anderem auch die Bestimmung der Kristallstruktur, die Herstellung eines polyklonalen Antikörpers und die Suche nach Protein-Interaktionspartnern mit Hilfe von „pull down“-Experimenten vereinfachen. Die Suche nach Bindungspartnern des Wdr16-Proteins mittels Ko-Immunpräzipitation war auch ein Thema der Doktorarbeit, da deren Identifikation wertvolle Hinweise über die molekulare Funktion des Proteins geben kann

Dos calendarios agrícolas

El calendario, que ordena nuestra vida diaria estableciendo ciclos de actividad, se basa en la periodicidad. Los fenómenos que mejor responden a la misma son, como es sabido, los astronómicos de absoluta regularidad. Sin embargo, somos testigos de otros hechos asimismo periódicos, que aun no siendo tan precisos, podrían también servir para el mismo efecto. Entre ellos, se cuentan los ciclos agrícolas. En el presente artículo hacemos referencia a dos calendarios especiales que, a pesar de que su vigencia está distanciada en el tiempo y en el espacio, tienen en común su relación con la agricultura.Fundación Museo La Plat

El Mar Muerto : Un mar insólito

Varios son los motivos que justifican este calificativo que atribuimos al Mar Muerto. Por definición, insólito es “desacostumbrado, no común ni ordinario” que precisamente es el caso presente, cuando consideramos entre otras cosas, su ubicación altimétrica, la concentración salina de sus aguas, la ausencia de vida en su seno. A ello debemos agregar la presencia en su vecindad de numerosos lugares que rememoran hechos importantes que ocurrieron allí a lo largo de la historia o que las tradiciones ubican en ese lugar. Todo lo anterior confiere a este accidente geográfico un interés especial que justifica dediquemos nuestra atención.Fundación Museo La Plat

Dos calendarios agrícolas

El calendario, que ordena nuestra vida diaria estableciendo ciclos de actividad, se basa en la periodicidad. Los fenómenos que mejor responden a la misma son, como es sabido, los astronómicos de absoluta regularidad. Sin embargo, somos testigos de otros hechos asimismo periódicos, que aun no siendo tan precisos, podrían también servir para el mismo efecto. Entre ellos, se cuentan los ciclos agrícolas. En el presente artículo hacemos referencia a dos calendarios especiales que, a pesar de que su vigencia está distanciada en el tiempo y en el espacio, tienen en común su relación con la agricultura.Fundación Museo La Plat

El Mar Muerto : Un mar insólito

Varios son los motivos que justifican este calificativo que atribuimos al Mar Muerto. Por definición, insólito es “desacostumbrado, no común ni ordinario” que precisamente es el caso presente, cuando consideramos entre otras cosas, su ubicación altimétrica, la concentración salina de sus aguas, la ausencia de vida en su seno. A ello debemos agregar la presencia en su vecindad de numerosos lugares que rememoran hechos importantes que ocurrieron allí a lo largo de la historia o que las tradiciones ubican en ese lugar. Todo lo anterior confiere a este accidente geográfico un interés especial que justifica dediquemos nuestra atención.Fundación Museo La Plat

El Mar Muerto : Un mar insólito

Varios son los motivos que justifican este calificativo que atribuimos al Mar Muerto. Por definición, insólito es “desacostumbrado, no común ni ordinario” que precisamente es el caso presente, cuando consideramos entre otras cosas, su ubicación altimétrica, la concentración salina de sus aguas, la ausencia de vida en su seno. A ello debemos agregar la presencia en su vecindad de numerosos lugares que rememoran hechos importantes que ocurrieron allí a lo largo de la historia o que las tradiciones ubican en ese lugar. Todo lo anterior confiere a este accidente geográfico un interés especial que justifica dediquemos nuestra atención.Fundación Museo La Plat

Analysis of optical magnetoelectric effect in GaFeO_3

We study the optical absorption spectra in a polar ferrimagnet GaFeO_3. We consider the E1, E2 and M1 processes on Fe atoms. It is shown that the magnetoelectric effect on the absorption spectra arises from the E1-M1 interference process through the hybridization between the 4p and 3d states in the noncentrosymmetry environment of Fe atoms. We perform a microscopic calculation of the spectra on a cluster model of FeO_6 consisting of an octahedron of O atoms and an Fe atom displaced from the center with reasonable values for Coulomb interaction and hybridization. We obtain the magnetoelectric spectra, which depend on the direction of magnetization, as a function of photon energy in the optical region 1.0-2.5 eV, in agreement with the experiment.Comment: 18 pages, 5 figure