Pacifica: Poetry International: Revolutions in Tunisian Poetry

A collection of contemporary poetry from Tunisia, including poems in translation with their French and Arabic original texts

The evolving SARS-CoV-2 epidemic in Africa: Insights from rapidly expanding genomic surveillance

INTRODUCTION Investment in Africa over the past year with regard to severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) sequencing has led to a massive increase in the number of sequences, which, to date, exceeds 100,000 sequences generated to track the pandemic on the continent. These sequences have profoundly affected how public health officials in Africa have navigated the COVID-19 pandemic. RATIONALE We demonstrate how the first 100,000 SARS-CoV-2 sequences from Africa have helped monitor the epidemic on the continent, how genomic surveillance expanded over the course of the pandemic, and how we adapted our sequencing methods to deal with an evolving virus. Finally, we also examine how viral lineages have spread across the continent in a phylogeographic framework to gain insights into the underlying temporal and spatial transmission dynamics for several variants of concern (VOCs). RESULTS Our results indicate that the number of countries in Africa that can sequence the virus within their own borders is growing and that this is coupled with a shorter turnaround time from the time of sampling to sequence submission. Ongoing evolution necessitated the continual updating of primer sets, and, as a result, eight primer sets were designed in tandem with viral evolution and used to ensure effective sequencing of the virus. The pandemic unfolded through multiple waves of infection that were each driven by distinct genetic lineages, with B.1-like ancestral strains associated with the first pandemic wave of infections in 2020. Successive waves on the continent were fueled by different VOCs, with Alpha and Beta cocirculating in distinct spatial patterns during the second wave and Delta and Omicron affecting the whole continent during the third and fourth waves, respectively. Phylogeographic reconstruction points toward distinct differences in viral importation and exportation patterns associated with the Alpha, Beta, Delta, and Omicron variants and subvariants, when considering both Africa versus the rest of the world and viral dissemination within the continent. Our epidemiological and phylogenetic inferences therefore underscore the heterogeneous nature of the pandemic on the continent and highlight key insights and challenges, for instance, recognizing the limitations of low testing proportions. We also highlight the early warning capacity that genomic surveillance in Africa has had for the rest of the world with the detection of new lineages and variants, the most recent being the characterization of various Omicron subvariants. CONCLUSION Sustained investment for diagnostics and genomic surveillance in Africa is needed as the virus continues to evolve. This is important not only to help combat SARS-CoV-2 on the continent but also because it can be used as a platform to help address the many emerging and reemerging infectious disease threats in Africa. In particular, capacity building for local sequencing within countries or within the continent should be prioritized because this is generally associated with shorter turnaround times, providing the most benefit to local public health authorities tasked with pandemic response and mitigation and allowing for the fastest reaction to localized outbreaks. These investments are crucial for pandemic preparedness and response and will serve the health of the continent well into the 21st century

Caractérisation des matorrals et des garrigues à Urginea pancration Phil. dans le Djebel Tessala (Algérie occidentale)

Une caractérisation des biotopes occupés actuellement par Urginea pancration (Steinh.) Phil. dans le Djebel Tessala entre 700 et 1000 m d'altitude est présentée. Douze parcelles ont été étudiées selon 14 paramètres écologiques dont la pente, l'exposition, l'altitude, le type de sol… Cette étude a permis de définir l'habitat biologique et édaphique de cette plante et de connaître la richesse floristique des stations qu'elle occupe sur le Djebel Tessala.Les résultats obtenus montrent qu'elle tient une place d'autant plus importante dans les matorrals et les garrigues que les conditions édaphiques sont difficiles et que la dégradation du couvert végétal est poussée.A characterization of habitats currently occupied by Urginea pancration (Steinh.) Phil. in Tessala Mounts between 700 and 1000 m of altitude is presented. Twelve plots were studied according to 14 ecological parameters of which slope, exposure, altitude, soil type…This study permitted to define the biological and edaphic habitat of this plant and to show the floristic richness of the sites which it occupies in Tessala Mounts. The obtained results show that it takes up a place more important in the matorral and scrubland when soil conditions are harsh and that the degradation of vegetation cover is important

Copépodes, Cladocères et Rotifères du lac Sidi M'hamed Benali (Algérie Nord-Occidentale)

En 2008, 33 espèces de Cladocères, Copépodes et Rotifères ont été observées dans le lac Sidi M'hamed Benali (contre 12 seulement en 1992).Les Copépodes dominent en mars, avril, juillet, août et septembre, avec respectivement des dominances (Do) égales à : 56,6 %, 55,0 %, 55,0 %, 46,4 % et 90,0 %. Les Cladocères dominent en février (Do = 37,2 %), mai (Do = 47,4 %) et décembre (Do = 48,6 %). Les Rotifères sont extrêmement abondants et présentent une large dominance en janvier (Do = 95,3 %). La population zooplanctonique est très faible en juillet et en août. Au cours de l'année le peuplement varie en fonction de la température, des conditions hydrologiques, de l'abondance de la nourriture et de la prédation par les poissons.In 2008, 33 species of Cladocers, Copepods and Rotifers have been observed in Sidi M’hamed Benali Lake (against only 12 species in 1992). The Copepods dominate in March, April, July, August and September, respectively with dominance (Do) equal to 56.6 %, 55.0 %, 55.0 %, 46.4 % and 90.0 %. Cladocers dominated in February (Do = 37.2 %), May (Do = 47.4 %) and December (Do = 48.6 %). The rotifers are extremely abundant and have a wide dominance in January (Do = 95.3%). The zooplankton population is very low in July and August. During the year, the population varies with temperature, water conditions, abundance of food and predation by fishes

Caractérisation et valorisation des polysaccharides pariétaux d’Urginea pancration (Steinh) Phil. de Djebel Tessala (Nord-Ouest Algérien)

As part in valorization of Mediterranean plant species, we have study the variation composition of cell wall polysaccharides of Urginea pancration (Steinh.) Phil. contained in the bulb and foliage.The results of this study reveal a wealth of cellulose from an average of 68.40% and pectin with an average of 11%.The study of the saccharide composition of cellulose by thin layer chromatography revealed the presence of glucose as sugar majority and traces of xylose in both parties analyzed of the species. For hemicelluloses, it indicates the presence of xylose, arabinose and glucose in the leaves, by cons in the bulbs they are composed only of xylose and glucose.Dans le cadre de la valorisation des espèces végétales méditerranéennes, nous avons mené une étude sur la variation de la composition en polysaccharides pariétaux d’Urginea pancration (Steinh.) Phil. contenus dans le bulbe et dans le feuillage. Les résultats de cette étude révèlent une richesse en cellulose d’une moyenne de 68,40% et en pectines avec une moyenne de 11%. L’étude de la composition osidique de la cellulose par Chromatographie sur couches minces révèle la présence du glucose comme sucre majoritaire et quelques traces de xylose dans les deux parties analysées de l’espèce. Pour les hémicelluloses, elle indique la présence de xylose, d’arabinose et de glucose dans les feuilles, par contre dans les bulbes elles ne sont composées que de xylose et de glucose

Habitat characterisation for the threatened geophyte (Tulipa sylvestris L.) in the forest of Bouhriz (west Algeria)

Ce travail consiste à évaluer l’habitat naturel et écologique de Tulipa sylvestris L. espèce menacée et rare, localisée dans la forêt de Bouhriz (région de Sidi Bel Abbes). Pour cela, quatre stations réparties dans la partie Sud, Sud-est et Nord-est de la forêt ont été choisies en fonction de la présence des géophytes, sur lesquels des prélèvements du sol étaient analysés et des relevés floristiques ont été effectués. En effet, Tulipa sylvestris L. est localisée dans la partie Sud (station 3 uniquement), les résultats pédologiques ont montré que l’espèce est liée à une texture limono-sableuse, peut humide et un pH légèrement alcalin, moyennement riche en matière organique avec un sol modérément calcaire. L’analyse floristique et statistique par l’analyse factorielle des correspondances (AFC) indiquent une importante richesse de l’ordre de 50 taxons soumis à une forte thérophytisation, un indice de perturbation élevé, justifiant ainsi la rareté et la vulnérabilité de Tulipa sylvestris L. dû essentiellement à l’action anthropique et au surpâturage associé aux incendies

Caractérisation de l’habitat naturel d’une espèce de géophyte menacée (Tulipa sylvestris L.) dans la fôret de Bouhriz (ouest Algérien)

AbstractHabitat characterisation for the threatened geophyte (Tulipa sylvestris L.) in the forest of Bouhriz (west Algeria)This work consists to evaluate the natural and ecological habitat of the threatened and rare species Tulipa sylvestris L., located in Bouhriz forest (Sidi Bel Abbes region). For this, four stations distributed in the South, South-East and North-East of the forest were chosen according to the presence of the geophytes, on which soil samples were analyzed and floristic surveys were carried out. Indeed, the Tulipa sylvestris was located in the southern part (station 3 only), soil results have shown that the species is associated with a sandy loam-sandy texture and a slightly alkaline pH, moderately rich in organic matter with a moderately calcareous soil. The floristic and statistical analysis by the correspondence factorial analysis (CFA) indicates an important richness of the order of 50 taxons subjected a strong therophytisation, an index of high perturbation, justifying thus the rarity and the vulnerability of Tulipa sylvestris L. due mainly to human activity and overgrazing associated with fires.Key words: Tulipa sylvestris L, Bouhriz forest, Algeria, anthropization. RésuméCe travail consiste à évaluer l’habitat naturel et écologique de Tulipa sylvestrisL. espèce menacée et rare, localisée dans la forêt de Bouhriz (région de Sidi Bel Abbes). Pour cela, quatre stations réparties dans la partie Sud, Sud-est et Nord-est de la forêt ont été choisies en fonction de la présence des géophytes, sur lesquels des prélèvements du sol étaient analysés et des relevés floristiques ont été effectués. En effet, Tulipa sylvestris L. est localisée dans la partie Sud (station 3 uniquement), les résultats pédologiques ont montré que l’espèce est liée à une texture limono-sableuse, peut humide et un pH légèrement alcalin, moyennement riche en matière organique avec un sol modérément calcaire. L’analyse floristique et statistique par l’analyse factorielle des correspondances (AFC) indiquent une importante richesse de l’ordre de 50 taxons soumis à une forte thérophytisation, un indice de perturbation élevé, justifiant ainsi la rareté et la vulnérabilité de Tulipa sylvestris L. dû essentiellement à l’action anthropique et au surpâturage associé aux incendies. Mots-clés: Tulipa sylvestris L., foret Bouhriz, Algérie, anthropisation.AbstractHabitat characterisation for the threatened geophyte (Tulipa sylvestris L.) in the forest of Bouhriz (west Algeria)This work consists to evaluate the natural and ecological habitat of the threatened and rare species Tulipa sylvestris L., located in Bouhriz forest (Sidi Bel Abbes region). For this, four stations distributed in the South, South-East and North-East of the forest were chosen according to the presence of the geophytes, on which soil samples were analyzed and floristic surveys were carried out. Indeed, the Tulipa sylvestris was located in the southern part (station 3 only), soil results have shown that the species is associated with a sandy loam-sandy texture and a slightly alkaline pH, moderately rich in organic matter with a moderately calcareous soil. The floristic and statistical analysis by the correspondence factorial analysis (CFA) indicates an important richness of the order of 50 taxons subjected a strong therophytisation, an index of high perturbation, justifying thus the rarity and the vulnerability of Tulipa sylvestris L. due mainly to human activity and overgrazing associated with fires.Key words: Tulipa sylvestris L, Bouhriz forest, Algeria, anthropization. RésuméCe travail consiste à évaluer l’habitat naturel et écologique de Tulipa sylvestrisL. espèce menacée et rare, localisée dans la forêt de Bouhriz (région de Sidi Bel Abbes). Pour cela, quatre stations réparties dans la partie Sud, Sud-est et Nord-est de la forêt ont été choisies en fonction de la présence des géophytes, sur lesquels des prélèvements du sol étaient analysés et des relevés floristiques ont été effectués. En effet, Tulipa sylvestris L. est localisée dans la partie Sud (station 3 uniquement), les résultats pédologiques ont montré que l’espèce est liée à une texture limono-sableuse, peut humide et un pH légèrement alcalin, moyennement riche en matière organique avec un sol modérément calcaire. L’analyse floristique et statistique par l’analyse factorielle des correspondances (AFC) indiquent une importante richesse de l’ordre de 50 taxons soumis à une forte thérophytisation, un indice de perturbation élevé, justifiant ainsi la rareté et la vulnérabilité de Tulipa sylvestris L. dû essentiellement à l’action anthropique et au surpâturage associé aux incendies. Mots-clés: Tulipa sylvestris L., foret Bouhriz, Algérie, anthropisation