Comparative study of three different procedures for RNA extraction from formalin-fixed paraffin-embedded samples

INTRODUÇÃO: O desenvolvimento de métodos de extração de RNA a partir de amostras fixadas em formalina e embebidas em parafina (FFEP) possibilitou estudos retrospectivos de biologia molecular. Objetivos: Comparar a quantidade e a qualidade do RNA extraído de amostras FFEP a partir de três kits disponíveis comercialmente. MATERIAL E MÉTODO: Utilizando-se três diferentes procedimentos, o RNA total foi extraído de 14 blocos de parafina contendo fragmentos de carcinomas mamários, todos arquivados há 10 anos. A quantidade do RNA foi expressa em pg/µl; e a qualidade, pelo número de integridade do RNA (NIR), utilizando-se o Bioanalyzer da Agilent com o Pico LabChip. O RNA de maior NIR extraído de cada uma das 14 amostras foi amplificado por reação em cadeia da polimerase com transcrição reversa (RT-PCR) utilizando-se o gene G6PD, com primers designados para gerar fragmentos de 67, 151 e 242 pares de bases (pb). RESULTADOS: A média e a mediana da quantidade do RNA extraído para os três protocolos foram, respectivamente, 42,91 e 31,31 pg/µl. A média e a mediana do NIR foram, respectivamente, 1,8 e 2. Em todas as amostras, o gene G6PD foi amplificado para fragmentos de RNA de 67 e 151 pb. DISCUSSÃO: Como houve grande variação individual na quantidade e na qualidade do RNA extraído para cada amostra, os dados do presente estudo indicam que, se não for possível extrair RNA de uma determinada amostra na primeira tentativa, uma segunda extração deve ser realizada antes de se descartar essa amostra para testes de biologia molecular. CONCLUSÕES: Nos três procedimentos utilizados foi possível extrair RNA de qualidade aceitável para amplificação por RT-PCR (com NIR > 1,4).BACKGROUND: The development of methods for RNA extraction from formalin-fixed paraffin-embedded (FFPE) samples has allowed retrospective studies of molecular biology. OBJECTIVES: To compare the quantity and quality of RNA extracted from FFPE samples using three commercially available kits. Material and methods: Using three different procedures, the total RNA was extracted from 14 paraffin blocks containing fragments of mammary carcinomas, which had been archived for 10 years. The quantity of RNA was expressed in pg/µl; and the quality in RNA integrity number (RIN), by using the Agilent Bioanalyser with Pico LabChip. The RNA with higher RIN extracted from each of the 14 samples was amplified by reverse transcriptase-polymerase chain reaction (RT-PCR) using the G6PD gene with primers designed to create fragments with 67, 151 and 242 base pairs (bp). RESULTS: The mean and median of RNA quantity extracted for the three procedures were respectively 42.91 and 31.31 pg/µl. The mean and median of RIN were respectively 1.8 and 2. In all the samples, the G6PD gene was amplified for RNA fragments with 67 and 151 bp. DISCUSSION: Due to the significant individual variation in quantity and quality of the extracted RNA from each sample, the data from the present study show that, if it is not possible to extract RNA from a given sample in the first attempt, a second extraction should be performed before excluding this sample. CONCLUSION: It was possible to extract RNA with acceptable quality for amplification by RT-PCR (RIN > 1.4) in the three procedures used.Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES

PROYECTO DE MODIFICACIÓN DEL ARTÍCULO 15 DEL REGLAMENTO DE INSCRIPCIÓN DE REGISTRO DE PREDIOS PARA DOTAR MAYOR EFICACIA A LA PRESUNCIÓN DE GANANCIALIDAD

Se plantea la modificación del artículo 15 del Reglamento de Inscripción de Registro de Predios para dotar mayor eficacia a la presunción de ganancialidad, debido a que es un acto rectificatorio y tiene como propósito otorgarle la calidad de bien social a un bien que se publicitó como propio; pero que esta rectificación, solo se formalice con el acta certificada de matrimonio, es por ello que se propone un proyecto de ley que modifique el articulo señalado, referente al título (partida de matrimonio) como único título que acredita fehaciente e indubitablemente la presunción de ganancialidad, sin necesidad de escritura pública y otros documentos; teniendo en cuenta que solo y únicamente se trata de rectificar un acto ya inscrito, que brinda como garantía y seguridad jurídica, toda vez que la sociedad conyugal este facultado para proteger los intereses de familia como un derecho consagrado constitucional. También conlleva este estudio un análisis económico, desde un enfoque costo - beneficio, de que el patrimonio se convierta en un bien social y no pueda ser transferido como bien propio a terceros.Tesi

Multi-year, post-harvesting impact assessment in a neotropical secondary Atlantic Forest

Subject to overexploitation in the past centuries, the Atlantic Forest is subject to very rigorous protection rules. However, the law is a controversial issue since landowners are not compensated for the limited choice of land use possibilities. We believe that, alternatively to a general timber harvest ban, sustainable forest management of the Atlantic Forest has the potential to generate income for the landowners while sustaining important ecological functions of the forest. Such choice would require better understanding of the potential effects of timber harvesting on the forest ecosystem and on species composition and succession over time. In this context, we assessed the harvesting impact of a conventional harvesting method (CM) and compared it to an alternative harvesting method (AM) in three different stands (stands A, B and C) of a secondary forest fragment in southern Brazil. Results from three comprehensive forest inventories over a period of two years were used to assess the timber harvesting impact. Measurements of species composition (i.e., number of species, life form, ecological group), forest structure (i.e., density, basal area, DBH, volume) and saplings density formed the basis of the impact assessment. The inventories were carried out before, immediately after and two years after harvesting. Intensities of damage on remnant trees immediately after harvesting and two years after harvesting were also measured. Before harvesting, a total of 114 tree species (trees, tree fern and palm tree) belonging to 49 families were identified in the study site’s three research stands. Palm trees and secondary species, such as Euterpe edulis, represented the majority of recruited individuals (DBH ≥ 5 cm) two years after harvesting. However, new saplings (DBH ≤ 5 cm) after two years were mainly pioneer woody tree species, such as Cecropia glaziovii and Schizolobium parahyba. On average, AM reduced damage to saplings by 5%. Most of the damages caused by CM were moderate to severe, while AM caused light to moderate damages. Binary logistic regression indicated dependency of the mortality rates on the independent variables “stand, stem and leaning damages.” On the other hand, the recovery rates of damaged trees were dependent on crown, stem and leaning damages. Therefore, two years after harvesting a higher mortality rate of low-dimensional trees was observed in stands with high density of smaller trees and high density of improvement felling. Although crown damages were not related to mortality rates, high intensity of crown damages reduced recovery rates over time.publishedVersio

Avaliação da automedicação entre estudantes de medicina de uma instituição de ensino de Alagoas

O uso medicamentoso de substâncias químicas na sociedade moderna tem crescido gradativamente. Nesse contexto, a prática de automedicação por profissionais e acadêmicos da área de saúde tem sido cada vez mais frequente, levando a uma preocupação quando se avalia o consumo abusivo de psicofármacos. A partir dessa problemática, relevante à saúde pública, se faz importante desenvolver meios e métodos que possam orientar com cautela sobre os riscos do uso indiscriminado de medicamentos. Objetivo: Avaliar a prática de automedicação e as particularidades atribuídas a ela entre estudantes de medicina de uma instituição de ensino superior. Metodologia: trata-se de um estudo descritivo do tipo transversal com abordagem quantitativa realizado no Centro Universitário CESMAC através de questionários aplicados aos acadêmicos de medicina. Das 9 turmas disponíveis para realização da pesquisa, todas tiveram os dados coletados e seus resultados interpretados a partir de bancos de dados criados utilizando o programa Microsoft Office Excel. Resultados e Discussões: 280 voluntários relataram fazer uso de automedicação, sendo essa representada em sua maior parte pelos anti-inflamatórios e apenas 4 pessoas alegaram se utilizar o metilfenidato por conta própria antes das provas. Conclusão: É evidente que o hábito de automedicação de maneira inadequada acarreta em consequências indesejáveis e no mascaramento de doenças evolutivas, o que se configura, portanto, em uma atividade a ser prevenida, assim como a utilização racional de medicamentos e a recomendação de profissional especializado devem ser enfatizadas.The drug use of chemicals in modern society has gradually grown. In this context, the practice of self-medication by professionals and academics in the health field has been increasingly frequent, leading to a concern when evaluating abusive use of psychoactive drugs. From this problematic, relevant to Public Health, it is important to develop ways and methods that can guide carefully the indiscriminate use of medicines. Objective: Evaluate the practice of self-medication and the particularities attributed to it among medical students of a higher education institution. This is a cross-sectional descriptive study with a quantitative approach carried out at CESMAC University Center through questionnaires applied to medical students. Of the 9 groups available to perform the research, all had the data collected and their results interpreted from databases created using the Microsoft Office Excel program. Results: 280 volunteers reported using self-medication, which was mostly anti-inflammatory and only 4 people reported using methylphenidate on their own before the tests. Conclusion: It is evident that the habit of self-medication improperly entails undesirable consequences and in masking of evolutionary diseases, which is, therefore, an activity to be prevented, as well as the rational use of medicines and the recommendation of a specialized professional should be emphasized

O Largo da Banana e a presença negra em São Paulo

The Largo da Banana relates to the history of the black population in São Paulo. Acknowledged as one of São Paulo’s “cradle” of samba, samba musicians are its main spokespersons. Largo da Banana used to be located near the former Barra Funda Railway Station. From the first decades to around half the Twentieth century, informal laborers in the railway logistics used to gather together in that space. Within a precarious and unsteady daily life, they used to play samba and tiririca. In the fifties, the municipality built the Pacaembu Viaduct in that area, aiming to extend the homonym avenue beyond the railway road. In the sixties, samba musician Geraldo Filme wrote two songs in which he paid homage to Largo da Banana and regrettedits disappearance after the viaduct’s inauguration. In these and other of his songs, the artist recorded his perceptions on the life conditions of São Paulo’s blacks and samba musicians, their sociabilities, and also the urban changes he witnessed. Considering that his artistic work contributes to enlighten aspects of social reality, I analyze some of his songs to interpret the sociabilities at Largo da Banana, as well as the urban intervention in that location.O Largo da Banana está associado à história da população negra em São Paulo. Reconhecido como um dos “berços” do samba paulista, é sobretudo através dos próprios sambistas que essa história pode hoje ser conhecida. Localizado junto à antiga estação da Barra Funda, desde as primeiras décadas até meados do século passado, aquele espaço concentrou trabalhadores informais vinculados às atividades da ferrovia. Em meio a um cotidiano precário e instável, essa população realizava rodas de samba e de tiririca. Nos anos 1950, foi construído naquele local o Viaduto Pacaembu, que prolongava a avenida homônima para além davia férrea. A partir da década de 1960, o sambista negro Geraldo Filme compôs duas canções em que homenageava o Largo da Banana e lamentava seu desaparecimento após a inauguração do viaduto. Nessas e em outras composições, o artista registrou suas percepções sobre as condições de vida da população negra e sambista na cidade, suas sociabilidades, bem como sobre as transformações urbanas que testemunhou. Considerando que sua obra artística contribui para iluminar aspectos da realidade social, ela é adotada como fonte para analisar as formas de sociabilidade no Largo da Banana e a intervenção urbanística naquele local

Proyecto de modificación del artículo 15 del reglamento de inscripción de registro de predios para dotar mayor eficacia a la presunción de ganancialidad

Se plantea la modificación del artículo 15 del Reglamento de Inscripción de Registro de Predios para dotar mayor eficacia a la presunción de ganancialidad, debido a que es un acto rectificatorio y tiene como propósito otorgarle la calidad de bien social a un bien que se publicitó como propio; pero que esta rectificación, solo se formalice con el acta certificada de matrimonio, es por ello que se propone un proyecto de ley que modifique el articulo señalado, referente al título (partida de matrimonio) como único título que acredita fehaciente e indubitablemente la presunción de ganancialidad, sin necesidad de escritura pública y otros documentos; teniendo en cuenta que solo y únicamente se trata de rectificar un acto ya inscrito, que brinda como garantía y seguridad jurídica, toda vez que la sociedad conyugal este facultado para proteger los intereses de familia como un derecho consagrado constitucional. También conlleva este estudio un análisis económico, desde un enfoque costo - beneficio, de que el patrimonio se convierta en un bien social y no pueda ser transferido como bien propio a terceros.Tesi