Assessment of genetic relationship in Persea spp by traditional molecular markers

Currently, the reclassification of the genus Persea is under discussion with molecular techniques for DNA analysis representing an alternative for inter- and intra-specific differentiation. In the present study, the traditional random-amplified polymorphic DNA (RAPD) and the inter simple sequence repeat (ISSR) markers were used to determine the genomic relationship of different species and hybrids representative of the subgenera Eriodaphne and Persea in a population conserved in a germplasm bank. The data were analyzed statistically using multivariate methods. In the RAPD analysis, a total of 190 polymorphic bands were produced, with an average of 23.7 bands per primer, the percentage contribution of each primer was from 7.66 to 19.63; the polymorphic information content (PIC) ranged from 0.23 to 0.45, with an average of 0.35. In the ISSR analysis, a total of 111 polymorphic bands were considered, with an average of 18.5 bands per primer, the percentage contribution of each was from 11.83 to 19.57; the PIC ranged from 0.35 to 0.48, with an average of 0.42. The phenograms obtained in each technique showed the relationship among the accessions through the clusters formed. In general, J.C. Reyes-Alemán et al. 2 Genetics and Molecular Research 15 (2): gmr.15027359 ©FUNPEC-RP www.funpecrp.com.br both the techniques grouped representatives of the Persea americana races (P. americana var. drymifolia, P. americana var. guatemalensis, and P. americana var. americana). However, it was not possible to separate the species of Persea used as reference into independent clades. In addition, they tended to separate the representatives of subgenera Eriodaphne and Persea

Determinación de tamaño de muestra de características del xilema de brote de aguacate mediante remuestreo

The objective of this work was to determine the suitable sample size, to detect statistical differences in the analysis of variance of xylem characters, in annual shoots of avocado trees. For this, xylem characters of three trees with contrasting height were registered for frequency, area, perimeter and diameter of xylem vessels. Starting from 50 observations from each tree, a total of 5.000 non parametric bootstraps were done for each of the replicates from 2 to 50 microscopic fields. Starting from a sample size of 15 replicates, the deviations in the five statistical estimates are minimal, so it is proposed as the minimum for sampling the mentioned variables.The objective of this work was to determine the suitable sample size, to detect statistical differences in the analysis of variance of xylem characters, in annual shoots of avocado trees. For this, xylem characters of three trees with contrasting height were registered for frequency, area, perimeter and diameter of xylem vessels. Starting from 50 observations from each tree, a total of 5.000 non parametric bootstraps were done for each of the replicates from 2 to 50 microscopic fields. Starting from a sample size of 15 replicates, the deviations in the five statistical estimates are minimal, so it is proposed as the minimum for sampling the mentioned variables.El propósito de este trabajo fue determinar el tamaño de muestra adecuado, para detectar diferencias estadísticas en análisis de varianza de los caracteres de xilema, en brotes anuales de aguacate. Para esto, fueron registradas en tres árboles con altura contrastante las variables frecuencia, área, perímetro y diámetro de los vasos del xilema. A partir de 50 observaciones de cada árbol, se realizaron 5.000 remuestreos no paramétricos, para cada repetición de 2 a 50 campos microscópicos. A partir del tamaño de muestra de 15 repeticiones, las desviaciones en los cinco estadísticos son mínimas, por lo que se propone como el mínimo para el muestreo de dichas variables

Variabilidad anatómica de los sistemas de conducción y estomático de genotipos de Prunus spp. de diferentes orígenes

The aim of this research was to study the relationships between environmental humidity availability and the anatomical characteristics of water conduction and stomatal systems, in five Mexican peach genotypes with different origins (Jalatzingo and Misantla, Veracruz; Temascaltepec, México; Tulancingo, Oaxaca; Sombrerete, Zacatecas), one almond and Nemaguard rootstock. Shoots, leaves and stomata of six months old plants were anatomically characterized by means of 25 characters. The almond tree and the rootstock Nemaguard showed differences in relation to the peaches, which had higher similarity, although they maintained a separation according to their origin. Groups were differentiated by the following characters: stomatal density; width of the leaf upper epidermis; number, frequency and perimeter of xylem vessels; and the index of vulnerability of the leaf central vein, pith, xylem and phloem percentage of the shoot. The conditions of humidity availability of their origin showed strong association with the studied anatomical characteristics, because the environment with more deficit of humidity (Tulancingo and Sombrerete) showed plants with bigger size and smaller frequency of vessels of xylem, as well as low xylem and phloem percentage in shoot, which can be interpreted as resistance adaptations to drought. The area where the occurrence of drought (Jalatzingo) is rare showed the opposite characteristics.The aim of this research was to study the relationships between environmental humidity availability and the anatomical characteristics of water conduction and stomatal systems, in five Mexican peach genotypes with different origins (Jalatzingo and Misantla, Veracruz; Temascaltepec, México; Tulancingo, Oaxaca; Sombrerete, Zacatecas), one almond and Nemaguard rootstock. Shoots, leaves and stomata of six months old plants were anatomically characterized by means of 25 characters. The almond tree and the rootstock Nemaguard showed differences in relation to the peaches, which had higher similarity, although they maintained a separation according to their origin. Groups were differentiated by the following characters: stomatal density; width of the leaf upper epidermis; number, frequency and perimeter of xylem vessels; and the index of vulnerability of the leaf central vein, pith, xylem and phloem percentage of the shoot. The conditions of humidity availability of their origin showed strong association with the studied anatomical characteristics, because the environment with more deficit of humidity (Tulancingo and Sombrerete) showed plants with bigger size and smaller frequency of vessels of xylem, as well as low xylem and phloem percentage in shoot, which can be interpreted as resistance adaptations to drought. The area where the occurrence of drought (Jalatzingo) is rare showed the opposite characteristics.El propósito de esta investigación fue estudiar las relaciones ambientales de disponibilidad de humedad, con las características anatómicas del sistema de conducción de agua y estomático, en cinco genotipos de duraznos mexicanos con diferentes orígenes (Jalatzingo y Misantla, Veracruz; Temascaltepec, México; Tulancingo, Oaxaca; Sombrerete, Zacatecas), un almendro y el portainjerto Nemaguard. Fueron caracterizados anatómicamente brotes, hojas y estomas de plántulas de seis meses de edad, mediante 25 caracteres. El almendro y el portainjerto Nemaguard presentaron diferencias con respecto a los duraznos, los cuales tuvieron mayor similitud, aunque mantuvieron una separación acorde con su origen. Los caracteres que diferenciaron los grupos fueron: densidad estomática, grosor de la epidermis superior, número, frecuencia y perímetro de vasos, el índice de vulnerabilidad de la nervadura central, y el porcentaje de médula, xilema y floema del brote. Las condiciones de disponibilidad de humedad del origen presentaron fuerte asociación con las características anatómicas estudiadas, debido a que los ambientes con mayor déficit de humedad (Tulancingo y Sombrerete) presentaron mayor tamaño y menor frecuencia de vasos de xilema, así como bajo porcentaje de xilema y floema en brote, lo que puede interpretarse como adaptaciones de resistencia a sequía. La zona donde es rara la ocurrencia de sequía (Jalatzingo) presentó características opuestas

La vid silvestre en México. Actualidades y potencial

En ocho capítulos se aborda el estado del arte de la vid silvestre en MéxicoEl estudio de las especies vegetales nativas de México representa un reto que cada día más investigadores mexicanos asumen. Durante muchos años, el apoyo a la investigación pública ha sido mínimo; desde el punto de vista agronómico es insuficiente para avanzar a la velocidad que requiere nuestro país para afrontar problemas de producción y distribución de alimentos. Por esa razón, entre otras, me es grato presentar esta obra que compila parte de los trabajos de la Red de Vid Silvestre patrocinada por el Sistema Nacional de Recursos Fitogenéticos (sinarefi) dependiente de la sagarpa; trabajos apuntalados por investigadores que sin pertenecer a la red han colaborado en el estudio de las plantas del género Vitis. En este libro se muestra el potencial del país para aprovechar el recurso vid, empleado desde antes de la conquista española por nativos mexicanos que conocían sus bondades. Es necesario continuar el avance en el conocimiento de este recurso, por ello el presente libro pretende invitar a toda persona interesada en contribuir con el rescate y conservación de las vides mexicanas. Los autores y editores, así como las instituciones en donde laboramos y aquellas que patrocinan estas investigaciones, esperamos se cumpla este objetivo y que el lector, alumno, profesor, investigador, público en general, disfrute esta lectura y, sobre todo, se interese en el recurso VitisSEP, SINAREFI, UAEME

Variabilidad anatómica de los sistemas de conducción y estomático de genotipos de Prunus spp. de diferentes orígenes Anatomical variability of water conduction and stomatal systems in genotypes of Prunus spp. of different origins

El propósito de esta investigación fue estudiar las relaciones ambientales de disponibilidad de humedad, con las características anatómicas del sistema de conducción de agua y estomático, en cinco genotipos de duraznos mexicanos con diferentes orígenes (Jalatzingo y Misantla, Veracruz; Temascaltepec, México; Tulancingo, Oaxaca; Sombrerete, Zacatecas), un almendro y el portainjerto Nemaguard. Fueron caracterizados anatómicamente brotes, hojas y estomas de plántulas de seis meses de edad, mediante 25 caracteres. El almendro y el portainjerto Nemaguard presentaron diferencias con respecto a los duraznos, los cuales tuvieron mayor similitud, aunque mantuvieron una separación acorde con su origen. Los caracteres que diferenciaron los grupos fueron: densidad estomática, grosor de la epidermis superior, número, frecuencia y perímetro de vasos, el índice de vulnerabilidad de la nervadura central, y el porcentaje de médula, xilema y floema del brote. Las condiciones de disponibilidad de humedad del origen presentaron fuerte asociación con las características anatómicas estudiadas, debido a que los ambientes con mayor déficit de humedad (Tulancingo y Sombrerete) presentaron mayor tamaño y menor frecuencia de vasos de xilema, así como bajo porcentaje de xilema y floema en brote, lo que puede interpretarse como adaptaciones de resistencia a sequía. La zona donde es rara la ocurrencia de sequía (Jalatzingo) presentó características opuestas.The aim of this research was to study the relationships between environmental humidity availability and the anatomical characteristics of water conduction and stomatal systems, in five Mexican peach genotypes with different origins (Jalatzingo and Misantla, Veracruz; Temascaltepec, México; Tulancingo, Oaxaca; Sombrerete, Zacatecas), one almond and Nemaguard rootstock. Shoots, leaves and stomata of six months old plants were anatomically characterized by means of 25 characters. The almond tree and the rootstock Nemaguard showed differences in relation to the peaches, which had higher similarity, although they maintained a separation according to their origin. Groups were differentiated by the following characters: stomatal density; width of the leaf upper epidermis; number, frequency and perimeter of xylem vessels; and the index of vulnerability of the leaf central vein, pith, xylem and phloem percentage of the shoot. The conditions of humidity availability of their origin showed strong association with the studied anatomical characteristics, because the environment with more deficit of humidity (Tulancingo and Sombrerete) showed plants with bigger size and smaller frequency of vessels of xylem, as well as low xylem and phloem percentage in shoot, which can be interpreted as resistance adaptations to drought. The area where the occurrence of drought (Jalatzingo) is rare showed the opposite characteristics

Variación de la región ribosómica nuclear en Crataegus L. del centro y sur de México

This study was conducted at the Universidad Autónoma de Chapingo and concluded in October 2008, to determine the genetic relationships among species of Crataegus fromcentral and southern Mexico. The variation in the sequences of the nuclear ribosomal region was low in all accessions of germplasm of Mexican Crataegus, and the phylogramonly showed separation of the species used as positive controls, but did not show a clear separation of groups of species. However, all accessions had the same pattern of nucleotide substitution and very low values of the distanceof nucleotide composition; thus, Mexican Crataegus species have high genetic relationship among them, but there is alack of evidence to conclude that they are variants of the same taxonomic species. C. nelsoni and C. stipulosa could be a source of genes for C. mexicana because both species,from Chiapas, have the closest relationship with this species,which has the best agronomic characteristics.Este estudio fuerealizado en la Universidad Autónoma Chapingo y concluido en octubre de 2008 y tuvo como objetivo determinar las relaciones genéticas entre especies de Crataegus del centro y sur de México. La variación en las secuencias de la región ribosómica nuclear fue baja en todas las accesiones de germoplasma de Crataegus mexicanos, y el filograma sólomostró separación de las especies usadas como controles positivos, pero no mostró una clara separación de gruposde especies. Sin embargo, todas las accesiones tuvieron un mismo patrón de sustitución de nucleótidos y muy bajos valores en la distancia de composición de nucleótidos; porlo que las especie s mexicanas de Crataegus mostraron altarelación genética, pero falta evidencia para concluir que son variantes de una misma especie taxonómica. C nelsoni y C.stipulosa pueden ser una fuente de genes para C. mexicana porque ambas especies, originarias de Chiapas, tienen la másestrecha relación con esta especie , que es la que presenta las mejores características agronómicas

Variación de la región ribosómica nuclear en Crataegus L. del centro y sur de México.

This study was conducted at the Universidad Autónoma de Chapingo and concluded in October 2008, to determine the genetic relationships among species of Crataegus fromcentral and southern Mexico. The variation in the sequences of the nuclear ribosomal region was low in all accessions of germplasm of Mexican Crataegus, and the phylogramonly showed separation of the species used as positive controls, but did not show a clear separation of groups of species. However, all accessions had the same pattern of nucleotide substitution and very low values of the distanceof nucleotide composition; thus, Mexican Crataegus species have high genetic relationship among them, but there is alack of evidence to conclude that they are variants of the same taxonomic species. C. nelsoni and C. stipulosa could be a source of genes for C. mexicana because both species,from Chiapas, have the closest relationship with this species,which has the best agronomic characteristics.Este estudio fuerealizado en la Universidad Autónoma Chapingo y concluido en octubre de 2008 y tuvo como objetivo determinar las relaciones genéticas entre especies de Crataegus del centro y sur de México. La variación en las secuencias de la región ribosómica nuclear fue baja en todas las accesiones de germoplasma de Crataegus mexicanos, y el filograma sólomostró separación de las especies usadas como controles positivos, pero no mostró una clara separación de gruposde especies. Sin embargo, todas las accesiones tuvieron un mismo patrón de sustitución de nucleótidos y muy bajos valores en la distancia de composición de nucleótidos; porlo que las especie s mexicanas de Crataegus mostraron altarelación genética, pero falta evidencia para concluir que son variantes de una misma especie taxonómica. C nelsoni y C.stipulosa pueden ser una fuente de genes para C. mexicana porque ambas especies, originarias de Chiapas, tienen la másestrecha relación con esta especie , que es la que presenta las mejores características agronómicas