L’Avifaune nidificatrice d’une forêt de chênes pédoncules en bourgogne : étude de deux successions écologiques

Deux types de successions écologiques se développent cycli quement dans les massifs forestiers du Querceto Carpinetum primuletosum de Bourgogne selon l’exploitation forestière en Futaie ou en Taillis-sous-futaie. Nous avons dénombré pendant 9 ans les Passereaux, Picidés et Colombidés nichant dans les divers stades évolutifs des deux successions. Les dénombrements furent effectués par la méthode des IKA couplée avec celle des plans quadrillés, sur 185 échantillons répartis au sein de quelques grands massifs représentent une surface de 6 000 hectares de biotope homogène. 1) Les espèces nicheuses sont, pour la plupart, extrêmement sensibles à la physionomie du peuplement végétal, telle que la déterminent le mode d’exploitation et l’âge de la forêt, à tel point que peu d’entre elles se montrent capables d’habiter une succession d’un bout à l’autre de son évolution. 2) Les dénombrements spécifiques nous montrent des espèces qui ont un preferendum temporaire à un des stades évolutifs et d’autres qui augmentent progressivement jusqu’au climax. Au sein de chaque groupe phvlétique on voit comment les espèces évitent la concurrence en ayant soit des optimums différents soit des limites de tolérances différentes. 3) Beaucoup d’espèces montrent ainsi une préférence pour les jeunes stades initiaux buissonnants (phase à Sylviidés domi nants) et beaucoup d’autres pour les vieux boisements sub-clima- ciques (phase à Paridés dominants), mais très peu trouvent leur optimum dans les hauts buissons ou perchis intermédiaires. 4) Ces préférences spécifiques font que l’abondance totale de l’avifaune évolue selon une courbe à deux maximums séparés par un minimum. Ces deux maximums sont dus respectivement à une avifaune exogène , qui a pu pénétrer nos régions récemment à la suite des défrichements et qui conserve un caractère migra teur, et à Y avifaune endogène sédentaire qui a évolué sur place dans le climax des forêts étudiées. Les stades intermédiaires, créés artificiellement par l’homme, sont trops récents et éphé mères pour avoir permis l’adaptation d’une faune qui leur soit propre et ne conviennent bien à aucune des deux autres faunes. 5) Le nombre d’espèces nicheuses évolue parallèlement à l’abondance totale et il y a une corrélation positive très étroite entre ces deux caractéristiques des avifaunes. 6) La taille moyenne des oiseaux nicheurs augmente du début à la fin des successions. 7) Les avifaunes des deux successions, très différentes au début, montrent de plus en plus de points communs au cours de leur évolution jusqu’à se trouver presque identiques aux derniers stades, où elles représentent une avifaune probablement voisine de celle du climax. 8) Le facteur essentiel de l’abondance totale semble être l 'hétérogénéité du peuplement végétal ; les stades les plus riches en biomasse sont ceux où la physionomie du peuplement est la plus variée, et notamment ceux qui sont capables d’attirer des espèces appartenant aux deux avifaunes précitées. 9) Le sub-climax n’est pas le stade d’abondance ni de diver sité maximales. Par contre, c’est le stade où la taille moyenne des oiseaux est la plus forte et où l’avifaune est la plus sédentaire.Two types of ecological successions develop in semi-natural Quercus pedunculata forests in Burgundy, depending on the type of forestry management undertaken : Shelterwood system (evolving towards High forest) or Coppice-with-standards system. Counts were made over a 9 year period of Passerinæ, Picidæ and Colum- bidæ breeding in the various stages of both successions. A transect method (Kilometric Index Abundance) was used, in conjunction with mapping plots, in 185 different sample areas chosen within a total forest area of 6000 ha. 1) Most breeding species are greatly influenced by vegetation physionomy, as effected by type of exploitation and age of the plot. Few species are capable of colonizing an area throughout the entire time span of a successional sequence. 2) Some species are favoured by a particular succession stage, whilst other species increase in numbers up to the sub-climax. Within each phyletic group, competition pressure is lessened by the different times at which species numbers are at their optimum level and by different tolerance limits to particular successional stages. 3) Many species show a preference for initial low scrub stages (Sylviidæ dominant) and still others for late sub-climax stages (Paridæ dominant). Very few species reach optimum abundance in intermediate high scrub stages (Turdidæ dominant). 4) The curve of total bird numbers follows a wave like form with two peaks of abundance. The first peak is attributable to the influx of exogenous, migratory forms which quickly enter recently cleared areas. The second peak corresponds to endogenous, sedentary forms, living in climax forest areas in the region. Intermediary successional stages, between cleared areas and climax forest, lack a distinct avi-fauna. 5) The number of breeding species parallels, with a high positive correlation, the total bird number. 6) Te mean size of breeding birds increases with the age of the succession. 7) The bird populations of the two successions differ greatly at the start of the successions, but increase in similarity with stand age. In the latter stages of the successions they are practically identical. The faunas at that time closely resemble that associated with the climax. 8) Vegetation heterogeneity is the major factor influencing bird abundance. Highest bird biomasses were recorded when the physionomy of the vegetation showed its greatest variability, thus attracting species belonging to the two groups mentioned above (point 4). 9) In the sub-climax stage, the mean individual size of birds and the proportion of sedentary forms are at their maximal values. On the other hand, neither abundance nor diversity are maximal in this stage

Manipulation and Optical Detection of Colloidal Functional Plasmonic Nanostructures in Microfluidic Systems

The very strong optical resonances of plasmonic nanostructures can be harnessed for sensitive detection of chemical and biomolecular analytes in small volumes. Here we describe an approach towards optical biosensing in microfluidic systems using plasmonic structures (functionalized gold nanoparticles) in colloidal suspension. The plasmonic nanoparticles provide the optical signal, in the form of resonant light scattering or absorption, and the microfluidic environment provides means for selectively manipulating the nanoparticles through fluid dynamics and electric fields. In the first part we discuss recent literature on functionalized colloidal particles and the methods for handling them in microfluidic systems. Then we experimentally address aspects of nanoparticle functionalization, detection through plasmonic resonant light scattering under dark-field illumination and the electrokinetic behavior of the particles under the action of an alternating electric field

A Methodology and Tool for Rapid Prototyping of Data Warehouses using Data Mining: Application to Birds Biodiversity

International audienceData Warehouses (DWs) are large repositories of data aimed at supporting the decision-making process by enabling flexible and interactive analyses via OLAP systems. Rapid prototyping of DWs is necessary when OLAP applications are complex. Some work about the integration of Data Mining and OLAP systems has been done to enhance OLAP operators with mined indicators, and/or to define the DW schema. However, to best of our knowledge, prototyping methods for DWs do not support this kind of integration. Then, in this paper we present a new prototyping methodology for DWs, extending [3], where DM methods are used to define the DW schema. We validate our approach on a real data set concerning bird biodiversity

Gravel pits support waterbird diversity in an urban landscape

We assessed the benefit of 11 gravel pits for the settlement of waterbird communities in an urbanized area lacking natural wetlands. Gravel pits captured 57% of the regional species pool of aquatic birds. We identified 39 species, among which five were regionally rare. We used the Self Organizing Map algorithm to calculate the probabilities of presence of species, and to bring out habitat conditions that predict assemblage patterns. The age of the pits did not correlate with assemblage composition and species richness. There was a positive influence of macrophyte cover on waterbird species richness. Larger pits did not support more species, but species richness increased with connectivity. As alternative wetland habitats, gravel pits are attractive to waterbirds, when they act as stepping stones that ensure connectivity between larger natural and/or artificial wetlands separated in space

Daisy-like crystals: Not just the result of sampling artifact and not only in urine.

peer reviewe

Une méthode pour dénombrer les oiseaux nicheurs

En deux premières saisons (1956 et 1957) d’étude, où nous avons fait 66 dénombrements en 43 sorties, nous avons utilisé pour dénombrer les Oiseaux nicheurs com parativement dans les différents stades du taillis sous futaie, une méthode linéaire qui s’efforce de compter tous les couples nicheurs grâce à une sévère standardisa tion des conditions d’observation. Nous aboutissons à un Indice kilométrique d’ Abondance, qui représente, pour chaque espèce, le nombre de couples nicheurs dans un espace de 1 Km. de long et une largeur égale à la dis tance où l’espèce considérée se fait remarquer de l’obser vateur. Cet indice, qui est proportionnel à la densité, permet d’étudier l’influence des conditions écologiques sur cha que espèce étudiée. Pour apprécier les variations de l’avifaune globale, il faudra multiplier les I.K.A. par un facteur de conver sion, à calculer pour chaque espèce, qui donne la densité réelle

An approach to identify and levels of nesting habitat selection: a cross-scale analysis of Goshawk preferences

Nest site selection may result from diverse agents that work on different spatial scales, and amultilevel analysis can offer a more realistic vision of the search image (proximate factors) and of the scale of nesting habitat selection by a species. Cross-scale analyses of nesting habitat preferences are scarce : in this respect, the Goshawk (Accipiter gentilis) is one of the most intensely investigated species, but most studies have focused only on a single habitat feature. This study, conducted in Burgundy (Eastern France), describes Goshawk nest site preferences by using a multilevel spatial scale analysis (nest tree level, stand level, landscape level), and identifies the habitat level that represents the supposed proximate factor for this species. We identified 57 active Goshawk nest sites (6 .7 active nests/ 100 km2) . The stepwise logistic regression showed that 4 variables of the nest stand structure (high tree dbhs, high crown volumes, high flight space and short distance to trails) and 2 variables of the landscape surrounding nest trees (low avian prey richness for both 100-500 and 501-2000 g classes) were significant predictors of Goshawk nest site selection (98% ofnests correctly reclassified). We hypothesised that Goshawk species choose nest sites on the basis of the overall structural features of the stand, and then focus on a particular nest tree

Les peuplements d'oiseaux indicateurs de l'état de santé des écosystèmes d'eau courante

Extrait de documentRiparian communities of birds are characterized by a large number of species. Among these, some species depend closely on the running water, whereas other species depend on connected wet habitats or linear forests. For fifteen years, we have censused breeding birds on a 2500 km length of river course. The results underlined the importance of (i) the upstream-downstream gradient and (ii) the effects of the landscape characteristics of the valley on the structure of bird communities. In addition, our results showed that landscape structure may be described with a limited number of variables measured from field work or from analyses of satellite data. The bird census method used (IPA, spot abundance index) provided a robust description of the communities, and was presented as a suitable technique to study temporal or spatial bird community successions. We observed that bird censuses were accurate enough to detect environmental perturbations such as changes of land use within the valley or river channelizations. In addition our results showed that using birds as indicator species provided results that did not overlap those obtained using other taxa (fishes, invertebrates, algae), but instead brought complementary informations, particularly at the hydrosystem landscape level. Our initial attempts in the construction of a quality index based on bird communities indicated that separating bird communities for running waters, floodplains and land had more power than a global index.Les cours d'eau et leurs abords abritent des peuplements d'oiseaux abondants et diversifiés, dont les diverses espèces sont liées à l'eau de manières très différentes. Certaines dépendent obligatoirement de l'eau vive, d'autres des milieux humides latéraux, d'autres des cordons de ripisylve ... Des recensements d'oiseaux nicheurs conduits depuis 15 ans sur environ 2500 km de rivières montrent que la structure de leurs peuplements dépend étroitement de leur position longitudinale sur le gradient amont-aval et, transversalement, des éléments du paysage de la vallée. Ces derniers peuvent être décrits à partir d'un petit nombre d'unités paysagères repérables sur le terrain ou sur les données des satellites. La méthode de recensement employée (IPA) donne des résultats fiables et reproductibles, utilisables pour des comparaisons entre rivières ou des suivis temporels. Nous constatons que les peuplements d'oiseaux caractérisent assez fidèlement chaque type de cours d'eau (ou de secteur) et réagissent à divers impacts tels que la chenalisation du lit ou des changements d'occupation des sols dans la vallée. Il semble donc possible de les utiliser comme indicateurs de l'état de santé de l'hydrosystème, en construisant des indices s'appuyant à la fois sur des caractères collectifs du peuplement (nombres d'espèces, abondance ...) et sur certaines guildes ou espèces particulièrement sensibles. Les indications apportées par les oiseaux à l'échelle du paysage fluvial sont complémentaires de celles provenant d'autres taxons (invertébrés, diatomées, poissons). Après une série d'essais, nous envisageons de créer un indice à plusieurs critères distincts, permettant d'évaluer séparément le lit vif (en utilisant les oiseaux aquatiques), le lit inondable (avec les oiseaux typiques des prairies, annexes ou ripisylves) et la vallée à l'échelle du secteur (avec des espèces terrestres à grand rayon de déplacement, ou sensibles à l'urbanisation)

Suivi temporel des oiseaux nicheurs en rivière (programme STORI) : évolution sur 16 années (1991-2006) des communautés de l’Allier.

16 pagesNational audienc

An approach to identify factors and levels of nesting habitat selection: A cross-scale analysis of Goshawk preferences | Kanahaukan pesimäaikanen elinympäristönvalinta Ranskassa: Monimittakaavainen lähestymistapa

Nest site selection may result from diverse agents that work on different spatial scales, and a multilevel analysis can offer a more realistic vision of the search image (proximate factors) and of the scale of nesting habitat selection by a species. Cross-scale analyses of nesting habitat preferences are scarce: in this respect, the Goshawk (Accipiter gentilis) is one of the most intensely investigated species, but most studies have focused only on a single habitat feature. This study, conducted in Burgundy (Eastern France), describes Goshawk nest site preferences by using a multilevel spatial scale analysis (nest tree level, stand level, landscape level), and identifies the habitat level that represents the supposed proximate factor for this species. We identified 57 active Goshawk nest sites (6.7 active nests/100 km2). The stepwise logistic regression showed that 4 variables of the nest stand structure (high tree dbhs, high crown volumes, high flight space and short distance to trails) and 2 variables of the landscape surrounding nest trees (low avian prey richness for both 100-500 and 501-2000 g classes) were significant predictors of Goshawk nest site selection (98% of nests correctly reclassified). We hypothesised that Goshawk species choose nest sites on the basis of the overall structural features of the stand, and then focus on a particular nest tree.Peer Reviewe