Managing ethnic conflict : the menu of institutional engineering

The debate on institutional engineering offers options to manage ethnic and other conflicts. This contribution systematically assesses the logic of these institutional designs and the empirical evidence on their functioning. Generally, institutions can work on ethnic conflict by either accommodating (“consociationalists”) or denying (“integrationists”) ethnicity in politics. Looking at individual and combined institutions (e.g. state structure, electoral system, forms of government), the literature review finds that most designs are theoretically ambivalent and that empirical evidence on their effectiveness is mostly inconclusive. The following questions remain open: a) Is politicized ethnicity really a conflict risk? b) What impact does the whole “menu” (not just single institutions) have? and c) How are effects conditioned by the exact nature of conflict risks

Primers4clades: A Web Server to Design Lineage-Specific PCR Primers for Gene-Targeted Metagenomics

This chapter presents a practical overview and case study of the usage and capabilities of the primers4clades version 1.0 web server [Cont reras-Moreira et al., 2009], a software tool useful to desi gn degenerate PCR primers for gene-targeted analysis of metagenomic DNA (see also Chapter 28, Vol. I) and multilocus sequence analysis. Although direct shotgun sequencing of community DNA is now feasible [Venter et al., 2004], polymerase chain reaction (PCR) remains the most widely used technology to gain molecular markers for studies in molecular ecology and systematics.Peer Reviewe

Caracterización bioquímica de AmiJ33, una amilasa de Bacillus amyloliquefaciens aislada de suelos cultivados con caña de azúcar en la región del Papaloapan

La amilasa (E.C. 3.2.1.1) de Bacillus amyloliquefaciens JJC33M (AmiJ33) fue producida por fermentación sumergida. Se probó el efecto de peptona, extracto de levadura, Ca+2 y glicina en la producción de AmiJ33. El extracto de levadura y Ca+2 tuvieron un efecto positivo sobre la síntesis de AmiJ33. La enzima fue recuperada mediante precipitación a saturación al 60% con (NH4)2SO4. El peso molecular aproximado de la enzima purificada fue de 50 kDa. Así mismo, se evaluó el efecto del pH y la temperatura sobre la actividad enzimática, concluyendo que los valores más altos de actividad se observaron a pH 6.0 y 80°C, respectivamente. En condiciones ligeramente ácidas (pH 4.0 y 5.0), AmiJ33 mantuvo el 72% de su actividad. AmiJ33 fue estable por 3 h a 40°C, y por 30 min a 45 y 50°C, conservando el 88 y 82% de actividad residual. A 60°C, la actividad disminuyó 40%. La actividad de AmiJ33 se incrementó 50.27% con b- mercaptoetanol, no fue inhibida por EDTA y se inhibió totalmente con SDS

Starch- and cellulose-related microbial diversity of soil sown with sugarcane crops in the Papaloapan Basin, a megadiverse region of Mexico

Abstract: Introduction: Sugarcane is an essential agricultural product for bioethanol production in Mexico. The discovery of both the bacterial community associated with this crop and the soil status is a decisive step towards understanding how microorganisms influence crop productivity. Culture enrichment allows for the identification of the biodiversity of biological samples. The objective of this research was to identify the bacterial biodiversity related with two complex carbohydrate sources (starch and cellulose) in soils sown with sugarcane in the Papaloapan Basin in Oaxaca, Mexico via a metagenomic approach. Method: Soil content was analyzed chemically. Liquid LB, LB-starch and LB-1% carboximetilcellulose media were inoculated with 2 g soil and cultured at 180 rpm, 37°C for 48 h. The biomass was collected and the 16S rDNA gene was amplified and a library was constructed which was analyzed by sequencing. Results: N, K and Zn content of organic matter showed higher values than average, as opposed to P and Na, which were lower than average. In the library, 35 OTUs related to Clostridium, Bacillus, Enterococcus, Lysinibacillus and Citrobacter genera were found which could contain genes for breaking cellulose and starch. Discussion or Conclusion: This is the first approach to identify the diversity related to starch and cellulose hydrolysis in the Papaloapan region, where the principal genera detected were Clostridium, Bacillus, Enterococcus, Citrobacter and Lysinibacillus in a soil moderately rich in organic matter.Resumen: Introducción: La caña de azúcar es un producto agrícola esencial para producir bioetanol en México. El conocimiento de la comunidad bacteriana asociada a este cultivo y el estado del suelo es un paso decisivo para comprender cómo los microorganismos influyen en la productividad de los cultivos. Los cultivos enriquecidos con sustrato es una técnica que permite conocer la biodiversidad de muestras biológicas. El objetivo de esta investigación fue identificar a través de cultivos enriquecidos la biodiversidad bacteriana relacionada con dos fuentes complejas de carbohidratos, almidón y celulosa, en suelos de cultivo con caña de azúcar en la cuenca del Papaloapan en Oaxaca, México. Método: El contenido del suelo fue analizado químicamente. Medios de LB, LB-almidón y LB-carboximetilcelulosa 1% se inocularon con 2 g de suelo y se mantuvieron a 180 rpm y 37°C durante 48 h. A partir de la biomasa recolectada, se amplificó el gen 16S rDNA y se construyó una librería que fue analizada por secuenciación. Resultados: Los contenidos de materia orgánica y N, K y Zn mostraron valores moderadamente altos, a diferencia del fosfato asimilable y el Na, los cuales fueron menores al promedio. En la librería, se encontraron 35 unidades taxonómicas operacionales (OTUs) relacionados con los géneros Clostridium, Bacillus, Enterococcus, Lysinibacillus y Citrobacter, que podrían tener genes para romper la celulosa y el almidón. Discusión o Conclusión: Esta es la primera aproximación de diversidad relacionada con la hidrólisis del almidón y celulosa en la región de Papaloapan, donde los principales géneros detectados fueron Clostridium, Bacillus, Enterococcus, Citrobacter y Lysinibacillus en un suelo moderadamente alto en materia orgánica

Pathogens, parasites, and parasitoids associated with bumble bees (Bombus spp.) from Uruguay

As elsewhere in the world, bumble bees play a vital role as pollinators in Uruguay, but knowledge on their health status is still limited. Between September 2012 and May 2013, 403 adult individuals of the two speciesof Bombus known for the country (Bombus atratus , Bombus bellicosus ) were collected in six localities.We found that 177 (119 B. atratus, 58 B. bellicosus ) were harboring one or two types of pathogens, parasites, or parasitoids.Identification of these natural enemies carried out by morphological or molecular procedures revealed the presence of two species of Microsporidia [Nosema ceranae (prevalence: 18.2 % in B. atratus; 44.9 % in B. bellicosus ),Tubulinosema pampeana (prevalence: 13 % in B. atratus )], two species of Nematoda [Sphaerularia bombi (prevalence: 40.4 % in B. atratus; 40% in B. bellicosus ) and an unidentified Mermithidae (prevalence: 0.8 % inB. bellicosus )], and one species of Diptera parasitoid (prevalence: 3.2 % in B. atratus ; 4.2 % in B. bellicosus ). Except N. ceranae , none of the other species have been previously reported in Uruguay.Fil: Plischuk, Santiago. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Estudios Parasitológicos y de Vectores. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Naturales y Museo. Centro de Estudios Parasitológicos y de Vectores; ArgentinaFil: Salvarrey, Sheena. Universidad de la República. Facultad de Ciencias; UruguayFil: Arbulo, Natalia. Universidad de la República; UruguayFil: Santos, Estela. Universidad de la República. Facultad de Ciencias; UruguayFil: Skevington, Jeffrey H.. Canadian National Collection of Insects; CanadáFil: Kelso, Scott. Canadian National Collection of Insects; CanadáFil: Revainera, Pablo Damian. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata; ArgentinaFil: Maggi, Matías Daniel. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - Mar del Plata; Argentina. Universidad Nacional de Mar del Plata; ArgentinaFil: Invernizzi, Ciro. Universidad de la República. Facultad de Ciencias; UruguayFil: Lange, Carlos Ernesto. Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas. Centro Científico Tecnológico Conicet - La Plata. Centro de Estudios Parasitológicos y de Vectores. Universidad Nacional de La Plata. Facultad de Ciencias Naturales y Museo. Centro de Estudios Parasitológicos y de Vectores; Argentina. Provincia de Buenos Aires. Gobernación. Comisión de Investigaciones Científicas; Argentin