Cylindrotheca closterium as a novel model to study diatom life cycle

Diatoms, siliceous micro-algae, are among the world's most prolific primary producers, contributing about one-fifth of global oxygen production. They are characterised by a tremendous biodiversity and an almost ubiquitous presence in the biosphere, with habitats in freshwater, marine and wet terrestrial environments. Consequently, multiple lifestyles and survival strategies have evolved to fit a wide variety of light climates, temperature ranges, and ecological niches. They are considered one of the most diverse groups of eukaryotes and are the most diverse group of micro-algae, with an estimated number of 100,000 to 200,000 species. Sexual reproduction is the main driver of speciation, but in diatoms it is also the main mechanism for restoring cell size. As a result of their characteristic silica cell wall, repeated mitotic divisions cause a gradual decrease in the cell size of diatom populations, resulting in cell death. However, sexual reproduction can be initiated below a species-specific size threshold. Gametes are produced and fuse into a zygote, which expands into an auxospore, a large cell unique to diatoms, which eventually releases a large initial cell, restoring the original cell size. Although well described, the molecular drivers of this characteristic sequence of sexual cell stages are almost completely unexplored. In this thesis, we performed physiological experiments in combination with genomics, transcriptomics and genome editing to investigate the genetic basis of life cycle regulation in the pennate diatom Cylindrotheca closterium, which we introduce here as a new model

Pheromone mediated sexual reproduction of pennate diatom Cylindrotheca closterium

Benthic diatoms dominate primary production in marine subtidal and intertidal environments. Their extraordinary species diversity and ecological success is thought to be linked with their predominantly heterothallic sexual reproduction. Little is known about pheromone involvement during mating of pennate diatoms. Here we describe pheromone guided mating in the coastal raphid diatom Cylindrotheca closterium. We show that the two mating types (mt(+) and mt(-)) have distinct functions. Similar to other benthic diatoms, mt(+) cells are searching for the mt(-) cells to pair. To enhance mating efficiency mt(-) exudes an attraction pheromone which we proved by establishing a novel capillary assay. Further, two more pheromones produced by mt(-) promote the sexual events. One arrests the cell cycle progression of mt(+) while the other induces gametogenesis of mt(+). We suggest that C. closterium shares a functionally similar pheromone system with other pennate diatoms like Seminavis robusta and Pseudostaurosira trainorii which synchronize sexual events and mate attraction. Remarkably, we found no evidence of mt(+) producing pheromones, which differentiates C. closterium from other pennates and suggests a less complex pheromone system in C. closterium

Suunnittelijan suuri nimijahti : nimeämisen haasteet ja mahdollisuudet markkinointialalla

Opinnäytetyössäni kerron nimeämisen prosessista, nimen merkityksestä liiketoiminnalle ja nimeämisen perusteista. Käsittelen hyvän nimen merkitystä ja tuon esille esimerkkejä hyvistä nimistä ja nimeämistavoista. Kerron nimeämistä rajoittavista tekijöistä ja muista käytännön asioista, jotka nimeämisessä on syytä ottaa huomioon. Hyvän yritys- tai tuotenimen suunnittelua ei rajoita vain luovuus, vaan monet ikäviltä tuntuvat seikat. Nimen tulee ensinnäkin olla yksilöllinen ja rekisteröitävissä Kaupparekisteriin. Toiseksi nimellä tulee olla olemassa myös vapaa domain-nimi. Äkkiseltään nimeäjän valtaa epätoivo, ettei sopivia ja vapaita nimiä enää löydy. Osittain onkin totta, että hyvät nimet on jo varattu. Tarjoan tähän ongelmaan työssäni ratkaisuja. Nimeämisen yksi haasteista on, varsinkin luovan suunnittelijan mielestä, visuaalinen näyttävyys verrattuna suomen kielen kielioppisääntöihin. Nimen tulee mielellään noudattaa oikeinkirjoitussääntöjä ja sitä tulee voida taivuttaa ongelmitta ja sen tulee myös toimia ääneen lausuttuna. Epäselvä nimi ei toimi, koska sitä ei ymmärretä, eikä muisteta. Lisäksi ulkomaille tähdätessä, tulee varmistua ettei nimellä ole loukkaavaa merkitystä kohdemaan kielellä. Kaupallisen nimen tärkein ominaisuus on olla erottuva ja myyvä. Hyvällä nimellä on myös muita ominaisuuksia, jotka liittyvät nimen mahdollisuuteen tehdä vaikutus asiakkaisiin ja jäädä mieliin. Parhaimmat nimet ovat mitaltaan lyhyitä ja lisäksi oivaltavia. Työssäni kerron lisää nimen monista vaatimuksista ja myös mahdollisuuksista ilahduttaa vastaantulijoitaan. Nimeäminen on vaativaa työtä jopa luovien suunnittelutoimistojen ammattilaisille. Nimeämiseen tulee varata riittävästi aikaa ja tehdä se ehdottomasti useamman henkilön voimin. Hyvä nimi suunnitellaan aina valitun strategian pohjalta ja se perustuu kohderyhmän syvään ymmärtämiseen. Nimiehdokkaat kannattaa testata kohderyhmässä, jotta niiden toimivuus ja mielleyhtymät saadaan selvitettyä ennen lopullisen nimen lanseerausta. Usein lopullinen nimi on kompromissi, johon ihastutaan vasta ajan kanssa. Eikä työ pääty nimen löytämiseen. Kun nimi on valittu ja varattu, puhalletaan nimeen eloa luomalla sen ympärille tarina ja toimintaa.Naming the business correctly is an essential element in the success of the company. An appropriate name can contribute the company to become more successful, while an improper name can lead to its failure. In my thesis, I present the process of naming. I describe what the basic rules of naming are, what factors need to be taken into account, and how to proceed after having found an outstanding name. Furthermore, I give examples on functioning names and advise what kind of names should be avoided. Finding a good name takes time, and the naming process seems to be demanding even for those working in creative agencies. Naming is not only a creative process since several other aspects, e.g. spelling and declining the name, also require consideration. In global business, names which are offending in some cultures should not be used. In addition, it may seem that all the good names are already taken. The most effective names are unique without the fear of being mixed up with the names of other companies. Obtaining a valid domain name can be challenging. This thesis aims to offer solutions for that problem as well. In the process of naming, firstly, it is important to know the target audience and their values. There should be a clear view on what images the name evokes in the audience. Briefly, a name should convey the expertise, value and uniqueness of the service or product. Secondly, keeping the name short helps people to remember it without hesitation. Thirdly, finding a good name becomes easier when there are several persons participating in the process. Testing the name candidates in target audience has also proved to be especially useful. Finally, the process of naming often requires compromises. After a while, the chosen name typically functions brilliantly in its context