Pharmacogenetics of efficacy and safety of HCV treatment in HCV-HIV coinfected patients: significant associations with IL28B and SOCS3 gene variants.

Background and Aims This was a safety and efficacy pharmacogenetic study of a previously performed randomized trial which compared the effectiveness of treatment of hepatitis C virus infection with pegylated interferon alpha (pegIFNα) 2a vs. 2b, both with ribavirin, for 48 weeks, in HCV-HIV coinfected patients. Methods The study groups were made of 99 patients (efficacy pharmacogenetic substudy) and of 114 patients (safety pharmacogenetic substudy). Polymorphisms in the following candidate genes IL28B, IL6, IL10, TNFα, IFNγ, CCL5, MxA, OAS1, SOCS3, CTLA4 and ITPA were assessed. Genotyping was carried out using Sequenom iPLEX-Gold, a single-base extension polymerase chain reaction. Efficacy end-points assessed were: rapid, early and sustained virological response (RVR, EVR and SVR, respectively). Safety end-points assessed were: anemia, neutropenia, thrombocytopenia, flu-like syndrome, gastrointestinal disturbances and depression. Chi square test, Student's T test, Mann-Whitney U test and logistic regression were used for statistic analyses. Results As efficacy is concerned, IL28B and CTLA4 gene polymorphisms were associated with RVR (p<0.05 for both comparisons). Nevertheless, only polymorphism in the IL28B gene was associated with SVR (p = 0.004). In the multivariate analysis, the only gene independently associated with SVR was IL28B (OR 2.61, 95%CI 1.2-5.6, p = 0.01). With respect to safety, there were no significant associations between flu-like syndrome or depression and the genetic variants studied. Gastrointestinal disturbances were associated with ITPA gene polymorphism (p = 0.04). Anemia was associated with OAS1 and CTLA4 gene polymorphisms (p = 0.049 and p = 0.045, respectively), neutropenia and thromobocytopenia were associated with SOCS3 gene polymorphism (p = 0.02 and p = 0.002, respectively). In the multivariate analysis, the associations of the SOCS3 gene polymorphism with neutropenia (OR 0.26, 95%CI 0.09-0.75, p = 0.01) and thrombocytopenia (OR 0.07, 95%CI 0.008-0.57, p = 0.01) remained significant. Conclusions In HCV-HIV coinfected patients treated with PegIFNα and ribavirin, SVR is associated with IL28B rs8099917 polymorphism. HCV treatment-induced neutropenia and thrombocytopenia are associated with SOCS3 rs4969170 polymorphism

Estudi del virus de la inmunodeficiència humana tipus 1 (VIH-1) en pacients infectats crònics sotmesos a interrupcions estructurades del tractament (IET).

[spa] La imposibilidad de erradicar el virus de la immunodeficiencia humana (VIH-1) del organismo humano con las pautas terapéuticas de alta eficacia (TARGA), la adherencia a pautas terapéuticas complejas y el riesgo a una importante toxicidad farmacológica aguda y crónica, son los principales problemas en la administración prolongada de los fármacos antirretrovirales. Es iminente la necesidad de diseñar nuevas estrategias de tratamiento y en este sentido se han desarrollado las terapias inmuno-mediadas, siendo un ejemplo las interrupciones estrucutradas del tratamiento (IET), dirigidas a controlar la replicación del VIH en base a la recuperación de la respuesta inmune específica. Con estos antecedentes, el estudio virológico de la dinámica y evolución del VIH a lo largo de las diferentes interrupciones estructuradas del tratamiento, permitirá un mejor conocimiento de los cambios observados en la replicación viral durante el periodo de las IET, ya sea debido a factores inmunológicos, virológicos o ambos, para ello se determinó la dinámica viral durante las IET y su relación con la respuesta celular T VIH-1 específica en un grupo de pacientes sometidos a IET, en un grupo de pacientes sometidos a IET y un immunomodulador, la hidroxiurea y en un un grupo de pacientes sometidos a IET y un inmunosupresor, el ácido micofenólico. También se realizó un estudio de evolución del virus en el primer grupo de pacientes. Por último, el estudio de las mutaciones de resistencia en estos pacientes ayudarán a determinar el riesgo que puede comportar la aplicación de esta terapia a la práctica clínica.Los resultados obtenidos en el análisis de la dinámica viral fueron que en todos los pacientes se observó un rebrote de la carga viral en cada una de las interrupciones del tratamiento. Cabe destacar que se observaron atenuaciones significativas en el rebrote de la carga viral a lo largo de las IET.Un 25% de los pacientes mantuvieron valores de estabilización del la carga viral <5000 copias/ml durante una media de 52 semanas de la última interrupción, en los que se observó un incremento de la respuesta celular inmune específica frente al VIH-1. En la totalidad de los pacientes se consiguieron cargas virales indetectables una vez reintroducido el tratamiento.En los resultados obtenidos en la evolución genética del virus a lo largo de las IET no se observó una tendencia a la homogenización de las cuasiespecies virales. No se observaron diferencias significativas en la variabilidad genética entre los virus de pacientes con capacidad o no de neutralizar la replicación viral. En cambio si se detectó la reactivación con la consiguiente reemergencia de provirus ancestrales en el rebrote de carga viral como consecuencia de la interrupción del tratamiento. Al estudiar el riesgo de selección de mutaciones de resistencia durante las IET se observó que un 26% de los pacientes presentaban mutaciones, de los cuales la mitad los seleccionaron de novo durante el periodo de las IET. De estos pacientes un 23% presentaron mutaciones de novo a los inhibidores de la transcriptasa inversa no análogos de nucleósidos (ITIANN), 12% a los inhibidores de la transcriptasa inversa análogos de nucleósidos (ITIAN). No se detectaron mutaciones de resistencia a los inhibidotes de la proteasa (IP).El riesgo de selección de las mutaciones de resistencia fue superior a los ITIANN debido a la larga vida media de estos fármacos, hecho que se debe tener en cuenta cuando se realiza este tipo de estrategia terapéutica

Pharmacogenetics of efficacy and safety of HCV treatment in HCV-HIV coinfected patients: significant associations with IL28B and SOCS3 gene variants.

Background and Aims This was a safety and efficacy pharmacogenetic study of a previously performed randomized trial which compared the effectiveness of treatment of hepatitis C virus infection with pegylated interferon alpha (pegIFNα) 2a vs. 2b, both with ribavirin, for 48 weeks, in HCV-HIV coinfected patients. Methods The study groups were made of 99 patients (efficacy pharmacogenetic substudy) and of 114 patients (safety pharmacogenetic substudy). Polymorphisms in the following candidate genes IL28B, IL6, IL10, TNFα, IFNγ, CCL5, MxA, OAS1, SOCS3, CTLA4 and ITPA were assessed. Genotyping was carried out using Sequenom iPLEX-Gold, a single-base extension polymerase chain reaction. Efficacy end-points assessed were: rapid, early and sustained virological response (RVR, EVR and SVR, respectively). Safety end-points assessed were: anemia, neutropenia, thrombocytopenia, flu-like syndrome, gastrointestinal disturbances and depression. Chi square test, Student's T test, Mann-Whitney U test and logistic regression were used for statistic analyses. Results As efficacy is concerned, IL28B and CTLA4 gene polymorphisms were associated with RVR (p<0.05 for both comparisons). Nevertheless, only polymorphism in the IL28B gene was associated with SVR (p = 0.004). In the multivariate analysis, the only gene independently associated with SVR was IL28B (OR 2.61, 95%CI 1.2-5.6, p = 0.01). With respect to safety, there were no significant associations between flu-like syndrome or depression and the genetic variants studied. Gastrointestinal disturbances were associated with ITPA gene polymorphism (p = 0.04). Anemia was associated with OAS1 and CTLA4 gene polymorphisms (p = 0.049 and p = 0.045, respectively), neutropenia and thromobocytopenia were associated with SOCS3 gene polymorphism (p = 0.02 and p = 0.002, respectively). In the multivariate analysis, the associations of the SOCS3 gene polymorphism with neutropenia (OR 0.26, 95%CI 0.09-0.75, p = 0.01) and thrombocytopenia (OR 0.07, 95%CI 0.008-0.57, p = 0.01) remained significant. Conclusions In HCV-HIV coinfected patients treated with PegIFNα and ribavirin, SVR is associated with IL28B rs8099917 polymorphism. HCV treatment-induced neutropenia and thrombocytopenia are associated with SOCS3 rs4969170 polymorphism