Robust estimation of bacterial cell count from optical density

Optical density (OD) is widely used to estimate the density of cells in liquid culture, but cannot be compared between instruments without a standardized calibration protocol and is challenging to relate to actual cell count. We address this with an interlaboratory study comparing three simple, low-cost, and highly accessible OD calibration protocols across 244 laboratories, applied to eight strains of constitutive GFP-expressing E. coli. Based on our results, we recommend calibrating OD to estimated cell count using serial dilution of silica microspheres, which produces highly precise calibration (95.5% of residuals <1.2-fold), is easily assessed for quality control, also assesses instrument effective linear range, and can be combined with fluorescence calibration to obtain units of Molecules of Equivalent Fluorescein (MEFL) per cell, allowing direct comparison and data fusion with flow cytometry measurements: in our study, fluorescence per cell measurements showed only a 1.07-fold mean difference between plate reader and flow cytometry data

Glossari il·lustrat de morfologia botànica bàsica. Racons verds: aportació al coneixement morfològic dels espermatòfits

Els resultats s’emmarquen en el projecte d’innovació docent «Innovació en l’ambientalització curricular de la Botànica en el grau de Farmàcia: Jardins per a la Salut» (codi 2018PID-UB/034) del Grup d’Innovació Docent de Botànica Aplicada a les Ciències Farmacèutiques (GIBAF).Facultat de Farmàcia, Universitat de Barcelona. Ensenyament: Grau de Farmàcia. Assignatura: Botànica farmacèutica. Curs: 2017-2018. Coordinadors: Cèsar Blanché, Carles Benedí, Maria Bosc i Joan SimonProjecte: 2018PID-UB/034Es presenta a continuació un glossari il·lustrat realitzat per 35 estudiants de l’assignatura Botànica Farmacèutica del grau de Farmàcia. Els resultats s’emmarquen en el projecte d’innovació docent «Innovació en l’ambientalització curricular de la Botànica en el grau de Farmàcia: Jardins per a la Salut» (codi 2018PID-UB/034) del Grup d’Innovació Docent de Botànica Aplicada a les Ciències Farmacèutiques (GIBAF). El glossari s’ha il·lustrat a partir de fotografies dels estudiants sobre detalls morfològics de les espècies del jardí de la Facultat de Farmàcia que s’ha inclòs en els «Racons Verds de la UB». El resultat ha estat la descripció i il·lustració de 80 caràcters d’organografia vegetativa i reproductora i constitueixen un nou recurs docent en obert realitzat pels propis estudiants. El treball dut a terme s’ha realitzat de forma voluntària, tutoritzada i restringida en tres grups de teoria (M2, M3 i T3) de l'assignatura troncal de Botànica Fermacèutica del grau de Farmàcia. Els resultats hanrepercutit fins a 0,5 punts sobre la nota final un cop s’ha superat l’assignatura.Grup d'Innovació Docent en Botànica Aplicada a les Ciències Farmacèutiques (GIBAF

Glossari il·lustrat de morfologia botànica bàsica. Racons verds: aportació al coneixement morfològic dels espermatòfits

Els resultats s’emmarquen en el projecte d’innovació docent «Innovació en l’ambientalització curricular de la Botànica en el grau de Farmàcia: Jardins per a la Salut» (codi 2018PID-UB/034) del Grup d’Innovació Docent de Botànica Aplicada a les Ciències Farmacèutiques (GIBAF).Facultat de Farmàcia, Universitat de Barcelona. Ensenyament: Grau de Farmàcia. Assignatura: Botànica farmacèutica. Curs: 2017-2018. Coordinadors: Cèsar Blanché, Carles Benedí, Maria Bosc i Joan SimonProjecte: 2018PID-UB/034Es presenta a continuació un glossari il·lustrat realitzat per 35 estudiants de l’assignatura Botànica Farmacèutica del grau de Farmàcia. Els resultats s’emmarquen en el projecte d’innovació docent «Innovació en l’ambientalització curricular de la Botànica en el grau de Farmàcia: Jardins per a la Salut» (codi 2018PID-UB/034) del Grup d’Innovació Docent de Botànica Aplicada a les Ciències Farmacèutiques (GIBAF). El glossari s’ha il·lustrat a partir de fotografies dels estudiants sobre detalls morfològics de les espècies del jardí de la Facultat de Farmàcia que s’ha inclòs en els «Racons Verds de la UB». El resultat ha estat la descripció i il·lustració de 80 caràcters d’organografia vegetativa i reproductora i constitueixen un nou recurs docent en obert realitzat pels propis estudiants. El treball dut a terme s’ha realitzat de forma voluntària, tutoritzada i restringida en tres grups de teoria (M2, M3 i T3) de l'assignatura troncal de Botànica Fermacèutica del grau de Farmàcia. Els resultats hanrepercutit fins a 0,5 punts sobre la nota final un cop s’ha superat l’assignatura.Grup d'Innovació Docent en Botànica Aplicada a les Ciències Farmacèutiques (GIBAF

Prosthetic Valve Candida spp. Endocarditis: New Insights Into Long-term Prognosis—The ESCAPE Study

International audienceBackground: Prosthetic valve endocarditis caused by Candida spp. (PVE-C) is rare and devastating, with international guidelines based on expert recommendations supporting the combination of surgery and subsequent azole treatment.Methods: We retrospectively analyzed PVE-C cases collected in Spain and France between 2001 and 2015, with a focus on management and outcome.Results: Forty-six cases were followed up for a median of 9 months. Twenty-two patients (48%) had a history of endocarditis, 30 cases (65%) were nosocomial or healthcare related, and 9 (20%) patients were intravenous drug users. "Induction" therapy consisted mainly of liposomal amphotericin B (L-amB)-based (n = 21) or echinocandin-based therapy (n = 13). Overall, 19 patients (41%) were operated on. Patients <66 years old and without cardiac failure were more likely to undergo cardiac surgery (adjusted odds ratios [aORs], 6.80 [95% confidence interval [CI], 1.59-29.13] and 10.92 [1.15-104.06], respectively). Surgery was not associated with better survival rates at 6 months. Patients who received L-amB alone had a better 6-month survival rate than those who received an echinocandin alone (aOR, 13.52; 95% CI, 1.03-838.10). "Maintenance" fluconazole therapy, prescribed in 21 patients for a median duration of 13 months (range, 2-84 months), led to minor adverse effects.Conclusion: L-amB induction treatment improves survival in patients with PVE-C. Medical treatment followed by long-term maintenance fluconazole may be the best treatment option for frail patients

Correction to: Comparative effectiveness and safety of non-vitamin K antagonists for atrial fibrillation in clinical practice: GLORIA-AF Registry

International audienceIn this article, the name of the GLORIA-AF investigator Anastasios Kollias was given incorrectly as Athanasios Kollias in the Acknowledgements. The original article has been corrected

Patterns of oral anticoagulant use and outcomes in Asian patients with atrial fibrillation: a post-hoc analysis from the GLORIA-AF Registry

Background: Previous studies suggested potential ethnic differences in the management and outcomes of atrial fibrillation (AF). We aim to analyse oral anticoagulant (OAC) prescription, discontinuation, and risk of adverse outcomes in Asian patients with AF, using data from a global prospective cohort study. Methods: From the GLORIA-AF Registry Phase II-III (November 2011-December 2014 for Phase II, and January 2014-December 2016 for Phase III), we analysed patients according to their self-reported ethnicity (Asian vs. non-Asian), as well as according to Asian subgroups (Chinese, Japanese, Korean and other Asian). Logistic regression was used to analyse OAC prescription, while the risk of OAC discontinuation and adverse outcomes were analysed through Cox-regression model. Our primary outcome was the composite of all-cause death and major adverse cardiovascular events (MACE). The original studies were registered with ClinicalTrials.gov, NCT01468701, NCT01671007, and NCT01937377. Findings: 34,421 patients were included (70.0&nbsp;±&nbsp;10.5 years, 45.1% females, 6900 (20.0%) Asian: 3829 (55.5%) Chinese, 814 (11.8%) Japanese, 1964 (28.5%) Korean and 293 (4.2%) other Asian). Most of the Asian patients were recruited in Asia (n&nbsp;=&nbsp;6701, 97.1%), while non-Asian patients were mainly recruited in Europe (n&nbsp;=&nbsp;15,449, 56.1%) and North America (n&nbsp;=&nbsp;8378, 30.4%). Compared to non-Asian individuals, prescription of OAC and non-vitamin K antagonist oral anticoagulant (NOAC) was lower in Asian patients (Odds Ratio [OR] and 95% Confidence Intervals (CI): 0.23 [0.22-0.25] and 0.66 [0.61-0.71], respectively), but higher in the Japanese subgroup. Asian ethnicity was also associated with higher risk of OAC discontinuation (Hazard Ratio [HR] and [95% CI]: 1.79 [1.67-1.92]), and lower risk of the primary composite outcome (HR [95% CI]: 0.86 [0.76-0.96]). Among the exploratory secondary outcomes, Asian ethnicity was associated with higher risks of thromboembolism and intracranial haemorrhage, and lower risk of major bleeding. Interpretation: Our results showed that Asian patients with AF showed suboptimal thromboembolic risk management and a specific risk profile of adverse outcomes; these differences may also reflect differences in country-specific factors. Ensuring integrated and appropriate treatment of these patients is crucial to improve their prognosis. Funding: The GLORIA-AF Registry was funded by Boehringer Ingelheim GmbH