132 research outputs found

    NOVEL POST-TRANSLATIONAL MODIFICATION AND FUNCTION OF FUS: THE RELEVANCE TO AMYOTROPHIC LATERAL SCLEROSIS

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    Amyotrophic Lateral Sclerosis (ALS) is a neurodegenerative disease characterized by the preferential death of motor neurons. Approximately 10% of ALS cases are familial and 90% are sporadic. Fused in Sarcoma (FUS) is a ubiquitously expressed RNA binding protein implicated in familial ALS and frontotemporal dementia (FTD). FUS is ubiquitously expressed in cells and has a variety of functions in the nucleus and cytoplasm. FUS mutations in the nuclear localization sequence (NLS) causes mislocalization of FUS in the cytoplasm, where it can undergo liquid-liquid phase separation and become stress granules or protein inclusions. Although FUS inclusion bodies can be found in post-mortem tissues from ALS patients, the pathological mechanism of the disease remains to be fully elucidated. This dissertation includes two independent studies about FUS regulation and function in the cell. In the first study, we discovered a novel post-translational modification, i.e. lysine acetylation on FUS and aimed to understand whether lysine acetylation plays a role in regulating FUS function. We identified three acetylation sites in FUS: K315/K316 in the RRM domain and K510 in the NLS. We found that K510 disrupted the interaction with Transportin-1 and increased cytoplasmic protein aggregates that co-localized with stress granule markers. Interestingly, acetylation in K315/K316 reduced RNA binding to FUS and decreased the cytoplasmic inclusion formation. Similarly, treatment with deacetylase inhibitors also decreased protein aggregation in cells expressing ALS mutation P525L. Furthermore, ALS patient derived fibroblasts showed higher levels of acetylation at K510, compared to healthy controls. Finally, we demonstrated that CBP/p300 acetylates FUS, while both HDACs and Sirtuins contribute to FUS deacetylation. We concluded that FUS acetylation regulates RNA binding, subcellular localization, and inclusion formation, linking acetylation of FUS to a potential molecular mechanism for ALS/FTD. The second study aimed to determine the function of FUS in the autophagy pathway. We found that mutant FUS did not affect autophagy flux in N2A cells. However, FUS knockout (KO) N2A cells showed a significant decrease in the basal autophagy flux compared to wild-type (WT) cells. Bafilomycin A1 treatment showed a decrease in autophagy flux in FUS KO cells, and induction of autophagy by rapamycin was not as efficient in FUS KO cells compared to WT cells. These results suggest that FUS KO affects early stages of the autophagy pathway. We found that FIP200, ATG16L1, and ATG12 gene and protein expression levels were significantly lower in FUS KO cells. FIP200 is involved in autophagy initiation and Atg16 and Atg12 form a complex to induce phagophore elongation. Overexpressing WT FUS in FUS KO cells was able to rescue gene and protein expression levels of FIP200 and ATG16L1. These findings demonstrate a novel function of FUS in regulating transcription of genes involved in early stages of the autophagy pathway. Failure to maintain protein homeostasis by protein degradation has been demonstrated in neurodegenerative diseases and finding new protein targets can be useful to discover new therapeutic options for ALS. The two studies of this dissertation produce novel findings of FUS protein modification and function. Each study provides new insights into the role of FUS in neurodegenerative diseases including ALS and FTD, as well as novel therapeutic targets. Future studies that determine the molecular mechanisms connecting these two findings will be necessary to evaluate how FUS acetylation and inclusion formation will impact the autophagy pathway

    Evaluación de la eficacia analgésica postoperatoria de 3 tratamientos administrados a hembras felinas (Felis catus) sometidas a ovario histerectomía mediante la escala multidimensional UNSP-BOTUCATU

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    La identificación y tratamiento del dolor postoperatorio es una de las principales complicaciones que se presentan en el postquirúrgico ya que afecta de manera significativa a la recuperación del paciente. Hay un mayor interés en el reconocimiento y establecimiento de una terapia adecuada para el dolor, así como el compromiso de los profesionales encargados de prevenir o indicar un tratamiento. Actualmente en Medicina Veterinaria se están incluyendo nuevas terapias para la prevención del dolor postoperatorio como el uso de Bupivacaina instilada intraperitoneal al momento de cirugías de carácter abdominal o muy recientemente el uso de Gabapentina, cuya indicación es básicamente en tratamiento de dolores neuropáticos o crónicos, en procesos de dolor agudo su eficacia analgésica aún está en constante investigación demostrando un gran potencial en su uso a diferencia de las terapias convencionales. Este estudio fue diseñado para comparar la analgesia postoperatoria que proporciona la combinación de meloxicam con bupivacaina, meloxicam con gabapentina y meloxicam en gatas sometidas a ovario histerectomía electiva. En el estudio se evaluaron 30 gatas que fueron sometidas a ovario histerectomía y se distribuyeron aleatoriamente en tres tratamientos, de 10 gatas por tratamiento. A cada tratamiento se le colocó previamente 0,1mg/kg de meloxicam IV y se completó la dosis con 0,2 mg/kg IM para lograr una dosis de 0,3 mg/kg, al primer tratamiento Bupivacaina/Meloxicam se instilo intraperitoneal 2 mg/kg de bupivacaina a 0,25% al comienzo de la cirugía, al segundo grupo Gabapentina/Meloxicam se administró 25 mg/kg 12h y 1h antes PO para lograr un total de 50 mg/kg. El grado de analgesia fue evaluado posteriormente a las 2, 4 y 6 horas mediante la escala multidimensional UNSP-Botucatu. Para el análisis de los datos se utilizó estadística frecuencial y se aplicó instrumental no paramétrico como la prueba Kruskal-Wallis. Los resultados sugieren que a las 2h postoperatorio se mostró diferencia significativa entre los 3 grupos (p<0,05), a las 4h postoperatorio se mostró diferencia significativa entre los 3 grupos (p<0,05), a las 6h postoperatorio se mostró diferencia significativa (p<0,05) en los 3 grupos. Finalmente, los resultados sugieren que el tratamiento más eficaz para el manejo del dolor postoperatorio fue el compuesto por Bupivacaina más Meloxicam, seguido del tratamiento Gabapentina más Meloxicam y el menos eficaz fue el tratamiento compuesto por Meloxicam

    Evaluating the Neolithic expansion at both shores of the Mediterranean Sea

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    During the Neolithic, human populations underwent cultural and technological developments that led to an agricultural revolution. Although the population genetics and evolution of European Neolithic populations have been extensively studied, little is known regarding the Neolithic expansion in North Africa with respect to Europe. One could expect that the different environmental and geological conditions at both shores of the Mediterranean Sea could have led to contrasting expansions. In order to test this hypothesis, we compared the Neolithic expansion in Europe and North Africa accounting for possible migration between them through the Strait of Gibraltar. We analyzed the entire X chromosome of 580 individuals from 20 populations spatially distributed along the North of Africa and Europe. Next, we applied approximate Bayesian computation based on extensive spatially explicit computer simulations to select among alternative scenarios of migration through the Strait of Gibraltar and to estimate population genetics parameters in both expansions. Our results suggest that, despite being more technologically advanced, Neolithic populations did not expand faster than Paleolithic populations, which could be interpreted as a consequence of a more sedentary lifestyle. We detected reciprocal Neolithic migration between the Iberian Peninsula and North Africa through the Strait of Gibraltar. Counterintuitively, we found that the studied Neolithic expansions presented similar levels of carrying capacity and migration, and occurred at comparable speeds, suggesting a similar demic process of substitution of hunter–gatherer populations. Altogether, the Neolithic expansion through both Mediterranean shores was not so different, perhaps because these populations shared similar technical abilities and lifestyle patterns.Fundação para a Ciência e a Tecnologia | Ref. POCI-01-0145-FEDER-007274Fundação para a Ciência e a Tecnologia | Ref. SFRH/BD/97200/2013Fundação para a Ciência e a Tecnologia | Ref. IF/01262/2014Fundação para a Ciência e a Tecnologia | Ref. IF/00955/2014Ministerio de Economía y Competitividad | Ref. RYC-2015-18241Ministerio de Economía y Competitividad | Ref. CGL2013-44351-

    A nonlinear population Monte Carlo scheme for the Bayesian estimation of parameters of alpha-stable distributions

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    The class of alpha-stable distributions enjoys multiple practical applications in signal processing, finance, biology and other areas because it allows to describe interesting and complex data patterns, such as asymmetry or heavy tails, in contrast with the simpler and widely used Gaussian distribution. The density associated with a general alpha-stable distribution cannot be obtained in closed form, which hinders the process of estimating its parameters. A nonlinear population Monte Carlo (NPMC) scheme is applied in order to approximate the posterior probability distribution of the parameters of an alpha-stable random variable given a set of random realizations of the latter. The approximate posterior distribution is computed by way of an iterative algorithm and it consists of a collection of samples in the parameter space with associated nonlinearly-transformed importance weights. A numerical comparison of the main existing methods to estimate the alpha-stable parameters is provided, including the traditional frequentist techniques as well as a Markov chain Monte Carlo (MCMC) and a likelihood-free Bayesian approach. It is shown by means of computer simulations that the NPMC method outperforms the existing techniques in terms of parameter estimation error and failure rate for the whole range of values of a, including the smaller values for which most existing methods fail to work properly. Furthermore, it is shown that accurate parameter estimates can often be computed based on a low number of observations. Additionally, numerical results based on a set of real fish displacement data are providedE.K. acknowledges the support of Ministerio de Educación of Spain (Programa de Formación de Profesorado Universitario, Ref. AP2008-00469). J.M. acknowledges the partial support of Ministerio de Economía y Competitividad of Spain (program Consolider-Ingenio 2010 CSD2008-00010 COMONSENS and project COMPREHENSION TEC2012-38883-C02-01) and the Office of Naval Research Global (award no. N62909-15-1-2011). At the time of the original submission of this paper, J.M. was with the Department of Signal Theory and Communications, Universidad Carlos III de Madrid (Spain). M.A acknowledges the financial support of the Natural Sciences and Engineering Council of Canada (Discovery Grant 138680), the Coordenação de Apoioao Pessoal do Ensino Superior (grant No.1351/11-7) and the Fundação de Amparo à Pesquisado Estado do Rio de Janeiro (grant No.E-26/110.864/2012), and thanks J. Nolan for providing a free copy of the STABLE software. A.M.S. acknowledges the financial support from Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico(grant No. 308016/2014-9) and Coordenação de Apoio ao Pessoal do Ensino Superior, DGU Program (grant No. 257/12)

    Laboratorio de innovación social en el marco del bosque modelo Risaralda para la adaptación al cambio climático desde una perspectiva de género

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    Los ecosistemas, la biodiversidad e inclusive los seres humanos experimentarán las consecuencias del cambio climático; sin embargo, en términos sociales sus impactos serán diversos según las regiones, la edad, la condición económica y el sexo. En los países en vía de desarrollo se evidenciará un mayor impacto para las comunidades marginales en condición de vulnerabilidad. Dentro de estas poblaciones se encuentran las mujeres, debido a que representan la mayoría dentro de la clasificación de personas “pobres” en el mundo y dependen más de los recursos naturales amenazados (Osman-Elasha, 2009). En un contexto local, según lo menciona la Tercera Comunicación Nacional sobre Cambio Climático (TNCC) los escenarios para Risaralda en el período 2071-2100, sin acciones de adaptación y mitigación, se podrían prever con aumentos de temperatura de hasta 2,6ºc, aumento de la precipitación hasta del 28% particularmente en los municipios de Pereira, Balboa, Santuario, Apía y Guática. Lo cual, pone en riesgo la integridad del territorio y sus habitantes. Con base en lo anterior, la Universidad Tecnológica de Pereira por medio de su Facultad de Ciencias Empresariales (FACIEM) aunó esfuerzos con organismos internacionales como la Unión Europea, en busca de la creación de espacios para el fortalecimiento de las capacidades de investigación aplicada e innovación y con el propósito de crear un escenario de diálogo para construir soluciones sostenibles frente a los desafíos que el cambio climático genera en la región. Un ejemplo de este esfuerzo es el diseño del Laboratorio de Innovación Social en el marco del Bosque Modelo Risaralda para la mitigación y adaptación al cambio climático desde una perspectiva de género (Living Lab UTP)Ecosystems, biodiversity and even human beings will experience the consequences of climate change; however, in social terms, its impacts will vary according to region, age, economic status and gender. In developing countries, there will be a greater impact on marginalized communities in vulnerable conditions. Among these populations are women, since they represent the majority of the world's "poor" people and are more dependent on threatened natural resources (Osman-Elasha, 2009). In a local context, as mentioned in the Third National Communication on Climate Change (TNCC), the scenarios for Risaralda in the period 2071-2100, without adaptation and mitigation actions, could foresee temperature increases of up to 2.6ºC, and an increase in precipitation of up to 28%, particularly in the municipalities of Pereira, Balboa, Santuario, Apía and Guática. This puts the integrity of the territory and its inhabitants at risk. Based on the above, the Technological University of Pereira through its Faculty of Business Sciences (FACIEM) joined efforts with international organizations such as the European Union, in search of the creation of spaces for the strengthening of applied research and innovation capacities and with the purpose of creating a scenario for dialogue to build sustainable solutions to the challenges that climate change generates in the region. An example of this effort is the design of the Social Innovation Laboratory within the framework of the Risaralda Model Forest for climate change mitigation and adaptation from a gender perspective (Living Lab UTP).PregradoLicenciado(a) en Literatura y Lengua CastellanaÍndice de contenido Resumen .........................................................................................................................................9 1. Introducción ..........................................................................................................................11 2. Definición del problema........................................................................................................12 3. Sistematización del problema ...............................................................................................16 4. Objetivos...............................................................................................................................17 4.1. Objetivo general...............................................................................................................17 4.2. Objetivos específicos.......................................................................................................17 5. Justificación ..........................................................................................................................18 5.1. Metodológica ...................................................................................................................18 5.2. Práctica.............................................................................................................................19 6. Marco de referencia...............................................................................................................19 6.1. Marco teórico...................................................................................................................19 Cambio climático........................................................................................................20 Adaptación al cambio climático ............................................................................24 Cambio climático desde una perspectiva de género ..............................................25 Innovación social .......................................................................................................27 Innovación social en el contexto latinoamericano.................................................29 Innovación social en Colombia .............................................................................31 Metodologías para la innovación social.................................................................33 Laboratorio de innovación social................................................................................34 6.2. Marco contextual .............................................................................................................37 Bosque Modelo Risaralda...........................................................................................37 Universidad Tecnológica de Pereira ...........................................................................42 6.3. Marco legal ......................................................................................................................44 7. Metodología ..........................................................................................................................48 7.1. Design Thinking...............................................................................................................48 7.1.1. Empatizar....................................................................................................................48 Teoría Fundamentada .................................................................................................49 Innovación social...................................................................................................53 Cambio climático...................................................................................................54 Perspectiva de género ............................................................................................55 Diseño del mapeo interno ...........................................................................................56 Diseño del Mapeo Externo .........................................................................................58 7.1.2. Definir.........................................................................................................................60 7.1.3. Idear............................................................................................................................60 7.1.4. Prototipar ....................................................................................................................60 7.1.5. Testear.........................................................................................................................60 8. Resultados.............................................................................................................................61 8.1. Mapeo de la Universidad Tecnológica de Pereira............................................................62 8.2. Mapeo del Departamento del Risaralda ...........................................................................66 8.3. Líneas de Acción del Laboratorio....................................................................................68 Línea de sensibilización y educación..........................................................................68 Línea de cadenas de valor...........................................................................................70 Línea de negocios verdes............................................................................................73 Línea de liderazgo adaptativo .....................................................................................75 8.4. Diseño del Laboratorio “Living Lab UTP”......................................................................77 8.4.1. Modelo de gobernanza................................................................................................77 Mecanismos de enlace interinstitucional ....................................................................79 8.4.2. Direccionamiento estratégico .....................................................................................81 Misión....................................................................................................................83 Visión.....................................................................................................................83 Objetivos................................................................................................................83 Objetivo general.....................................................................................................83 Objetivos específicos.............................................................................................83 Diseño organizacional.................................................................................................84 Organigrama ..........................................................................................................84 Proceso de Innovación................................................................................................87 Ruta de innovación “5c de la Innovación Social ...................................................88 Construcción física .....................................................................................................90 Modelo de sostenibilidad financiera ...........................................................................94 Casos de éxito de sostenibilidad financiera ...........................................................96 Reglamentación de manejo de recursos en la UTP – Proyectos Especiales....................99 Modelo de sostenibilidad financiera Living Lab UTP.........................................100 Plan de integración institucional...............................................................................105 Corto plazo. .........................................................................................................105 Mediano plazo. ....................................................................................................105 Largo Plazo..........................................................................................................105 Proyecto Piloto..........................................................................................................107 9. Conclusiones.......................................................................................................................109 10. Recomendaciones y observaciones.....................................................................................110 11. Bibliografía .........................................................................................................................11

    Spatially explicit analysis reveals complex human genetic gradients in the Iberian Peninsula

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    The Iberian Peninsula is a well-delimited geographic region with a rich and complex human history. However, the causes of its genetic structure and past migratory dynamics are not yet fully understood. In order to shed light on them, here we evaluated the gene flow and genetic structure throughout the Iberian Peninsula with spatially explicit modelling applied to a georeferenced genetic dataset composed of genome-wide SNPs from 746 individuals belonging to 17 different regions of the Peninsula. We found contrasting patterns of genetic structure throughout Iberia. In particular, we identified strong patterns of genetic differentiation caused by relevant barriers to gene flow in northern regions and, on the other hand, a large genetic similarity in central and southern regions. In addition, our results showed a preferential north to south migratory dynamics and suggest a sex-biased dispersal in Mediterranean and southern regions. The estimated genetic patterns did not fit with the geographical relief of the Iberian landscape and they rather seem to follow political and linguistic territorial boundaries.Fundação para a Ciência e a Tecnologia | Ref. POCI-01-0145-FEDER-007274Fundação para a Ciência e a Tecnologia | Ref. SFRH/BD/97200/2013Fundação para a Ciência e a Tecnologia | Ref. IF/01262/2014Ministerio de Economía | Ref. RYC-2015-18241Ministerio de Economía | Ref. MDM-2014-0370Ministerio de Economía y Competitividad | Ref. CGL2016-75389-

    Propuesta de mejoras en el área de mantenimiento y almacén para reducir los costos operacionales en una empresa de servicio automotriz

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    El presente proyecto tiene como objetivo diagnosticar los costos operacionales en el área de mantenimiento y almacén para diseñar una propuesta de mejora en una empresa de mantenimiento automotriz, para incrementar su rentabilidad, para lo cual se aplicará temas como Gestión de Mantenimiento, Distribución de Planta, Lean Manufacturing, entre otros. Para obtener los datos necesarios primero se entrevistó a los propietarios y trabajadores, así como la consulta en diversas fuentes de información. Posteriormente, se procedió a la evaluación de los diversos procesos y datos, los cuales nos proporcionaron información detallada para así facilitar el estudio de cada una de las actividades implícitas en este. Luego, se realizó un diagnóstico actual de la empresa permitiendo de esta manera determinar los problemas en cada uno de sus procesos productivos aplicando los temas antes mencionados. Seguidamente se procedió al cálculo con la utilización de las herramientas con la finalidad de minimizar los costos operacionales en las áreas de mantenimiento y almacén y también para mejorar el flujo en las áreas mencionadas

    Construction of a literature map on collaborative virtual white boards

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    The aim of higher education is to make the student the protagonist of their learning. In this context, the researchers&nbsp;must create appropriate scenarios that enable students to explore and develop critical thinking both independently and cooperatively while making use of information technology.&nbsp; &nbsp;This paper presents a model of pedagogical practice in the subject of Introduction to Research Methodology (IRM) based on the construction of literature maps applying John W. Creswell's research design theory through the use of virtual whiteboards. 120 students from the seventh cycle of the study plan of the School of Architecture of the National University of San Agustín participated. As a result, the model used in this paper enabled students to collect and organize the data necessary to formulate their research and develop critical thinking based on scientific knowledge. In this &nbsp;process, it was possible to reflect on the importance of emphasizing the development of critical and creative thinking skills in order to create literary maps that contribute to the comprehensive education of students. It should be noted that students are obliged to be protagonists in the construction of their knowledge especially in subjects that develop competencies related to scientific research

    Las competencias blandas en estudiantes de ingeniería industrial jornada especial de la Universidad Tecnológica de Pereira

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    En el mercado laboral cada día toman más fuerza las competencias diferenciadoras, aquellas habilidades que generan ventaja competitiva con respecto a otros profesionales, también llamadas competencias blandas. Las organizaciones actuales están comprendiendo que una empresa de clase mundial es la que ve en los recursos humanos una clave y su formación profesional debe ser integral, es decir, la unión de competencias específicas de su índole y las habilidades que dan plus en la competencia..

    Características de las tutorías del Centro de Lectura y Escritura de la Universidad Autónoma de Occidente: ¿Qué muestran los registros de atención?

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    En el presente artículo se socializan los principales hallazgos de una investigación que se adelantó en el primer semestre del 2015 para analizar las características de las tutorías llevadas a cabo en el Centro de Lectura y Escritura de la Universidad Autónoma de Occidente, con base en la revisión de los registros escritos de atención de los tutores. Entre los principales resultados, se evidencia que existen diferentes percepciones de la tutoría, que van desde las visiones remediales hasta las que se ocupan de fomentar el desarrollo de estrategias por parte de los asesorados
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