Supervised nearest neighbor search in finding similar operating conditions:case: mineral processing

Abstract. The main objective in this thesis was to identify and evaluate the applicability of machine learning methods that could be used in mineral processing as a tool for forecasting the direction in which where the current process values are going. The supervised machine learning method k-nearest neighbors (kNN) was selected for finding the closest correspondences from history data for the current process conditions. The literature review in this thesis describes mineral processing plant processes, mineral separation using flotation, mine-to-mill optimization, the CRISP-DM (Cross-industry Standard Process for Data Mining) procedure for data handling and machine learning methods in general. In addition, a few case studies on the usage of machine learning in mineral processing are presented. The experimental part of this thesis concentrates on data pre-processing and the development of the k-nearest neighbors function. MATLAB® was used for all the calculations and results presented in this thesis. The kNN algorithm presented in this study proved to be sufficient in finding the closest correspondence from history data for a current process conditions. At the time of completing this thesis, the kNN function was in a state where it could be used as part of a mine-to-mill expert system to extract a prediction of trajectories for the process’s key performance indicators. However, the function could still be improved by the addition of clustering, such as k-means, as a preliminary classification for kNN and ranking of nearest neighbors based on the area between the trajectories of neighbors and the query point.Samankaltaisten prosessitilojen etsiminen rikastusprosessissa lähimmän naapurin menetelmällä. Tiivistelmä. Työn päätavoitteena oli sellaisten koneoppimismenetelmien soveltuvuuden tunnistaminen ja arviointi, joita voitaisiin käyttää työkaluna rikastusprosessissa prosessin tilan ennusteissa. Ohjattua koneoppimista edustava k:n lähimmän naapurin menetelmä (kNN) valittiin keinoksi etsiä historiadatasta lähimmät vastaavuudet prosessin nykytilanteelle. Työn kirjallisuuskatsaus sisältää esittelyn rikastusprosessin yksikköprosesseihin, mineraalien erottamiseen vaahdotuksen avulla, mine-to-mill optimointiin, datan käsittelyyn suunniteltuun toimintamalliin (CRISP-DM) sekä koneoppimisen peruskäsitteisiin. Kirjallisuuskatsauksessa esitellään myös muutama tapaustutkimus koneoppimisen käyttämisestä rikastusprosessissa. Työn kokeellinen osa keskittyy datan esikäsittelyyn sekä k:n lähimmän naapurin menetelmän sovittamiseen työssä käytettävälle datasetille. Esikäsittely sekä työssä esitetyt tulokset tehtiin MATLAB® ohjelmiston avulla. Työssä esitelty k:n lähimmän naapurin algoritmi todettiin sopivaksi menetelmäksi löytää historiadatasta lähimmät vastaavuudet nykyiselle prosessitilalle. Työn valmistumishetkellä funktio oli siinä tilassa, että sitä voitaisiin käyttää osana mine-to-mill optimointiasiantuntijajärjestelmää prosessin tärkeimpien suorituskyvystä kertovien muuttujien (KPI) arvojen trajektorien ennustamisessa. Funktiota voitaisiin kehittää lisäämällä klusterointi, esimerkiksi k-means esiluokitteluksi k:n lähimmän naapurin menetelmälle, sekä järjestämällä menetelmän löytämät naapurit paremmuusjärjestykseen testipisteen ja niiden välisen pinta-alan perusteella

Social relationships among adolescents as described in an electronic diary : a mixed methods study

Social relationships among adolescents with mental disorders are demanding. Adolescents with depressive symptoms may have few relationships and have difficulties sharing their problems. Internet may offer reliable and easy to use tool to collect real-time information from adolescents. The aim of this study is to explore how adolescents describe their social relationships with an electronic diary. Mixed methods were used to obtain a broad picture of adolescents' social relationships with the data gathered from network maps and reflective texts written in an electronic diary. Adolescents who visited an outpatient clinic and used an intervention (N=70) designed for adolescents with signs of depression were invited to use the electronic diary; 29 did so. The quantitative data gathered in the electronic diary were summarized with descriptive statistics, and the qualitative data were categorized using a thematic analysis with an inductive approach. We found that social relationships among adolescents with signs of depression can vary greatly in regards to the number of existing relationships (from lacking to 21) and the quality of the relationships (from trustful to difficult). However, the relationships may change, and the adolescents are also willing to build up their social relationships. Professionals need to be aware of the diversity of adolescents' social relationships and their need for personalized support.Peer reviewe

Killing of Gyrodactylus salaris by heat and chemical disinfection

BACKGROUND: Gyrodactylus salaris is a monogenean, which has collapsed tens of wild Atlantic salmon populations. One of the means of preventing the spread of the parasite is the disinfection of the fishing equipment, which is used in the rivers having susceptible salmon populations. Little is known about the dosage of disinfectants against G. salaris. There are not standards for the testing of disinfectants against multicellular parasites. The present investigation developed a method to test disinfectants and examined the effectiveness of heated water and a commercially available disinfectant (Virkon S) in killing G. salaris. Individual G. salaris worms were followed under the microscope during treatment with heated water or Virkon S disinfectant blend. The logarithm of the time needed to kill the parasite was used as a dependent variable in linear regression. The upper 99.98 % prediction line for the dependent variable was used to obtain a value resembling the time needed for a 4 log reduction of the microbial pathogen, which is commonly used as a criterion for disinfectants. Also 6 log reduction was applied. RESULTS: Exposure to a relatively low temperature was found to kill the parasite. Even 5–50 min treatment (=10–100 times the 99.98 % upper prediction value) with heated water at 40 °C might be used. This would enable the utilisation of hot tap water in the disinfection of fishing gear. The present practice of 1 % Virkon S for 15 min was also found to kill the parasite. CONCLUSIONS: The follow-up of single parasites of a test population and the use of the calculated upper predictive line in the regression analysis offers a method to analyse the effects of disinfectants on parasites like G. salaris. The results of our tests give possibilities for using disinfection methods, which may be more acceptable by the fishermen than the present ones

Clinical efficacy of seasonal influenza vaccination : characteristics of two outbreaks of influenza A(H1N1) in immunocompromised patients

Background: Influenza A(H1N1) causes serious complications in immunocompromised patients. The efficacy of seasonal vaccination in these patients has been questioned. Aim: To describe two outbreaks of influenza A(H1N1) in immunocompromised patients. Methods: Two outbreaks of influenza A(H1N1) occurred in our institution: on the kidney transplant ward in 2014 including patients early after kidney or simultaneous pancreas-kidney transplantation, and on the oncology ward in 2016 including patients receiving chemotherapy for malignant tumours. Factors leading to these outbreaks and the clinical efficacy of seasonal influenza vaccination were analysed. Findings: Altogether 86 patients were exposed to influenza A(H1N1) during the outbreaks, among whom the seasonal influenza vaccination status was unknown in 10. Only three out of 38 vaccinated patients were infected with influenza A(H1N1), compared with 20 out of 38 unvaccinated patients (P = 0.02). The death of one out of 38 vaccinated patients was associated with influenza, compared with seven out of 38 unvaccinated patients (P = 0.06). Shared factors behind the two outbreaks included outdated facilities not designed for the treatment of immunosuppressed patients. Vaccination coverage among patients was low, between 40% and 70% despite vaccination being offered to all patients free of charge. Vaccination coverage of healthcare workers on the transplant ward was low (46%), but, despite high coverage on the oncology ward (92%), the outbreak occurred. Conclusion: Seasonal influenza vaccination was clinically effective with both a reduced risk of influenza infection and a trend towards reduced mortality in these immunocompromised patients. Several possible causes were identified behind these two outbreaks, requiring continuous awareness in healthcare professionals to prevent further outbreaks. (C) 2017 The Healthcare Infection Society. Published by Elsevier Ltd. All rights reserved.Peer reviewe

Strongyloides stercoralis infection in a Finnish kennel

Background: Intestinal threadworm Strongyloides stercoralis is a parasite of dog, cat and primates that occurs worldwide being most prevalent in tropical and subtropical countries. The adult parasitic worm is about 2 mm long and slender. It possesses both parasitic and free-living lifecycles. The parasitic worms are females. Strongyloides stercoralis infects the host via percutaneous, peroral or transmammary transmission in addition to autoinfection. Clinical disease varies from inapparent to severe enteritis and pneumonia. The diagnosis is based on demonstration of larvae in fresh faeces, which is best made by Baermann technique. Case presentation: Strongyloides stercoralis infection was diagnosed in autopsy in a 10-week-old puppy born and raised in a Finnish kennel. Prior to its sudden death, the puppy had suffered from gastrointestinal disturbance for three weeks. Subsequent sampling of the dogs in the kennel revealed that three adult dogs in the kennel were also infected. Conclusion: The present case shows that S. stercoralis can complete its life cycle and cause disease in dogs also in Northern Europe. Infection can be maintained also in a temperate climate and may become a chronic problem in a kennel environment. Infection may be underdiagnosed as Baermann technique is not routinely performed in small animal practice

Asiakaslähtöinen Toimintakykyni-sovellus. Kehittäminen ja käytettävyystutkimus

62 s.Tausta: Asiakkaan toimintakyvyn arviointi on tärkeä, toistuva ja aikaa vievä vaihe asiakkaan hakeutuessa sote-palveluihin. Asiakkaat kokevat asioidensa toistamisen useampaan kertaan turhauttavaksi. Kelan kehittämisrahaston rahoittamassa THL:n, Invalidiliiton ja Jyväskylän Ammattikorkeakoulun yhteistyöhankkeessa kehitettiin asiakkaille prototyyppi toimintakyvyn itsearviointia helpottavasta sovelluksesta ja testattiin sen käytettävyyttä. Sovelluksen työnimi oli mobiili ICanFunction (mICF, suomeksi Toimintakykyni). Menetelmät: Asiakkaan käyttöliittymää kehitettiin erikseen aikuisten (n = 47) ja lasten (n = 11) palvelumuotoilutyöpajoissa. Useista lähteistä koottu arkikielinen sisältö sillattiin ICF-luokkiin. Sisällön ylläpitoa ja sovelluksessa näyttämistä varten luotiin FunctionMapper-metatietokanta THL:n Termieditoriin. Standardoidut fyysisen toimintakyvyn PROMIS-mittari aikuisille ja liikkumisen PROMIS-mittari lapsille käännettiin suomeksi ja aikuisten mittari liitettiin sovellukseen. Koodaus toteutettiin standardien pohjalta ja kehitysversion 0.0.12 sai ladattua Playkaupasta tai Appstoresta omiin mobiililaitteisiin. Lapset (n = 11) sekä nuoret ja aikuiset (n = 19) käyttivät sitä noin viikon ajan, jonka jälkeen heidän kokemuksiaan sovelluksen käytettävyydestä kerättiin haastatteluilla. Lyhytkasvuisten henkilöiden (n = 13) toimintakyky-tietoa verrattiin LYHTY-tutkimuksen toimintakykyaineistoon. Tulokset: Sovelluksen avulla käyttäjä voi valita tärkeäksi kokemiaan aiheita ja kuvailla valitsemiaan toimintakykyyn tai ympäristötekijöihin liittyviä asioita asteikolla, sanallisesti tai valokuvilla. Käyttäjä sai täyttämistään tiedoista yhteenvedon, jota hän voi näyttää ammattilaiselle. Aikuiset ja nuoret kokivat Toimintakykyni-sovelluksen hyväksyttäväksi. He käyttäisivät sitä hakemusten teossa tai sote-palveluihin mennessään, jos se olisi liitetty niihin. Se koettiin helppokäyttöiseksi, mutta käyttömukavuus paranisi sovelluksen navigointia ja virheitä korjaamalla. He toivoivat sovellukseen alkuopastusta, visuaalisempaa yhteenvetoa ja mahdollisuutta seurata omassa tilanteessaan tapahtuvia muutoksia. Omaa arkitilannettaan he eivät voineet jakaa ammattilaisille, koska se koettiin keskeneräiseksi ja irralliseksi palveluista. Lapset käyttivät sovellusta innostuneesti. He pitivät sitä todella hyvänä välineenä saada oma äänensä kuuluviin. Johtopäätökset: Lopputuloksena syntyi Toimintakykyni-sovelluksen prototyyppi, joka mahdollisti asiakkaalle yksilöllisen ja monipuolisen sekä samalla rakenteisen toimintakykytiedon kuvaamisen. Aikuiset, nuoret ja lapset hyväksyivät sen ja pitivät sitä hyödyllisenä ja helppokäyttöisenä. He pystyivät kuvaamaan sovelluksen avulla elämäntilannettaan yksilöllisesti, mutta sovelluksen käsitteitä tulisi kehittää lisää. Asiakkaat käyttäisivät sovellusta erityisesti, jos se liitettäisiin moniin palveluihin. Jatkossa pitää varmistaa, että asiakkaiden kehitysehdotukset otetaan huomioon ja että sovelluksesta kehitetään yhteys sosiaali- ja terveydenhuollon tietojärjestelmiin. Asiakkaiden raportoima tieto tulisi ottaa huomioon palveluiden suunnittelussa ja seurannassa, jotta asiakkaat saisivat sovelluksen käytöstä täyden hyödyn

Asiakaslähtöinen Toimintakykyni-sovellus : Kehittäminen ja käytettävyystutkimus

Tausta: Asiakkaan toimintakyvyn arviointi on tärkeä, toistuva ja aikaa vievä vaihe asiakkaan hakeutuessa sote-palveluihin. Asiakkaat kokevat asioidensa toistamisen useampaan kertaan turhauttavaksi. Kelan kehittämisrahaston rahoittamassa THL:n, Invalidiliiton ja Jyväskylän Ammattikorkeakoulun yhteistyöhankkeessa kehitettiin asiakkaille prototyyppi toimintakyvyn itsearviointia helpottavasta sovelluksesta ja testattiin sen käytettävyyttä. Sovelluksen työnimi oli mobiili ICanFunction (mICF, suomeksi Toimintakykyni). Menetelmät: Asiakkaan käyttöliittymää kehitettiin erikseen aikuisten (n = 47) ja lasten (n = 11) palvelumuotoilutyöpajoissa. Useista lähteistä koottu arkikielinen sisältö sillattiin ICF-luokkiin. Sisällön ylläpitoa ja sovelluksessa näyttämistä varten luotiin FunctionMapper-metatietokanta THL:n Termieditoriin. Standardoidut fyysisen toimintakyvyn PROMIS-mittari aikuisille ja liikkumisen PROMIS-mittari lapsille käännettiin suomeksi ja aikuisten mittari liitettiin sovellukseen. Koodaus toteutettiin standardien pohjalta ja kehitysversion 0.0.12 sai ladattua Playkaupasta tai Appstoresta omiin mobiililaitteisiin. Lapset (n = 11) sekä nuoret ja aikuiset (n = 19) käyttivät sitä noin viikon ajan, jonka jälkeen heidän kokemuksiaan sovelluksen käytettävyydestä kerättiin haastatteluilla. Lyhytkasvuisten henkilöiden (n = 13) toimintakyky-tietoa verrattiin LYHTY-tutkimuksen toimintakykyaineistoon. Tulokset: Sovelluksen avulla käyttäjä voi valita tärkeäksi kokemiaan aiheita ja kuvailla valitsemiaan toimintakykyyn tai ympäristötekijöihin liittyviä asioita asteikolla, sanallisesti tai valokuvilla. Käyttäjä sai täyttämistään tiedoista yhteenvedon, jota hän voi näyttää ammattilaiselle. Aikuiset ja nuoret kokivat Toimintakykyni-sovelluksen hyväksyttäväksi. He käyttäisivät sitä hakemusten teossa tai sote-palveluihin mennessään, jos se olisi liitetty niihin. Se koettiin helppokäyttöiseksi, mutta käyttömukavuus paranisi sovelluksen navigointia ja virheitä korjaamalla. He toivoivat sovellukseen alkuopastusta, visuaalisempaa yhteenvetoa ja mahdollisuutta seurata omassa tilanteessaan tapahtuvia muutoksia. Omaa arkitilannettaan he eivät voineet jakaa ammattilaisille, koska se koettiin keskeneräiseksi ja irralliseksi palveluista. Lapset käyttivät sovellusta innostuneesti. He pitivät sitä todella hyvänä välineenä saada oma äänensä kuuluviin. Johtopäätökset: Lopputuloksena syntyi Toimintakykyni-sovelluksen prototyyppi, joka mahdollisti asiakkaalle yksilöllisen ja monipuolisen sekä samalla rakenteisen toimintakykytiedon kuvaamisen. Aikuiset, nuoret ja lapset hyväksyivät sen ja pitivät sitä hyödyllisenä ja helppokäyttöisenä. He pystyivät kuvaamaan sovelluksen avulla elämäntilannettaan yksilöllisesti, mutta sovelluksen käsitteitä tulisi kehittää lisää. Asiakkaat käyttäisivät sovellusta erityisesti, jos se liitettäisiin moniin palveluihin. Jatkossa pitää varmistaa, että asiakkaiden kehitysehdotukset otetaan huomioon ja että sovelluksesta kehitetään yhteys sosiaali- ja terveydenhuollon tietojärjestelmiin. Asiakkaiden raportoima tieto tulisi ottaa huomioon palveluiden suunnittelussa ja seurannassa, jotta asiakkaat saisivat sovelluksen käytöstä täyden hyödyn

Use of private gynaecologist does not relate to better prevention outcomes – An ecological analysis from Finland

BACKGROUND: Control of reproduction and prevention of reproductive health problems are important reasons for women to use health services, but the proper organisational level of service provision is not clear. The purpose of this study was to investigate whether visits to private gynaecologists correlate with better health outcomes and worse participation in organised screening for cancer programs. METHODS: This is an ecological analysis using municipalities and groups of women at 5-year age intervals within municipalities as study units. First, the Finnish municipalities (n = 452) were classified into three groups by the age-adjusted level of use of private gynaecologists. Secondly, each age group within municipalities was classified into tertiles by the level of private gynaecologist use. The outcomes were participation in cervical and organised breast cancer screening for cancer programmes, stage of gynaecological and breast cancers at diagnosis, and abortion rates and ratios. All data were obtained from national registers by groups at 5-year age intervals and by municipality. Raw and adjusted (age groups, and in some analyses, municipality social class index) odds ratios, total and by urbanity, were calculated. RESULTS: The proportions of women participating in cervical cancer and organised breast cancer screening for cancer were somewhat higher in the groups having a low use of private gynaecologists. The proportions of local cancers of all cervical, uterine, ovarian and breast cancers were similar in the three groups, even though the first analysis method suggested somewhat better results for the low-use group in case of cervical cancer and for the high-use group in case of uterine and breast cancer. The rates of induced abortion were higher in municipalities having a high use of private gynaecologists than in those having lower use. CONCLUSION: This ecological analysis suggests that frequent use of private gynaecologists relates somewhat to lower organised screening for cancer participation, and is not better in preventing abortions or in detecting cancer earlier. Our results suggest that a planned system relying mainly on general practitioners and public health nurses as the first line care providers is equally good for women's reproductive health as that in which specialists are used

Routine wastewater-based monitoring of antibiotic resistance in two Finnish hospitals : focus on carbapenem resistance genes and genes associated with bacteria causing hospital-acquired infections

Background: Wastewater-based monitoring represents a useful tool for antibiotic resist-ance surveillance. Aim: To investigate the prevalence and abundance of antibiotic resistance genes (ARGs) in hospital wastewater over time. Methods: Wastewater from two hospitals in Finland (HUS1 and HUS2) was monitored weekly for nine weeks (weeks 25-33) in summer 2020. A high-throughput real-time poly-merization chain reaction (HT-qPCR) system was used to detect and quantify 216 ARGs and genes associated with mobile genetic elements (MGEs), integrons, and bacteria causing hospital-acquired infections (HAIs), as well as the 16S rRNA gene. Data from HT-qPCR were analysed and visualized using a novel digital platform, ResistApp. Eight carbapenem resistance genes (blaGES, blaKPC, blaVIM, blaNDM, blaCMY, blaMOX, blaOXA48, and blaOXA51) and three genes associated with bacteria causing HAIs (Acinetobacter bau-mannii, Klebsiella pneumoniae, and Pseudomonas aeruginosa) were studied. Findings: There was a significantly higher number of ARGs at both hospitals in weeks 27-30 (174-191 genes) compared to other sampling weeks (151-171 genes). Our analyses also indicated that the two hospitals, which used different amounts of antibiotics, had significantly different resistance gene profiles. Carbapenem resistance genes were more prevalent and abundant in HUS1 than HUS2. Across both hospitals, blaGES and blaVIM were the most prevalent and abundant. There was also a strong positive association between blaKPC and K. pneumoniae in HUS1 wastewater. Conclusion: Routine wastewater-based monitoring using ResistApp can provide valuable information on the prevalence and abundance of ARGs in hospitals. This helps hospitals understand the spread of antibiotic resistance in hospitals and identify potential areas for intervention. (c) 2021 The Authors. Published by Elsevier Ltd on behalf of The Healthcare Infection Society. This is an open access article under the CC BY-NC-ND license (http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/).Peer reviewe