Aplicação de análises estatísticas univariada e multivariada na seleção clonal de Eucalyptus spp. para a produção de carvão vegetal

The aim of this study was to select superior materials of Eucalyptus spp. using univariate and multivariate statistical analyzes. Twenty-five genetic materials from Eucalyptus spp. collected in Itamarandiba, Minas Gerais were used. The properties of wood and charcoal were determined for all genetic materials, in addition to the gravimetric yield. Data were submitted to Scott-Knott hierarchical clustering algorithm as univariate analysis. For the multivariate approach, a combination between principal component analysis and hierarchical cluster analysis was used. Both analyzes were efficient in the selection of genetic materials for charcoal production. According to the Scott-Knott test, genetic materials 9 and 21 were the most suitable to produce charcoal. By means of the multivariate analyzes the most indicated were 9, 10 and 21. The Scott-Knott test allowed the visualization of the results of each quality parameter independently. On the other hand, the multivariate tools enabled the observation of the relation between the properties of wood and charcoal.O objetivo deste trabalho foi selecionar os materiais superiores de Eucalyptus spp. a partir de análises estatísticas univariada e multivariada. Utilizaram-se 25 materiais genéticos de Eucalyptus spp., coletados no município de Itamarandiba, Minas Gerais. Foram determinadas as propriedades da madeira e do carvão vegetal para todos os materiais genéticos, além do rendimento gravimétrico. Os dados foram submetidos ao algoritmo de agrupamento hierárquico Scott-Knott, como análise univariada. Para a realização da abordagem multivariada, utilizou-se uma combinação entre as análises de componentes principais e a análise de agrupamentos hierárquicos. Ambas as análises se mostraram eficientes na seleção de materiais genéticos para a produção de carvão vegetal. De acordo com o teste de Scott-Knott, os materiais genéticos 9 e 21 foram os mais indicados para a produção de carvão vegetal. Por meio das análises multivariadas, os mais indicados foram o 9, 10 e 21. O teste de Scott-Knott permitiu a visualização dos resultados de cada parâmetro de qualidade de forma independente, por outro lado, as ferramentas multivariadas possibilitaram a observação das relações entre as propriedades da madeira e do carvão vegetal

Precisão experimental de métodos de análise espacial para avaliação da produtividade de famílias de feijão comum

As estratégias de análise que modelam a dependência espacial, na forma de análise de covariância, têm sido sugeridas no melhoramento de plantas, a fim de exercer maior controle local e aumentar a precisão experimental. Este estudo teve como objetivo avaliar o grau de dependência espacial de erros em ensaios de produtividade para avaliar famílias de feijão comum; comparar a precisão experimental dos métodos de análise espacial, média móvel e Papadakis; identificar as parcelas vizinhas mais adequadas para o cálculo do índice ambiente; e propor e avaliar mudanças na aplicação desses métodos de análise espacial. Foram utilizados dados de rendimento de grãos de famílias de feijoeiro da temporada de inverno 2006/2007 e seca 2007/2008. Nesses ensaios, o número de famílias avaliadas variou de 25 a 400, caracterizando a rede quadrada de 5 × 5 a 20 × 20. As médias móveis e os métodos de Papadakis, combinados com o delineamento de blocos ao acaso, garantem independência espacial dos erros e apresentaram precisão experimental semelhante à da análise em látice. Para o cálculo do índice ambiental, a maior precisão experimental foi obtida a partir do uso de duas parcelas vizinhas, uma superior e outra inferior à parcela de referência. A modificação proposta na aplicação dos métodos de análise espacial proporcionou maior precisão experimental em relação à análise em látice, principalmente em ensaios com moderada dependência espacial e com a reaplicação do método de Papadakis.The analysis strategies that model spatial dependence, in the form of covariance analysis, have been suggested in plant breeding, in order to exert greater local control and to increase experimental precision. This study aimed to evaluate the degree of spatial dependence of errors in productivity experiments to evaluate common bean families, to compare the experimental precision of the methods of spatial analysis, moving average and Papadakis, identify the most suitable neighboring plots for the calculation of the environmental index, besides proposing and evaluating changes in the application of these methods of spatial analysis. Data of grain yield of common bean families of the winter season 2006/2007 and drought season 2007/2008 were used. In these experiments, the number of families evaluated ranged from 25 to 400, characterizing the 5 × 5 to 20 × 20 square lattice. The moving averages and Papadakis methods, combined with the randomized block design, ensure spatial independence of the errors and presented experimental precision similar to that of the lattice analysis. For the calculation of the environmental index, the highest experimental precision was obtained from the use of two neighboring plots, one upper and one lower than the reference plot. The proposed modification in the application of the methods of spatial analysis provided greater experimental precision in relation to the lattice analysis, especially in experiments with moderate spatial dependence and using the reapplication of the Papadakis metho

DESEMPENHO DOS MÉTODOS DE ESTIMAÇÃO GENÔMICOS NA IDENTIFICAÇÃO DA RESISTÊNCIA DO ARROZ À BRUSONE

In recent years, rice crop losses have increased due to biotic and abiotic stresses, among which brusone, which can result in 100% losses in susceptible rice cultivars. Therefore, it becomes strategic to identify methodologies that select resistant cultivars. In this work, we aimed to use ROC (Receiver operator characteristic) curve analysis and traditional measures to evaluate the performance of genomic estimation models (RR-BLUP, BLASSO and Bayes Cπ) in identifying rice resistance to brusone. The RR-BLUP and Bayes Cπ models were most accurate for the prediction of brusone resistance, while the best runtime was obtained by RR-BLUP. The area under the ROC curve was equivalent to traditional measures to evaluate the accuracy of the models, with the advantage of allowing graphical evaluation. By graphical analysis, BLASSO performed worst at high levels of specificity (>0.75). At lower levels of specificity, the sensitivity of the models was similar. The ROC methodology proved to be a good alternative for the evaluation of genomic prediction models, and can be used for the selection of rice cultivars resistant to brusone.En los últimos años ha aumentado la pérdida de cosechas de arroz debido a estreses bióticos y abióticos, entre los que destaca la brusona, que puede provocar pérdidas del 100% en los cultivares de arroz susceptibles. Por lo tanto, resulta estratégico identificar metodologías que seleccionen cultivares más resistentes a la enfermedad. En este trabajo, nos propusimos utilizar el análisis de la curva ROC (Receiver operator characteristic) y las medidas tradicionales para evaluar el rendimiento de los modelos de estimación genómica (RR-BLUP, BLASSO y Bayes Cπ) en la identificación de la resistencia del arroz a la brusona. Los modelos RR-BLUP y Bayes Cπ fueron los más precisos para la predicción de la resistencia a la brusona, mientras que el menor tiempo de ejecución lo consiguió el RR-BLUP. El área bajo la curva ROC era equivalente a las medidas tradicionales para evaluar la precisión de los modelos, con la ventaja de permitir una evaluación gráfica. Mediante el análisis gráfico, BLASSO consiguió un rendimiento inferior a niveles altos de especificidad (>0,75). A niveles de especificidad más bajos, la sensibilidad de los modelos era similar. La metodología ROC demostró ser una buena alternativa para la evaluación de modelos de predicción genómica, y puede utilizarse para la selección de cultivares de arroz resistentes a la brusona.Nos últimos anos, a perda de safras de arroz vem aumentando devido a estresses bióticos e abióticos, dentre os quais se destaca a brusone, que pode resultar em perdas de 100% em cultivares de arroz susceptíveis. Portanto, torna-se estratégico identificar metodologias que selecionem cultivares mais resistentes à doença. Neste trabalho, objetivou-se utilizar a análise de curva ROC (Receiver operator characteristic) e medidas tradicionais para a avaliação do desempenho de modelos de estimação genômicos (RR-BLUP, BLASSO e Bayes Cπ) na identificação da resistência do arroz à brusone. Os modelos RR-BLUP e Bayes Cπ foram mais acurados para a predição de resistência à brusone, enquanto o menor tempo de execução foi obtido pelo RR-BLUP. A área abaixo da curva ROC foi equivalente às medidas tradicionais para avaliar a acurácia dos modelos, com a vantagem de permitir a avaliação gráfica. Pela análise gráfica, o BLASSO obteve menor desempenho em altos níveis de especificidade (>0,75). Em menores níveis de especificidade, a sensibilidade dos modelos foi similar. A metodologia ROC mostrou-se uma boa alternativa para avaliação de modelos de predição genômica, podendo ser utilizada para a seleção de cultivares de arroz resistentes à brusone. Palavras-chave: brusone do arroz; modelagem estatística; seleção genômica ampla; análise ROC; acurácia.   Performance of genomic estimation methods in the identification of rice resistance to brusone   ABSTRACT: In recent years, rice crop losses have increased due to biotic and abiotic stresses, among which brusone, which can result in 100% losses in susceptible rice cultivars. Therefore, it becomes strategic to identify methodologies that select resistant cultivars. In this work, we aimed to use ROC (Receiver operator characteristic) curve analysis and traditional measures to evaluate the performance of genomic estimation models (RR-BLUP, BLASSO and Bayes Cπ) in identifying rice resistance to brusone. The RR-BLUP and Bayes Cπ models were most accurate for the prediction of brusone resistance, while the best runtime was obtained by RR-BLUP. The area under the ROC curve was equivalent to traditional measures to evaluate the accuracy of the models, with the advantage of allowing graphical evaluation. By graphical analysis, BLASSO performed worst at high levels of specificity (>0.75). At lower levels of specificity, the sensitivity of the models was similar. The ROC methodology proved to be a good alternative for the evaluation of genomic prediction models, and can be used for the selection of rice cultivars resistant to brusone. Keywords: rice blast; statistical modelling; genomics wide selection; ROC analysis; accuracy

Análise de medidas repetidas na avaliação de clones de café 'Conilon'

The objective of this work was to evaluate the production of fi fty clonal varieties coffee 'Conilon' (Coffea canephora), through the repeated measure methodology in order to identify and cluster them to obtainmore productive genetic materials and to model, simultaneously, the correlation between subsequent years. The infl uence of productive cycles was effi ciently regarded in the analysis by modeling the correlations between successive records of the genetic materials of fi ve years (1997 to 2001), through this statistical methodology. The repeated measure analysis showed annual oscillations over the cycles of C. canephora, related to the largest productions in the third and forth years. Moreover, the cluster analysis grouped the 50 clones into 10 groups, according to standard production oscillations identifi ed through the adopted regression model.O objetivo deste trabalho foi analisar a produção de 50 clones de café 'Conilon' (Coffea canephora), por meio da análise de medidas repetidas, para identifi cá-los e agrupá-los para a formação de variedades maisprodutivas e, simultaneamente, modelar possíveis oscilações da produção ao longo do tempo. A infl uência de ciclos produtivos foi considerada, tendo-se modelado as correlações existentes entre anos subseqüentes, de forma efi ciente, por meio da metodologia de análise de medidas repetidas, para avaliar produções dos materiais genéticos em cinco safras (1997 a 2001), o que possibilitou captar oscilações anuais na produção, ao longo do ciclo produtivo de C. canephora, relacionadas às maiores produções no terceiro e quarto anos. Além disso, a análise de grupo classifi cou os 50 materiais avaliados em apenas 10 grupos, de acordo com o padrão deoscilação da produção identifi cado pelo modelo de regressão adotado

Vitamin C supplementation in diets for giant trahira

The objective of this work was to evaluate the effect of diet supplementation with vitamin C on productive performance, morphological changes, and fatty acid profile of the carcass of juvenile giant trahira (Hoplias lacerdae). A completely randomized design was used, with seven treatments (0, 17.5, 52.5, 87.5, 122.5, 175, and 350 mg kg-1 of vitamin C in the diet) and four replicates. After 62 days, the following were evaluated: weight and length gains, survival and cannibalism rates, final length uniformity, clinical signs of excess or deficiency of vitamin C, the presence of bone deformities, and fatty acid profile of the carcass. Fish fed the diet without vitamin C showed higher final length uniformity. No deformities were detected in fish body. Radiological analysis confirmed the absence of bone deformities. A positive linear effect was observed in vitamin C levels in the diet for myristic and arachidonic acids. Therefore, vitamin C influences the metabolism of fatty acids in fish carcass. During the initial growth of juvenile giant trahira, vitamin C does not cause bone deformities and does not influence productive performance, but negatively affects uniformity as to the final length of juvenile giant trahira.O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da suplementação da dieta com vitamina C no desempenho produtivo, nas alterações morfológicas e no perfil de ácidos graxos da carcaça de juvenis de trairão (Hoplias lacerdae). Utilizou-se o delineamento inteiramente casualizado, com sete tratamentos (0, 17,5, 52,5, 87,5, 122,5, 175 e 350 mg kg-1 de vitamina C na ração) e quatro repetições. Ao final de 62 dias, foram avaliados: ganhos de peso e comprimento, taxas de sobrevivência e canibalismo, uniformidade do comprimento final, sinais clínicos de excesso ou deficiência de vitamina C, presença de deformidades ósseas e perfil de ácidos graxos da carcaça. Peixes alimentados com a dieta isenta de vitamina C apresentaram maior uniformidade em comprimento final. Não foram detectadas deformidades no corpo dos peixes. As análises radiológicas confirmaram a ausência de deformidades ósseas. Observou-se efeito linear positivo dos níveis de vitamina C na dieta para os ácidos mirístico e araquidônico. Portanto, a vitamina C influencia o metabolismo de ácidos graxos da carcaça dos peixes. Durante o crescimento inicial de juvenis de trairão, a vitamina C não causa deformidades ósseas e não influencia o desempenho produtivo, porém afeta de forma negativa a uniformidade quanto ao comprimento final de juvenis de trairão

Suplementação de vitamina C em dietas para juvenis de trairão

The objective of this work was to evaluate the effect of diet supplementation with vitamin C on productive performance, morphological changes, and fatty acid profile of the carcass of juvenile giant trahira (Hoplias lacerdae). A completely randomized design was used, with seven treatments (0, 17.5, 52.5, 87.5, 122.5, 175, and 350 mg kg-1 of vitamin C in the diet) and four replicates. After 62 days, the following were evaluated: weight and length gains, survival and cannibalism rates, final length uniformity, clinical signs of excess or deficiency of vitamin C, the presence of bone deformities, and fatty acid profile of the carcass. Fish fed the diet without vitamin C showed higher final length uniformity. No deformities were detected in fish body. Radiological analysis confirmed the absence of bone deformities. A positive linear effect was observed in vitamin C levels in the diet for myristic and arachidonic acids. Therefore, vitamin C influences the metabolism of fatty acids in fish carcass. During the initial growth of juvenile giant trahira, vitamin C does not cause bone deformities and does not influence productive performance, but negatively affects uniformity as to the final length of juvenile giant trahira.O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da suplementação da dieta com vitamina C no desempenho produtivo, nas alterações morfológicas e no perfil de ácidos graxos da carcaça de juvenis de trairão (Hoplias lacerdae). Utilizou-se o delineamento inteiramente casualizado, com sete tratamentos (0, 17,5, 52,5, 87,5, 122,5, 175 e 350 mg kg-1 de vitamina C na ração) e quatro repetições. Ao final de 62 dias, foram avaliados: ganhos de peso e comprimento, taxas de sobrevivência e canibalismo, uniformidade do comprimento final, sinais clínicos de excesso ou deficiência de vitamina C, presença de deformidades ósseas e perfil de ácidos graxos da carcaça. Peixes alimentados com a dieta isenta de vitamina C apresentaram maior uniformidade em comprimento final. Não foram detectadas deformidades no corpo dos peixes. As análises radiológicas confirmaram a ausência de deformidades ósseas. Observou-se efeito linear positivo dos níveis de vitamina C na dieta para os ácidos mirístico e araquidônico. Portanto, a vitamina C influencia o metabolismo de ácidos graxos da carcaça dos peixes. Durante o crescimento inicial de juvenis de trairão, a vitamina C não causa deformidades ósseas e não influencia o desempenho produtivo, porém afeta de forma negativa a uniformidade quanto ao comprimento final de juvenis de trairão