Elucidating differential nano-bio interactions of multi-walled andsingle-walled carbon nanotubes using subcellular proteomics

Understanding the relationship between adverse exposure events and specific material properties will facilitate predictive classification of carbon nanotubes (CNTs) according to their mechanisms of action, and a safe-by-design approach for the next generation of CNTs. Mass-spectrometry-based proteomics is a reliable tool to uncover the molecular dynamics of hazardous exposures, yet challenges persist with regards to its limited dynamic range when sampling whole organisms, tissues or cell lysates. Here, the simplicity of the sub-cellular proteome was harnessed to unravel distinctive adverse exposure outcomes at the molecular level, between two CNT subtypes. A549, MRC9 and human macrophage cells, were exposed for 24h to non-cytotoxic doses of single-walled or multi-walled CNTs (swCNTs or mwCNTs). Label-free proteomics on enriched cytoplasmic fractions was complemented with analyses of reactive oxygen species (ROS) production and mitochondrial integrity. The extent/number of modulated proteoforms indicated the single-walled variant was more bioactive. Greater enrichment of pathways corresponding to oxido-reductive activity was consistent with greater intracellular ROS induction and mitochondrial dysfunction capacities of swCNTs. Other compromised cellular functions, as revealed by pathway analysis were; ribosome, spliceosome and DNA repair. Highly upregulated proteins (fold change in abundance >6) such as, APOC3, RBP4 and INS are also highlighted as potential markers of hazardous CNT exposure. We conclude that, changes in cytosolic proteome abundance resulting from nano-bio interactions, elucidate adverse response pathways and their distinctive molecular components. Our results indicate that CNT-protein interactions might have a thus far unappreciated significance for protein trafficking, and this warrants further investigation.Peer reviewe

Sähköisen moniammatillisen kotiutuslistan kehittäminen sairaalasta kotiutuksen tueksi

To promote effective and safe patient discharge, it is necessary to harmonize discharge practices and improve the content of the electronic nursing discharge summary. The use of a discharge checklist can improve the continuity and quality of patient’s care. It helps to remind of the essential things that are relevant to the continuity of care during the care period and can used in, for example, the compilation of an electronic nursing discharge summary.   In this article we describe the development of the content of a multiprofessional discharge checklist into the nursing documentation system in order to harmonize the recording of the patient’s admission and care period as a result of co-operation between literature and professionals (n = 82) working in specialized health care, primary care and social work. The discharge checklist included some of the key issues for safe patient discharge that emerged from the literature, the available paper discharge checking list examples and multiprofessional workgroups. The discharge checklist was piloted at Satakunta Hospital District. Piloting was carried out in three central hospital wards (lung diseases, internal medicine, neurology) and at the elderly psychiatry and rehabilitation wards in paper format, after which the information content was transferred into an electronic form into Efficais nursing documentation system as part of the patient’s clinical care plan.Potilaan sujuvan ja turvallisen kotiutumisen edistämiseksi tarvitaan kotiutuskäytäntöjen yhtenäistämistä ja sähköisen hoitotyön yhteenvedon tietosisällön parantamista. Kotiutuslistan käytöllä voidaan parantaa potilaan hoidon jatkuvuutta ja laatua. Se auttaa muistuttamaan hoidon jatkuvuuden kannalta oleellisista asioista hoitojakson aikana, ja sitä voidaan hyödyntää esimerkiksi sähköisen hoitotyön yhteenvedon laatimisessa. Kuvaamme tässä artikkelissa moniammatillisen kotiutuslistan tietosisällön kehittämistä hoitokertomukseen potilaan tulotilanteen ja hoitojakson aikaisen kirjaamisen yhtenäistämiseksi kirjallisuuden sekä erikoissairaanhoidossa, perusterveydenhuollossa ja sosiaalipalveluissa työskentelevien ammattilaisten (n = 82) yhteistyön tuloksena. Kotiutuslistaan sisällytettiin aikaisemman kirjallisuuden, käytössä olleiden paperisten kotiutuslistaesimerkkien ja moniammatillisten työryhmien tuotoksena syntyneitä potilaan turvallisen kotiutuksen kannalta keskeisiä tarkasteltavia asioita. Kotiutuslista pilotoitiin Satakunnan sairaanhoitopiirissä. Pilotointi toteutettiin kolmella keskussairaalan vuodeosastolla, keuhkosairauksilla, sisätaudeilla ja neurologialla, sekä vanhuspsykiatrian ja kuntoutuksen vuodeosastoilla paperimuodossa. Pilotoitu tietosisältö siirrettiin sähköiseen muotoon Effican hoitokertomukseen (hokeen) osaksi potilaan kliinistä hoitosuunnitelmaa. Moniammatillinen kotiutuslista otettiin pilotin jälkeen käyttöön Satakunnan erikoissairaanhoidon palveluissa. Kotiutuslistan keskeisimmät jatkokehittämistarpeet kohdistuvat asiakas- ja potilasnäkökulman esille saamiseen sekä sen tekniseen toimivuuteen potilastietojärjestelmässä

Pathways affected by asbestos exposure in normal and tumour tissue of lung cancer patients

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Studies on asbestos-induced tumourigenesis have indicated the role of, e.g., reactive oxygen/nitrogen species, mitochondria, as well as NF-κB and MAPK signalling pathways. The exact molecular mechanisms contributing to asbestos-mediated carcinogenesis are, however, still to be characterized.</p> <p>Methods</p> <p>In this study, gene expression data analyses together with gene annotation data from the Gene Ontology (GO) database were utilized to identify pathways that are differentially regulated in lung and tumour tissues between asbestos-exposed and non-exposed lung cancer patients. Differentially regulated pathways were identified from gene expression data from 14 asbestos-exposed and 14 non-exposed lung cancer patients using custom-made software and Iterative Group Analysis (iGA). Western blotting was used to further characterize the findings, specifically to determine the protein levels of UBA1 and UBA7.</p> <p>Results</p> <p>Differences between asbestos-related and non-related lung tumours were detected in pathways associated with, e.g., ion transport, NF-κB signalling, DNA repair, as well as spliceosome and nucleosome complexes. A notable fraction of the pathways down-regulated in both normal and tumour tissue of the asbestos-exposed patients were related to protein ubiquitination, a versatile process regulating, for instance, DNA repair, cell cycle, and apoptosis, and thus being also a significant contributor of carcinogenesis. Even though UBA1 or UBA7, the early enzymes involved in protein ubiquitination and ubiquitin-like regulation of target proteins, did not underlie the exposure-related deregulation of ubiquitination, a difference was detected in the UBA1 and UBA7 levels between squamous cell carcinomas and respective normal lung tissue (p = 0.02 and p = 0.01) without regard to exposure status.</p> <p>Conclusion</p> <p>Our results indicate alterations in protein ubiquitination related both to cancer type and asbestos. We present for the first time pathway analysis results on asbestos-associated lung cancer, providing important insight into the most relevant targets for future research.</p

Coolest student papers at Finland Futures Research Centre 2020–2021: Tulevaisuuden tutkimuskeskuksen valittuja opiskelijatöitä 2020–2021

You are reading our already sixth annual publication of the Coolest Student Papers. With this publication, we at the Finland Futures Research Centre (FFRC) want to create a channel for making visible the hard work, academic talent and creativity featured in our courses. This issue covers courses from the international Master’s Degree Programme in Futures Studies (FUTU), courses organised by Finland Futures Academy (FFA) (taught in Finnish), and the interdisciplinary team work course of Sustainable Development Studies (KEKO) (taught both in Finnish and in English). All study programs are coordinated by the FFRC. Each course forms its own section with a description of intended learning outcomes, an introduction by the teacher(s), followed by the papers. This year’s papers are unique not only because of their interesting ways of exploring and peeking into futures but also because they all have been written during the global pandemic. It makes you appreciate these papers even more, when you realize the lack of luxury of face-to-face peer commenting. The futures community in Finland is quite widespread and we know that both our current students and our alumni are always looking forward getting a hold of this publication. But only when we learned that we have readers around the world we have realized that there is a special need for this kind of a publication. Academic approach does not have to be boring and full of rules. We hope that you enjoy the perceptional knowledge and the kaleidoscopic view these papers offer in futures studies. We would also appreciate any feedback you want to give! You can send your feedback via [email protected]

COOLEST STUDENT PAPERS AT FINLAND FUTURES RESEARCH CENTRE 2021–2022: Tulevaisuuden tutkimuskeskuksen valittuja opiskelijatöitä 2021–2022

Tärkeä osa maisteriopintojen oppimistavoitteita on osoittaa, että opiskelija pystyy itsenäiseen tutkimustyöhön ja tuottamaan tieteellistä tekstiä artikkeleiden ja muiden julkaisutapojen muodossa. Akateeminen kirjoittaminen on oma osaamisalueensa, ja vaikka sosiaalinen media ja tieteen popularisaatio asettavat erilaisia haasteita ja kanavia tutkimustulosten levittämiseen kuin perinteinen akateeminen julkaiseminen, tiedeyhteisössä vallinnee konsensus siitä, että tutkijoiden on osattava tuottaa akateemista tekstiä. Opintojen on tuettava tämän taidon kehittymistä. Tulevaisuuden tutkimuskeskus on julkaissut vuodesta 2016 lähtien koosteita ansiokkaista opiskelijoiden opintojensa aikana kirjoittamista esseistä, harjoitustöistä ja muista kirjallisista opintosuoritteista. Haluamme tarjota opiskelijoille oikean julkaisukanavan ja auttaa heitä saamaan vaikka sen ensimmäisen julkaisutiedon ansioluetteloon. Tämänvuotinen julkaisumme osoittaa, että pelko opiskelijoiden kirjallisten kykyjen huonontumisesta tai taantumisesta on turhaa. Samalla se todistaa myös opettajiemme onnistuneen opiskelijoiden akateemisen kirjoittamisen taitojen harjaannuttamisessa. Julkaisumme koostuu tulevaisuudentutkimuksen kansainvälisen maisteriohjelman, Turun yliopiston kestävän kehityksen opintokokonaisuuden (KEKO) ja Tulevaisuudentutkimuksen Verkostoakatemian (TVA) opiskelijoiden kirjoituksista. Koska opiskelijatyöt on tehty englanniksi maisteriohjelmassa ja suomeksi KEKO- ja TVA-opinnoissa, julkaisemme työt alkuperäisellä kielellä. Sisällöllisesti aiheet vaihtelevat suuresti, mutta niitä yhdistävä tekijä on tulevaisuussuuntautuneisuus. Samalla ne kertovat tulevaisuuksien moninaisuudesta sekä mahdollisista tavoista ja keinosta ymmärtää tulevaisuuksia. Toivotan mukavia lukuhetkiä!---- An important part of the study goals of master’s studies is that students show that they are able to make works of independent research and produce scientific texts in different forms, like articles and other publication formats. Academic writing is a skill of its own and even if social media and popularisation of science have changed the criteria of dissemination of research results compared to traditional academic publication forums, I believe that the scientific community still would agree that researchers must be able to produce scientific text. Studies have to support the development of writing skills. Finland Futures Research Centre has published since 2016 a collection of the most prominent student papers written during their studies. FFRC wants to offer a real publication forum for students and perhaps help them to get their first publication marked on their list of publications. This year’s collection of papers shows that any fear of declining or worsening academic writing skills of students is groundless. At the same time, it shows that our teachers are succeeding in training of these skills. Our publication consists of writings by students from our Masters Degree Programme in Futures Studies, Sustainable Development Studies at the University of Turku and Finland Futures Academy. These study programs are coordinated by FFRC. Because student papers are originally written in Finnish or English, we publish them in their original language. The contents and context of the papers vary a lot, but the common feature is futures orientation. All of them tell a story of multiple futures and of possible ways and means to understand futures. I hope You enjoy reading our book

Hiilinanoputkien aiheuttamien terveysvaikutusten karakterisointi systeemitoksikologian avulla

Hiilinanoputket ovat monikäyttöisiä teollisia nanomateriaaleja, jotka soveltuvat lukuisiin teollisuusaloihin. Hiilinanoputkien asbestin kaltainen muoto on kuitenkin nostanut esiin kysymyksiä niiden turvallisuudesta.1

Coolest Student Papers at Finland Futures Research Centre 2021–2022. Tulevaisuuden tutkimuskeskuksen valittuja opiskelijatöitä 2021–2022

Tärkeä osa maisteriopintojen oppimistavoitteita on osoittaa, että opiskelija pystyy itsenäiseen tutkimustyö-hön ja tuottamaan tieteellistä tekstiä artikkeleiden ja muiden julkaisutapojen muodossa. Akateeminen kir-joittaminen on oma osaamisalueensa, ja vaikka sosiaalinen media ja tieteen popularisaatio asettavat eri-laisia haasteita ja kanavia tutkimustulosten levittämiseen kuin perinteinen akateeminen julkaiseminen, tie-deyhteisössä vallinnee konsensus siitä, että tutkijoiden on osattava tuottaa akateemista tekstiä. Opintojen on tuettava tämän taidon kehittymistä.Tulevaisuuden tutkimuskeskus on julkaissut vuodesta 2016 lähtien koosteita ansiokkaista opiskelijoi-den opintojensa aikana kirjoittamista esseistä, harjoitustöistä ja muista kirjallisista opintosuoritteista. Halu-amme tarjota opiskelijoille oikean julkaisukanavan ja auttaa heitä saamaan vaikka sen ensimmäisen jul-kaisutiedon ansioluetteloon. Tämänvuotinen julkaisumme osoittaa, että pelko opiskelijoiden kirjallisten ky-kyjen huonontumisesta tai taantumisesta on turhaa. Samalla se todistaa myös opettajiemme onnistuneen opiskelijoiden akateemisen kirjoittamisen taitojen harjaannuttamisessa.Julkaisumme koostuu tulevaisuudentutkimuksen kansainvälisen maisteriohjelman, Turun yliopiston kestävän kehityksen opintokokonaisuuden (KEKO) ja Tulevaisuudentutkimuksen Verkostoakatemian (TVA) opiskelijoiden kirjoituksista. Koska opiskelijatyöt on tehty englanniksi maisteriohjelmassa ja suo-meksi KEKO- ja TVA-opinnoissa, julkaisemme työt alkuperäisellä kielellä. Sisällöllisesti aiheet vaihtelevat suuresti, mutta niitä yhdistävä tekijä on tulevaisuussuuntautuneisuus. Samalla ne kertovat tulevaisuuksien moninaisuudesta sekä mahdollisista tavoista ja keinosta ymmärtää tulevaisuuksia. Toivotan mukavia lukuhetkiä!An important part of the study goals of master’s studies is that students show that they are able to make works of independent research and produce scientific texts in different forms, like articles and other publi-cation formats. Academic writing is a skill of its own and even if social media and popularisation of science have changed the criteria of dissemination of research results compared to traditional academic publication forums, I believe that the scientific community still would agree that researchers must be able to produce scientific text. Studies have to support the development of writing skills.Finland Futures Research Centre has published since 2016 a collection of the most prominent student papers written during their studies. FFRC wants to offer a real publication forum for students and perhaps help them to get their first publication marked on their list of publications. This year’s collection of papers shows that any fear of declining or worsening academic writing skills of students is groundless. At the same time, it shows that our teachers are succeeding in training of these skills.Our publication consists of writings by students from our Masters Degree Programme in Futures Stud-ies, Sustainable Development Studies at the University of Turku and Finland Futures Academy. These study programs are coordinated by FFRC. Because student papers are originally written in Finnish or English, we publish them in their original language. The contents and context of the papers vary a lot, but the common feature is futures orientation. All of them tell a story of multiple futures and of possible ways and means to understand futures. I hope You enjoy reading our book!FFRC eBooks 9/202