Agrupamento de sequências de miRNA utilizando aprendizado não-supervisionado baseado em grafos

Cluster analysis is the organization of a collection of patterns into clusters based on similarity which is determined by using properties of data. Clustering techniques can be useful in a variety of knowledge domains such as biotechnology, computer vision, document retrieval and many others. An interesting area of biology involves the concept of microRNAs (miRNAs) that are approximately 22 nucleotide-long non-coding RNA molecules that play important roles in gene regulation. Clustering miRNA sequences can help to understand and explore sequences belonging to the same cluster that has similar biological functions. This research work investigates and explores seven unsupervised clustering algorithms based on graphs that can be divided into three categories: algorithm based on region of influence, algorithm based on minimum spanning tree and spectral algorithm. To assess the contribution of the proposed algorithms, data from miRNA families stored in the online miRBase database were used in the conducted experiments. The results of these experiments were presented, analysed and evaluated using clustering validation indexes as well as visual analysis.Não recebi financiamentoA análise de agrupamento é uma organização de coleção de padrões em grupos, baseando-se na similaridade das propriedades pertencentes aos dados. A técnica de agrupamento pode ser utilizado em muitas áreas de conhecimento como biotecnologia, visão computacional, recuperação de documentos, entre outras. Uma área interessante da biologia envolve o conceito de microRNAs (miRNAs), que são moléculas não-codificadas de RNA com aproximadamente 22 nucleotídeos e que desempenham um papel importante na regulação dos genes. O agrupamento de sequências de miRNA podem ajudar em sua exploração e entendimento, pois as sequências que pertencem ao mesmo grupo possuem uma função biológica similar. Esse trabalho explora e investiga sete algoritmos de agrupamentos não-supervisionados baseados em grafos que podem ser divididos em três categorias: algoritmos baseados em região de influência, algoritmos baseados em árvore spanning minimal e algoritmo espectral. Para avaliar a contribuição dos algoritmos propostos, os experimentos conduzidos utilizaram os dados das famílias de miRNAs disponíveis no banco de dados denominado miRBase. Os resultados dos experimentos foram apresentados, analisados e avaliados usando índices de validação de agrupamento e análise visual

Evolução do escorregamento epifisário proximal do fêrmur após tratamento não cirúrgico Evolution of slipped capital femoral epiphysis after nonsurgical treatment

OBJETIVO: Avaliar a eficácia do tratamento conservador em pacientes com epifisiólise proximal do fêmur (EEPF) e as complicações devidas à evolução da doença. MÉTODOS: Foram analisados, retrospectivamente, 18 pacientes (26 quadris) consecutivamente atendidos no período entre dezembro de 1996 e agosto de 2006 no Serviço de Ortopedia da Santa Casa de Misericórdia de São Paulo, encaminhados por outros serviços com diagnóstico de EEPF e tratados de forma não cirúrgica. RESULTADOS: A progressão do escorregamento aconteceu em 19 quadris (73%), sendo que, dos quadris com escorregamento leve, oito permaneceram leves, quatro progrediram para moderados e um tornou-se grave pela classificação Southwick. Dos seis quadris classificados como moderados, quatro evoluíram para grave e os dois graves acentuaram-se um pouco mais. Conclusões: Apesar de a indicação cirúrgica ser hoje consenso no tratamento do EEEP para evitar a progressão do escorregamento, há ainda pacientes com diagnóstico confirmado que são tratados de forma conservadora, e isto representa um grande erro, pois implica no aumento da morbidade da doença.<br>OBJECTIVE: To evaluate the efficacy of conservative treatment of slipped capital femoral epiphysis (SCFE) and the complications due to the progression of the slip. METHODS: 18 patients (26 hips) seen consecutively from December 1996 to August 2006 at the Orthopedics Service of Santa Casa de Misericórdia de São Paulo, referred from other services with a SCFE diagnosis and treated without surgery were retrospectively analyzed. RESULTS: Slip progression was observed in 19 hips (73%). Among the mild cases, 8 remained mild, four turned moderate and one became severe according to Southwick classification. Four out of the six originally moderate cases became severe and the two already severe cases worsened. Conclusion: Despite there being a consensus regarding the use of surgical treatment to prevent SCFE progression, some cases are still being treated conservatively. This represents a grave error, since it increases the morbidity of the disease

Osteomielite aguda do escafóide: relato de caso Osteomyelitis of the scaphoid: a case report

Relata-se um raro caso de osteomielite aguda do escafóide em punho esquerdo, por Staphylococcus aureus, em homem de 53 anos de idade, paraplégico, sem causa inicial aparente. O tratamento realizado foi baseado em antibioticoterapia venosa específica e drenagem cirúrgica, com bom resultado funcional após seis meses.The authors report a rare case of acute osteomyelitis of the scaphoid bone in the left wrist, due to Staphylococcus aureus, in a 53 year-old paraplegic man without an apparent initial cause. The treatment used was based in specific venous therapy with antibiotics and surgical draining, with good functional result after six months

食品包装用フィルムを用いた褥瘡治療の試み

ポリ塩化ビニリデン製食品包装用フィルム(サランラップ^,以下ラップ)を用いた治療を,ステージII(いずれも創が真皮深層にまで達する),III,IV(NPUAP分類)のいわゆる「深い褥瘡」を対象に行い,軟膏とガーゼによる治療成績と比較し,ラップの創傷治癒効果について検討した。ポケットのないステージII,IIIの褥瘡では,ラップを用いた治療の方が軟膏とガーゼによる治療に比べ,よりよい創傷治癒効果を発揮した。また,両大転子に同程度の大きさ,深さおよび壊死組織量のステージIVの褥瘡が認められる患者に対し,一方にはラップを用いた治療を,他方には軟膏とガーゼによる治療を行った。すると,ラップを用いた方は,ガーゼと軟膏を施した方に比べ,著しい死腔の拡大を来す結果となった。We tried to treat pressure ulcer of Stage n (all involving the deep layer of dermis), III, and IV using plastic wrap (Saranwrap^) to examine the effect of wrapping on wound healing of pressure ulcer, compared with the effects of conventional treatment with ointment and gauze without wrapping. In pressure ulcer without pocket formation in Stage II and III, wrapping resulted in more beneficial effects on wound healing than the conventional treatment with only ointment and gauze. In a case of IV pressure ulcers on the bilateral greater trochanters, both of which the size, depth and volume of necrotic tissue were almost the same degree, we treated with wrapping on one side and without wrapping on the other side. In this case, however, the dead space within the ulcer enlarged more remarkably by wrapping compared to that of the ulcer of contralateral side