Inflammatory parameters after pleurodesis in recurrent malignant pleural effusions and their predictive value

AbstractRecurrent pleural malignant effusion is a common problem which can be treated by inducing symphysis of the pleural sheets. Many different drugs administered into the pleural space can be used to achieve this. The drugs cause an inflammatory response, which in turn is believed to cause the symphysis. Comparatively little has been published on the degree of pleural inflammation and the systemic response and whether this will affect the outcome.The aim of this study was to describe the systemic inflammatory reaction following instillation of a chemical agent into the pleura and to investigate whether this had any predictive value for the outcome (i.e. the pleurodesis). The markers investigated were simple ones: erythrocyte sedimentation rate, C-reactive protein, and leukocyte count from venous blood samples, and the fever reaction.Eighty-nine prospective patients with malignant pleural effusion who underwent pleurodesis with either talc (48 patients) or quinacrine (41 patients) were included in the study. Symphysis was achieved in 82 patients (92 per cent) and all had a prominent transitional elevation of the inflammatory parameters. The unsuccessful attempts caused negligible or very small elevations, but due to the small numbers only the degree of fever after 8 and 48h showed a statistically significant difference.In conclusion, pleurodesis causes a systemic inflammation and there is a tendency to a correlation between the success of pleurodesis and the degree of inflammation. High fever and high inflammatory parameters including CRP are due to this inflammatory response and do not indicate infection

Response of marine benthic fauna to thin-layer capping with activated carbon in a large-scale field experiment in the Grenland fjords, Norway

A field experiment with thin-layer capping was conducted in the Grenland fjords, Norway, for remediation in situ of mercury and dioxin-contaminated sediments. Experimental fields at 30 and 95 m depth were capped with (i) powdered activated carbon (AC) mixed with clay (AC+cla`y), (ii) clay, and (iii) crushed limestone. Ecological effects on the benthic community and species-feeding guilds were studied 1 and 14 months after capping, and a total of 158 species were included in the analyses. The results show that clay and limestone had only minor effects on the benthic community, while AC+clay caused severe perturbations. AC+clay reduced the abundance, biomass, and number of species by up to 90% at both 30 and 95 m depth, and few indications of recovery were found during the period of this investigation. The negative effects of AC+clay were observed on a wide range of species with different feeding strategies, although the suspension feeding brittle star Amphiura filiformis was particularly affected. Even though activated carbon is effective in reducing sediment-to-water fluxes of dioxins and other organic pollutants, this study shows that capping with powdered AC can lead to substantial disturbances to the benthic community.publishedVersio

Ecosystem functioning along gradients of increasing hypoxia and changing soft-sediment community types

Marine ecosystems world-wide are threatened by oxygen deficiency, with potential serious consequences for ecosystem functioning and the goods and services they provide. While the effects of hypoxia on benthic species diversity are well documented, the effects on ecosystem function have only rarely been assessed in real-world settings. To better understand the links between structural changes in macro- and meiofaunal communities, hypoxic stress and benthic ecosystem function (benthic nutrient fluxes, community metabolism), we sampled a total of 11 sites in Haystensfjord and Askerofjord (Swedish west coast) in late summer, coinciding with the largest extent and severity of seasonal hypoxia in the area. The sites spanned oxic to anoxic bottom water, and a corresponding gradient in faunal diversity. Intact sediment cores were incubated to measure fluxes of oxygen and nutrients (NO3-, NO2-, NH4+, PO43-, SiO4) across the sediment-water interface. Sediment profile imaging (SPI) footage was obtained from all sites to assess structural elements and the bioturbadon depth, and additional samples were collected to characterise sediment properties and macro- and meiofaunal community composition. Bottom-water O-2 concentration was the main driver of macrofauna communities, with highest abundance and biomass, as well as variability, at the sites with intermediate O-2 concentration. Meiofauna on the other hand was less sensitive to bottom-water O-2 concentration. Oxygen was the main driver of nutrient fluxes too, but macrofauna as well meiofauna were also significant predictors; DistLM analyses indicated that O-2 concentration, macrofaunal abundance or biomass, and meiofaunal abundance collectively explained 63%, 30% and 28% of the variation in sediment O-2 consumption, NH4+ flux and PO43+ flux, respectively. The study provides a step towards a more realistic understanding of the link between benthic fauna and ecosystem functioning, and the influence of disturbance on this relationship, which is important for management decisions aimed at protecting the dwindling biodiversity in the coastal zones around the world.Peer reviewe

Lung abscess predicts the surgical outcome in patients with pleural empyema

<p>Abstract</p> <p>Objectives</p> <p>Most cases of pleural empyema are caused by pulmonary infections, which are usually combined with pneumonia or lung abscess. The mortality of patients with pleural empyema remains high (up to 20%). It also contributes to higher hospital costs and longer hospital stays. We studied pleural empyema with combined lung abscess to determine if abscess was associated with mortality.</p> <p>Methods</p> <p>From January 2004 to December 2006, we retrospectively reviewed 259 patients diagnosed with pleural empyema who received thoracscopic decortications of the pleura in a single medical center. We evaluated their clinical data and analyzed their chest computed tomography scans. Outcomes of pleural empyema were compared between groups with and without lung abscess.</p> <p>Results</p> <p>Twenty-two pleural empyema patients had lung abscesses. Clinical data showed significantly higher incidences in the lung abscess group of pre-operative leukocytosis, need for an intensive care unit stay and mortality.</p> <p>Conclusion</p> <p>Patients with pleural empyema and lung abscess have higher intensive care unit admission rate, higher mortality during 30 days and overall mortality than patients with pleural empyema. The odds ratio of lung abscess is 4.685. Physician shall pay more attention on high risk patient of lung abscess for early detection and management.</p

Övervakning av mjukbottenfaunan längs Sveriges västkust : Rapport från verksamheten år 2005

Övervakningsprogrammet för bottenfaunan i Västerhavet har till syfte att påvisa långsiktiga förändringar i den marina miljön som en effekt av främst övergödning och syrebrist samt till viss del även kartlägga förändringar i den biologiska mångfalden på sublittorala sedimentbottnar.Lokalerna inom programmet ska också tjäna som referenslokaler inom olika lokala program.Programmet är från och med år 2002 ett samordnat program mellan Naturvårdsverket, Bohusläns Vattenvårdsförbund samt länsstyrelserna i Västra Götaland och Halland. Vid de lokaler som ska ligga till grund för jämförelser mellan havsområdena Kattegatt och Skagerrak tas fyra bottenhugg per lokal. Lokalerna inom varje havsområde indelas i utsjö- respektive kustnära lokaler. Jämförelserna mellan utsjö- och kustnära lokaler inom varje havsområde baseras på två hugg per lokal (Lindegarth 2000).Programmet omfattar 33 lokaler varav Göteborgs universitet tar prover på 31 lokaler och länsstyrelsen i Halland två lokaler. Nedanstående metodbeskrivning gäller de lokaler som Göteborgs Universitet tar prover på. Djupet på lokalen är mätt med ekolod som är kalibrerat till havsytan och positionen har bestämts med GPS i enlighet med koordinatsystem VGS 84. Vid de inomskärslokaler som tidigare ingått i PMK kontrolleras positionen även med enslinjer. En översikt över lokalernas fördelning längs kusten visas ifigur 1. Deras exakta position, antal replikat och vilka år prover tidigare har tagits redovisas i tabell 1. Totalt omfattar programmet 96 hugg varav 86 prov tas, analyseras och redovisas av Göteborgs universitet och resterande 10 ingår i de två lokaler från vilka prover tas av länsstyrelsen i Halland. Djup och sedimentkaraktäristik för samtliga lokaler återges i tabell 2. I tabellen anges även en grov uppskattning av hur exponerat lokalerna är belägna. Kustlokaler är belägna i de typområden som Håkansson &amp; Hansson (2003) klassificerade som yttre och mellan skärgård, fjordlokalerna i allmänhet i inneskärgård och fjordar. Provtagningarna 2005 utfördes under perioden 9: e till 25: e maj.I denna rapport redovisas data för de lokaler som ej var färdiganalyserade vid 2004 års redovisning samt, de 16 lokaler av 2005 års provtagning som var rapporterade till NV: s datavärd i mars i år.Totalt inom hela programmet, inklusive Hallandslokalerna, var det totala antalet individer och taxa något högre 2004 än vid 2003 års provtagning. Antalet individer var 26 522 fördelade på 248 olika taxa vid 2004 års provtagning medan antalet var 24 832 fördelat på 231 taxa år 2003.För samtliga 33 lokaler i programmet har 335 olika taxa registrerats under perioden 2002 t.o.m. 2004.Samtliga faunadata som analyserats under året redovisas stationsvis i appendix med angivande av medelvärden och standardavvikelser. Varje art är också kategoriserad efter födostrategisk och taxonomisk tillhörighet. För varje lokal har ett sammanfattande miljökvalitetsindex (Benthic Quality Index) beräknats (Blomqvist et al. 2004 och Rosenberg et al. 2004). Detta miljöindex är framtaget för att bedöma2miljökvaliteten enligt EU: s vattendirektiv längs Sveriges kuster. BQI baseras på de på lokalen förekommande arternas känslighet eller tolerans mot miljöstörningar.Klassificeringen av arternas tolerans mot störning har beräknats ur alla tillgängliga data, från nationella och lokala program, som kunnat uppbringas från Kattegatt och Skagerrak (Blomqvist et al. 2004). Totalt har det funnits underlag för att bedöma toleransen mot störning för ca 300 allmänt förekommande arter. På bottnar djupare än 20 m längs svenska västkusten föreslås följande intervall för bedömning av miljökvaliteten på lokalen. Lokaler med BQI &gt;16 betraktas ha en hög miljökvalitet, lokaler med BQI 16 &gt;12 god kvalitet, 12 &gt; 8 måttlig kvalitet, 8 &gt; 4 fattig eller otillfredsställande kvalitet och &lt; 4 dålig kvalitet (Rosenberg et. al. 2004).För att bedöma hur syresituationen i området har varit under året har dels data på syrehalten i bottenvattnet inhämtats från SMHI: s monitoringsprogram SHARK, dels har sedimentets redox-status analyserats vid varje lokal i samband med provtagning. Mätningar av syrehalten sker inom ramen för svensk samordnad miljöövervakning mellan Bohuskustens Vattenvårdsförbund och SMHI

En kvantkemisk studie av elektronisk cirkulär dikroism hos oligopeptider av alanin

Circular dichroism (CD) spectroscopy, exploiting the wavelength-dependentdifferential absorption of left- and right-handed circularly polarized light, isa popular method of protein characterization. Theoretically computed CDspectra from quantum mechanical computer models of peptides can widen theapplicability of the method. In this work, the usefulness of Time-DependentDensity Functional Theory (TD-DFT) with the CAM-B3LYP functional and6-31+G(d) basis set in obtaining CD spectra of model alanine α-helices 3to 15 residues long is investigated.  It is found that including 10 excitedstates per residue in the TD-DFT calculation resolves the characteristic partof the spectra sufficiently.  However, the results suffer from blueshift andimproper weakness of the 222 nm peak of the characteristic α-helix spectracorresponding to the n → π∗ transition, despite extension of the basis set to6-311++G(d,p) and use of the Polarizable Dielectric Continuum Model totreat solvent effects. In this case, these issues are limiting the usefulness ofTD-DFT for prediction of peptide CD spectra. More advanced methods totreat solvent interaction and benchmarking the performance of the functionalwith higher-level ab initio methods are suggestions for future studies. A introduction to electronic structure theory and the use of time-dependentperturbation theory to treat spectroscopy is also given in this work.Cirkulär dikroism (CD), den våglängdsberoende skillnaden i absorption avvänster- och högercirkulärpolariserat ljus, utnyttjas i populära spektroskopis-ka metoder för att karakterisera proteiner. Teoretiskt beräknade CD-spektraerhållna från kvantmekaniska datormodeller av peptider kan vidga metodensapplicerbarhet. I detta arbete undersöks användbarheten hos tidsberoendedensitetsfunktionalteori (TD-DFT) med funktionalen CAM-B3LYP och bas-mängden 6-31+G(d) för beräkning av CD-spektra för modeller av α-helixarav alanin, 3 till 15 aminosyror långa. Det visas att beräkningar som inkluderar 10 exciterade tillstånd per alanin är tillräckliga för att erhålla den karakteristiska delen av spektrat hos α-helixar. Resultaten lider dock av blåskiftoch felaktig svaghet hos toppen vid 222 nm i det karakteristiska α-helix-spektrat motsvarande övergången n → π∗, trots utvidgning av basmängdentill 6-311++G(d,p) och användning av metoden Polarizable Dielectric Continuum Model (PCM) för att behandla inverkan från lösningsmedel. Dessabrister begränsar i detta fall användbarheten av TD-DFT för bestämningav strukturbestämning från CD-spektran. Förslag för framtida studier är attbehandla interaktion från lösningsmedlet med mer avancerade metoder samtatt kontrollera prestandan hos funktionalen med ab initio-metoder av högrenivå. En introduktion till elektronstrukturteori och användningen av tidsberoendestörningsteori för att behandla spektroskopi ges även i detta verk