Comparison of Drought Tolerance of Some Wheat Varieties Grown in Turkey

The effect of drought stress on 21 wheat (Triticum aestivum L.) varieties were screened at the germination stage for drought tolerance. Four levels of osmotic stress was assessed by applying different polyethylene glycol (PEG-6000%253B 0%25, 10%25, 15%25 and 20%25 (w%252Fv)) concentrations. Germination rate, root-shoot length, total chlorophyll amount (SPAD), specific leaf area (SLA), relative water content (RWC), superoxide anion (O2.ˉ) and hydrogen peroxide (H2O2) accumulation were determined on the 8th day after sowing. The increased osmotic stress, significantly reduced germination rate, root-shoot length, SLA, chlorophyll amount and RWC in KateA-1, Gelibolu and Sultan-95 varieties. Pehlivan, Karahan-99 and Tekirdağ varieties were less affected by osmotic stress and these varieties were determined as drought tolerant varieties than other varieties

Determination of Salt Tolerance of Some Barley Varieties Based on Physiological and Biochemical Properties

Salt stress is one of the important environmental factors limiting the growth and productivity of barley (Hordeum vulgare L.) worldwide. Increasing salt stress negatively affects plant growth and development, posing a threat to global food security. In this study, some physiological and biochemical effects of salt stress at different concentrations (0, 50, 100, 200 mM NaCl) on 8 barley varieties (Kıral-97, Harman, Yaprak, Yaba, Larende, Cumhuriyet-50, Kalaycı-97, Çıldır-02) grown in Turkey were determined. For this purpose, the effects of salt stress on root-shoot length, biomass, pigment content, specific leaf area (SLA), relative water content (RWC), lipid peroxidation content (TBARS), hydrogen peroxide (H2O2) (spectrophotometric and histochemical staining) content were determined in 35-day-old seedlings. Our results showed that increased salt stress decreased the root-shoot lengths, biomass, SLA, and pigment contents in Cumhuriyet-50 and Çıldır-02 varieties, while increasing the amount of TBARS and H2O2. It was determined that Yaprak and Yaba varieties were less affected by salt stress and were more resistant to salinity compared to other varieties

Determination of Meteorological and Hydrological Drought Maps with Various Interpolation Methods in the Euphrates Basin

Kuraklık hidroelektrik enerji üretimi, sağlık, sanayi, turizm, ekonomi, tarım ve hayvancılık gibi çeşitli sektörleri olumsuz etkileyen bir doğal afettir. Bu nedenle izlenmesi, zamansal ve mekânsal dağılımının belirlenmesi ve önlemler alınarak kuraklık risklerinin yönetilmesi büyük öneme sahiptir. Bu çalışmada, Fırat Havzası’ndaki çeşitli meteorolojik ve hidrolojik kuraklıkların Kriging, Radyal Tabanlı Fonksiyon (RTF) ve Ters Mesafe Ağırlıklandırma (TMA) enterpolasyon yöntemleri ile zamansal ve mekânsal değişimleri kuraklık sınıflarına göre renklendirilerek haritalandırması ve havzadaki kuraklık risk durumunun değerlendirilmesi amaçlanmıştır. Bunun için Fırat Havzası ve çevresinde bulunan 16 adet Meteoroloji Gözlem İstasyonu ve 18 adet Akım gözlem istasyonuna ait Standartlaştırılmış Yağış İndeksi, İstatistiksel Z-Skoru İndeksi, Yağış Anomalisi İndeksi, Standardize Yağış Evapotranspirasyon İndeksi, Keşif Kuraklık İndeksi ve Standart Akım İndeksi değerleri kullanılmıştır. Analizler sonucunda havzada meteorolojik kuraklıkların tahmininde Kriging metodu, hidrolojik kuraklıkların tahmininde ise RTF en etkili yöntemler olduğu tespit edilmiştir. Havzanın kuraklık risk düzeyi yüksek tespit edildiği için çalışma alanında kuraklık yönetim planının yapılması, olumsuz kuraklık etkilerinin azaltılması, erken uyarı ve kuraklık önlemlerinin alınması önerilmektedir.Drought is a natural disaster that adversely affects various sectors such as hydroelectric power generation, health, industry, tourism, economy, agriculture and animal husbandry. For this reason, monitoring, determining the spatio-temporal distribution, and managing drought risks by taking precautions are of great importance. In this study, it is aimed to map the spatio-temporal changes of various meteorological and hydrological droughts in the Euphrates Basin according to drought classes with Kriging, Radial Based Function (RBF) and Inverse Distance Weighting (IDW) interpolation methods and to evaluate the drought risk situation in the basin. For this, Standardized Precipitation Index, Statistical Z-Score Index, Precipitation Anomaly Index, Standardized Precipitation Evapotranspiration Index, Reconnaissance Drought Index and Standardized Runoff Index values were used for 16 Meteorology Observation Stations and 18 stream-gauging stations in the Euphrates Basin. As a result of the analyses, it has been determined that the Kriging method is the most effective method in predicting meteorological droughts in the basin, and RBF is the most effective method in predicting hydrological droughts. Since the drought risk level of the basin is determined to be high, it is recommended to make a drought management plan in the study area, to reduce negative drought effects, and to take early warnings and drought precautions

Grating coupler integrated photodiodes for plasmon resonance based sensing

Cataloged from PDF version of article.In this work, we demonstrate an integrated sensor combining a grating-coupled plasmon resonance surface with a planar photodiode. Plasmon enhanced transmission is employed as a sensitive refractive index (RI) sensing mechanism. Enhanced transmission of light is monitored via the integrated photodiode by tuning the angle of incidence of a collimated beam near the sharp plasmon resonance condition. Slight changes of the effective refractive index (RI) shift the resonance angle, resulting in a change in the photocurrent. Owing to the planar sensing mechanism, the design permits a high areal density of sensing spots. In the design, absence of holes that facilitate resonant transmission of light, allows an easy-to-implement fabrication procedure and relative insensitivity to fabrication errors. Theoretical and experimental results agree well. An equivalent long-term RI noise of 6.3 x 10(-6) RIU/root Hz is obtained by using an 8 mW He-Ne laser, compared to a shot-noise limited theoretical sensitivity of 5.61 x 10(-9) RIU/root Hz. The device features full benefits of grating-coupled plasmon resonance, such as enhancement of sensitivity for non-zero azimuthal angle of incidence. Further sensitivity enhancement using balanced detection and optimal plasmon coupling conditions are discussed

Rejeneratif periodontal tedavide farklı greft materyallerinin kullanılmasının klinik,radyografik ve mikrobiyolojik olarak incelenmesi

Bu çalışmada, Erken Başlayan Periodontitis'li (EBP) bireylerin interproksimal kemik içi defektlerinde kortikal demineralize dondurulmuş kurutulmuş kemik (DDKK), biyoaktif cam ve bu iki greft materyalinin karışımı kullanılarak yapılan tedavinin klinik, radyografik ve mikrobiyolojik sonuçları değerlendirilmiştir. Araştırma kapsamına en az 6 mm cep derinliği, radyografik olarak 3 mm kemik içi defekti olan 22 EBP'li hasta alındı. Bu hastalardaki 30 interproksimal defekt her biri 10 defekt içeren 3 ayrı tedavi grubuna ayrılarak tedavi edildi. Hastalarda tedavi başlangıcı, operasyon öncesi ve operasyon sonrası klinik ölçümler yapıldı ve standart radyografiler alındı. Mikrobiyolojik inceleme yapmak için hastalardan tedavi başlangıcı ile operasyon sonrası 6.ayda subgingival plak örnekleri alındı. Bulguların değerlendirilmesi sonunda; plak indeksi, gingival indeks ve dişeti kanama indeksinde her üç grupta da operasyon öncesi değerlerde elde edilen azalmanın operasyon sonrasında da korunduğu görülmüştür. Tüm gruplarda dişeti çekilmesi görülmüş ancak gruplar arası farklar istatistiksel olarak anlamlı bulunmamıştır. KDDB'nda da dişeti çekilmesine paralel azalma her üç grupta da görülmüştür. Cep derinliğinde defektin en derin noktasında tüm gruplarda istatistiksel olarak ileri derecede anlamlı azalma görülmüştür (p<0.01).Tedavi başlangıcı ile operasyon sonrası cep derinliği ortalama azalması gruplarda sırasıyla 4.60 mm, 4.55 mm, 4,20 mm olarak bulunmuştur. Ataşman kazancı gruplarda sırasıyla ortalama 2.80 mm, 2.40 mm, 2.25 mm olarak bulunmuş ve en yüksek değer DDKK grubunda görülmüştür. Gruplar arası fark anlamlı bulunmamıştır. Tedavi sonunda gruplarda sırasıyla 1.45 mm, 1.25 mm, 1.50 mm yeni kemik elde edilmiştir (p<0.05, p<0.01, p<0.01). Gruplar arası fark anlamlı bulunmamıştır. Radyografik olarak yeni kemik oluşumu ise sırasıyla 1.30 mm, 1.35 mm, 1.27 mm olarak bulunmuştur. Gruplar arası fark anlamlı değildir. Tüm bulgular bu üç tedavi grubunda benzer sonuçlar elde edildiğini göstermektedir. Tedavi sonrasında zorunlu anaerob ve capnophilic mikroorganizmaların TVC'ye olan oranları azalırken, fakültatif anaerobların oranları artmıştır. Tedavi öncesi ve sonrası yüzde değişimleri DDKK grubunda zorunlu anaeroblar için %52.21 - %13.06 (p<0.05), capnophilic mikoorganizmalar için %37.81 - %0.05 (p<0.05), fakültatif anaeroblar için ise %9.97 - %83.87 (p<0.01) olarak bulunmuştur. Bu değerler Bioglass grubu için sırayla %58 - %4.29 (p<0.05), %31.2 - %3.04 (p<0.01) ve %9.62 - %65.76 (p<0.05), Kombine grubu için ise %56.71 - %13.10 (p< 0.05), %28.91 - %3.75 (p<0.05), 14.37 - 83.15 (p<0.01) olarak bulunmuştur. Çalışmamızda tedavi başlangıcında defekt bölgesinden elde edilen ve periodontal patojen olarak kabul edilen A.a, P.gingivalis, P.intermedia, Fusobacterium türleri, Capnocytophaga türleri, Eikenella corrodens ve Campylobacter rectus gibi mikroorganizmaların tedavi sonunda görülme sıklıklarının ve cfu değerlerinin azaldığı görülmüştür. Bununla beraber fakültatif anaerob olan streptokok ve actinomyces türleri için bu değerler yükselmiştir. Bütün bu bulgulara göre EBP'li bireylerde DDKK, Biyoaktif cam ve bunun kombinasyonu ile yapılan tedaviden klinik olarak başarılı sonuçlar alındığı ve elde edilen mikrobiyolojik verilerin de bu sonucu desteklediği görülmüştür. SUMMARY In this study, the clinical, radiographic and microbiological results of periodontal therapy of interproximal osseous defects using cortical demineralized freeze-dried bone, bioactive glass and combination of these two graft materials were evaluated in patients with early onset periodontitis (EOP). Twenty-two EOP patients having periodontal pockets with at least 6 mm or more pocket depth and radiographically 3 mm intrabony defect were included in the study. A total of 30 interproximal defects of these patients were divided into 3 groups each consisting of 10 defects. Clinical measurements were recorded and standard periapical radiographs were taken before initial therapy and before and after surgery. For microbiological evaluation subgingival plaque samples were collected prior to therapy and 6 months postoperatively. Data obtained from this study showed that; in all treatment groups initial plaque index, gingival index and gingival bleeding index scores are significantly reduced before surgery and these scores remained approximately at the same level during postoperative 6 months examination period. Gingival recessions were observed in all groups. Comparison of the groups showed no signficant differences. Width of the keratinized gingival tissue is also reduced in parallel with the recession. The mean pocket depth reductions in treatment groups before initial therapy and 6 months after surgery are 4.60 mm, 4.55 mm and 4.20 mm, respectively. The relative attachment gains in groups are 2.80 mm, 2.40 mm, 2.25 mm, respectively. Although the highest score was in Combined group the differences between the groups were not significant. After treatment new bone formation was noted in all groups. Bone level changes were 1.45 mm, 1.25 mm, and 1.50 mm. Radiographic bone level changes were 1.30 mm, 1.35 mm, and 1.27 mm. Difference between the groups were not significant. In all groups, while the proportions of obligate anaerob and capnophilic microorganisms to TVC were reduced after treatment, values for facultative anaerob microorganisms were increased. In DFDBA group percent changes for obligate anaerobes were %52.21 - %13.06 (p<0.05), for capnophilic microorganisms %37.81 - %0.05 (p<0.05) and for facultative anaerobes %9.97 - %83.87 (p<0.01). In Bioglass group these changes were found as %58 - %4.29 (p<0.05), %31.2 - %3.04 (p<0.01), %9.62 - %65.76 (p<0.05), and in Combined group %56.71 - %13.10 (p< 0.05), %28.91 - %3.75 (p<0.05), 14.37 - 83.15 (p<0.01) respectively. Evaluation of the plaque samples obtained from the groups revealed that while the frequencies and bacterial counts of the periodontal pathogens such as Actinobacillus actinomycetemcomitans, P.gingivalis, P.intermedia, Fusobacterium spp., Capnocytophaga spp, Eikenella corrodens and Campylobacter rectus were significantly reduced, facultative anaerobes such as streptococcus and actinomyces species were increased after treatment. All the gathered data indicates that use of DFDBA, bioactive glass and the combination of both materials in the treatment of interproximal defects in EOP patients produced significant soft and hard tissue improvements. Our microbiological findings also support clinical results

Kurağa dayanıklı bazı arpa türlerinde (Hordeum spp. ) süperoksit dismutaz aktivitelerinin araştırılması

vıı ABSTRACT THE STUDY OF SUPEROXIDE DISMUTASE (SOD, EC 1.15.1.1.) ACTIVITIES IN SOME DROUGHT SENSITIVE AND RESISTANT BARLEY {Hordeum spp.) VARIETIES ACAR, Okan PhD in Biology Department Supervisor: Prof. Dr. îsmail TÜRKAN February 1999, 87 Pages In tins study, the effects of water scarcity and PEG 3000 application on superoxide dismutase (SOD) activity, total protein content, relative water content and radicle and coleoptil growth of two drought resistant barley {Hordeum spp.) varieties (Karatay - 97, Tokak 157/37), one middle tolerant (5600 / MISC.S.CMB) and tree drougth sensitive varieties (Krai - 97, Erginel - 90, Cumhuriyet - 50) were investigated. Radicle and coleoptile of growth resistant varieties were inhibited less than those sensitive ones. Total SOD activities increased in growth resistant cultivars as compared to sensitive varieties. 5600 / MISC.S.CMB showed a middle drought tolerance both radicle and coleoptil growth and SOD activity. Relative water content (RWC) of leaves in Cumhuriyet - 50 and 5600 / MISC.S.CMB decreased as to other varieties. A general increase has been observed in total protein content in all of the varieties depending on the drought increasement. Total SOD activities werevııı found higher in drought resistant varieties then those of sensitive ones. 5600/MISC.S.CMB behaved in terms of SOD activity as drought resistant varieties in short - term drought stress. However, as longevity of drought stress increase, it behaved as sensitive ones. In conclusion, although a difference in SOD activity were recorded among drought resistant and sensitive barley varieties a clear cut conclusion from present result can not be drawn for the role of SOD in drought tolerans in barley cultivars studied. To enlighten the role of other antioxidant enzymes would be worthy in this manner. Keywords: Barley (Hordeum spp.), Superoxide dismutase (SOD), oxidative stress, drought.ÖZET KURAĞA DUYARLI VE DAYANIKLI BAZI ARPA {Hordeum spp.) ÇEŞİTLERİNDE SÜPEROKSİT DİSMUTAZ (SOD, EC 1.15.1.1) AKTİVİTELERİNİN ARAŞTHOLMASI ACAR, Okan Doktora Tezi, Biyoloji Anabilim Dalı Tez Yöneticisi: Prof. Dr. İsmail TÜRKAN Şubat 1999, 87 Sayfa Bu araştırmada, su kıtlığı ve polietilen glikol (PEG 3000) uygulanarak yaratılan kuraklık stresinin kurağa dayanıklı (Karatay-97, Tokak-157 /37) ve duyarlı (Kıral-97, Erginel-90, Cumhuriyet-50) oldukları bilinen ve kurağa toleransı bilinmeyen bir (5600/MISC.S.CMB) arpa (Hordeum spp.) çeşidinde; total Süperoksit Dismutaz (SOD) aktivitesi, total protein, bağıl nem içeriği ve radikula- koleoptil büyümesi üzerine olan etkileri incelenmiştir. % 15'lik PEG 3000 uygulaması sonucunda radikula ve koleoptil büyümeleri kurağa dayanıklı çeşitlerde, duyarlı olanlara göre daha az engellenmiştir. Total SOD aktiviteleri ise dayanıklı genotiplerde duyarlı olanlara göre artış göstermiştir. 5600/ MISC.S.CMB ise su kıtlığına bağlı olarak radikula ve koleoptil büyümesi ve total SOD miktarındaki değişimlere açısından orta-duyarlı tepki göstermiştir. Su kıtlığı uygulamasında ise, yaprak bağıl nem içerikleri Cumhuriyet-50 ve 5600/MISC.S.CMB 'de kuraklıkVI etkisiyle diğer çeşitlere göre kontrole göre azalmıştır. Protein içerikleri ise tüm genotiplerde genellikle kuraklık artışına bağlı olarak kontrole göre artış göstermiştir. Kurağa dayanıklı türlerde duyarlı olanlara göre total SOD aktivitelerinin arttığı saptanmıştır. 5600/MISC.S.CMB ise kısa süreli kuraklık stresi altında SOD aktivitesini arttırmış ancak uzun süreli kuraklık koşullarında duyarlı gibi davranmıştır. Araştırma sonucunda çalışılan arpa (Hordeum spp.) çeşitlerinde SOD aktivitesinin, kuraklığa tepkide dayanıklı ve duyarlı kültivarlar arasında bir kriter olarak kullanılabilir olduğu saptanmıştır. Bununla birlikte diğer antioksidatif enzimlerin de araştırılması gereklidir