Analysis Of Mefv Gene Alternatively Spliced Transcripts Expression Patterns In Cell Culture Models

Tez (Yüksek Lisans) -- İstanbul Teknik Üniversitesi, Fen Bilimleri Enstitüsü, 2013Thesis (M.Sc.) -- İstanbul Technical University, Institute of Science and Technology, 2013Ailevi Akdeniz Ateşi (AAA), bölgemizdeki görülme sıklığı 1/200 ila 1/1073 arasında olan otoenflamatuvar bir hastalıktır. Temel semptomları, periyodik olarak tekrarlanan ağrılı karın zarı, akciğer zarı, eklem sıvısı ve kalp dış zarı enflamasyonlarıdır. Bu ataklar sonucu “amiloid” denilen protein çökeltilerinin oluşma olasılığı yüksektir, tedavi edilmezse amiloid birikimi böbrek yetmezliğine bağlı olarak ölüme sebebiyet verebilir. FMF hastalığıyla ilintili olan gen MEFV olup FMF hastalarında bu genin 200’den fazla varyasyonu tanımlanmıştır. FMF hastalığının kalıtım modeli otozomal resesif olarak kabul edilmesine rağmen bazı durumlar baskın geçişli ya da bileşik heterozigot geçişli olarak raporlanmış olup, bazılarında hiç mutasyon gözlenmemiştir. MEFV geni enflamatuvar/regülatör gen olup “Pyrin/Marenostrin (P/M)” adı verilen bir proteini kodlar. P/M, pro-enflamatuvar elementlerle etkileşim halinde enflamazom kompleksinin bir parçasını oluşturarak enflamasyon yolizine dahil olur. Bununla birlikte MEFV geninin Behcet Sendromu, Crohn’s hastalığı ve gut gibi diğer otoenflamatuvar hastalıklarla da ilgili olduğu kanıtlanmıştır. Alternatif kırpılma, transkripsiyon aşamasında gen ekzonlarının farklı sıralarda birleştirilmesi sonucu aynı genden türetilmiş çeşitli protein izoformlarının oluşmasını sağlayan bir süreçtir. “Anlamsızlık aracılıklı yıkım (AAY)” adı verilen bir mekanizma ile birlikte alternatif kırpılma, gen ekspresyonu ve protein üretiminin düzenlenmesi ve çeşitli protein yapılarının evrilmesi süreçlerinin bir parçasıdır. Aynı genden üretilen çeşitli protein izoformlarından, hücre gelişim seviyesine göre işlevsel olmayan protein AAY aracılığıyla parçalanır. Hücrede bu mekanizmalar, ihtiyaç duyulan proteinin üretilmesinde düzenleyici olarak işlev görür. Kompleks hastalık patofizyolojilerinde önemli bir rol oynadığı düşünülen bu süreçler, aynı zamanda gelişimsel farklılaşma yolizlerinde de oldukça etkin bir rol üstlenir. Alternatif kırpılmanın kanser, Parkinson, Alzheimer ve Kistik fibrozis gibi hastalık patolojilerinde görülen moleküler etkileşimlerde önemli rolü bulunduğu bilinmektedir. MEFV geni transkriptleri çeşitli alternatif kırpılmış formlarda üretilmektedir. Özellikle lökositlerde ve eklem sıvısında en yaygın olarak gözlenen MEFV alternatif kırpılmış formları şunlardır: MEFV-8ext (8. ekzonun ek bir kısmını içeren izoform), MEFV-4a ( 5, 6, 7, 8, 9 ve 10. ekzonları içermeyen, 4. ekzonun bir kısmını içeren form), MEFV-2a (2. ekzonun bir parçasını içeren form) ve MEFV-2Δ (2. ekzonu içermeyen transkript). MEFV geninin 2. ekzonunun proteinin lokalizasyon tayininde önemli rol oynadığı düşünülmektedir. 2. ekzonun delesyonunun, ortamda nükleer lokalizasyon sinyalleri bulunmasına rağmen molekülün hatalı lokalizasyonuna yol açtığı bilinmektedir. Grubumuzca yapılan bir çalışmada da MEFV-2Δ izoformunun FMF hastalarında sağlıklı kontrollere göre daha yüksek oranda bulunduğu gösterilmiştir (p=0,026). Bu buluntular, enflamasyon yolizi ile MEFV-2Δ izoformunun ekspresyon seviyesi arasında bir bağlantı olasılığını işaret etmektedir. Gen ekspresyon seviyesi belirleme ve karşılaştırma çalışmalarında sıklıkla kullanılan yöntemlerden biri ters transkripsiyon - relatif kantitasyondur. Bu tip çalışmalarda, öncelikle örneklerden RNA izolasyonu yapılır ve RNA’dan, ters transkripsiyon polimeraz zincir reaksiyonu ile komplementer DNA sentezlenir. Komplementer DNA sentezi için rastlantısal primerler, “oligo-dT” primerleri veya hedefe özgü dizayn edilmiş primerler kullanılabilir. Bu üç yöntemden rastlantısal primerler ve oligo-dT primerleri, izole edilmiş RNA havuzu içinden herhangi bir RNA’ya bağlanarak hedef gözetmeksizin reaksiyon sonunda karışık bir komplementer DNA içeriği oluşmasını sağlarlar. Hedefe özgü primerler ise belirli bir RNA molekülüne bağlanarak özellikle bu RNA’ya ait bir komplementer DNA sentezini sağlarlar. Rastlantısal ve oligo-dT primerleri, tek reaksiyon ile birden fazla çeşitte komplementer DNA sentezine olanak verirken hedefe özgü primerler, bir reaksyonda tek tip komplementer DNA sentezini sağlar. Hedefe özgü primerler ile nadir olarak üretilen bir transkriptin tespiti sağlanabilir. Literatürde yer alan çalışmalarda, gen havuzu içinde nadir olarak üretilen transkriptlerin tespitinde hedefe özgü primerlerin daha doğru sonuç verdiği belirtilmiştir. Çalışmamızın temel hipotezi enflamatuvar yolizlerinde MEFV’in kesin rolünün belirlenmesidir. Enflamasyonda MEFV geninin rolünü anlamak için öncelikle insan primer lökosit kültüründe bir enflamasyon modeli tasarladık. Lökositleri aktive etmek için lipopolisakkarit (LPS) kullandık ve sonuç enflamatuvar sitokin seviyesini ölçtük. İlk buluntularımız primer kültür enflamasyon modelinde düşük sitokin seviyesini göstermekteydi. Bunun üzerine HL-60 premiyelotik hücre hattı hücrelerini kullanarak başka bir enflamasyon modeli hazırladık. Sonuç olarak Forbol 12-miristat 13-asetat (PMA) uygulanmış HL-60 hücrelerinin LPS ile uyarımı, proenflamatuvar bir sitokin olan İnterlökin 1-beta (IL-1β)’nın yüksek oranda üretimine yol açtı. Daha sonra, MEFV-2Δ üretimini atak dönemindeki AAA hastalarının eklem sıvısı ve kan örneklerindeki diğer transkriptlerle karşılaştırdık. Bunun için örneklerden RNA izolasyonunu gerçekleştirdikten sonra Reverse Transkripsiyon Polimeraz Zincir Reaksiyonu (RT-PCR) yöntemini Kantitatif Gerçek Zamanlı Polimeraz Zincir Reaksiyonu (Q-RT PCR) yöntemi ile birlikte kullandık. MEFV-2Δ transkriptinin diğer RNA’lar içinde nadir üretilen bir ürün olması sebebiyle, ekspresyon profilinin doğru karşılaştırılabilmesi için iki farklı cDNA sentez stratejisi uyguladık. Bu stratejiler MEFV alternatif kırpılmış transkriptlerinden rastlantısal primerler ile komplementer DNA(cDNA) sentezi ve hedefe özgü primerler ile cDNA sentezi idi. Enflamasyon durumunu deneyin her bir basamağındaki enflamatuvar sitokinler pro-IL-1β ve Tumor Necrosis Factor-Alpha (TNF-α) üretimi seviyesiyle ve sağlıklı kontrollerle karşılaştırdık. Enflamasyon modelini PMA ve LPS uygulanmış hücrelerde başarı ile gerçekleştirdik. Ayrıca hedefe özgü primerler ile sentezlenen cDNA’lar ile rastlantısal primerlerle sentezlenmiş cDNA’lara göre daha doğru sonuçlar alınmıştır. Buna göre hedefe özgü primerlerle sentezlenmiş cDNAnın taslak DNA olarak kullanıldığı durumda, gerçek zamanlı PCR’da referansa göre belirlenen eşik değer floresan sinyalinin aşıldığı döngü sayısı (Ct) ortalama 25 iken rastlantısal primerle sentezlenmiş cDNA’nın taslak olarak kullanıldığı reaksiyonlarda bu değerler ortalama 40 olarak bulunmuştur. Sonuç olarak, enflamasyon durumunda diğer transkriptlerin ekspresyon seviyesinin düşmesine rağmen MEFV-2Δ transkriptinin ekspresyonunun arttığı gözlenmiştir (enflamasyon modelinde p=0,024, sinoviyal sıvı örneklerinde p=0,037). Bu artış, özellikle hedefe özgü primerlerle yapılan sentezlenmiş komplementer DNA karşılaştırmalarında belirgin olarak gösterilmiştir. Enflamasyon ile paralel olarak gözlenen MEFV-2Δ ekspresyon artışı akut FMF durumundaki hastaların sinoviyal sıvı ve kan örneklerinden alınan sonuçlarla doğrulanmış olup, MEFV-2Δ transkriptinin enflamatuvar yolizinde önemli bir rolü olabileceği hipotezi desteklenmiştir. Daha yüksek sayıda hasta örneklemesi ile MEFV-2Δ izoformu ve pyrin ile etkileşen proteinlerin tanımlaması çalışmanın daha sonraki basamakları için gereklidir.Familial Mediterranean Fever (FMF) is an autoinflammatory disease of our region with a frequency of 1/200 to 1/1073. Main symptoms include periodicly recurrent fever attacks with painful inflammation in peritoneum, pleura, synovium and pericardium. These FMF attacks may result as amyloid formation and aggregation, if not treated, aggregation may lead to renal failure. The gene of FMF is MEFV, in which to date more than 200 variations were identified in patients. Although hereditary mode of inheritance of FMF was accepted as autosomal recessive, dominant or compound heterozygous cases as well as patients without any MEFV pathological mutations were identified. Furthermore there is evidence of MEFV involved in other inflammatory immune diseases such as Behcet syndrome, Crohn’s Disease and Gut. MEFV gene is an inflammatory/regulatory gene, codes for Pyrin/Marenostrin (P/M) protein. P/M is involved in inflammatory pathway through interacting with pro-inflammatory elements, forms a part of the “inflammasome” complex. Inflammasome assembled in the cytoplasm causes the secretion of proinflammatory cytokines and leads to inflammatory response. MEFV gene is transcripted in several alternatively spliced forms. The most common MEFV protein isoforms found in peripheral blood leukocytes and synovial fibroblasts are MEFV-8ext (additional extension of exon 8), MEFV-4a (lacking exon 5, 6, 7, 8, 9 and 10, with the addition of part of exon 4), MEFV-2a (with part of indicated exon) and MEFV-2Δ (exon 2 deleted transcript). Especially exon 2 is thought to be important in localization estimation. It was shown that, deletion of exon 2, leads to localization errors even if the localization signals exist in the environment . Previous study of our group indicated that MEFV-2Δ is expressed higher in FMF cases rather than healthy controls (p= 0.026) in total blood samples.These findings leaded to the assumption that there can be a connection between inflammatory pathway and MEFV-2Δ transcript levels. Our main hypothesis is to test the exact role of MEFV in inflammatory pathways. To understand the relationship, first we designed an inflammation model with primary human peripheral blood leukocyte (PBL) cell culture. We used lipopolysaccharide (LPS) induction to model inflammation and measured inflammatory cytokine levels. Our initial findings indicated a low cytokine levels in primary cell culture model. Therefore we constructed another inflammation model with HL-60 premyelocytic cell line cells. LPS induction of Phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA) treated HL-60 cells produced excess amount of proinflammatory cytokine interleukin 1-beta (IL-1β). We further compared MEFV-2Δ expression with oher alternatively spliced transcripts in synovial fluid and blood samples of FMF patients in their attack period. To do this, we isolated RNA molecules from the samples and applied Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction (RT-PCR) in combination with Quantitatvie Real Time PCR (QRT-PCR). Due to MEFV-2Δ’s being a rare product in all other RNA molecules, two different cDNA synthesis strategies were applied and compared to detect the accurate relative amounts of MEFV-2Δ and other MEFV transcripts. These strategies were cDNA synthesis with random priming and cDNA synthesis with target specific priming of MEFV aternatively spliced transcripts. We checked inflammation status with pro-IL-1β and TNF-α mRNA levels in each set up and we compared MEFV alternatively spliced transcript levels in stimulated versus untreated cells, additionally in synovial fluid and blood samples of FMF cases. We constructed inflammation model succesfully with LPS induction after phorbol 12-myristate 13-acetate (PMA) differentiation. Furthermore, target specific cDNA synthesis resulted more accurately than random primed cDNA synthesis. Ct values of randomly primed MEFV alternatively spliced form cDNAs were around 40, while target specifically primed cDNA Ct values were in interval of 20-25 especially in inflammation cases. In conclusion, our findings indicated that MEFV-2Δ is highly expressed in inflammation conditions (in inflammation model p=0.024; in synovial fluid samples p=0.037), and this transcript may have a putative function in inflammatory pathway and in FMF pathology.This result was confirmed with acute FMF synovial fluid and blood samples and the hypothesis of MEFV-2Δ transcript’s being important for inflammatory pathway was supported. Further studies are required in higher number of patients during attack and remission periods, as well proteins interacting with MEFV-2Δ isoform and fulllenght pyrin need to be identified.Yüksek LisansM.Sc

An Evaluation of Teacher Candidates’ Opinions about Art Education and Form-meaning Relationship

AbstractWe live in an age in which visuality is important. In this day and time, instead of long texts and narrations, incarnated forms of meaning and notions are used for informational transfer. As to the reach of an individual for abstract notions, it is a competence of that individual which is gained by the education. Due tothe indispensable contributions of art education classes have on an individual's reasoning and imagination, they also directly contribute to development of said individual's cognitive abilities.This research aims to evaluate the ability of thinking in expressible meanings of forms, examined among the teacher candidates who took visual arts education and art and aesthetics class in 2012-2013 academic year, majoring in pre-school teaching and social studies teaching respectively. Purpose is to present how teaching candidates develop the form-meaning relationship. A total of 298 teacher candidates were involved in the research. Symbols such as circle, triangle, square, tree, pencil, hand, fish, flying bird, wheel, bitten apple, and yin-yang were shown to these teacher candidates before and after 12 weeks curriculum, and it is asked from them to answer the question of what these symbols are and what may them express. Finally, answers were evaluated using qualitative research model

Kur’ân’ın anlam farklılaşmasına i’râbın etkisi (Âlûsî tefsiri örneği)

06.03.2018 tarihli ve 30352 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan “Yükseköğretim Kanunu İle Bazı Kanun Ve Kanun Hükmünde Kararnamelerde Değişiklik Yapılması Hakkında Kanun” ile 18.06.2018 tarihli “Lisansüstü Tezlerin Elektronik Ortamda Toplanması, Düzenlenmesi ve Erişime Açılmasına İlişkin Yönerge” gereğince tam metin erişime açılmıştır.Bu çalışmada hem ulûmü'l-Kur'ân hem de dilbilimsel tefsirin altdalı olan i'râbü'l-Kur'ân'ın anlama etkisi ele alınmıştır. Ayrıca Kur'ân'ın anlamının müfessirlere göre değişmesinde i'râbın rolü incelenmiştir. Bu incelemede tefsir ihtilafında i'râbın etkisi ve bu etkinin sebepleri ortaya konulmuştur. Tefsir ihtilafına etki eden i'râbın müfessirlere göre değişken olmasıyla i'râb vecihlerinin farklılaşmasına yol açan etkenler de ele alınmıştır. Kur'ân nazmının sahip olduğu i'râb vecihlerinden hangisinin tercih edileceğinin tefsirde ihtilaf konusu olmasının arkasında yatan nedenlerin neler olduğu tespit edilmiştir. Bu şekilde i'râb vecihleri arasında yapılacak tercihlerin anlama ne şekilde yansıdığı anlaşılmaya çalışılmıştır. Bu araştırmanın, herbir tefsirde ele alınması çalışmanın sınırlarını aşmaktadır. Bu nedenle klasiğin son halkalarından sayılan ve Osmanlının son dönemlerinin Hanefî müftüsü olan Âlûsî'nin tefsiri ile konu sınırlandırılmıştır. İşârî tefsir türlerinden biri olarak bilinen bu eserin seçilmesinde, dilbilimsel açıklamaların özellikle de i'râbla ilgili izahların tefsirin büyük çoğunluğunu oluşturması etkili olmuştur. Böylece Âlûsî'nin, i'râbü'l-Kur'ân konusundaki yaklaşımları ve öncekilerine göre farklılıkları dikkate alınarak i'râbın, anlam farklılığına etkisi tüm yönleriyle ele alınmıştır. Bu çalışmada, Âlûsî tefsirindeki âyetler üzerindeki i'râb tahlillerinin tamamı incelenerek konularına göre tasniflenmiştir. Tefsirdeki tahliller, kendinden önceki temel i'râbü'l-Kur'ân kaynaklarıyla özellikle Âlûsî'nin ağırlıklı olarak referansta bulunduğu Zemahşeri ve Ebû Hayyan'ın tefsirindeki i'râb tahlilleriyle mukayese edilmiştir. Böylece Âlûsî tefsirinin, geçmiş birikime dair değerlendirmesi ve katkıları ortaya konulmuştur. Zemahşerî i'râbı ağırlık olarak belâgatla, Ebû Hayyân nahivle irtibatlı ele alırken Âlûsî ise ikisi arasında bir denge kurmaya çalışmıştır. Bu çalışmada ortaya çıkan sonuca göre, i'râbın anlama etkisi, iki taraflı olan bir durumdur. Buna göre i'râb ve anlam birbirleriyle karşılıklı etkileşim içindedir. Bununla birlikte hangi tarafın diğerine ağır bastığı, müfessirlere göre değişmektedir. Kendinden önceki i'râb izahlarının eleştirel bir bakış açısıyla sentezlendiği Âlûsî, tefsirinde Kur'ân'ın anlamını, i'râb ve diğer dilbilimsel araçlardan daha fazla öncelenmiştir. İ'râba etki eden anlamın tespiti ise tefsire katkı sağlayan diğer unsurlar dikkate alınmakla birlikte i'râbın ait olduğu nahiv ilminin yerleşik kuralları Âlûsî tarafından daha fazla önemsenmiştir.In this study, the effect of i'rab al-Qur'an, which is a sub-branch of the Quranic sciences (ulum al-Qur'an) and linguistic exegesis, on the understanding of Qur'an was discussed. Furthermore, we analysed the role of i'rab in the determination of the meaning of the Qur'an by the commentators. What kind of factors that cause variations in the aspects of i'rab together with some influences on exegetical disputes in accordance with different exegetes were dealt with in this thesis. What are the main motives and reasons behind the selection of particular i'rab aspect in the structure of Qur'anic text was tried to be understood. In this way the preferring a specific i'rab among various i'rab aspects and their contribution to the meaning of the text would be argued. Studying the notion of i'rab al-Qur'an in many published Quranic exegesis is almost impossible. Therefore, this thesis confines itself to the exegesis of Alusi, who is considered one of the last chain of classical scholarship and Hanafite mufti in the late Ottoman period. Rationale behind the selection of this exegesis lies in its extensive usage of linguistic analysis, especially its focus on i'rab al-Qur'an despite being introduced as a mystical commentary in various Qur'anic studies circles. Thus, this study takes Alusi's different views on i'rab al-Qur'an, his commonality and differences among i'rab related issues in his exegesis into account in great detail. Alusi's evaluations in his commentary were compared mainly with other i'rab al-Qur'an resources such as al-Zamakhshari and Abu Hayyan's works. Consequently, Alusi's original evaluations and re-readings of the traditions together with some of his contributions to this topic would be seen clearly. While al-Zamakhshari was dealing with the notion of i'rab al-Qur'an mostly in connection with rethoric and Abu Hayyan was mainly concentrating on Arabic syntax, Alusi exerted great effort to find a middle way. It is safe to assume that he was very successfull in having a good balance between these two approaches. According to the conclusions of this study, the effects of i'rab on the meaning of the Qur'anic text have two side phenomen. Because of this, i'rab and the meaning are in interaction constantly with each other. However, preferring one side to other varies in accordance with different commentators. Alusi, who synthesized previous explanations of i'rab al-Quran with a critical perspective, gives priority to the meaning of Qur'an more than i'rab and other linguistic devices. Compared with other factors that contribute to the determination of the meaning, he considers very well-established Arabic grammar vital. It should be remembered that i'rab is part of this very well-established grammer tradition

Gerilim kararlılığı iyileştiricilerinin çatallaşma ve kaotik analizleri

06.03.2018 tarihli ve 30352 sayılı Resmi Gazetede yayımlanan “Yükseköğretim Kanunu İle Bazı Kanun Ve Kanun Hükmünde Kararnamelerde Değişiklik Yapılması Hakkında Kanun” ile 18.06.2018 tarihli “Lisansüstü Tezlerin Elektronik Ortamda Toplanması, Düzenlenmesi ve Erişime Açılmasına İlişkin Yönerge” gereğince tam metin erişime açılmıştır.Anahtar Kelimeler : Sürekli Güç Akısı, Gerilim Kararlılıgı, FACTS, Çatallasma Analizi,Kaotik osilasyonlarGüç sistemi planlama ve kontrol çalısmaları yapan mühendisler için sistemin gerilimkararlılıgı analizinin kapsamlı bir biçimde yapılmasının önemi gitgide artmaktadır.Generatör ve iletim hatlarının kapasitelerinin sınırlı olması ve sistem yüklerinin artmasısonucu olarak giderek lineer olmayan bölgelerde çalısan sistemler için gerilim kararlılıgıanalizine büyük ölçüde ihtiyaç duyulmaktadır.Son zamanlarda, gerilim kararlılıgı vegerilim çökmesi olayı güç sistem analizi ve kontrolunda çok önemli bir konu olmayabaslamıstır. Arastırmacılar bu problem için statik ve dinamik yaklasımlarla çözümönerileri sunmuslardır.Çatallasma teorisi güç sistemlerindeki açısal ve gerilim kararlılıgı gibi degisiksorunların analiz edilmesinde kullanılan en yaygın yöntemlerden birisidir. Çatallasmateorisi, özellikle denge noktalarının küçük-sinyal kararlılıgı ve çatallasması, salınımlıkararsızlıklar ve gerilim çökmesi gibi dinamik olayların analizinde pratik yöntemlergelistirme imkanını vermektedir . Bir güç sisteminde yük artısı sonucu Eyer Noktası veHopf çatallasmaları gibi temel çatallasma olayları meydana gelir. Eyer noktasıçatallasması güç sistemlerinde gerilim çökmesi noktası olarak bilinir ve bu noktada,sistem Jakobiyen matrisinin özdegerlerinden biri orijindedir. Hopf çatallasmasınoktasında sistem sanal eksen üzerinde bulunan iki adet özdegere sahiptir ve buözdegerler sistemde salınımlı kararsızlıkların olusmasına sebep olmaktadır.Her ikiçatallasma olayı güç sisteminin lineer olmayan çalısma bölgesindeki kararsızlıkmekanizmasını açıklar ve kaotik yapıya dönüsecegi yüklenme aralıklarını tesbitetmemize olanak saglar. Bu parametrik degerler sistemin kararlılık ve kontrolçalısmalarında kullanılabilir.Bu tez çalısmasında gerilim kararlılıgı analizi hem statik hem de dinamik yaklasımlarlaele alınmıstır. Lineer olmayan bölgelerde çalısan güç sistemlerinde Kademe DegistiriciTransformatör (KDT) , Faz Kaydırıcı Transformatör (FKT), Flexible Alternatif CurrentTransmission Systems (FACTS) cihazları olarak bilinen Static Var Compensators(SVC) ile Thyristor Controlled Series Capacitors (TCSC) gibi gerilim kararlılıgınıiyilestirici cihazların statik ve dinamik modelleri kullanılarak çatallasma ve kaotikanalizleri yapılmıstır. Elde edilen güç sistem modelleri ile bu cihazların iyilestiriciperformansları karsılastırılmıstır. Çalısmada öncelikle iki baralı bir güç sistemi elealınmıs daha sonra genellestirilerek N baralı sistemlere uygulanabilirligi gösterilmistir.Keywords : Power Flow Continuation, Voltage Stability, FACTS, Bifurcation Analysis,Chaotic OscillationsIt is becoming increasingly important for power system planning and operatingengineers to be capable of performing comprehensive voltage stability analyses of thesystems. This need is largely due to the recent trends towards operating systems understressed conditions as a result of increasing system loads without sufficient transmissionand generation enhancements. There have been many failures, due to voltage instabilityin power systems around the world. In recent years voltage stability and voltage collapsephenomena have become more and more important issues in power system analysis andcontrol. Researchers have suggested techniques for voltage stability analysis consideringboth static and dynamic aspects.The bifurcation theory is one of the most common theory which is used to analysis theproblems such as angular and voltage stability in power systems. Bifurcation theoryallows us to develop practical methods especially in analysis of dynamic events such assmall-signal stability and bifurcation of balance nodes oscillate instabilities and voltagecollapse. Power systems are consist of Saddle-Node and Hopf bifurcations which as aresult of load increasing. Saddle node bifurcation is known as voltage collapse node inpower systems and on this mode one of the eigenvalues of the system jacobian matrix ison the origin. The system has two eigenvalues on the imaginary axis and theseeigenvalues cause oscillative instabilities. Both of these bifurcation events explain theinstability mechanism that is in the nonlinear work zone of the power system and enableus to establish the loading intervals that will be turn into chaotic building. Theseparametric values can be used in stability and control studies of the system.In this thesis, voltage stability analysis is dealing with both static and dynamicapproaches. Bifurcation and chaotic analysis have been done by using the static anddynamic models of the devices that improve the voltage stability, such as tap changertransformers (LTC), phase shifting transformers (PST), Static var Compensators (SVC)known as Flexible Alternatif Current Transmission Systems (FACTS) devices andThyristor Controlled Series Capacitors (TCSC) in power systems that work on thenonlinear zones. The power system models that has been obtained. Furthermore theimproving performances of these devices have been compared. In this study, firstly atwo bus power system has been taken up, then by generalizing this, it has been indicatedthat it can be applied to N bus system

Two Portrayals of Women Solidarity

How is women’s solidarity portrayed and handled in the novels “The Handmaid’s Tale” by Margaret Atwood and “The Power” by Naomi Alderman in terms of religion, power, and gender norms

Analysis of the electromagnetic field inside the gradient coils and investigation of the nerve and cardiac stimulation risk for the patients during MRI

Ankara : The Department of Electrical and Electronics Engineering and the Institute of Engineering and Sciences of Bilkent University, 2008.Thesis (Master's) -- Bilkent University, 2008.Includes bibliographical references leaves 49-53.During magnetic resonance imaging (MRI), the static magnetic field, the radio frequency field and the gradient fields are utilized. In the literature, there are several studies with the aim of understanding the bioeffects of these fields. Due to the time varying gradient fields, an electric field is induced in the body which may cause nerve and cardiac stimulation. In order to investigate this risk, researchers have been working on solving the induced electric field both analytically and by using computational methods. The field distribution inside the body has also been investigated. It is vital to verify the risk of MRI to patients with an implant. In order to improve the understandability of the field pattern, the field should be expressed as simple as possible. In this thesis, the simplified expressions of induced electric field are derived inside and outside of the cylindrical, homogenous volume, which is taken as the human body model. For this derivation, low frequency based assumptions are used and gradient field is assumed to be perfectly uniform. The obtained results satisfy the expected conditions for the electric and magnetic fields. The field patterns obtained with these simplified expressions are compared with the former studies and the maximum electric field values obtained for a different gradient field and slew rates are used to investigate the stimulation risk. Moreover, by using these electric field values, the worst position for an implant lead and the length of the lead is determined. We believe that with these simplified expressions, the understandability of the field distribution is enhanced and to comment on the risk of MRI to a patient with an implant becomes easier.Abacı, EsraM.S

Estimation of genetic and phenotypic parameters for body condition score, milk yield and milk composition, and factors affecting related traits during the first 150 days of lactation in Holstein cows

This study aimed to estimate the genetic and phenotypic parameters for BCS, milk yield and its composition in Holstein cows. The data were collected in the first 150 days in milk (DIM) of 317 Holstein cows calved between 2017 and 2018 raised at a pri-vate dairy cattle farm located in Kırşehir of Turkey. In this study, parity and DIM were included as fixed factors in the model. The cows were grouped according to their BCS: low (BCS≤2.50), moderate (BCS=2.75-3.00) and high (BCS≥3.25). The results showed that effects of parity and DIM on BCS, test-day milk yield (TDMY), solids-non-fat (SNF), protein content (PC), lactose (LACT), fat yield (FY) and protein yield (PY) were significantly important (P<0.05), whereas fat content (FC) was not. The highest TDMY, FY and PY were determined in cows with low BCS. FC, SNF, PC and LACT were the highest in cows with high BCS compared to those with low BCS and moderate BCS. The estimated heritability were 0.188, 0.301, 0.184, 0.197, 0.194, 0.223, 0.196 and 0.342 for BCS, TDMY, FC, SNF, PC, LACT, FY and PY, respectively. Repeatability for these traits was estimated to vary from 0.257 to 0.521. Genetic correlations between BCS and milk yield traits were generally low and ranged from-0.175 to 0.191. Low to moderate phenotypic correlations were also observed between BCS and milk yield traits (-0.234 to 0.217). Despite estimated low heritability and correlations during the early lactation period in our study, these results showed that cows with lower BCS had higher milk yield and lower milk contents, and selection programs including BCS will lead to slight improvements of milk yield traits in Holstein cows. © 2022, Massimo Morgante. All rights reserved

Allelopathic and Antifungal potentials of endemic Salvia absconditiflora Greuter & Burdet collected from different locations in Turkey

We determined the antifungal and bioherbicidal properties of essential oils of Salvia absconditiflora. Its plant samples were collected from 10-locations in Kirsehir province, Turkey and dried in shade. Essential oils of dried plant samples were extracted by hydro-distillation method using a Schilcher device and the compounds identified in S. absconditiflora essential oils by GC-MS analysis were: Camphor (10.52-58.64%), Bicyclo [2.2.1] Heptane-2-One, 1.7.7 (21.94-30.16%) and viridiflorol (3.42-25.2%). S. absconditiflora essential oil (a dose of 10 mu l/petri dishes) inhibited the mycelium growth of Sclerotinia sclerotiorum and Alternaria solani pathogens by 9.3 and 54.40 %, respectively. At dose of 20 mu l/petri dish, the essential oil completely inhibited the mycelium growth of both pathogens. The S. absconditiflora essential oil at 20 mu l/petri dish. was 100 % phytotoxic to seed germination and seedling growth of Lepidum sativum and Amaranthus retroflexus. Thus S. absconditiflora essential oil can be used as an alternative to synthetic fungicide and herbicide to control the plant pathogenic fungi and weeds, respectively