A Genomic View of Alternative Splicing of Long Non-coding RNAs during Rice Seed Development Reveals Extensive Splicing and lncRNA Gene Families

Alternative splicing (AS) is a key modulator of development in many eukaryotic organisms. In plants, alternative splice forms of non-coding RNAs (ncRNAs) are known to modulate flowering time in Arabidopsis and fertility in rice. Here we demonstrate that alternative splicing of coding and long non-coding RNAs occurs during rice seed development by comparing AS in immature seeds vs. embryo and endosperm of mature seeds. Based on computational predictions of AS events determined from a Bayesian analysis of junction counts of RNA-seq datasets, differential splicing of protein-coding, and non-coding RNAs was determined. In contrast to roots, leaves, flowers, buds, and reproductive meristems, developing seeds had 5.8-57 times more predicted AS. Primers designed to span introns and exons were used to detect AS events predicted by rMATs in cDNA derived from early (milk) seed, embryo, and endosperm. Comparing milk seed vs. mature embryo and endosperm, AS of MORC7 (a gene implicated in epigenetic gene silencing), was markedly different. Long non-coding RNAs (lncRNAs) also underwent AS during the transition from milk seed to mature embryo and endosperm, with a complex gene structure, and were more extensively processed than predicted by current genome annotation. Exon retention of lncRNAs was enhanced in embryos. Searching all 5,515 lncRNAs in the NCBI genome annotation uncovered gene families based on highly conserved regions shared by groups of 3-35 lncRNAs. The homologies to other lncRNAs, as well as homologies to coding sequences, and the genomic context of lncRNAs provide inroads for functional analysis of multi-exonic lncRNAs that can be extensively processed during seed development

Problemáticas sociales latinoamericanas: una experiencia multidisciplinar

El presente trabajo da cuenta de la experiencia iniciada en el 2015 en el Área de Ciencias Sociales del Bachillerato de Bellas Artes-U.N.L.P como espacio optativo de profundización para alumnos del 7° año del Establecimiento, último del Diseño y al cual acceden con una edad un año superior a la edad de egreso en los otros establecimientos. A partir de la aplicación del Nuevo Plan de Estudios se planteó la implementación de este tipo de Espacios curriculares a fin de que sirvan como complemento y ampliación de temas desarrollados en los años anteriores, pero también atendiendo a una demanda más o menos explícita de los estudiantes. Se plantea su carácter optativo a fin de que los alumnos elijan entre una oferta de cuatro espacios areales elaborados por cuatro Departamentos docentes. El caso que se presenta aquí ha sido elaborado dentro del área de las Ciencias Sociales como Espacio Optativo de Profundización temática para el 7º año. Su carácter interdisciplinario se apoya en una variedad epistemológica centrada en los diversos campos del saber que componen el área con el agregado de la interdisciplinariedad. Es decir que se encuentra enriquecido por las miradas y discursos cruzados y complejizadores elaborados en diversos ámbitos disciplinares pero confluyendo en una perspectiva novedosa y única. En ella se diluyen los planteos encasillados en las prácticas de los diversos campos científicos, generando una mirada holística e integradora. En la práctica concreta, se trata del abordaje común de una problemática de índole social, situada temporal y espacialmente, contextualizada en el ámbito latinoamericano. Esta particularidad intenta cubrir una visión amplia en la que se analizan y problematizan aspectos sociales, económicos, laborales, políticos, ambientales o culturales.Bachillerato de Bellas Artes "Prof. Francisco A. De Santo

Problemáticas sociales latinoamericanas : Un espacio multidisciplinar en la enseñanza media preuniversitaria

El presente trabajo da cuenta de la experiencia iniciada en el Área de Ciencias Sociales del Bachillerato de Bellas Artes de la UNLP como espacio optativo de profundización para alumnos del 7° Año (último año en un bachillerato artístico). Dicha actividad surge como respuesta de los docentes del área al pedido de los alumnos para profundizar sobre aspectos económicos y políticos de actualidad. La experiencia, iniciada en 2015 y que se encuentra en realización de su segundo año, intenta avanzar sobre los pedidos de los alumnos mediante prácticas pedagógicas y académicas que implican un nivel de multidisciplinariedad en el cual la Geografía, en el marco de las ciencias sociales, representa una experiencia enriquecedora de las miradas tradicionales en el área. Junto con este aspecto, una serie de prácticas novedosas (trabajo en parejas pedagógicas con temáticas autónomas simultáneas, manejo de fuentes de nivel universitario, sistema de evaluaciones particulares e integradas…) se pusieron en juego junto con otras que ya habían sido implementadas por los docentes involucrados, tales como la recurrencia a temáticas críticas de la realidad mediante la participación de los estudiantes vistas con ojos no convencionales, el reconocimiento de conflictos subyacentes y la construcción de posibles soluciones alternativas o la realización de actividades complementarias tales como asistencia a conferencias, debate con especialistas no institucionales, debate sobre films temáticos o argumentales, presentación de resultados en jornadas internas del colegio o la utilización de tecnología virtual en horas no presenciales previstas por el diseño curricular. En ese contexto, el carácter multidisciplinar resulta un condimento esencial dado que las miradas epistemológicas disciplinares se funden en una sola experiencia donde el debate cultural trasciende esas perspectivas.Facultad de Humanidades y Ciencias de la Educació

Problemáticas sociales latinoamericanas : Un espacio multidisciplinar en la enseñanza media preuniversitaria

El presente trabajo da cuenta de la experiencia iniciada en el Área de Ciencias Sociales del Bachillerato de Bellas Artes de la UNLP como espacio optativo de profundización para alumnos del 7° Año (último año en un bachillerato artístico). Dicha actividad surge como respuesta de los docentes del área al pedido de los alumnos para profundizar sobre aspectos económicos y políticos de actualidad. La experiencia, iniciada en 2015 y que se encuentra en realización de su segundo año, intenta avanzar sobre los pedidos de los alumnos mediante prácticas pedagógicas y académicas que implican un nivel de multidisciplinariedad en el cual la Geografía, en el marco de las ciencias sociales, representa una experiencia enriquecedora de las miradas tradicionales en el área. Junto con este aspecto, una serie de prácticas novedosas (trabajo en parejas pedagógicas con temáticas autónomas simultáneas, manejo de fuentes de nivel universitario, sistema de evaluaciones particulares e integradas…) se pusieron en juego junto con otras que ya habían sido implementadas por los docentes involucrados, tales como la recurrencia a temáticas críticas de la realidad mediante la participación de los estudiantes vistas con ojos no convencionales, el reconocimiento de conflictos subyacentes y la construcción de posibles soluciones alternativas o la realización de actividades complementarias tales como asistencia a conferencias, debate con especialistas no institucionales, debate sobre films temáticos o argumentales, presentación de resultados en jornadas internas del colegio o la utilización de tecnología virtual en horas no presenciales previstas por el diseño curricular. En ese contexto, el carácter multidisciplinar resulta un condimento esencial dado que las miradas epistemológicas disciplinares se funden en una sola experiencia donde el debate cultural trasciende esas perspectivas.Facultad de Humanidades y Ciencias de la Educació

Problemáticas sociales latinoamericanas : Un espacio multidisciplinar en la enseñanza media preuniversitaria

El presente trabajo da cuenta de la experiencia iniciada en el Área de Ciencias Sociales del Bachillerato de Bellas Artes de la UNLP como espacio optativo de profundización para alumnos del 7° Año (último año en un bachillerato artístico). Dicha actividad surge como respuesta de los docentes del área al pedido de los alumnos para profundizar sobre aspectos económicos y políticos de actualidad. La experiencia, iniciada en 2015 y que se encuentra en realización de su segundo año, intenta avanzar sobre los pedidos de los alumnos mediante prácticas pedagógicas y académicas que implican un nivel de multidisciplinariedad en el cual la Geografía, en el marco de las ciencias sociales, representa una experiencia enriquecedora de las miradas tradicionales en el área. Junto con este aspecto, una serie de prácticas novedosas (trabajo en parejas pedagógicas con temáticas autónomas simultáneas, manejo de fuentes de nivel universitario, sistema de evaluaciones particulares e integradas…) se pusieron en juego junto con otras que ya habían sido implementadas por los docentes involucrados, tales como la recurrencia a temáticas críticas de la realidad mediante la participación de los estudiantes vistas con ojos no convencionales, el reconocimiento de conflictos subyacentes y la construcción de posibles soluciones alternativas o la realización de actividades complementarias tales como asistencia a conferencias, debate con especialistas no institucionales, debate sobre films temáticos o argumentales, presentación de resultados en jornadas internas del colegio o la utilización de tecnología virtual en horas no presenciales previstas por el diseño curricular. En ese contexto, el carácter multidisciplinar resulta un condimento esencial dado que las miradas epistemológicas disciplinares se funden en una sola experiencia donde el debate cultural trasciende esas perspectivas.Facultad de Humanidades y Ciencias de la Educació

Groundwater of Rome

This paper describes the contents of the new Hydrogeological Map of the City of Rome (1:50,000 scale). The map extends to the entire municipality (1285 km2) and is based on both the most recent scientific studies on the groundwater field and new survey activities carried out in order to fill the data gaps in several areas of the examined territory. The map is the result of a combination of different urban groundwater expertise and Geographic Information System (GIS)-based mapping performed using the most recent available data and has been produced with the intention of furnishing the City of Rome with the most recent and updated information regarding groundwater

Matrix metalloproteinase-9 polymorphisms affect plasma MMP-9 levels and antihypertensive therapy responsiveness in hypertensive disorders of pregnancy

Abnormal matrix metalloproteinase (MMP)-9 levels may have a role in hypertensive disorders of pregnancy. We examined whether MMP-9 genetic polymorphisms (g.-1562C>T and g.-90(CA)(13-25)) modify plasma MMP-9 and tissue inhibitor of metalloproteinase (TIMP)-1 levels and the responses to antihypertensive therapy in 214 patients with preeclampsia (PE), 185 patients with gestational hypertension (GH) and a control group of 214 healthy pregnant (HP). Alleles for the g.-90(CA)(13-25) polymorphism were grouped L (low) (<21 CA repeats) or H (high) (>= 21 CA repeats). Plasma MMP-9 and TIMP-1 concentrations were measured by enzyme-linked immunosorbent assay. Plasma MMP-9 concentrations were not affected by genotypes or haplotypes in HP and PE groups, except for the g.-90(CA)(13-25) polymorphism: GH patients with the LH genotype for this polymorphism have higher MMP-9 levels than those with other genotypes. The T allele for the g.-1562C>T polymorphism and the H4 haplotype (combining T and H alleles) are associated with GH and lack of responsiveness to antihypertensive therapy in GH. The H2 haplotype (combining C and H alleles) was associated with lack of responsiveness to antihypertensive therapy in PE, but not in GH. In conclusion, our results show that MMP-9 genetic variants are associated with GH and suggest that MMP-9 haplotypes affect the responsiveness to antihypertensive therapy in hypertensive disorders of pregnancy. The Pharmacogenomics Journal (2012) 12, 489-498; doi: 10.1038/tpj.2011.31; published online 19 July 2011Fundacao de Amparo a Pesquisa do Estado de Sao Paulo (FAPESP)Conselho Nacional de Desenvolvimento Cientifico e Tecnologico (CNPq)Coordenadoria de Aperfeicoamento de Pessoal de Nivel Superior (CAPES