Investigation of class 1 integrons with antibiotic resistance genes in multidrug-resistant acinetobacter baumannii strains and determination of plant extract effects on multidrug-resistant isolates

This study aimed to investigate the presence of resistance genes in multidrug-resistant A. baumannii isolates as well as to determine the antibacterial activity of selected plant extracts against isolates. 41 strains were isolated from various clinical samples. PCR tests were performed using the primers. Methanol was used as solvent for the preparation of the plant extracts. MIC values of the plant extracts were determined by the broth microdilution method. The bla(OXA-)(23), bla(CTX-M-1), bla(CTX-M-2), bla(GES) genes and Class 1 integrons were detected in five isolated strains. The lowest MIC value (2.25 mg/mL) was determined for the Echinacea putpurea extract, while the highest MIC value (50 mg/mL) was determined for the Morus alba extract. Determination of the antibacterial effect of plants extracts used in the study against A. baumannii isolates shows the importance of screening the antibacterial activity of plants in the fight against antibiotic resistance.Studiul a avut ca scop investigarea genelor de rezistență ale izolatelor de A. baumannii multirezistente, precum și determinarea activității antibacteriene a unor extracte vegetale supra a 41 specii microbiene izolate din diferite probe clinice. Metanolul a fost folosit ca solvent de extracție. Valorile concentrației minime inhibitorii ale extractelor obținute au fost determinate prin metoda microdiluției. Genele blaOXA-23, blaCTX-M-1 , blaCTX-M2 și blaGES, alături de integroni din clasa 1 au fost decelate pentru 5 specii izolate. Valoarea MIC cea mai scăzută (2,25 mg/mL) a fost obținută pentru extractul din Echinaceea purpurea, în timp ce cea mai mare valoare MIC (50 mg/mL) a fost determinată pentru extractul de Morus alba. Determinarea efectului antibacterian ale extractelor vegetale împotriva izolatelor de A. baumannii arată importanța screeningului activității antibacteriene a plantelor în lupta împotriva rezistenței la antibiotice

Quality of Life and Self - Efficacy of Adolescents with Chronic Health Conditions

Objective: Chronic Health Conditions (CHC) and problems among adolescents have recently become more frequent. CHC may have an influence on their perception of quality of life and self-efficacy. This research aimed to compare quality of life and self-efficacy among adolescents with CHC and without CHC. Methods: The research was conducted with 778 adolescents from a high school. Students were asked as follows: “Have you had any health condition which requires a doctor supervision and/or which requires continuous medication (pills, injection, oral or nasal usage) at least for 6 months or more?” All students completed the Self - Efficacy Questionnaire for Children (SEQ-C) and Pediatric Quality of Life Inventory (PedsQL). Results: All diseases declared by the students are accepted as chronic health conditions. The frequency of having chronical health condition is 19.5% among the high school students. PedsQL for adolescents with CHC were significantly lower compared to those without CHC (p0.05). Conclusion: It has been observed that the PedQL of students with chronic health problems was negatively affected as a result of our work. Lower QoL associated with school functioning of adolescents with chronic health problems suggests the importance of school-related factors (friends, teachers and physical structure) in the intervention of improving quality of life

1973 sonrası tarımsal kalkınma ve köy kalkınma kooperatifleri

Ankara : İhsan Doğramacı Bilkent Üniversitesi İktisadi, İdari ve Sosyal Bilimler Fakültesi, Tarih Bölümü, 2017.This work is a student project of the The Department of History, Faculty of Economics, Administrative and Social Sciences, İhsan Doğramacı Bilkent University.by Fatma Özden Mercan

Microorganisms isolated from blood cultures during the period of one year at the 82nd Year Rize State Hospital and their susceptibility to antibiotics

AMAÇ: Şubat 2010 ve Şubat 2011 tarihleri arasında Rize 82.Yıl Devlet Hastanesi Mikrobiyoloji Laborotuvarına gönderilen kan kültür örneklerinden izole edilen çeşitli mikroorganizmalar ve antibiyotiklere duyarlılıkları retrospektif olarak araştırılarak antibiyotik kullanım politikalarına katkıda bulunulması amaçlanmıştır. YÖNTEMLER: Bu süre içerisinde laboratuvara 900 kan kültürü örneği gelmiştir. Laboratuvarımıza gönderilen kan kültürü örnekleri bifazik Rosmedia (GBL), besiyerine ekilmiş ve rutin prosedürlerine uygun olarak EMB ve koyun kanlı agara pasajlanmıştır. Üreme sonrası mikroorganizmaların identifikasyonu koloni morfolojisi, Gram boyama ve biyokimyasal testleri içeren konvansiyonel yöntemlerle yapılmıştır. Antibiyotik duyarlılıkları Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) önerilerine göre Kirby-Bauer disk difüzyon yöntemi ile belirlenmiştir. BULGULAR: : Laboratuvara gelen kan kültür örneklerinin 750’sinde (%83.3) üreme olmamış, 15 örnek (% 1.7) kontaminasyon olarak değerlendirilmiştir. Örneklerin 135’inde (% 15.0) çeşitli mikroorganizmalar izole edilmiştir. Bu mikroorganizmaların 108’i (%80.0) Gram-pozitif bakteriler, 23’ü (% 17.0) Gram-negatif bakteriler ve 4’ü (% 3.0) Candida spp. olarak bulunmuştur. Gram-pozitif bakterilerden 94’ü (%87.0 ) koagülaz-negatif stafilokok (KNS), 4’ü (%3.7) S.aureus ve 10’u (%9.3) Enterococcus spp. idi. Metisilin direnci KNS’da % 70.2, S. aureus’ta % 50.0 olarak bulunmuştur. Stafilokoklarda ve enterokoklarda glikopeptit direncine rastlanmamıştır.Gram negatif bakterilerden 6 (%26.0)’sı Escherichia coli (E.coli), 5 (%21.7)’i Klebsiella spp., 5 (%21.7)’i Pseudomonas spp., 7 (%30.4)’si Acinetobacter spp., olarak tanımlanmıştır. Gram-negatif bakterilerden en sık izole edilen E.coli, Klebsiella spp. ve Pseudomonas spp. izolatlarında en duyarlı antimikrobiyal imipenem olarak bulunmuştur. Yoğun bakım ünitesinde üreyen Acinetobacter spp. izolatlarının 6 (%85.7)‘sı imipeneme dirençli bulunmuştur. SONUÇ: Bakteriyemi etkenleri arasında önemli yer tutan bakterilerin tanımlanması için kanın alınış tekniğinden başlanarak kan kültürleri konusunda hastane personeline eğitim verilmeli, en az iki şişe kan kültürü gönderilmesi konusunda klinikler bilgilendirilmeli ve bunların sonucunda kan kültürlerinin daha etkin çalışılması için otomatize sistemlere geçilmelidir. Ayrıca bakteriyemi etkenlerinin direnç profillerinde de zamanla değişim olduğundan antibiyotik tedavi stratejilerini belirlemek için bu etkenlerin antibiyotik direnç oranlarının takip edilmesi gerekmektedir.OBJECTIVE: The microorganisms which were isolated from blood cultures and their antibiotic susceptibilities during the between February 2010 and February 2011 in Microbiology Laboratory of Rize Central Hospital were assessed retrospectively, and aimed to contribute to antibiotic usage policies. METHODS: : During this period, 900 blood culture samples were sent to our laboratory. Blood culture samples which send to our laboratory added to biphasic blood culture medium (Rosmedia, GBL) and were inoculated both sheep blood agar and EMB agar in accordance with routine procedures. After growth, microorganisms were identified with colony morphology and conventional methods which containing gram staining and biochemical tests. Antibiotic susceptibility was determined by Kirby-Bauer disk diffusion method according to the recommendations of Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). RESULTS: There was no growth in 750 of these samples (83.3% ) and 15 samples were (1.7 %) accepted as contamination. Various bacteria were determined in 135 samples (15.0 %); 108 of these organisms were (80.0 %) gram-positives, 23 were (17.0 %) gram-negatives and 4 were (3.0 %) Candida spp. Coagulase Negative Staphylococcus (CNS) were the most frequently isolated species 94 (%87.0), followed by Staphylococcus aureus (S. aureus) 4 (%3.7), and Enterococcus spp. 10 (%9.3 ). Methicillin resistance were in 70.2 % of CNS and in 50.0 % of S.aureus. Glucopeptide resistance was not found in Staphylococcus and Enterococcus. The most frequently isolated Gram-negative species were Escherichia coli 6 (26.0%), Klebsiella species 5(21.7%), Pseudomonas spp. 5 (21.7%), Acinetobacter species 7(30.4%). The most effective antibiotics were found as imipenem for the isolates of E.coli, and Klebsiella species and Pseudomonas spp. which were the most frequently isolated Gram-negative bacteria. But imipenem resistance was found 6(85.7%) of Acinetobacter spp. isolates which growth in the intensive care unit. CONCLUSION: For determination of important bacteremia factors, the hospital staff should be given training on concerning blood collection techniques, the clinics should be informed about sending at least two blood culture bottles, and as a result of these, for studying more effectively, blood culture systems should be automated. Also, following the rates of antibiotic resistance would be in place approach for the determination of antibiotic treatment strategies because of changing the resistance of bacteria which important factors causing bacteremia

A single clone acinetobacter baumannii outbreak in a state hospital in Turkey

ERTURK, AYSE/0000-0001-6413-9165WOS: 000320094900014PubMed: 23698489Acinetobacter baumannii is an important pathogen in hospitalized patients, particularly those in the intensive care unit (ICU). A total of 21 A. baumannii (6 from 5 patients and 15 from environmental samples) were isolated in the ICU and the isolation room of a state hospital in June 2011. the possible source of the outbreak was investigated. A. baumannii isolates were identified using conventional biochemical tests, BBL Crystal Identification Systems, OXA-51 specific PCR, and 16S rDNA sequencing. All the isolates were multidrug-resistant, showing resistance to cephalosporins, carbapenems, fluoroquinolones, and the aminoglycoside group of antibiotics. Pulsed-field gel electrophoresis suggested that all A. baumannii isolates were derived from a common source

In vitro activity of ceftaroline to MRSA isolates: a multicenter study

Metisiline dirençli Staphylococcus aureus (MRSA), toplum ve hastane kaynaklı ciddi enfeksiyonlara neden olabilen önemli bir patojendir. MRSA’nın neden olduğu enfeksiyonlarda tedavi seçeneklerinin sınırlı kalmasından dolayı alternatif tedavi arayışlarına devam edilmektedir. Seftarolin, MRSA kaynaklı cilt ve solunum yolu enfeksiyonlarının tedavisinde kullanılmaya başlayan geniş spektrumlu yeni kuşak bir sefalos- porindir. Bu çalışmada, ülkemizin farklı illerindeki (Bolu, Samsun, Rize, Tekirdağ, Sakarya, Amasya, Osmaniye) yedi hastanenin mikrobiyoloji laboratuvarında çeşitli klinik örneklerden izole edilen MRSA suşlarına karşı seftarolinin in vitro etkinliğinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya toplam 192 MRSA izolatı (89 cilt/yara yeri/abse, 38 kan, 36 solunum yolu, 29 idrar/steril vücut sıvısı/kateter) dahil edilmiş ve seftarolin duyarlılığı sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle araştırılmıştır. Çalışmada, 181 (%94.3) izolatın MİK değeri CLSI duyarlılık sınır değeri olan 1 ?g/ml ve altında saptanarak duyarlı olarak belirlenmiş; 11 (%5.7) izolatın MİK değeri ise 2 ?g/ml olarak saptanarak seftaroline orta duyarlı olarak kabul edilmiştir. İzolatların seftarolin için MİK aralığı 0.25-2 ?g/ml olarak bulunmuştur. Çalışmaya katılan merkezlerde seftaroline orta duyarlı olarak bulunan izolat oranları %0-12.5 arasında değişmektedir. Tüm izolatlar değerlendirildiğinde MİK50 ve MİK90 değerleri sırasıyla 0.5 ?g/ml ve 1 ?g/ml olarak belirlenmiştir. Merkezler arasında ortalama MİK değerleri açısından anlamlı farklılık bulunamamıştır (p> 0.05). MİK50 ve MİK90 değerleri, Samsun ve Bolu izolatlarında genel dağılımla aynı bulunurken, Amasya izolatlarında 0.5 ?g/ml ve 0.5 ?g/ml; Rize, Tekirdağ, Osmaniye ve Sakarya için 1 ?g/ml ve 1 ?g/ml olarak belirlenmiştir. Klinik örnek türüne göre incelendiğinde ise MİK50 ve MİK90 değerlerinin genel dağılıma ait değerlerle benzer olduğu izlenmiş, orta duyarlı olarak saptanan izolat sayıları açısından da gruplar arasında anlamlı fark bulunamamıştır (p> 0.05). Ülkemizin yedi ayrı merkezinden elde edilen izolatların seftarolin MİK değerlerinin dağılım profili ve duyarlılık oranları Avrupa ve Amerika kaynaklı çalışmalarla benzer bulunmuştur. Bu çalışmada, seftarolinin MRSA üzerine etkinliği ile ilgili ilk Türkiye verileri elde edilmiştir. Elde edilen bu ön veriler, seftarolinin Türkiye izolatlarında da etkili olduğunu ve geniş spektrumlu antimikrobiyal kullanımı gereken durumlarda iyi bir seçenek olabileceğini düşündürmekle birlikte daha geniş kapsamlı ileri çalışmalara gerek vardır.Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is an emerging pathogen that cause severe community- and hospital-acquired infections. Studies continue on searching alternatives due to the limited number of therapeutic options in MRSA infections. Ceftaroline is a wide-spectrum new generation cephalosporin which has been begun to be used in treatment of skin and respiratory tract infections caused by MRSA. The aim of this study was to investigate the in vitro activity of ceftaroline against MRSA strains isolated from various clinical specimens in microbiology laboratories of seven hospitals located at different provinces (Bolu, Samsun, Rize, Tekirdag, Sakarya, Amasya, Osmaniye) of Turkey. A total of 192 MRSA isolates (89 skin/wound/abscess, 38 blood, 36 respiratory tract, 29 urine/sterile body fluids/catheter) were included in the study, and ceftaroline susceptibilities of the strains were detected by broth microdilution method. MIC values of 181 (94.3%) isolates were determined as ≤ 1 μg/ml meaning of susceptible according to the criteria of CLSI, and MIC values of 11 (5.7%) isolates were found as 2 μg/mL indicating intermediate susceptibility. The range of MIC values of the isolates was found between 0.25- 2 μg/ml. The rates of intermediate isolates have varied between 0-12.5% from the participating centers. MIC50 and MIC90 values of all the isolates were determined as 0.5 μg/ml and 1 μg/ml, respectively. No significant differences were found between the centers in terms of mean MIC values (p> 0.05). MIC50 and MIC90 values in Samsun and Bolu isolates were found to be the same with the whole group, however, MIC50 and MIC90 were 0.5 μg/ml and 0.5 μg/ml in Amasya isolates and 1 μg/ml and 1 μg/ml in Rize, Tekirdag, Osmaniye and Sakarya isolates, respectively. When evaluating MIC50 and MIC90 values and isolation rates of intermediate strains according to the specimen types, there were no significant differences (p> 0.05). Susceptibility rates to ceftaroline and the distribution profiles of MIC values of the isolates obtained from seven centers of Turkey have been detected similar with the previous American and European reports. With this study, initial data on the activity of ceftaroline against MRSA were obtained from Turkey. These preliminary findings indicate that ceftaroline is effective even on Turkish isolates and can be a suitable treatment in cases requiring wide-spectrum antimicrobiotic use, however further large-scaled studies are needed

In vitro activity of ceftaroline to MRSA isolates: A multicenter study

Metisiline dirençli Staphylococcus aureus (MRSA), toplum ve hastane kaynaklı ciddi enfeksiyonlara neden olabilen önemli bir patojendir. MRSA’nın neden olduğu enfeksiyonlarda tedavi seçeneklerinin sınırlı kalmasından dolayı alternatif tedavi arayışlarına devam edilmektedir. Seftarolin, MRSA kaynaklı cilt ve solunum yolu enfeksiyonlarının tedavisinde kullanılmaya başlayan geniş spektrumlu yeni kuşak bir sefalos- porindir. Bu çalışmada, ülkemizin farklı illerindeki (Bolu, Samsun, Rize, Tekirdağ, Sakarya, Amasya, Osmaniye) yedi hastanenin mikrobiyoloji laboratuvarında çeşitli klinik örneklerden izole edilen MRSA suşlarına karşı seftarolinin in vitro etkinliğinin araştırılması amaçlanmıştır. Çalışmaya toplam 192 MRSA izolatı (89 cilt/yara yeri/abse, 38 kan, 36 solunum yolu, 29 idrar/steril vücut sıvısı/kateter) dahil edilmiş ve seftarolin duyarlılığı sıvı mikrodilüsyon yöntemiyle araştırılmıştır. Çalışmada, 181 (%94.3) izolatın MİK değeri CLSI duyarlılık sınır değeri olan 1 ?g/ml ve altında saptanarak duyarlı olarak belirlenmiş; 11 (%5.7) izolatın MİK değeri ise 2 ?g/ml olarak saptanarak seftaroline orta duyarlı olarak kabul edilmiştir. İzolatların seftarolin için MİK aralığı 0.25-2 ?g/ml olarak bulunmuştur. Çalışmaya katılan merkezlerde seftaroline orta duyarlı olarak bulunan izolat oranları %0-12.5 arasında değişmektedir. Tüm izolatlar değerlendirildiğinde MİK50 ve MİK90 değerleri sırasıyla 0.5 ?g/ml ve 1 ?g/ml olarak belirlenmiştir. Merkezler arasında ortalama MİK değerleri açısından anlamlı farklılık bulunamamıştır (p> 0.05). MİK50 ve MİK90 değerleri, Samsun ve Bolu izolatlarında genel dağılımla aynı bulunurken, Amasya izolatlarında 0.5 ?g/ml ve 0.5 ?g/ml; Rize, Tekirdağ, Osmaniye ve Sakarya için 1 ?g/ml ve 1 ?g/ml olarak belirlenmiştir. Klinik örnek türüne göre incelendiğinde ise MİK50 ve MİK90 değerlerinin genel dağılıma ait değerlerle benzer olduğu izlenmiş, orta duyarlı olarak saptanan izolat sayıları açısından da gruplar arasında anlamlı fark bulunamamıştır (p> 0.05). Ülkemizin yedi ayrı merkezinden elde edilen izolatların seftarolin MİK değerlerinin dağılım profili ve duyarlılık oranları Avrupa ve Amerika kaynaklı çalışmalarla benzer bulunmuştur. Bu çalışmada, seftarolinin MRSA üzerine etkinliği ile ilgili ilk Türkiye verileri elde edilmiştir. Elde edilen bu ön veriler, seftarolinin Türkiye izolatlarında da etkili olduğunu ve geniş spektrumlu antimikrobiyal kullanımı gereken durumlarda iyi bir seçenek olabileceğini düşündürmekle birlikte daha geniş kapsamlı ileri çalışmalara gerek vardır.Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) is an emerging pathogen that cause severe community- and hospital-acquired infections. Studies continue on searching alternatives due to the limited number of therapeutic options in MRSA infections. Ceftaroline is a wide-spectrum new generation cephalosporin which has been begun to be used in treatment of skin and respiratory tract infections caused by MRSA. The aim of this study was to investigate the in vitro activity of ceftaroline against MRSA strains isolated from various clinical specimens in microbiology laboratories of seven hospitals located at different provinces (Bolu, Samsun, Rize, Tekirdag, Sakarya, Amasya, Osmaniye) of Turkey. A total of 192 MRSA isolates (89 skin/wound/abscess, 38 blood, 36 respiratory tract, 29 urine/sterile body fluids/catheter) were included in the study, and ceftaroline susceptibilities of the strains were detected by broth microdilution method. MIC values of 181 (94.3%) isolates were determined as ≤ 1 µg/ml meaning of susceptible according to the criteria of CLSI, and MIC values of 11 (5.7%) isolates were found as 2 µg/mL indicating intermediate susceptibility. The range of MIC values of the isolates was found between 0.25- 2 µg/ml. The rates of intermediate isolates have varied between 0-12.5% from the participating centers. MIC50 and MIC90 values of all the isolates were determined as 0.5 µg/ml and 1 µg/ml, respectively. No significant differences were found between the centers in terms of mean MIC values (p> 0.05). MIC50 and MIC90 values in Samsun and Bolu isolates were found to be the same with the whole group, however, MIC50 and MIC90 were 0.5 µg/ml and 0.5 µg/ml in Amasya isolates and 1 µg/ml and 1 µg/ml in Rize, Tekirdag, Osmaniye and Sakarya isolates, respectively. When evaluating MIC50 and MIC90 values and isolation rates of intermediate strains according to the specimen types, there were no significant differences (p> 0.05). Susceptibility rates to ceftaroline and the distribution profiles of MIC values of the isolates obtained from seven centers of Turkey have been detected similar with the previous American and European reports. With this study, initial data on the activity of ceftaroline against MRSA were obtained from Turkey. These preliminary findings indicate that ceftaroline is effective even on Turkish isolates and can be a suitable treatment in cases requiring wide-spectrum antimicrobiotic use, however further large-scaled studies are needed