SCMFTS: Scalable and Distributed Complexity Measures and Features for Univariate and Multivariate Time Series in Big Data Environments

This research has been partially funded by the following grants: TIN2016-81113-R from the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness, P12-TIC-2985 and P18-TP-5168 from Andalusian Regional Government, Spain, and EU Commission with FEDER funds. Francisco J. Baldan holds the FPI grant BES-2017-080137 from the Spanish Ministry of Economy and Competitiveness. D. Peralta is a Postdoctoral Fellow of the Research Foundation of Flanders (170303/12X1619N). Y. Saeys is an ISAC Marylou Ingram Scholar.Time series data are becoming increasingly important due to the interconnectedness of the world. Classical problems, which are getting bigger and bigger, require more and more resources for their processing, and Big Data technologies offer many solutions. Although the principal algorithms for traditional vector-based problems are available in Big Data environments, the lack of tools for time series processing in these environments needs to be addressed. In this work, we propose a scalable and distributed time series transformation for Big Data environments based on well-known time series features (SCMFTS), which allows practitioners to apply traditional vector-based algorithms to time series problems. The proposed transformation, along with the algorithms available in Spark, improved the best results in the state-of-the-art on the Wearable Stress and Affect Detection dataset, which is the biggest publicly available multivariate time series dataset in the University of California Irvine (UCI) Machine Learning Repository. In addition, SCMFTS showed a linear relationship between its runtime and the number of processed time series, demonstrating a linear scalable behavior, which is mandatory in Big Data environments. SCMFTS has been implemented in the Scala programming language for the Apache Spark framework, and the code is publicly available.Spanish Government TIN2016-81113-R BES-2017-080137Andalusian Regional Government, Spain P12-TIC-2985 P18-TP-5168European Commission European Commission Joint Research Centre European Commissio

Complexity Measures and Features for Times Series classification

Classification of time series is a growing problem in different disciplines due to the progressive digitalization of the world. Currently, the state-of-the-art in time series classification is dominated by The Hierarchical Vote Collective of Transformation-based Ensembles. This algorithm is composed of several classifiers of different domains distributed in five large modules. The combination of the results obtained by each module weighed based on an internal evaluation process allows this algorithm to obtain the best results in state-of-the-art. One Nearest Neighbour with Dynamic Time Warping remains the base classifier in any time series classification problem for its simplicity and good results. Despite their performance, they share a weakness, which is that they are not interpretable. In the field of time series classification, there is a tradeoff between accuracy and interpretability. In this work, we propose a set of characteristics capable of extracting information on the structure of the time series to face time series classification problems. The use of these characteristics allows the use of traditional classification algorithms in time series problems. The experimental results of our proposal show no statistically significant differences from the second and third best models of the state-of-the-art. Apart from competitive results in accuracy, our proposal is able to offer interpretable results based on the set of characteristics proposed.Spanish Government TIN2016-81113-R PID2020-118224RB-I00 BES-2017-080137Andalusian Regional Government, Spain P12-TIC-2958 P18-TP-5168 A-TIC-388-UGR-1

Nuevas estrategas proteómicas para el estudio de la evolución de albuminuria en pacientes con hipertensión arterial

Las enfermedades cardiovasculares (ECV) representan la primera causa de muerte a nivel mundial, siendo la hipertensión arterial (HTA) el principal factor de riesgo asociado a ellas. El Sistema Renina-Angiotensina (SRA) es un sistema hormonal que desempeña un papel fundamental en el control de la presión arterial (PA). Dado que es un mediador clave en la progresión del daño renal y cardiovascular (CV), el uso de fármacos que inhiben el SRA se considera la mejor terapia para el manejo de la HTA. Sin embargo, en un número no despreciable de individuos la progresión hacia ECV y renal sigue avanzando a pesar de estar tratados crónicamente con inhibidores del SRA, lo que indica un cierto grado de ineficacia y respuesta incompleta del tratamiento. El incremento de la excreción de albúmina en orina (albuminuria), a consecuencia de la PA, se considera un marcador de disfunción vascular generalizada y predictor del desarrollo de futuras complicaciones CV y renales. Por ello, la detección temprana de la albuminuria, así como un mejor conocimiento de los mecanismos que puedan estar relacionados con el daño renal subyacente, tendrá un efecto importante en la prevención y progresión de esta patología. En este trabajo hemos llevado a cabo un abordaje multi-proteómico tanto en plasma como en vesículas extracelulares (VEs) circulantes del plasma de individuos hipertensos con supresión del SRA y distinto grado de afectación renal con el objetivo de identificar los perfiles proteómicos de estos individuos, así como también, la búsqueda de potenciales marcadores pronósticos asociados al desarrollo de la albuminuria. Además, se ha realizado un estudio prospectivo de dos años en el que se identificaron proteínas en plasma con valor predictor de la progresión a albuminuria. Por otro lado, el análisis de las VEs del plasma ha permitido identificar proteínas con potencial valor como marcadores de disfunción endotelial en pacientes con albuminuria, lo que supondría una excelente estrategia para monitorizar la condición vascular en estos individuos..

La dimensión personal en la formación inicial docente. Una experiencia de innovación educativa

This article describes the experience carried out in the subject Education for Diversity in the Primary Education Degree, during the COVID-19 pandemic. The objective is to broaden the concept of inclusion, incorporating the development of the personal dimension as a key element for initial teacher training. One hundred twenty-two students participated in the experience and the information gathering techniques used were documentary analysis and questionnaire. The results show the importance of developing the personal dimension in the Primary Education Degree; the objectives proposed were successfully achieved, despite the situation at that time. In conclusion, we emphasize the need to work on the personal dimension in initial teacher training and to incorporate these concepts into the inclusive education model.En este artículo se describe la experiencia llevada a cabo en la asignatura “Educación para la Diversidad” del Grado de Maestro/a de Educación Primaria, durante la pandemia por el COVID19. El objetivo es ampliar el concepto de inclusión, incorporando el desarrollo de la dimensión personal como un elemento clave para la formación inicial del profesorado. Participaron ciento veintidós estudiantes y las técnicas de obtención de información fueron el análisis documental y el cuestionario. Los resultados ponen de manifiesto la importancia de desarrollar la dimensión personal en el Grado de Maestro/a de Educación Primaria; los objetivos establecidos fueron alcanzados con éxito, a pesar de la situación vivida en ese momento. Como conclusión, destacamos la necesidad de trabajar la dimensión personal en la formación inicial de docentes e incorporar dichos conceptos al modelo de educación inclusiva

Coordinación docente y precariedad. Modelos de coordinación en la enseñanza de la Sociología en Andalucía

Desde la implantación de los Sistemas de Garantía de Calidad, la enseñanza universitaria ha incorporado mecanismos y figuras de coordinación a la práctica docente. Sin embargo, su aplicación dista de ser homogénea. Un mecanismo diseñado originalmente para la mejora de la calidad docente ha cobrado una nueva significación e importancia debido al contexto de precarización generalizada de las plantillas de profesorado en la universidad. Este trabajo plantea un análisis del contexto, las bases teóricas y los distintos modelos de coordinación implementados en una serie de universidades donde se imparte el grado de Sociología en Andalucía, pero los resultados son perfectamente extrapolables a otras disciplinas y lugares. Empleando un análisis autoetnográfico, a partir de la experiencia de los autores del texto, se elaboran dos modelos típico ideales de coordinación. Las prácticas docentes reales en los diferentes departamentos analizados se mueven en un continuo que va desde la coordinación total a la autonomía total. Cada uno de estos modelos tienen una serie de ventajas e inconvenientes, y son fruto de una particular combinación de factores materiales, culturales y humanos. Nuestros resultados muestran la utilidad de un mayor grado de coordinación en contextos de plantillas inestables o en formación, frente a la adecuación de la autonomía a las situaciones de mayor estabilidad y experiencia. La coordinación puede servir para mitigar algunos problemas causados por la precariedad, pero no debería ser una coartada para profundizar en ella

Molecular characterization of a gilthead sea bream (Sparus aurata) muscle tissue cDNA for carnitine palmitoyltransferase 1B (CPT1B)

Understanding the control of piscine fatty acid metabolism is important for determining the nutritional requirements of fish, and hence for the production of optimal aquaculture diets. The regulation and expression of carnitine palmitoyltransferase 1 (CPT1; EC No 2.3.1.21) are critical processes in the control fatty acid metabolism, and here we report a cDNA from gilthead sea bream (Sparus aurata) which encodes a protein with high identity to vertebrate CPT1. This sea bream CPT1 mRNA is predominantly expressed in skeletal and cardiac muscle, with little expression in other tissues. Phylogenetic analysis of other vertebrate CPT1 sequences show that fish genomes contain a single gene related to mammalian CPT1B, and a further two multi-gene families related to mammalian CPT1A. Genes related to mammalian CPT1C are absent in fish. Therefore, based on both functional and evolutionary orthology to mammalian CPT1B, the sea bream CPT1 reported here is a CPT1B isoform. Sea bream CPT1B mRNA expression progressively decreases in heart and muscle up to 12 hours after last feeding, but returns to initial, non-fasted levels after 72 hours. In contrast, in liver non-fasted expression is low, but strongly increases at 24 and 72 hours after last feeding. In white muscle and liver, CPT1B mRNA expression is highly correlated with the expression of peroxisomal proliferator-activated receptor ı (PPARı).Thus fatty acid metabolism by CPT1B and its control by PPARs is similar in fish and mammals, but multiple genes for CPT1A-like proteins in fish also suggest different and more complex pathways of lipid utilisation than in mammals