Structure et dynamique de protéines de la salive humaine en interaction avec les tanins du vin de Bordeaux

La complexation des tanins avec les protéines de la salive est à l'origine de l'astringence, sensation tactile propre aux vins rouges. La protéine IB7, son peptide dérivé IB714 et le tanin B3 ont été synthétisés. Leur mode d'interaction a été étudié par RMN des liquides et des solides (rotation à l'angle magique), spectrométrie de masse, dichroïsme circulaire et dynamique moléculaire. Le peptide IB714 et la protéine entière sont constitués d'hélice de type II (1/3) et de pelote statistique (2/3) ; la glycine centrale du peptide joue le rôle de charnière de part et d'autre de régions en hélice. Le tanin, quant à lui, revêt une forme compacte majoritaire en milieu aqueux. L'ensemble des paramètres physico-chimique ont été mesurés : la stoechiométrie du complexe est de 3 molécules B3 par peptide IB714 ; la constante de dissociation est de l'ordre du mM ; la nature des liaisons assurant la cohésion du complexe est de type liaisons hydrogène ; les sites de fixation ainsi que la taille du complexe ont été déterminés. Ces informations permettraient de comprendre l'astringence d'un point de vue physico-chimique.The complexation of tannins with salivary proteins is the source of astringency phenomenon, red wine tactil sensation. IB7 protein, protein fragment IB714 and B3 tanin were synthesized. The interaction between B3 tannin and protein were monitored by 1H magic angle spinning NMR, mass spectrometry, circular dichroism and molecular dynamic. Peptide and protein are constituted by type II helix (1/3) and random coil conformation (2/3); the central glycine appears to act as a flexible rotula separating two helices II regions. The tannin adopt a “tweezer” conformation. All the physico-chemical parameters were measured: the complex stoichiometry is of 3 tannins molecules per peptide IB714; the dissociation constant is of millimolar range; the principal driving forces toward association are governed by hydrogen bonding; the nature of the binding sites and the size of the complex were determined. These findings allow us to understand the physico-chemistry of astringency

Les logiciels de planification des déplacements urbains : catalogue

Les logiciels mentionnés dans ce catalogue sont les logiciels les plus présents sur le marché français, dans la catégories des logiciels de planification des déplacements en milieu urbain. Par opposition, ne sont pas pris en compte les logiciels de gestion et de simulation du trafic qui permettent de gérer en temps réel ou de simuler la gestion de la circulation.Les logiciels font l’objet d’une présentation par fiche, que l’on a souhaitée la plus lisible et la plus construite possible. Chaque fiche présente de nombreuses informations d’ordre pratique (prix du logiciel, coordonnées des sociétés distributrices et conceptrice, etc.), ergonomique (saisie des données, traitement des données de sorties, interface, etc.) et méthodologique (modèles possibles, problèmes spécifiques de transport, etc.). Un avis d’ensemble sur le logiciel basé sur une enquête auprès des utilisateurs a également été rédigé.Les fiches suivent le plan ci-dessous :Description générale, Méthodologie, Tarifs et services, Environnement et matériel, Coordonnées des sociétés, Caractéristique du logiciel, Architecture du logiciel, Techniques de modélisation, Données d’entrée nécessaires, Modalités de prise en compte des données, Description des données de sorties, Analyse des données de sorties, Limites du logiciel, Prises en compte de problématiques particulières de déplacements, Références d’études récentes réalisées avec le logiciel, Développements du logiciel, Impressions écran, Le point de vue des utilisateurs

L'AIS : une donnée pour l'analyse des activités en mer

4 pages, session "Mer et littoral"International audienceCette contribution présente des éléments méthodologiques pour la description des activités humaines en mer dans une perspective d'aide à la gestion. Différentes procédures, combinant l'exploitation de bases de données spatio-temporelles issue de données AIS archivées à des analyses spatiales au sein d'un SIG, sont testées afin de caractériser le transport maritime en Mer d'Iroise (Bretagne, France) sur les plans spatiaux, temporels et quantitatifs au cours d'une année

Diagnostic du colmatage des générateurs de vapeur à l'aide de modèles physiques et statistiques

Steam generators are massive heat exchangers feeding the turbines of pressurised water nuclear power plants. Internal parts of steam generators foul up with iron oxides which gradually close some holes aimed for the passing of the fluid. This phenomenon called clogging causes safety issues and means to assess it are needed to optimise the maintenance strategy. The approach investigated in this thesis is the analysis of steam generators dynamic behaviour during power transients with a monodimensional physical model. Two improvements to the model have been implemented. One was taking into account flows orthogonal to the modelling axis, the other was introducing a slip between phases accounting for velocity difference between liquid water and steam. These two elements increased the model's degrees of freedom and improved the adequacy of the simulati onto plant data. A new calibration and validation methodology has been proposed to assess the robustness of the model. The initial inverse problem was ill posed: different clogging spatial configurations can produce identical responses. The relative importance of clogging, depending on its localisation, has been estimated by sensitivity analysis with the Sobol' method. The dimension of the model functional output had been previously reduced by principal components analysis. Finally, the input dimension has been reduced by a technique called sliced inverse regression. Based on this new framework, a new diagnosis methodology, more robust and better understood than the existing one, has been proposed.Les générateurs de vapeur sont d'imposants échangeurs de chaleur qui alimentent les turbines des centrales nucléaires à eau pressurisée. Au cours de leur exploitation, des dépôts d'oxydes s'y accumulent et obstruent progressivement des trous prévus pour le passage du fluide. Ce phénomène, appelé colmatage, pose des problèmes de sûreté. Une méthode de diagnostic est nécessaire pour optimiser la stratégie de maintenance permettant de s'en prémunir. La piste explorée dans cette thèse est l'analyse de la réponse dynamique des générateurs de vapeur lors de transitoire de puissance, à l'aide d'un modèle physique monodimensionnel. Deux améliorations ont été apportées au modèle existant au cours de la thèse : la prise en compte des débits perpendiculaires à l'axe du générateur de vapeur et la modélisation du déséquilibre cinématique entre la phase liquide et la phase vapeur. Ces éléments ont ajouté des degrés de liberté permettant de mieux reproduire le comportement réel des générateurs de vapeur. Une nouvelle méthodologie de calage et de validation a alors été proposée afin de garantir la robustesse du modèle.Le problème inverse initial était mal posé car plusieurs configurations spatiales de colmatage peuvent donner des réponses identiques. La magnitude relative de l'effet des dépôts suivant leur localisation a été évaluée par analyse de sensibilité avec la méthode de Sobol'. La dimension de la sortie fonctionnelle du modèle a au préalable été réduite par une analyse en composantes principales.Enfin, une méthode de réduction de dimension appelée régression inverse par tranches a été mise en œuvre pour déterminer dessous-espaces de projection optimaux pour le diagnostic. Une méthode de diagnostic plus robuste et mieux maitrisée que celle existante a pu être proposée grâce à cette nouvelle formulation

Les formations du Jurassique supérieur et du Crétacé inférieur de l'avant-pays rifain oriental (Maroc)

The Upper Jurassic and the Lower Cretaceous deposits of the eastern Rif foreland, which are subdivided into four main formations, were studied from a lithostratigraphical and a sedimentological point of view.1) The "Beni Ourimeuch" Sandstones Fm (or "Bou Rached" Upper Sandstones") which is mainly composed of terrigenous siliciclastic deposits with intercalations of mainly oolitic or bioclastic carbonated levels of x1 m to x10 m thick. Depending on the locations, this formation either corresponds to deposits of a more or less diversified terrigenous coastal platform in the "Beni Snassen", or to deposits of a deltaic complex located on the "Guercif" bassins and surrounding areas.2) The "Mechra Klila" Limestones Fm, an almost entirely carbonated formation, partly dolomitized, which correspond to sediments deposited on a plaform comprising a large very shallow mudflat of 40 km to 70 km width, distally extended by an external mudflat with sponges, and proximally extended by a low-energy foreshore with stromatolites.In the distal part of the platform and of the external slope, the compartmentalization of the basement, slumps and breccias whose elements derived from the upper part of uplifted blocks results from extensional syn-sedimentary deformations.3) The "Ahmar Lakhdar" Limestones and Marls Fm only differs from the previous one by the argillaceous terrigenous deposits of the first half of the formation. This Fm correspond to a open carbonate ramp which gently slopes toward the external domain and ending, in the proximal side, by a olitic, bioclastic sandy foreshore of high-energy.4) The "Bou Rhennja" Marls Fm, which corresponds to deposits of a shallow platform, records two regional events, the purbeckian regression at the end of the Jurassic and the berriasian transgression which takes part to the global Lower Cretaceous transgression.In this eastern part of the South-Tethyan Margin, the sedimentary record and its organization were mainly controlled by the tectonics in a transform system between the expanding Central Atlantic and Tethys-Ligurian oceans.Le Jurassique supérieur et le Crétacé inférieur de l'avant-pays rifain oriental, subdivisés en quatre grandes formations, ont été étudiés d'un point de vue lithostratigraphique et sédimentologique.1) Les Grès de Beni Ourimeuch [ou Grès supérieurs de Bou Rached) constituent un ensemble sédimentaire à dominante terrigène silicoclastique intercalé de niveaux carbonatés essentiellement oolitiques ou bioclastiques, de quelques mètres à plusieurs dizaines de mètres d'épaisseur. Selon les secteurs, cette formation représente soit des dépôts de plate-forme littorale terrigène plus ou moins diversifiée selon les époques, dans les Beni Snassen, soit des dépôts d'un complexe deltaïque installé sur le bassin de Guercif et ses environs.2) Les Calcaires de Mechra Klila, formation presque totalement carbonatée, en partie dolomitisée, correspondent à des sédiments mis en place sur une plate-forme comprenant une vaste vasière très peu profonde, d'une largeur de 40 à 70 km, prolongée distalement par une vasière externe à spongiaires et proximalement par un estran de faible énergie porteur de tapis algaires stromatolitiques.Dans la partie distale de la plate-forme et du talus externe, de mouvements tectoniques syn-sédimentaires en distension résultent un compartimentage du sousbassement et la formation de slumps et de brèches dont les éléments sont issus de l'érosion de la partie haute des blocs soulevés.3) Les Marna-calcaires et Calcaires d'Ahmar Lakhdar ne diffèrent de la formation précédente que par les dépôts terrigènes argileux de la première moitié de la formation. Le dispositif sédimentaire correspond à une rampe carbonatée ouverte s'inclinant en pente douce vers le domaine externe et se terminant, côté proximal, par un estran sableux, oolitique et bioclastique, de forte énergie.4) Les Marna-calcaires de Bou Rhennja, dépôts de plate-forme également très peu profonde, enregistrent deux phénomènes d'ampleur régionale, la régression purbéckienne de la fin du Jurassique et la transgression berriasienne laquelle s'intègre dans le cadre transgressif général du Crétacé inférieur.Dans cette portion occidentale de la marge sud-téthysienne, le contrôle principal de l'organisation sédimentaire a été exercé par la tectonique dans le contexte général transformant, entre Atlantique central et Téthys ligure, tous deux en expansion

Programme d'aide pour les élèves dysphasiques et leurs parents

En famille, on est jamais seul à affronter son univers, tous les membres se voient confrontés au quotidien de chacun. Les parents veulent le meilleur pour leurs enfants et le bien-être, l'éducation, l'évolution et l'accomplissement de ceux-ci sont la priorité. Ce groupe social est parfois mis à l'épreuve et doit surmonter les obstacles associés. Il arrive que l'annonce d'un handicap comme la dysphasie ébranle les structures familiales et provoque des bouleversements importants. Face à une telle situation, les gens se voient parfois désarmés et démunis. Cette recherche porte sur un programme d'interventions qui s'adresse à la clientèle dysphasique. L'objectif est de vérifier l'efficacité et l'utilité d'un programme d'interventions spécifiques à l'intérieur duquel on retrouvera un document regroupant des supports visuels. En plus, cet outil présente des renseignements sur la dysphasie et sur les troubles pouvant y être associés. Finalement, on retrouve aussi les coordonnées de certaines ressources disponibles.\ud L'administration du programme a été effectuée auprès de sept adolescents dysphasiques âgés entre 12 et 17 ans fréquentant une école secondaire. Pour ce faire, nous avons obtenu l'appui de la direction générale de l'école. La participation, l'intérêt et la motivation des sujets ont contribué à la réalisation de ce mémoire. La collecte des données s'est échelonnée du 18 février au 21 avril 2007. Les résultats de cette étude montrent que l'utilisation du programme permet des apprentissages. En effet, l'aspect visuel, le matériel imagé proposé pour les tâches de français et de mathématique ainsi que les couleurs occupent une place importante et favorisent les apprentissages des dysphasiques. L'analyse des observations et des entrevues laisse entendre que les supports recommandés permettent de mieux comprendre les notions correspondantes. ______________________________________________________________________________ MOTS-CLÉS DE L’AUTEUR : Dysphasie, Programme d'intervention, Adolescents, Supports visuels

Un langage de programmation pour composer l'interaction musicale : la gestion du temps et des événements dans Antescofo

Mixed music is the association in live performance of human musicians and computer mediums, interacting in real-time. Authoring the interaction between the humans and the electronic processes, as well as their real-time implementation, challenge computer science in several ways. This contribution presents the Antescofo real-time system and its domain specific language. Using this language a composer is able to describe temporal scenarios where electronic musical processes are computed and scheduled in interaction with a live musician performance. Antescofo couples artificial machine listening with a reactive and temporized system. The challenge in bringing human actions in the loop of computing is strongly related the specification and the management of multiple time frameworks and timeliness of live execution despite heterogeneous nature of time in the two mediums. Interaction scenarios are expressed at a symbolic level through the management of musical time (i.e., events like notes or beats in relative tempi) and of the physical time (with relationships like succession, delay, duration, speed between the occurrence of the events during the performance on stage). Antescofo unique features are presented through a series of examples which illustrate how to manage execution of different audio processes through time and their interactions with an external environment. The Antescofo approach has been validated through numerous uses of the system in live electronic performances in contemporary music repertoire by various international music ensembles.La musique mixte se caractérise par l’association de musiciens instrumentistes et de processus électroniques pendant une performance. Ce domaine soulève des problématiques sur l’écriture de cette interaction et sur les mécanismes qui permettent d’exécuter des programmes dans un temps partagé avec les musiciens.Ce travail présente le système temps réel Antescofo et son langage dédié. Il permet de décrire des scénarios temporels où des processus sont calculés et ordonnancés en interaction avec un environnement musical. Antescofo couple un système de suivi de partition avec un système réactif temporisé.L’originalité du système réside dans la sémantique temporelle du langage adaptée aux caractéristiques critiques de l’interaction musicale. Le temps et les événements peuvent s’exprimer de façon symbolique dans une échelle en secondes ou dans des échelles relatives à des tempos.Nous présenterons les domaines de recherche apparentés à Antescofo en musique et en informatique, les caractéristiques du langage et de la partie réactive d’Antescofo qui ont été développés pendant cette thèse en particulier les stratégies synchronisations et les différents contrôles du temps et des évènements permis par le système. Nous donnerons une sémantique du langage qui formalise le fonctionnement du moteur d’exécution. À travers une série d’exemples d’applications issues de collaborations artistiques, nous illustrerons les interactions temporelles qu’il faut gérer entre une machine et un instrumentiste lors d’un concert. Le système a pu être validé à travers de nombreux concerts par différents orchestres d’envergure internationale

Régulation de la métalloprotéase ADAM10/Kuzbanian par les tétraspanines à 8 cystéines et conséquences sur l'activation de la voie Notch chez les mammifères et la Drosophile

L importance des activités protéolytiques associées à la membrane plasmique dans divers processus biologiques fondamentaux est de mieux en mieux définie. Les protéases de la famille ADAM (A Disintegrin and Metalloprotease), et ADAM10 en particulier, ont suscité un intérêt tout particulier du fait de l importance de leurs substrats (récepteur de l EGF, TNFa, Notch, APP ). Néanmoins, peu d études se sont intéressées aux mécanismes régulant le trafic d ADAM10.Les tétraspanines sont une super-famille de protéines de surface impliquées dans de nombreux processus biologiques fondamentaux parmi lesquels la migration, les interactions intercellulaires, la réponse immunitaire, la fusion des gamètes L une des caractéristiques majeure des tétraspanines est leur capacité à organiser un réseau d interactions moléculaires appelé le tetraspanin web . De précédentes études menées dans le laboratoire ont montré qu ADAM10 est associé au tetraspanin web . Néanmoins, la tétraspanine en interaction directe avec ADAM10 permettant son association au réseau n est pas encore connue. Dans cette étude nous nous sommes intéressés à la régulation d ADAM10 par les tétraspanines. Nous avons ainsi pu identifier une sous-famille de tétraspanines à 8 cystéines, les TspanC8 (Tspan5, Tspan10, Tspan14, Tspan15, Tspan17 et Tspan33), comme étant capables d interagir directement avec ADAM10 et de réguler sa sortie du réticulum endoplasmique. Nous avons montré que Tspan5, Tspan14, Tspan15 et Tspan33 sont capables de réguler l expression de surface d ADAM10 et que Tspan10 et Tspan17 entrainent l accumulation d ADAM10 dans un compartiment endosomal tardif. Les TspanC8 pourraient également contribuer à la régulation de la spécificité de substrat d ADAM10 puisque nous avons montré que l expression des TspanC8 humaines Tspan5 et Tspan14 augmente l activation de la voie Notch alors que Tspan15 n a pas d effet. Par ailleurs, les TspanC8 de Drosophile sont capables d interagir directement avec Kuzbanian (l orthologue d ADAM10), permettent son accumulation à la surface cellulaire et régulent l activation de la voie Notch dans différents contextes développementaux. Nous proposons que les TspanC8 soient une nouvelle famille de protéines ayant une fonction très conservée dans la régulation de l activité et du trafic d ADAM10, capables de réguler l activation de la voie Notch.Increasing evidence suggests a critical implication of membrane-associated protease activities in numerous biological processes. ADAM (A Disintegrin and Metalloprotease) proteases, and especially ADAM10, are of particular interest because of the importance of their substrates (EGF receptor, TNF a, Notch, APP ). However, few studies focus on the mechanisms of ADAM10 trafficking. Tetraspanins are a super-family of proteins implicated in numerous biological processes including migration, intercellular interactions, immune response, gamete fusion One of the most striking features of tetraspanins is their ability to organise multi-molecular complexes called Tetraspanin Web . Previous studies in the laboratory have shown that ADAM10 is associated to the Tetraspanin Web . Nevertheless, the tetraspanin in direct interaction with ADAM10 that drives its association to the web is not known. In this study, we focused on ADAM10 regulation by tetraspanins. We identified a subfamily of tetraspanins with 8 cysteines in their large extracellular domain that we called TspanC8 (Tspan5, Tspan10, Tspan14, Tspan15, Tspan17 and Tspan33) that can directly interact with ADAM10 and regulate its egress from the endoplasmic reticulum. We have shown that Tspan5, Tspan14, Tspan15 and Tspan33 regulate the surface expression of ADAM10 and that Tspan10 and Tspan17 accumulate ADAM10 in a late endosomal compartment. TspanC8 could also contribute to substrate specificity since Tspan5 and Tspan14 can increase Notch activation when Tspan15 cannot. Drosophila TspanC8 directly interact with the Drosophila ADAM10 ortholog Kuzbanian, increase its accumulation at the cell surface and modulate Notch activation in several developmental contexts. We propose that TspanC8 constitute a new family of Notch regulators with conserved functions in the regulation of ADAM10 trafficking and activity.PARIS11-SCD-Bib. électronique (914719901) / SudocSudocFranceF

Mécanismes de régulation de la voie NOTCH1

La voie NOTCH est activée de manière aberrante dans de nombreux cancers. Son activation implique la liaison d’un récepteur transmembranaire NOTCH à son ligand, engendrant une série de clivages qui libèrent le domaine intracellulaire de NOTCH appelé NIC. Ce dernier transloque au noyau, s’associe à ses partenaires transcriptionnels MAML1 et CSL pour réguler l’expression génique. À prime abord, la signalisation NOTCH apparaît donc simple. Cependant, il existe certainement des mécanismes de régulation précis encore mal connus à ce jour qui permettent de réguler finement cette voie de signalisation. Bien que des études montrent que NOTCH1 est constamment internalisé, l’activation de NOTCH1 au niveau des endosomes est controversée chez les mammifères. Nous n’avons pas pu déterminer clairement si l’activation de NOTCH1 pouvait se réaliser au niveau des endosomes. Néanmoins, nous avons observé que l’inhibition de l’endocytose réduit les niveaux d’expression de NIC1 suggérant une contribution des processus endocytiques dans la régulation de NOTCH1/NIC1. De plus, nous avons découvert qu’une forme de NIC1 non phosphorylée est rapidement dégradée dans le lysosome tandis qu’une forme de NIC1 hautement phosphorylée est dégradée par le protéasome. Les mécanismes de régulation de NIC1, une fois libéré, étant peu connus, une équipe avait généré des souris transgéniques ROSANic1. Cependant, nous avons remarqué que ce Nic1 était tronqué d’une grande partie de son domaine C-terminal. Nous avons donc généré une version humaine de NIC1 similaire au Nic1 des souris ROSANic1, nommé NIC1dC. Nous avons observé que NIC1dC est beaucoup plus stable que NIC1 et qu’il n’est plus dégradé par le protéasome. Cependant, nos résultats montrent qu’une plus grande stabilité de NIC1dC ne confère ni un plus fort pouvoir transcriptionnel à NIC1dC vs. NIC1 ni une plus grande capacité aux cellules de croître en indépendance d’ancrage comparativement aux cellules qui expriment NIC1. Nos analyses de spectrométrie de masse montrent que les partenaires d’interaction de NIC1dC sont différents de NIC1. Finalement, nos résultats démontrent que la délétion du domaine C-terminal de NIC1 augmente la stabilité de son partenaire transcriptionnel MAML1 et prévient sa phosphorylation. Dans leur ensemble, notre étude montre que la signalisation induite par NIC1dC ne phénocopie pas celle de NIC1 et suggère que le domaine C-terminal de NIC1 est important pour récapituler la durée et l’amplitude du signal NOTCH1 afin de médier des réponses cellulaires appropriées