An O(1) Solution to the Prefix Sum Problem on a Specialized Memory Architecture

In this paper we study the Prefix Sum problem introduced by Fredman. We show that it is possible to perform both update and retrieval in O(1) time simultaneously under a memory model in which individual bits may be shared by several words. We also show that two variants (generalizations) of the problem can be solved optimally in $\Theta(\lg N)$ time under the comparison based model of computation.Comment: 12 page

How to evaluate multiple range-sum queries progressively

Decision support system users typically submit batches of range-sum queries simultaneously rather than issuing individual, unrelated queries. We propose a wavelet based technique that exploits I/O sharing across a query batch to evaluate the set of queries progressively and efficiently. The challenge is that now controlling the structure of errors across query results becomes more critical than minimizing error per individual query. Consequently, we define a class of structural error penalty functions and show how they are controlled by our technique. Experiments demonstrate that our technique is efficient as an exact algorithm, and the progressive estimates are accurate, even after less than one I/O per query

An O(1) solution to the prefix sum problem on a specialized memory architecture

In this paper we study the Prefix Sum problem introduced by Fredman. We show that it is possible to perform both update and retrieval in O(1) time simultaneously under a memory model in which individual bits may be shared by several words. We also show that two variants (generalizations) of the problem can be solved optimally in Θ (lgN) time under the comparison based model of computation.4th IFIP International Conference on Theoretical Computer ScienceRed de Universidades con Carreras en Informática (RedUNCI

Knowledge Accumulation of Microbial Data Aiming at a Dynamic Taxonomic Framework

Deze thesis is een poging om precies dit onderzoeksgebied te overbruggen dat ligt tussen ruw gegeven en abstract concept, tussen praktijk en theorie, binnen het kader van de hedendaagse bacteriële taxonomie. Als gevolg hiervan is het een kruisbestuiving geworden tussen microbiologie, wiskunde en computerwetenschappen. De kunst om het landschap van de bacteriële diversiteit uit te tekenen, gebruikt als een metafoor voor het modelleren van de taxonomie, vereist het bepalen van een representatieve waaier aan reproduceerbare en vergelijkbare experimentele kenmerken van een verzameling bacteriën (microbiologie/taxonomie), het ontwerpen en implementeren van objectieve classificatiemethodes voor het groeperen van gegevens op een niet gecoördineerde manier (wiskunde/classificatie) en het consolideren van experimentele gegevens en hun verschillende onderverdelingen via een uniforme en weldoordachte aanpak (computerwetenschappen/kennisbeheer). Men kan zich gemakkelijk een globaal kennissysteem voor de geest halen dat de vellen vol experimentele gegevens die voortspruiten uit de microbiologische onderzoeksverrichtingen op een gestructureerde en geüniformiseerde manier kan absorberen. Een dergelijk kennisbeheersysteem zou een ongelofelijke vooruitgang betekenen voor de mogelijke toepassing van intelligente en goed gefundeerde methodes voor het ontginnen van de gegevens, ingezet als hulpmiddel om het afbakenen van objectieve en universele taxonomische consensusmodellen op een betere manier te stroomlijnen en te automatiseren. Bovendien kunnen dergelijke inferentiesystemen in staat worden geacht om ogenblikkelijk te reageren op een toevloed van nieuwe gegevens en interactief te communiceren met de buitenwereld indien noodzakelijke stukken voor het vervolledigen van de taxonomische puzzel zouden ontbreken. De geldigheid van nieuwe inzichten of hypothesen omtrent het leven en de evolutie van bacteriën zou onmiddellijk kunnen getoetst worden aan deze vergaarbakken vol kennis, mogelijks met een directe aanpassing van bestaande taxonomische modellen tot gevolg. Vooraleer de betrachtingen van een autodidactisch inferentiesysteem voor het uittekenen van het landschap van de bacteriële diversiteit kunnen gerealiseerd worden, moeten belangrijke technische en organisatorische hindernissen overwonnen worden. Dit vraagt het verleggen van de grenzen van een mondiale uitwisseling van gegevens, het nasporen en invullen van de hiaten in de waarnemingen, en het verkennen van de mogelijkheden van nieuwe technieken voor het ontginnen van gegevens, ten voordele van een beter inzicht in het leven en de evolutie van bacteriën. Spijts de nog vele onopgeloste kwesties, kunnen de ideeën die worden aangebracht in deze verhandeling als stimulans en leidraad dienen bij het integreren en exploiteren van microbiële gegevens, in plaats van het blijvend koesteren van een ijdele hoo

Flexible Data Cubes for Online Aggregation

. Applications like Online Analytical Processing depend heavily on the ability to quickly summarize large amounts of information. Techniques were proposed recently that speed up aggregate range queries on MOLAP data cubes by storing pre-computed aggregates. These approaches try to handle data cubes of any dimensionality by dealing with all dimensions at the same time and treat the different dimensions uniformly. The algorithms are typically complex, and it is difficult to prove their correctness and to analyze their performance. We present a new technique to generate Iterative Data Cubes (IDC) that addresses these problems. The proposed approach provides a modular framework for combining one-dimensional aggregation techniques to create space-optimal high-dimensional data cubes. A large variety of cost tradeoffs for high-dimensional IDC can be generated, making it easy to find the right configuration based on the application requirements. 1 Introduction Data cubes are used i..