Primeira descrição do cariótipo de Kerodon acrobata, um roedor endêmico do semiárido brasileiro

Kerodon acrobata é um roedor caviídeo endêmico do Cerrado brasileiro. A espécie foi descrita apenas em 1997, e as informações sobre ela são muito escassas. O objetivo deste trabalho foi caracterizar o cariótipo K. acrobata. Coloração em Giemsa, bandeamento da região organizadora do nucléolo, bandeamento da heterocromatina C-positiva e fluorescência DAPI foram utilizados em N metáfases de um espécime coletado na fazenda Asa Branca, na cidade de Aurora do Tocantins, estado do Tocantins, Brasil. K. acrobata apresentou o mesmo número diplóide, número fundamental e morfologia dos cromossomos de Kerodon rupestris. Mas a localização de sua NOR e os padrões de distribuição de heterocromatina indicam um perfil citogenético único quando comparado com sua espécie irmã, enfatizando a singularidade evolutiva desta espécie pouco conhecida. Este registro também estende a distribuição desta espécie em direção ao norte.Kerodon acrobata is a caviidae rodent endemic from Brazilian Cerrado. It was described only in 1997 and the data about it is very scarce. The aim of this work was to characterize the karyotype of K. acrobata. Giemsa staining, nucleolar organizer region (NOR) banding, C-positive heterochromatin banding and DAPI fluorescence were used in N metaphases of a specimen collected in Asa Branca Farm, in Aurora do Tocantins municipality, Tocantins state, Brazil. K. acrobata showed the same diploid number, fundamental number and chromosome morphology as Kerodon rupestris. But its NOR location and heterochromatin distribution patterns indicated a unique cytogenetic profile when compared to its sister species, emphasizing the evolutionary uniqueness of this relatively new and unknown species. This record also extends the distribution of this species northward

Phylogeography and cytogenetics of the genus Kerodon (CUIVER, 1825) (RODENTIA: Caviidae)

Entre os mamíferos dos biomas brasileiros, os roedores do gênero Kerodon (Wied 1820), ou mocó, são um dos táxons mais especializados. Uma de suas espécies, o Kerodon rupestris, um dos poucos mamíferos endêmicos do semiárido brasileiro, a caatinga, possui sua distribuição fragmentada devido à descontinuidade dos afloramentos rochosos onde eles vivem, e isso favorece uma variação intraespecífica entre suas populações. A outra espécie do gênero, K. acrobata, vive em uma pequena área do cerrado, entre os estados de Tocantins e Goiás. O objetivo deste trabalho foi a caracterização citogenética de uma fêmea de Kerodon acrobata e molecular das duas espécies de Kerodon. Foi caracterizado o cariótipo de uma fêmea de K. acrobata, utilizando coloração Giemsa, bandeamento NOR, bandeamento de heterocromatina e fluorescência com DAPI. O espécime mostrou o mesmo número diploide, número fundamental e morfologia cromossômica que Kerodon rupestris. Porém, as localizações de NOR e de heterocromatina indicaram padrões diferentes em relação a outros roedores, enfatizando a singularidade dessa espécie. O DNA foi extraído de tecido hepático das duas espécies e amplificações foram feitas para o gene nuclear Adh1-I2. Após sequenciamento, alinhamentos foram realizados com o ClustalW. A filogenia foi inferida usando os métodos Máxima Parcimônia e Máxima Verossimilhança usando o PAUP e Análise Bayesiana, com o MrBayes. Uma rede de haplótipo foi realizada com os programas DnaSP e Network. O gene nuclear mostrou dois grupos bem estruturados: o primeiro formado por K acrobata sem resolução interna, e o segundo que incluiu as populações de K rupestris e três sequências do chamado híbrido . Os dados obtidos sugerem alta diferenciação citogenética e molecular entre K rupestris e K acrobata, indicando diferentes idades entre elas. O chamado híbrido pode representar uma população altamente divergente dentro de K rupestris, como resultado dentro da dinâmica de expansão e retração pleistocênica da caatinga.Among mammals from Brazilian biomes, rodent of genus Kerodon (Wied 1820), or mocó, englobes one of the most specialist species and one of the few endemic mammals from Brazilian semiarid, or caatinga, Kerodon rupestris, and other species from semi-arid islands within the savannah, or cerrado, Kerodon acrobata. Their distribution is fragmented, due to discontinuous rock outcrops where these animals live. It suggests an intraspecific variation among their populations. Cranial and cytogenetic studies with K. rupestris had showed a separation in three groups: one in Minas Gerais state, other in Bahia and the last in Ceará. This study investigated genes from populations of Kerodon species, in order to make analysis to check inter and intra variation. A small group from another locality, probably a hybrid, was also analyzed. We first characterize the karyotype of a female from K. acrobata. Giemsa staining, nucleolar organizer region (NOR) banding, C-positive heterochromatin banding and DAPI fluorescence were used in N metaphases of a specimen collected in Asa Branca Farm, in Aurora do Tocantins municipality, Tocantins state, Brazil. K. acrobata showed the same diploid number, fundamental number and chromosome morphology as Kerodon rupestris. But its NOR location and heterochromatin distribution patterns indicated a unique cytogenetic profile when compared to its sister species, emphasizing the evolutionary uniqueness of this relatively new and unknown species. This record also extends the distribution of this species northward. We also extracted DNA from livers and amplifications were made for gene Adh1-I2. After sequencing, alignments were done with ClustalW software. Phylogeny was inferred using Maximum Parsimony and Maximum Likelihood methods using PAUP software. Bayesian Analysis was also made, using MrBayes software. One haplotype network was done with DnaSP and Network. All trees and network showed similar results. These relations agree with variation observed in previous studies, separating K. rupestris populations in several groups. K. acrobata was also split in other groups, and some results indicate that the hybrid population is in fact a K. rupestris group in speciation. A possible explanation for these partitions is the fact that rock outcrops fragmented geography from caatinga during Pleistocene and events of expansion/retraction of the habitat may have generated population isolation and differentiation.Fundação de Amparo a Pesquisa do Estado de Minas Gerai

Estimates of the effective population size for WB and TB, and for both colonies together.

<p>Estimates of the effective population size for WB and TB, and for both colonies together.</p

Haplotype networks for <i>SRY</i>.

<p>Numbers indicate haplotype frequency (when not written, haplotype frequency = 1). Black dots show mutational steps.</p

Features of 17 microsatellite loci for Antarctic seals.

<p>Features of 17 microsatellite loci for Antarctic seals.</p

Map of the sampling areas.

<p>Dash lines represent the grounding line.</p

Genetic variation of WB and TB colonies.

<p>Genetic variation of WB and TB colonies.</p

Haplotype networks.

<p>(A) <i>CYB</i>. (B) <i>DLOOP</i>. (C) <i>DLOOP</i> with MS haplotypes. Numbers indicate haplotype frequency (when not written, haplotype frequency = 1). Arrows indicate star shape. Black dots show mutational steps.</p

Analysis of recent expansion of Weddell seal colonies TB and WB.

<p>Analysis of recent expansion of Weddell seal colonies TB and WB.</p

Values of <i>N</i>_<i>e</i> for Weddell seal colonies from TB and WB, based on <i>Θ</i>.

<p>Values of <i>N</i>_<i>e</i> for Weddell seal colonies from TB and WB, based on <i>Θ</i>.</p