Nesting-driven antiferromagnetic order in Kondo lattice CePd5Al2

We investigated the electronic structure of the antiferromagnetic Kondo lattice CePd5Al2 using high-resolution angle-resolved photoemission spectroscopy. The experimentally determined band structure of the conduction electrons is predominated by the Pd 4d character. It contains multiple hole and electron Fermi pockets, in good agreement with density functional theory calculations. The Fermi surface is folded over Q0 = (0, 0, 1), manifested by Fermi surface reconstruction and band folding. Our results suggest that Fermi surface nesting drives the formation of antiferromagnetic order in CePd5Al2.Comment: 6 pages,3 figur

Subsurface interactions of actinide species and microorganisms: Implications for the bioremediation of actinide-organic mixtures

We use high-resolution angle-resolved photoemission spectroscopy to investigate the electronic structure of the antiferromagnetic heavy fermion compound CePt2In7, which is a member of the CeIn3-derived heavy fermion material family. Weak hybridization among 4f electron states and conduction bands was identified in CePt2In7 at low temperature much weaker than that in the other heavy fermion compounds like CeIrIn5 and CeRhIn5. The Ce 4f spectrum shows fine structures near the Fermi energy, reflecting the crystal electric field splitting of the 4f^1_5/2 and 4f^1_7/2 states. Also, we find that the Fermi surface has a strongly three-dimensional topology, in agreement with density-functional theory calculations.Comment: 7 pages, 4 figure

Tillstånd och trender för arter och deras livsmiljöer

2015 års upplaga av den svenska rödlistan är den fjärde i ordningen. Den är baserad på IUCN:s rödlistningskriterier och revideras vart femte år. I rödlistan bedöms risken som enskilda arter av djur, växter och svampar löper att försvinna från Sverige. Bedömningen utförs av ArtDatabankens medarbetare i samverkan med över 100 externa experter, indelade i 14 expertkommittéer för olika organismgrupper. Under arbetet med 2015 års rödlista har tillstånd och trender bedömts för 21 600 arter och 1 318 lägre taxa (apomiktiska arter, underarter och varieteter), sammanlagt ca 22 900 taxa. Av de bedömda arterna klassificerades 2 029 som hotade (kategorierna CR, EN och VU) och 4 273 som rödlistade (inkluderar även kategorierna NT, RE och DD). Förhållandet mellan antalet rödlistade och antalet bedömda arter ar 19,8 %, vilket är ungefär samma värde som 2010 och 2005. I denna rapport jämförs antalet och andelen rödlistade arter mellan olika organismgrupper, biotoper, substrat och påverkansfaktorer. Texten ar indelad i en allmän del och åtta kapitel inriktade på olika landskapstyper. Landskapstyperna utgör en grov indelning av landets miljöer enligt följande kategorier: Skog, Jordbrukslandskap, Urbana miljöer, Fjäll, Våtmarker, Sötvatten, Havsstränder och Havsmiljöer. Skogen och jordbrukslandskapet är de artrikaste landskapstyperna med 1 800 respektive 1 400 arter som har en stark anknytning dit, och ytterligare flera hundra arter som förekommer där mer sporadiskt. De faktorer som påverkar flest rödlistade arter i Sverige är skogsavverkning och igenväxning, som båda utgör ett hot mot vardera ca 30 % av de rödlistade arterna. Avverkning minskar arealen av skog där naturliga strukturer och naturlig dynamik upprätthålls, och den orsakar därmed förlust av livsmiljöer. Igenväxning orsakas av ett antal faktorer, bland annat upphörande hävd (bete och slåtter), gödsling, trädplantering och brist på naturliga störningsregimer som t.ex. regelbundna översvämningar kring vattendrag och sjöar. Andra viktiga påverkansfaktorer är fiske, torrläggning av våtmarker, tillbakagång hos värdarter (främst alm och ask som drabbats av invasiva svampsjukdomar), klimatförändringar och konkurrens från invasiva arter. IUCN:s rödlisteindex beräknas för ett urval av de bedömda organismgrupperna. Rödlisteindex visar att skillnaderna mellan rödlistorna från 2000, 2005, 2010 och 2015 är små. Ett par undantag finns dock. Groddjur och stora däggdjur har fått en något förbättrad situation sedan 2000. Totalt förefaller det ändå som att trycket mot Sveriges artstock har förblivit relativt konstant under de senaste 15 åren

Mapping of hormones and cortisol responses in patients after Lyme neuroborreliosis

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Persistent symptoms after treatment for neuroborreliosis are common for reasons mainly unknown. These symptoms are often unspecific and could be caused by dysfunctions in endocrine systems, an issue that has not been previously addressed systematically. We therefore mapped hormone levels in patients with previous confirmed Lyme neuroborreliosis of different outcomes and compared them with a healthy control group.</p> <p>Methods</p> <p>Twenty patients of a retrospective cohort of patients treated for definite Lyme neuroborreliosis were recruited 2.3 to 3.7 years (median 2.7) after diagnosis, together with 23 healthy controls. Lyme neuroborreliosis patients were stratified into two groups according to a symptom/sign score. All participants underwent anthropometric and physiological investigation as well as an extensive biochemical endocrine investigation including a short high-dose adrenocorticotropic hormone stimulation (Synacthen^®) test. In addition to hormonal status, we also examined electrolytes, 25-hydroxy-vitamin D and interleukin-6.</p> <p>Results</p> <p>Eight patients (40%) had pronounced symptoms 2-3 years after treatment. This group had a higher cortisol response to synacthen as compared with both controls and the Lyme neuroborreliosis patients without remaining symptoms (p < 0.001 for both comparisons). No other significant differences in the various baseline biochemical parameters, anthropometric or physiological data could be detected across groups.</p> <p>Conclusions</p> <p>Apart from a positive association between the occurrence of long-lasting complaints after Lyme neuroborreliosis and cortisol response to synacthen, no corticotropic insufficiency or other serious hormonal dysfunction was found to be associated with remaining symptoms after treatment for Lyme neuroborreliosis.</p

UFSRAT:Ultra-fast shape recognition with atom types -The discovery of novel bioactive small molecular scaffolds for FKBP12 and 11βHSD1

MOTIVATION:Using molecular similarity to discover bioactive small molecules with novel chemical scaffolds can be computationally demanding. We describe Ultra-fast Shape Recognition with Atom Types (UFSRAT), an efficient algorithm that considers both the 3D distribution (shape) and electrostatics of atoms to score and retrieve molecules capable of making similar interactions to those of the supplied query. RESULTS:Computational optimization and pre-calculation of molecular descriptors enables a query molecule to be run against a database containing 3.8 million molecules and results returned in under 10 seconds on modest hardware. UFSRAT has been used in pipelines to identify bioactive molecules for two clinically relevant drug targets; FK506-Binding Protein 12 and 11β-hydroxysteroid dehydrogenase type 1. In the case of FK506-Binding Protein 12, UFSRAT was used as the first step in a structure-based virtual screening pipeline, yielding many actives, of which the most active shows a KD, app of 281 µM and contains a substructure present in the query compound. Success was also achieved running solely the UFSRAT technique to identify new actives for 11β-hydroxysteroid dehydrogenase type 1, for which the most active displays an IC50 of 67 nM in a cell based assay and contains a substructure radically different to the query. This demonstrates the valuable ability of the UFSRAT algorithm to perform scaffold hops. AVAILABILITY AND IMPLEMENTATION:A web-based implementation of the algorithm is freely available at http://opus.bch.ed.ac.uk/ufsrat/