The role of FRIGIDA and FLOWERING LOCUS C genes in flowering time of Brassica rapa leafy vegetables

© 2019, The Author(s). There is a wide variation of flowering time among lines of Brassica rapa L. Most B. rapa leafy (Chinese cabbage etc.) or root (turnip) vegetables require prolonged cold exposure for flowering, known as vernalization. Premature bolting caused by low temperature leads to a reduction in the yield/quality of these B. rapa vegetables. Therefore, high bolting resistance is an important breeding trait, and understanding the molecular mechanism of vernalization is necessary to achieve this goal. In this study, we demonstrated that BrFRIb functions as an activator of BrFLC in B. rapa. We showed a positive correlation between the steady state expression levels of the sum of the BrFLC paralogs and the days to flowering after four weeks of cold treatment, suggesting that this is an indicator of the vernalization requirement. We indicate that BrFLCs are repressed by the accumulation of H3K27me3 and that the spreading of H3K27me3 promotes stable FLC repression. However, there was no clear relationship between the level of H3K27me3 in the BrFLC and the vernalization requirement. We also showed that if there was a high vernalization requirement, the rate of repression of BrFLC1 expression following prolonged cold treatments was lower

病名における「-性」の分析 : 一般書籍との比較から

Osaka UniversityOsaka UniversitySeinan Jo Gakuin UniversitySeinan Jo Gakuin UniversityNational Institute for Japanese Language and Linguistics会議名: 言語資源活用ワークショップ2020, 開催地: オンライン, 会期: 2020年9月8日−9日, 主催: 国立国語研究所 コーパス開発センター医療用語（病名）には，「-性」という語構成要素を含む合成語が多いが，どのような要素と「性」が結合するのか，また，どのように病名を構成するのかについては未だ詳らかではないといえる。本発表では，実践医療用語辞書ComeJisyo の見出し語を対象に「-性」を含む病名を調査し，その特徴について分析した。また，BCCWJ の書籍サブコーパスにおける「-性」の用例と比較することで，得られた特徴が病名特有のものであるかを検討した。病名における「-性」では「先天性」「多発性」「急性」などが高頻度に用いられ，「急性細菌性髄膜炎」のように他の「-性」との共起も見られる一方，書籍では「-性」の連続は見られず，「可能性」「必要性」のようにそれ自体が主語となる（体言用法の）ものが高頻度であるという違いが見られた。病名においては，一語で的確に症状を表現する必要があるため，「-性」を用いた細分化が行われていると考えられる

病名を表す合成語の語末調査

Seinan Jo Gakuin UniversitySeinan Jo Gakuin UniversityOsaka UniversityOsaka UniversityNational Institute for Japanese Language and Linguistics会議名: 言語資源活用ワークショップ2020, 開催地: オンライン, 会期: 2020年9月8日−9日, 主催: 国立国語研究所 コーパス開発センター本研究では合成語の語末により病名の判別が可能か否かを確認するために合成語の語末調査を行った。具体的には、病名を表す合成語5,465 語について語末のunigram、bigram、trigram を調べた。加えて、筆者等が着手している電子カルテに記載された合成語を対象とした語構成要素解析で定めた語単位で、合成語を分割した場合に語末となる語構成要素の頻度を調べた。その結果、（1）右側主要部の規則による意味を用いた判別が可能なこと、（2）病名の末尾には「ヘモクロマトーシス」のようなカタカナ語があり、文字単位での判別より語単位の判別の方が適していることが分かった。また、意味ラベル「接尾語」が付与された語構成要素と、「病名」が付与された語構成要素の内「接尾語」を含まない要素を用いることで「病名」の機械的な判別が可能であることが示唆された

「急性」を含む病名の語構成

Seinan Jo Gakuin UniversitySeinan Jo Gakuin University, PhysicianOsaka UniversityPhysicianNational Institute for Japanese Language and Linguistics会議名: 言語資源ワークショップ2022, 開催地: オンライン, 会期: 2022年8月30日-31日, 主催: 国立国語研究所 言語資源開発センター「急性骨髄性白血病」のように「～性」が複数含まれ、かつ「急性」を含む病名において、「急性」の緊急度と語順の関係を調べるために、『現代日本語書き言葉均衡コーパス』(BCCWJ)に出現した当該の病名28語について、BCCWJ、医師経過記録、多職種共有の経過記録での出現頻度を求めた。その結果、①「急性」は語頭に多く出現すること、②医療現場では使われない病名があること、③医療現場では「急性」無しの病名が多く使われていること、④「急性」とその他の「～性」の語順を変えた同義語が存在することが分かった

実践医療用語 語構成要素語彙試案表 Ver.2.0 の構築

Osaka UniversityKyorin UniversitySeinan Jo Gakuin UniversitySeinan Jo Gakuin University, PhysicianPhysicianKansai UniversityNational Institute for Japanese Language and Linguistics会議名: 言語資源ワークショップ2022, 開催地: オンライン, 会期: 2022年8月30日-31日, 主催: 国立国語研究所 言語資源開発センター医療記録データには、複数の単語が連結された合成語が多く存在する。そのため、自然言語処理を効率的に行うためには、合成語の語構成や、それらの構成要素の意味に着目し、合成語の構造を明らかにする必要がある。しかし、医療記録は非公開という資料的特質のため、言語学的な調査があまり行われてこなかった。また、医療関係者における意味のある言語単位も定まっておらず、整理の必要があった。こうした背景に基づいて作成した言語資源が『実践医療用語_語構成要素語彙試案表 Ver.2.0』である。本試案表は、『実践医療用語辞書ComeJisyoSjis-1』より抽出した合成語より作成した『実践医療用語_語構成要素語彙試案表Ver.1.0』を更新したもので、7,087語の合成語について、それぞれを構成する語構成要素6,633種と、語構成要素に付与した意味ラベル41種を収録している。本発表では、Ver1.0からの変更点と、本言語資源の特徴、意味ラベルに注目した語構成要素について概観を行った

Sweet Taste Receptor Expressed in Pancreatic β-Cells Activates the Calcium and Cyclic AMP Signaling Systems and Stimulates Insulin Secretion

BACKGROUND:Sweet taste receptor is expressed in the taste buds and enteroendocrine cells acting as a sugar sensor. We investigated the expression and function of the sweet taste receptor in MIN6 cells and mouse islets. METHODOLOGY/PRINCIPAL FINDINGS:The expression of the sweet taste receptor was determined by RT-PCR and immunohistochemistry. Changes in cytoplasmic Ca(2+) ([Ca(2+)](c)) and cAMP ([cAMP](c)) were monitored in MIN6 cells using fura-2 and Epac1-camps. Activation of protein kinase C was monitored by measuring translocation of MARCKS-GFP. Insulin was measured by radioimmunoassay. mRNA for T1R2, T1R3, and gustducin was expressed in MIN6 cells. In these cells, artificial sweeteners such as sucralose, succharin, and acesulfame-K increased insulin secretion and augmented secretion induced by glucose. Sucralose increased biphasic increase in [Ca(2+)](c). The second sustained phase was blocked by removal of extracellular calcium and addition of nifedipine. An inhibitor of inositol(1, 4, 5)-trisphophate receptor, 2-aminoethoxydiphenyl borate, blocked both phases of [Ca(2+)](c) response. The effect of sucralose on [Ca(2+)](c) was inhibited by gurmarin, an inhibitor of the sweet taste receptor, but not affected by a G(q) inhibitor. Sucralose also induced sustained elevation of [cAMP](c), which was only partially inhibited by removal of extracellular calcium and nifedipine. Finally, mouse islets expressed T1R2 and T1R3, and artificial sweeteners stimulated insulin secretion. CONCLUSIONS:Sweet taste receptor is expressed in beta-cells, and activation of this receptor induces insulin secretion by Ca(2+) and cAMP-dependent mechanisms

Yeast cell wall extract induces disease resistance against bacterial and fungal pathogens in Arabidopsis thaliana and Brassica crop.

Housaku Monogatari (HM) is a plant activator prepared from a yeast cell wall extract. We examined the efficacy of HM application and observed that HM treatment increased the resistance of Arabidopsis thaliana and Brassica rapa leaves to bacterial and fungal infections. HM reduced the severity of bacterial leaf spot and anthracnose on A. thaliana and Brassica crop leaves with protective effects. In addition, gene expression analysis of A. thaliana plants after treatment with HM indicated increased expression of several plant defense-related genes. HM treatment appears to induce early activation of jasmonate/ethylene and late activation of salicylic acid (SA) pathways. Analysis using signaling mutants revealed that HM required SA accumulation and SA signaling to facilitate resistance to the bacterial pathogen Pseudomonas syringae pv. maculicola and the fungal pathogen Colletotrichum higginsianum. In addition, HM-induced resistance conferred chitin-independent disease resistance to bacterial pathogens in A. thaliana. These results suggest that HM contains multiple microbe-associated molecular patterns that activate defense responses in plants. These findings suggest that the application of HM is a useful tool that may facilitate new disease control methods