Vers un système d'Information Géographique pour l'étude des épidémies du passé : L'exemple de la ville de Martigues (France, 1er quart du XVIIIe siècle) = Towards a GIS for the Study of Past Epidemics : the Example of the City of Martigues (France, in the First Quarter of the XVIIIth Century

La ville de Martigues (Bouches-du-Rhône, France) est, au début du XVIIIe siècle, une communauté de moyenne importance, composée de 3 paroisses "intra muros" et d'un vaste terroir.Des recherches en cours depuis quelques années ont permis de constituer une importante base de données nominatives, à partir d'un dénombrement établi en 1702 et des registres paroissiaux.Parallèlement à la constitution de ce fichier de population, nous avons travaillé à la constitution d'un Système d'Information Géographique, à l'échelle de la ville, en nous appuyant sur des données fiscales : principalement les registres terriers du XVIIIe siècle et le cadastre "napoléonien" de 1817.Nous proposons une reconstitution du cadre urbain de Martigues, de telle sorte qu'il soit possible de suivre, famille par famille, maison par maison, rue par rue, la progression des épidémies qui ravagèrent la ville durant la 1ère moitié du XVIIIe siècle

Des vivants et des morts. Débat

De la nécessité de déshumaniser l’adversaire pour l’affronter à celle de l’humaniser pour recouvrer sa dignité, il y a des variations d’attitudes multiples. Ce qui reste, c’est la quantité anormale de morts, blessés, prisonniers que génère la guerre. Comment une population, un groupe humain, s’y adapte t-elle ? Quels comportements, quels rituels, quels cadres vont permettre de gérer cette situation de crise ? S. Jean, Inrap Michel Tarpin Le statut des vaincus n’est pas réellement étudié po..

La peste à Marseille et dans le sud-est de la France en 1720-1722 : les épidémies d’Orient de retour en Europe

Bien que non exclusivement provençale, l’épidémie de 1720-1722, qui constitue en Europe occidentale, un ultime et tardif épisode de la seconde grande pandémie de peste, reste très attachée, dans l’imaginaire commun, à cette région. De fait, c’est bien d’abord à Marseille, principal pôle des échanges commerciaux maritimes en Méditerranée, que la maladie, en provenance des « échelles du Levant », fait son retour dans le royaume de France. Cet événement, dont la dimension tragique et a posteriori traumatique dans les mémoires se trouve renforcée par son caractère accidentel et relativement anachronique, a généré, dès son déroulement et dans son sillage, toute une littérature érudite et de témoignage, dans une moindre mesure une iconographie. Cette épidémie semble être en premier lieu la conséquence des entorses à un système de prévention pourtant bien éprouvé. Dans un tel contexte et face à une capacité de guérison encore hors de portée des savoirs médicaux, l’adaptation des pratiques mortuaires et la prise en main de la salubrité urbaine par des pouvoirs publics dotés de pouvoirs d’exception restent les rares moyens pour les communautés affectées de revendiquer encore une politique sanitaire.Although it did not only hit Provence, the epidemic of 1720-1722, the last episode in the second pandemic of the Great Plague in Western Europe, remains closely associated with this region in popular imagination. It was in fact from Marseille, the main hub of maritime trade in the Mediterranean area, that the disease, which had originated in Levantine ports, first returned to the Kingdom of France. The event left a tragic and retrospectively traumatic trace in memories due to its accidental and relatively anachronistic character. From the outset, it generated a rich body of scholarly literature and testimonies, and to a lesser extent iconographic documents. For the most part, this epidemic seems to have been the consequence of breaches in a well-established prevention system. In this context, at a time when a cure was still beyond the reach of medicine, the only way for affected communities to maintain a sanitary policy was to adapt burial practices and to grant public authorities exceptional powers over urban sanitation

Les processus de conservation différentielle du squelette des individus immatures

Les restes osseux des collections ostéologiques ne constituent pas un reflet de la population vivante, mais seulement un échantillon de la population d’origine. Des processus de conservation différentielle en fonction de l’âge peuvent entraîner une sous-représentation de certaines catégories d’individus (notamment des très jeunes enfants), ce qui constituerait un biais pour la reconstruction des structures des populations anciennes.La présente étude anthropologique a été développée sur trois collections ostéologiques modernes, représentant un total de 341 squelettes. L’étude de la conservation, tant sur le plan anatomique que sur le plan individuel, a été effectuée à l’aide du calcul de l’Indice de Conservation Anatomique (ICA).L’étude anatomique a évalué l’effet des processus de conservation différentielle sur l’analyse des paramètres paléodémographiques dépendants de l’âge. L’étude individuelle a permis de mettre en évidence de fortes disparités entre les différentes catégories d’âge, l’ICA des individus immatures étant toujours inférieur à celui des individus adultes. De plus, l’ICA moyen des individus immatures semble être en relation avec l’âge de ceux-ci.Bien que la relation directe entre conservation générale et âge des immatures soit patente, elle ne semble avoir que peu influencé les résultats paléodémographiques concernant les trois échantillons analysés.Bone remains in osteological collections are not a reflection of a living population, only a sample of the original population. Differential states of preservation related to the individuals’ age can result in under-representation of certain categories (especially very young children). Such under-representation produces a bias in the reconstruction of past populations.The present anthropological study was carried out on 341 skeletons from three modern osteoarchaeological collections. The state of preservation of these collections has been evaluated by the “Anatomical Preservation Index” (API).The anatomical study took into account the effect of differential preservation on the analysis of age-dependent palaeodemographic parameters. The individual study demonstrates strong disparities between the different age categories, the API of the sub-adult always being lower than that of the individual adults. Moreover, the average API of sub-adult individuals appears to be in relation to age.Although the direct relation between the general state of preservation and the age of sub-adults is clear, it does not appear to have much influence on the palaeodemographic results of the three samples analysed

Yersinia pestis Orientalis in Remains of Ancient Plague Patients

Yersinia pestis DNA was recently detected in human remains from 2 ancient plague pandemics in France and Germany. We have now sequenced Y. pestis glpD gene in such remains, showing a 93-bp deletion specific for biotype Orientalis. These data show that only Orientalis type caused the 3 plague pandemics

Structure génétique de la population de la région PACA du XIXe siècle à partir des patronymes

L’analyse de la distribution des patronymes à travers le temps et l’espace permet d’appréhender la structure des populations. L’étude de la diversité des stocks patronymiques rend possible l’observation des échanges entre les populations ou leur possible isolation. Dans la littérature scientifique, il a été montré que la région PACA était relativement isolée et différente sur la base des patronymes du reste de la France du XXe et du XXIe siècle. Classiquement les études analysant la structure..

Evidence of a Louse-Borne Outbreak Involving Typhus in Douai, 1710-1712 during the War of Spanish Succession

Background: The new field of paleomicrobiology allows past outbreaks to be identified by testing dental pulp of human remains with PCR. Methods: We identified a mass grave in Douai, France dating from the early XVIII th century. This city was besieged during the European war of Spanish succession. We tested dental pulp from 1192 teeth (including 40 from Douai) by quantitative PCR (qPCR) for R. prowazekii and B. quintana. We also used ultra-sensitive suicide PCR to detect R. prowazekii and genotyped positive samples. Results and Discussion: In the Douai remains, we identified one case of B. quintana infection (by qPCR) and R. prowazekii (by suicide PCR) in 6/21 individuals (29%). The R. prowazekii was genotype B, a genotype previously found in a Spanish isolate obtained in the first part of the XX th century. Conclusion: Louse-borne outbreaks were raging during the XVIII th century; our results support the hypothesis that typhus was imported into Europe by Spanish soldiers from America

High Throughput, Multiplexed Pathogen Detection Authenticates Plague Waves in Medieval Venice, Italy

Background: Historical records suggest that multiple burial sites from the 14th-16(th) centuries in Venice, Italy, were used during the Black Death and subsequent plague epidemics.Methodology/Principal Findings: High throughput, multiplexed real-time PCR detected DNA of seven highly transmissible pathogens in 173 dental pulp specimens collected from 46 graves. Bartonella quintana DNA was identified in five (2.9%) samples, including three from the 16th century and two from the 15th century, and Yersinia pestis DNA was detected in three (1.7%) samples, including two from the 14th century and one from the 16th century. Partial glpD gene sequencing indicated that the detected Y. pestis was the Orientalis biotype.Conclusions: These data document for the first time successive plague epidemics in the medieval European city where quarantine was first instituted in the 14th century