127 research outputs found

    Detecting QTLs and putative candidate genes involved in budbreak and flowering time in an apple multiparental population

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    UMR AGAP - équipe AFEF - Architecture et fonctionnement des espèces fruitièresIn temperate trees, growth resumption in spring time results from chilling and heat requirements, and is an adaptive trait under global warming. Here, the genetic determinism of budbreak and flowering time was deciphered using five related full-sib apple families. Both traits were observed over 3 years and two sites and expressed in calendar and degree-days. Best linear unbiased predictors of genotypic effect or interaction with climatic year were extracted from mixed linear models and used for quantitative trait locus (QTL) mapping, performed with an integrated genetic map containing 6849 single nucleotide polymorphisms (SNPs), grouped into haplotypes, and with a Bayesian pedigree-based analysis. Four major regions, on linkage group (LG) 7, LG10, LG12, and LG9, the latter being the most stable across families, sites, and years, explained 5.6–21.3% of trait variance. Co-localizations for traits in calendar days or growing degree hours (GDH) suggested common genetic determinism for chilling and heating requirements. Homologs of two major flowering genes, AGL24 and FT, were predicted close to LG9 and LG12 QTLs, respectively, whereas Dormancy Associated MADs-box (DAM) genes were near additional QTLs on LG8 and LG15. This suggests that chilling perception mechanisms could be common among perennial and annual plants. Progenitors with favorable alleles depending on trait and LG were identified and could benefit new breeding strategies for apple adaptation to temperature increase

    Vulnérabilité et adaptation des arbres fruitiers face au réchauffement climatique, quelles spécificités en agriculture biologique ?

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    National audienceFruit trees have trouble adapting to climate change. Impacts on tree physiology are beginning to be visible and are liable to production irregularities and a modification of regional specificities. Despite some specificities, organic farming have to adapt the varietal panel for parasitism and tree physiologyLes arbres fruitiers apparaissent comme des cultures particulièrement vulnérables face aux impacts du réchauffement climatique, qu’ils soient directs en modifiant la physiologie de l’arbre ou indirects (pressions parasitaires). Différents impacts sont précisés notamment pour des caractères de la floraison, ou seulement évoqués. Leurs conséquences sont également abordées en termes de vulnérabilité et d’adaptation. Face à ces conséquences, les exploitations conduites avec des pratiques biologiques devront s’adapter par une évolution des gammes variétales comme les exploitations conventionnelles. Cette adaptation pourrait être plus facile à atteindre en agriculture biologique du fait d’une capacité déjà éprouvée à cultiver et commercialiser des variétés relativement rustiques. A l’inverse, l’accroissement des pressions parasitaires apparaît davantage défavorable à l’agriculture biologique plus limitée dans ses possibilités de protection.Fruit trees trouble adapting to climate change. Impacts on tree physiology are beginning to be visible and are liable to production irregularities and a modification of regional specificities. Despite some specificities organic farming have to adapt the varietal panel for parasitism and tree physiolog

    Impacts du réchauffement climatique sur les arbres fruitiers. Quelles ressources génétiques pour y faire face ?

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    National audienceThe fruit tree sector will have trouble adapting to climate warming due to specific vulnerabilities. Impacts on tree physiology are beginning to be visible and are liable to production irregularities and modifications of regional specificities. Genetic resources and breeding strategies must be started to improve the varietal panel for a tree physiology and resistances to parasitism adapted to warmer climatic conditions.Les arbres fruitiers constituent des cultures particulièrement vulnérables face aux impacts du réchauffement climatique, qu’ils soient directs en modifiant la physiologie de l’arbre ou indirects (pressions parasitaires, disponibilité en eau). Quelques impacts, directs et avérés, sont précisés notamment pour des caractères de la floraison. D’autres sont seulement évoqués. Leurs conséquences sont également abordées en termes de vulnérabilité et d’adaptation par l’amélioration génétique. La caractérisation et l’exploitation des ressources génétiques doivent être rapidement et davantage orientées vers des traits influencés par le réchauffement climatique (incluant les résistances aux parasites), tout en conservant aux variétés fruitières leurs attraits alimentaires et commerciau

    Comparaison de la variabilité de populations d'abricotiers issus de graines irradiées et non irradiées de même origine

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    La variabilité d'abricotiers issus de graines irradiées à des doses croissantes d'un rayonnement gamma à faible débit de dose est comparée à celle d'une population témoin. Parmi les irradiés ont été observés, avec une fréquence non liée à la dose de traitement, quelques individus présentant un double phénotype et des individus plus nombreux à phénotype homogène mais « original » pour un ou plusieurs caractères par rapport à la variabilité phénotypique des témoins. Tous ces individus peuvent être considérés comme de présumés mutants. Pour une large majorité d'entre eux, la maturité des fruits est apparue relativement précoce par rapport à celle des témoins (aspect avantageux). Par contre, bien que dans une moindre mesure, beaucoup ont présenté une floraison précoce et/ou une faible productivité (aspects désavantageux). De même, à partir d'une dose de traitement à effet sublétal sur la germination (300 Gy), la vigueur et la productivité ont été excessivement diminuées pour presque tous les individus issus de ce traitement. Ces principaux résultats ainsi que diverses autres observations servent d'éléments de base à une discussion sur le problème du criblage de mutants en M1 dans le cas de graines d'arbres fruitiers, l'intérêt agronomique des résultats obtenus et la poursuite d'une telle étude

    Capacité germinative de graines d'amandier et d'abricotier exposées à un rayonnement gamma à faible débit de dose. Application à la détermination d'un traitement mutagène optimal

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    On peut espérer élargir la variabilité des géniteurs utilisés pour l'amélioration variétale des arbres fruitiers par des irradiations de graines de longue durée. Des études préalables de la radiosensibilité des graines à de tels traitements s'avèrent nécessaires pour situer la dose optimale de traitement. Ainsi des graines d'amandier de trois origines variétales et d'abricotier d'une seule origine ont été soumises avant stratification à des doses croissantes d'un rayonnement gamma à faible débit de dose. Une diminution de la capacité germinative des graines en fonction de l'augmentation de la dose de traitement a été observée en serre, avec des différences de comportement suivant l'origine variétale des graines comparativement réduites. Deux critères classiques d'estimation de tels traitements ont été utilisés : - le pourcentage cumulé de germination (plantules survivantes) en fonction du nombre de jours après le semis ; - la somme des hauteurs des plantules survivantes en fin de germination. La diminution de capacité germinative, estimée par le critère « somme des hauteurs », est apparue plus progressive (critère plus sensible). Pour cette raison la dose optimale de traitement que l'on peut rechercher, dans un premier temps, en fonction de différentes contraintes (rendement en plantes, vigueur et fe

    Comparaison de la variabilité de populations d'abricotiers issus de graines irradiées et non irradiées de même origine

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    La variabilité d'abricotiers issus de graines irradiées à des doses croissantes d'un rayonnement gamma à faible débit de dose est comparée à celle d'une population témoin. Parmi les irradiés ont été observés, avec une fréquence non liée à la dose de traitement, quelques individus présentant un double phénotype et des individus plus nombreux à phénotype homogène mais « original » pour un ou plusieurs caractères par rapport à la variabilité phénotypique des témoins. Tous ces individus peuvent être considérés comme de présumés mutants. Pour une large majorité d'entre eux, la maturité des fruits est apparue relativement précoce par rapport à celle des témoins (aspect avantageux). Par contre, bien que dans une moindre mesure, beaucoup ont présenté une floraison précoce et/ou une faible productivité (aspects désavantageux). De même, à partir d'une dose de traitement à effet sublétal sur la germination (300 Gy), la vigueur et la productivité ont été excessivement diminuées pour presque tous les individus issus de ce traitement. Ces principaux résultats ainsi que diverses autres observations servent d'éléments de base à une discussion sur le problème du criblage de mutants en M1 dans le cas de graines d'arbres fruitiers, l'intérêt agronomique des résultats obtenus et la poursuite d'une telle étude

    Comparaison de la variabilité de populations d'abricotiers issus de graines irradiées et non irradiées de même origine

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    La variabilité d'abricotiers issus de graines irradiées à des doses croissantes d'un rayonnement gamma à faible débit de dose est comparée à celle d'une population témoin. Parmi les irradiés ont été observés, avec une fréquence non liée à la dose de traitement, quelques individus présentant un double phénotype et des individus plus nombreux à phénotype homogène mais « original » pour un ou plusieurs caractères par rapport à la variabilité phénotypique des témoins. Tous ces individus peuvent être considérés comme de présumés mutants. Pour une large majorité d'entre eux, la maturité des fruits est apparue relativement précoce par rapport à celle des témoins (aspect avantageux). Par contre, bien que dans une moindre mesure, beaucoup ont présenté une floraison précoce et/ou une faible productivité (aspects désavantageux). De même, à partir d'une dose de traitement à effet sublétal sur la germination (300 Gy), la vigueur et la productivité ont été excessivement diminuées pour presque tous les individus issus de ce traitement. Ces principaux résultats ainsi que diverses autres observations servent d'éléments de base à une discussion sur le problème du criblage de mutants en M1 dans le cas de graines d'arbres fruitiers, l'intérêt agronomique des résultats obtenus et la poursuite d'une telle étude

    Comparaison de la variabilité de populations d'abricotiers issus de graines irradiées et non irradiées de même origine

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    La variabilité d'abricotiers issus de graines irradiées à des doses croissantes d'un rayonnement gamma à faible débit de dose est comparée à celle d'une population témoin. Parmi les irradiés ont été observés, avec une fréquence non liée à la dose de traitement, quelques individus présentant un double phénotype et des individus plus nombreux à phénotype homogène mais « original » pour un ou plusieurs caractères par rapport à la variabilité phénotypique des témoins. Tous ces individus peuvent être considérés comme de présumés mutants. Pour une large majorité d'entre eux, la maturité des fruits est apparue relativement précoce par rapport à celle des témoins (aspect avantageux). Par contre, bien que dans une moindre mesure, beaucoup ont présenté une floraison précoce et/ou une faible productivité (aspects désavantageux). De même, à partir d'une dose de traitement à effet sublétal sur la germination (300 Gy), la vigueur et la productivité ont été excessivement diminuées pour presque tous les individus issus de ce traitement. Ces principaux résultats ainsi que diverses autres observations servent d'éléments de base à une discussion sur le problème du criblage de mutants en M1 dans le cas de graines d'arbres fruitiers, l'intérêt agronomique des résultats obtenus et la poursuite d'une telle étude
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