Ontology Evolution for Experimental Data in Food

International audienceThroughout its life cycle, an ontology may change in order to adapt to domain changes or to new usages. This paper presents an ontology evolution activity [1] applied to an ontology dedicated to the annotation of experimental data in food [2], and a plug-in, DynarOnto, which assists ontology engineers for carrying out the ontology changes. Our evolution method is an a priori method which takes as input an ontology in a consistent state, implements the changes selected to be applied and manages all the consequences of those changes by producing an ontology in a consistent state

Alignement d'ontologies : exploitation des ontologies liées sur le web de données

International audienceNous proposons dans cet article une méthode d’alignement d’une ontologie source avec des ontologies cibles déjà publiées et liées sur le web de données. Nous présentons ensuite un retour d’expérience sur l’alignement d’une ontologie dans le domaine des sciences du vivant et de l’environnement avec AGROVOC et NALT

Results of the Ontology Alignment Evaluation Initiative 2021

The Ontology Alignment Evaluation Initiative (OAEI) aims at comparing ontology matching systems on precisely defined test cases. These test cases can be based on ontologies of different levels of complexity and use different evaluation modalities (e.g., blind evaluation, open evaluation, or consensus). The OAEI 2021 campaign offered 13 tracks and was attended by 21 participants. This paper is an overall presentation of that campaig

From Chemical Rules to Term Rewriting

AbstractIn this paper, rule-based programming is explored in the field of automated generation of chemical reaction mechanisms. We explore a class of graphs and a graph rewriting relation where vertices are preserved and only edges are changed. We show how to represent cyclic labeled graphs by decorated labeled trees or forests, then how to transform trees into terms. A graph rewriting relation is defined, then simulated by a tree rewriting relation, which can be in turn simulated by a rewriting relation on equivalence classes of terms. As a consequence, this kind of graph rewriting can be implemented using term rewriting. This study is motivated by the design of the GasEl system for the generation of kinetics reactions mechanisms. In GasEl, chemical reactions correspond to graph rewrite rules and are implemented by conditional rewriting rules in ELAN. The control of their application is done through the ELAN strategy language

Towards Large-Size Ontology Alignment by Mapping Groups of Concepts

International audienceThis paper presents a semi-automatic method to map groups of concepts between two ontologies

Vers une méthode d'évolution d'une ontologie guidée par l'annotation sémantique de tableaux du Web

Contact: [email protected], [email protected], [email protected] audienceNous présentons dans cet article nos premières réflexions sur le processus d'évolution d'une ontologie de domaine utilisée pour alimenter et interroger un entrepôt de données ouvert sur le Web. Nous présentons tout d'abord la manière dont l'ontologie a été modélisée et construite. Puis, nous rappelons les grandes étapes du processus d'annotation semi-automatique de tableaux de données du Web qui permet d'alimenter l'entrepôt. Nous analysons enfin de manière succincte les moyens de gérer les évolutions de l'ontologie afin d'améliorer la qualité de l'annotation des tableaux du Web

Modélisation d'une ressource termino-ontologique de domaine pour l'annotation sémantique de tableaux

International audienceNous proposons dans cet article une modélisation d'une ressource termino-ontologique (RTO) de domaine, guidée par la tâche d'annotation sémantique de tableaux. L'annotation d'un tableau consiste à annoter ses cellules, pour pouvoir ensuite identifier les concepts représentés par ses colonnes et enfin identifier la ou les relations n-aires qu'il représente. La RTO proposée permet d'une part de modéliser dans sa composante lexicale les termes utilisés pour l'annotation des cellules en intégrant la gestion des synonymes et du multilingue, et, d'autre part, de modéliser dans sa composante conceptuelle les concepts symboliques, les concepts numériques et les relations n-aires, qui sont propres au domaine étudié