Diversité des composés terpéniques volatils au sein du genre Lavandula : aspects évolutifs et physiologiques

The lavender production is of significant importance for the international visibility of the french Rhône-Alpes region. Uses of lavender essential oil (EO) are based on the growing of 3 species (L. angustifolia, L. latifolia, L. stoechas and an hybride L. x intermedia) with marked. The genus Lavandula is an ideal model for understanding the origin of the diversity of volatile organic compounds (VOCs), especially terpenes. Lavenders have the advantage of having a wide range of distribution areas with different bioclimatic regions, a limited number of species (39) with diverse morphological and ecological caracteristics. In order to characterize the diversity of the VOCs accumulated in the genus and consider their evolution, we have analyzed (GC-MS) the VOCS accumulated by 29 species (some for the first time). As often, in plants, the production of VOCs in the inflorescences of lavender is subject to spatial and temporal regulation. The differential emission of VOCs over time in L. angustifolia is a well known phenomenon for farmers who have observed a different quality of EO depending on the maturity of the inflorescences at harvest. To correlate these variations with stages of plant development, we have analysed the temporal variations of the main VOCs in leaves and inflorescences (several years and cultivars) at the chemical level (GC-FID) and the molecular level (qPCR). Upstream of this research on the genus Lavandula different bioinformatic tools have been developed. In particular, the module “MSeasy " which can automate GC-MS data retrieval. This is a prerequisite for using lavender in the future as a model study of VOCS in LamiaceaeLa production de lavande concoure au rayonnement de la région Rhône-Alpes. Les applications de l’huile essentielle (HE) de lavande reposent sur la culture de 3 espèces (L. aangustifolia, L. latifolia et L. stoechas et d’un hybride L. x intermedia) aux chémotypes marqués. Le genre Lavandula est un modèle idéal pour comprendre la structuration et l’origine de la diversité des composés organiques volatils (COV) en particulier des terpènes. Les lavandes ont l’avantage d’avoir une aire de distribution large avec des régions bioclimatiques différentes, un nombre d’espèces limité (39) ayant des caractéristiques morphologiques et écologiques variées. Pour caractériser la diversité des COV accumulés dans les espèces du genre et envisager leur évolution, nous avons analysé (GC-MS) les COV de 29 espèces (certaines pour la première fois). Comme souvent chez les plantes, la production de COV dans les inflorescences de lavande est soumise à une régulation spatio-temporelle. L'émission différentielle de COV au cours du temps chez L. angustifolia a été relevée par les agriculteurs qui ont observé une qualité d’HE différente suivant la maturité des inflorescences au moment de la récolte. Pour modéliser ces variations et les corréler avec des étapes du développement de la plante, nous avons analysé, au niveau chimique (GC-FID) et moléculaire (qPCR), les variations temporelles des principaux COV dans les feuilles et les inflorescences (plusieurs années et cultivars). En amont de ces recherches sur les COV du genre Lavandula, différent outils de bioinformatique ont été développés. En particulier, le module « MSeasy » qui permet d’automatiser le rapatriement de données de GC-MS. Ceci constitue un pré-requis pour utiliser la lavande comme modèle d’étude des COV chez les Lamiacée

Diversity of the volatile terpenic compounds within the genus Lavandula : evolutary and physiological aspects

La production de lavande concoure au rayonnement de la région Rhône-Alpes. Les applications de l’huile essentielle (HE) de lavande reposent sur la culture de 3 espèces (L. aangustifolia, L. latifolia et L. stoechas et d’un hybride L. x intermedia) aux chémotypes marqués. Le genre Lavandula est un modèle idéal pour comprendre la structuration et l’origine de la diversité des composés organiques volatils (COV) en particulier des terpènes. Les lavandes ont l’avantage d’avoir une aire de distribution large avec des régions bioclimatiques différentes, un nombre d’espèces limité (39) ayant des caractéristiques morphologiques et écologiques variées. Pour caractériser la diversité des COV accumulés dans les espèces du genre et envisager leur évolution, nous avons analysé (GC-MS) les COV de 29 espèces (certaines pour la première fois). Comme souvent chez les plantes, la production de COV dans les inflorescences de lavande est soumise à une régulation spatio-temporelle. L'émission différentielle de COV au cours du temps chez L. angustifolia a été relevée par les agriculteurs qui ont observé une qualité d’HE différente suivant la maturité des inflorescences au moment de la récolte. Pour modéliser ces variations et les corréler avec des étapes du développement de la plante, nous avons analysé, au niveau chimique (GC-FID) et moléculaire (qPCR), les variations temporelles des principaux COV dans les feuilles et les inflorescences (plusieurs années et cultivars). En amont de ces recherches sur les COV du genre Lavandula, différent outils de bioinformatique ont été développés. En particulier, le module « MSeasy » qui permet d’automatiser le rapatriement de données de GC-MS. Ceci constitue un pré-requis pour utiliser la lavande comme modèle d’étude des COV chez les LamiacéesThe lavender production is of significant importance for the international visibility of the french Rhône-Alpes region. Uses of lavender essential oil (EO) are based on the growing of 3 species (L. angustifolia, L. latifolia, L. stoechas and an hybride L. x intermedia) with marked. The genus Lavandula is an ideal model for understanding the origin of the diversity of volatile organic compounds (VOCs), especially terpenes. Lavenders have the advantage of having a wide range of distribution areas with different bioclimatic regions, a limited number of species (39) with diverse morphological and ecological caracteristics. In order to characterize the diversity of the VOCs accumulated in the genus and consider their evolution, we have analyzed (GC-MS) the VOCS accumulated by 29 species (some for the first time). As often, in plants, the production of VOCs in the inflorescences of lavender is subject to spatial and temporal regulation. The differential emission of VOCs over time in L. angustifolia is a well known phenomenon for farmers who have observed a different quality of EO depending on the maturity of the inflorescences at harvest. To correlate these variations with stages of plant development, we have analysed the temporal variations of the main VOCs in leaves and inflorescences (several years and cultivars) at the chemical level (GC-FID) and the molecular level (qPCR). Upstream of this research on the genus Lavandula different bioinformatic tools have been developed. In particular, the module “MSeasy " which can automate GC-MS data retrieval. This is a prerequisite for using lavender in the future as a model study of VOCS in Lamiacea

Diversité des composés terpéniques volatils au sein du genre Lavandula (aspects évolutifs et physiologiques)

La production de lavande concoure au rayonnement de la région Rhône-Alpes. Les applications de l huile essentielle (HE) de lavande reposent sur la culture de 3 espèces (L. aangustifolia, L. latifolia et L. stoechas et d un hybride L. x intermedia) aux chémotypes marqués. Le genre Lavandula est un modèle idéal pour comprendre la structuration et l origine de la diversité des composés organiques volatils (COV) en particulier des terpènes. Les lavandes ont l avantage d avoir une aire de distribution large avec des régions bioclimatiques différentes, un nombre d espèces limité (39) ayant des caractéristiques morphologiques et écologiques variées. Pour caractériser la diversité des COV accumulés dans les espèces du genre et envisager leur évolution, nous avons analysé (GC-MS) les COV de 29 espèces (certaines pour la première fois). Comme souvent chez les plantes, la production de COV dans les inflorescences de lavande est soumise à une régulation spatio-temporelle. L'émission différentielle de COV au cours du temps chez L. angustifolia a été relevée par les agriculteurs qui ont observé une qualité d HE différente suivant la maturité des inflorescences au moment de la récolte. Pour modéliser ces variations et les corréler avec des étapes du développement de la plante, nous avons analysé, au niveau chimique (GC-FID) et moléculaire (qPCR), les variations temporelles des principaux COV dans les feuilles et les inflorescences (plusieurs années et cultivars). En amont de ces recherches sur les COV du genre Lavandula, différent outils de bioinformatique ont été développés. En particulier, le module MSeasy qui permet d automatiser le rapatriement de données de GC-MS. Ceci constitue un pré-requis pour utiliser la lavande comme modèle d étude des COV chez les LamiacéesThe lavender production is of significant importance for the international visibility of the french Rhône-Alpes region. Uses of lavender essential oil (EO) are based on the growing of 3 species (L. angustifolia, L. latifolia, L. stoechas and an hybride L. x intermedia) with marked. The genus Lavandula is an ideal model for understanding the origin of the diversity of volatile organic compounds (VOCs), especially terpenes. Lavenders have the advantage of having a wide range of distribution areas with different bioclimatic regions, a limited number of species (39) with diverse morphological and ecological caracteristics. In order to characterize the diversity of the VOCs accumulated in the genus and consider their evolution, we have analyzed (GC-MS) the VOCS accumulated by 29 species (some for the first time). As often, in plants, the production of VOCs in the inflorescences of lavender is subject to spatial and temporal regulation. The differential emission of VOCs over time in L. angustifolia is a well known phenomenon for farmers who have observed a different quality of EO depending on the maturity of the inflorescences at harvest. To correlate these variations with stages of plant development, we have analysed the temporal variations of the main VOCs in leaves and inflorescences (several years and cultivars) at the chemical level (GC-FID) and the molecular level (qPCR). Upstream of this research on the genus Lavandula different bioinformatic tools have been developed. In particular, the module MSeasy " which can automate GC-MS data retrieval. This is a prerequisite for using lavender in the future as a model study of VOCS in LamiaceaeST ETIENNE-Bib. électronique (422189901) / SudocSudocFranceF

Capturer la géométrie dynamique vivante dans les cages

Reconstruire, synthétiser, analyser et réutiliser les formes dynamiques capturées depuis le monde en mouvement est un défi récent qui reste encore en suspens. Dans cette thèse, nous abordons le problème de l'extraction, l'acquisition et la réutilisation d'une paramétrisation non-rigide pour l'animation basée vidéo. L'objectif principal étant de préserver les propriétés globales et locales de la surface capturée sans squelette articulé, grâce à un nombre limité de paramètres contrôlables, flexibles et réutilisables. Pour résoudre ce problème, nous nous appuyons sur une réduction de dimensions détachée de la surface reposant sur le paradigme de la représentation par cage. En conséquence, nous démontrons la force d'un sous-espace de la forme d'une cage géométrique pour encoder des surfaces fortement non-rigides.Reconstructing, synthesizing, analyzing to re-using dynamic shapes that are captured from the real-world in motion isa recent and outstanding challenge. Nowadays, highly-detailed animations of live-actor performances are increasinglyeasier to acquire and 3D Video has reached considerable attention in visual media production. In this thesis, we addressthe problem of extracting or acquiring and then reusing non-rigid parametrization for video-based animations. At firstsight, a crucial challenge is to reproduce plausible boneless deformations while preserving global and local capturedproperties of the surface with a limited number of controllable, flexible and reusable parameters. To solve this challenge,we directly rely on a skin-detached dimension reduction thanks to the well-known cage-based paradigm. Indeed, to thebest of our knowledge, this dissertation opens the field of cage-based performance capture. First, we achieve ScalableInverse Cage-based Modeling by transposing the inverse kinematics paradigm on surfaces. To do this, we introduce acage inversion process with user-specified screen-space constraints. Secondly, we convert non-rigid animated surfacesinto a sequence of estimated optimal cage parameters via a process of Cage-based Animation Conversion. Building onthis reskinning procedure, we also develop a well-formed Animation Cartoonization algorithm for multi-view data in termof cage-based surface exaggeration and video-based appearance stylization. Thirdly, motivated by the relaxation of priorknowledge on the data, we propose a promising unsupervised approach to perform Iterative Cage-based GeometricRegistration. This novel registration scheme deals with reconstructed target point clouds obtained from multi-view videorecording, in conjunction with a static and wrinkled template mesh. Above all, we demonstrate the strength of cage-basedsubspaces in order to reparametrize highly non-rigid dynamic surfaces, without the need of secondary deformations. Inaddition, we state and discuss conclusions and several limitations of our cage-based strategies applied to life-like dynamicsurfaces, captured for vision-oriented applications. Finally, a variety of potential directions and open suggestions for furtherwork are outlined.BORDEAUX1-Bib.electronique (335229901) / SudocSudocFranceF

Mineral nutrition in hydroponically-grown Pinguicula

Volume: 41Start Page: 8End Page: 1

ChromAnnot a webserver for deep LC-HRMS/MS chromatogram annotation

International audienc

Multidimensional NMR approaches towards highly resolved, sensitive and high-throughput quantitative metabolomics

International audienceMulti-dimensional NMR is an appealing approach for dealing with the challenging complexity of biological samples in metabolomics. This article describes how spectroscopists have recently challenged their imagination in order to make 2D NMR a powerful tool for quantitative metabolomics, based on innovative pulse sequences combined with meticulous analytical chemistry approaches. Clever time-saving strategies have also been explored to make 2D NMR a high-throughput tool for metabolomics, relying on alternative data acquisition schemes such as ultrafast NMR. Currently, much work is aimed at drastically boosting the NMR sensitivity thanks to hyperpolarisation techniques, which have been used in combination with fast acquisition methods and could greatly expand the application potential of NMR metabolomics

Méthodologie de conception d’amplificateur faible bruit à base de FOM et de coefficient d’inversion pour applications RF Low Power

International audienc

Vers une meilleure efficacité et rapidité dans l'identification des métabolites dans le cadre d'études de métabolomique non ciblées ?

National audienc

Stratégie de mesure non ciblée de type métabolomique (couplage LC-HRMS ) pour identifier différents groupes de composés bioactifs accumulés dans les mollusques bivalves

La bioactivité des toxines du phytoplancton qui s’accumulent dans les coquillages est presque toujours évaluée sur modèle animal (test souris). Malgré ses avantages, la capacité de ce test à expliquer la nature de cette bio-activité reste limitée. Par ailleurs, le contrôle sanitaire actuellement basé sur une méthode ciblée d’identification et de quantification d’un ensemble de toxines connues ne permet pas de détecter des toxines encore inconnues. Afin de répondre à ce besoin de caractérisation de substances toxiques inconnues, une nouvelle approche de profilage chimique différentiel et non ciblé, de type métabolomique, a été proposée. Les 2 extraits sélectionnés sont ceux ayant montré une toxicité positive chez la souris, sans que les substances potentiellement responsables de cet effet toxique n’aient été révélées par des mesures ciblées