Chapitre 6. Étude biologique et archéo-anthropologique des structures funéraires

Trois structures à vocation funéraire ont été mises au jour : deux inhumations primaires individuelles (2160 et 2189) et une structure primaire de crémation (2057). I- Sépulture 2160 La sépulture primaire individuelle est complète, à l’exception du niveau supérieur du comblement, ôté lors du décapage de la zone. La conservation quantitative du squelette, de 81,3 % (ICA), est due à la disparition taphonomique des pièces ou parties des pièces les plus petites (phalanges, patella), les plus frag..

Systematic mapping of regions of human cardiac troponin I involved in binding to cardiac troponin C: N- and C-terminal low affinity contributing regions

AbstractThe Spot method of multiple peptide synthesis was used to map in a systematic manner regions of the human cardiac troponin I sequence (hcTnI) involved in interactions with its physiological partner, troponin C (cTnC). Ninety-six 20-mer peptides describing the entire hcTnI sequence were chemically assembled; their reactivity with [125I]cTnC, in the presence of 3 mM Ca2+, enabled the assignment of six sites of interaction (residues 19–32, 45–54, 129–138, 145–164, 161–178 and 191–210). For several sites, a good correlation with literature data was obtained, thus validating this methodological approach. Synthetic peptides, each containing in their sequence an interaction site, were prepared. As assessed by BIACORE, all of them exhibited an affinity for cTnC in the range of 10−6–10−7 M, except for hcTnI [39–58] which showed a nanomolar affinity. This peptide was also able to block the interaction between hcTnI and cTnC. We therefore postulate that despite the existence of multiple cTnC interaction sites on the hcTnI molecule, only that region of hcTnI allows a stabilization of the complex. Residues 19–32 from the N-terminal cardio-specific extension of hcTnI were also found to be involved in interaction with cTnC; residues 19–32 may correspond to the minimal sequence of the extension which could switch between the N- and C-terminal TnC domains, depending on its phosphorylation state. Finally, two Ca2+-dependent cTnC binding domains within the C-terminal part of hcTnI (residues 164–178 and 191–210) were also mapped. The latter site may be linked with the cardiac dysfunction observed in stunned myocardium

SIAMESE-RELATED1 Is Regulated Posttranslationally and Participates in Repression of Leaf Growth under Moderate Drought.

The plant cell cycle is tightly regulated by factors that integrate endogenous cues and environmental signals to adapt plant growth to changing conditions. Under drought, cell division in young leaves is blocked by an active mechanism, reducing the evaporative surface and conserving energy resources. The molecular function of cyclin-dependent kinase-inhibitory proteins (CKIs) in regulating the cell cycle has already been well studied, but little is known about their involvement in cell cycle regulation under adverse growth conditions. In this study, we show that the transcript of the CKI gene SIAMESE-RELATED1 (SMR1) is quickly induced under moderate drought in young Arabidopsis thaliana leaves. Functional characterization further revealed that SMR1 inhibits cell division and affects meristem activity, thereby restricting the growth of leaves and roots. Moreover, we demonstrate that SMR1 is a short-lived protein that is degraded by the 26S proteasome after being ubiquitinated by a Cullin-RING E3 ubiquitin ligase. Consequently, overexpression of a more stable variant of the SMR1 protein leads to a much stronger phenotype than overexpression of the native SMR1. Under moderate drought, both the SMR1 transcript and SMR1 protein accumulate. Despite this induction, smr1 mutants do not show overall tolerance to drought stress but do show less growth inhibition of young leaves under drought. Surprisingly, the growth-repressive hormone ethylene promotes SMR1 induction, but the classical drought hormone abscisic acid does not

Chapitre 3. Les activités

I- Gestion de l’eau (Frédéric Marty, Brice Chevaux, Sophie Ledrole, Jean-Marc Féménias) L’approvisionnement en eau est assuré par cinq puits. Leur localisation et leur faible diamètre permettent de leur attribuer un statut privé. Deux sont clairement localisés dans l’angle d’une cour (bât. 1 : 2196 ; bât. 11 : 185). Le puits 3082 se trouve coincé entre le hangar 52 et la pièce 54, dans un espace ouvert étroit correspondant à la cour du bâtiment 16, considérablement réduite après la constructi..

Une agglomération rurale gallo-romaine des rives de l’Étang de Berre

En 2011, une fouille archéologique préventive réalisée à Istres, au pied de la colline du Castellan n, a mis au jour les vestiges d’une agglomération rurale gallo-romaine, qui prend la suite d’une agglomération de hauteur des premier et second âges du fer, avant d’être démantelée par des récupérateurs de matériaux à la fin du IVe siècle ou au début du Ve siècle. Idéalement située dans l’environnement varié à proximité de l’étang de Berre, de la plaine de la Crau, des zones humides de Camargue et de la Méditerranée, cette agglomération a su tirer parti des ressources naturelles disponibles et de sa proximité avec le port antique de Fos, lieu d’échange des produits du commerce maritime. Les bâtiments, leurs aménagements et le mobilier révèlent la vie quotidienne et les pratiques culturelles d’une population gauloise rurale. La découverte de deux sépultures et d’un bûcher placés au plus près des vivants témoigne également des coutumes funéraires locales. Au total, ces investigations renouvellent profondément notre vision de l’occupation du territoire et des modes de peuplement à l’ouest de l’étang de Berte. Aux villae, établissements et bergeries viennent désormais s’ajourer de petites agglomérations qui trouvent leur place dans le maillage territorial

Comparative transcriptomics of drought responses in Populus: a meta-analysis of genome-wide expression profiling in mature leaves and root apices across two genotypes

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>Comparative genomics has emerged as a promising means of unravelling the molecular networks underlying complex traits such as drought tolerance. Here we assess the genotype-dependent component of the drought-induced transcriptome response in two poplar genotypes differing in drought tolerance. Drought-induced responses were analysed in leaves and root apices and were compared with available transcriptome data from other <it>Populus </it>species.</p> <p>Results</p> <p>Using a multi-species designed microarray, a genomic DNA-based selection of probesets provided an unambiguous between-genotype comparison. Analyses of functional group enrichment enabled the extraction of processes physiologically relevant to drought response. The drought-driven changes in gene expression occurring in root apices were consistent across treatments and genotypes. For mature leaves, the transcriptome response varied weakly but in accordance with the duration of water deficit. A differential clustering algorithm revealed similar and divergent gene co-expression patterns among the two genotypes. Since moderate stress levels induced similar physiological responses in both genotypes, the genotype-dependent transcriptional responses could be considered as intrinsic divergences in genome functioning. Our meta-analysis detected several candidate genes and processes that are differentially regulated in root and leaf, potentially under developmental control, and preferentially involved in early and long-term responses to drought.</p> <p>Conclusions</p> <p>In poplar, the well-known drought-induced activation of sensing and signalling cascades was specific to the early response in leaves but was found to be general in root apices. Comparing our results to what is known in arabidopsis, we found that transcriptional remodelling included signalling and a response to energy deficit in roots in parallel with transcriptional indices of hampered assimilation in leaves, particularly in the drought-sensitive poplar genotype.</p

Death and the Societies of Late Antiquity

Ce volume bilingue, comprenant un ensemble de 28 contributions disponibles en français et en anglais (dans leur version longue ou abrégée), propose d’établir un état des lieux des réflexions, recherches et études conduites sur le fait funéraire à l’époque tardo-antique au sein des provinces de l’Empire romain et sur leurs régions limitrophes, afin d’ouvrir de nouvelles perspectives sur ses évolutions possibles. Au cours des trois dernières décennies, les transformations considérables des méthodologies déployées sur le terrain et en laboratoire ont permis un renouveau des questionnements sur les populations et les pratiques funéraires de l’Antiquité tardive, période marquée par de multiples changements politiques, sociaux, démographiques et culturels. L’apparition de ce qui a été initialement désigné comme une « Anthropologie de terrain », qui fut le début de la démarche archéothanatologique, puis le récent développement d’approches collaboratives entre des domaines scientifiques divers (archéothanatologie, biochimie et géochimie, génétique, histoire, épigraphie par exemple) ont été décisives pour le renouvellement des problématiques d’étude : révision d’anciens concepts comme apparition d’axes d’analyse inédits. Les recherches rassemblées dans cet ouvrage sont articulées autour de quatre grands thèmes : l’évolution des pratiques funéraires dans le temps, l’identité sociale dans la mort, les ensembles funéraires en transformation (organisation et topographie) et les territoires de l’empire (du cœur aux marges). Ces études proposent un réexamen et une révision des données, tant anthropologiques qu’archéologiques ou historiques sur l’Antiquité tardive, et révèlent, à cet égard, une mosaïque de paysages politiques, sociaux et culturels singulièrement riches et complexes. Elles accroissent nos connaissances sur le traitement des défunts, l’emplacement des aires funéraires ou encore la structure des sépultures, en révélant une diversité de pratiques, et permettent au final de relancer la réflexion sur la manière dont les sociétés tardo-antiques envisagent la mort et sur les éléments permettant d’identifier et de définir la diversité des groupes qui les composent. Elles démontrent ce faisant que nous pouvons véritablement appréhender les structures culturelles et sociales des communautés anciennes et leurs potentielles transformations, à partir de l’étude des pratiques funéraires.This bilingual volume proposes to draw up an assessment of the recent research conducted on funerary behavior during Late Antiquity in the provinces of the Roman Empire and on their borders, in order to open new perspectives on its possible developments. The considerable transformations of the methodologies have raised the need for a renewal of the questions on the funerary practices during Late Antiquity, a period marked by multiple political, social, demographic and cultural changes. The emergence field anthropology, which was the beginning of archaeothanatology, and then the recent development of collaborative approaches between various scientific fields (archaeothanatology, biochemistry and geochemistry, genetics, history, epigraphy, for example), have been decisive. The research collected in this book is structured around four main themes: Evolution of funerary practices over time; Social identity through death; Changing burial grounds (organisation and topography); Territories of the Empire (from the heart to the margins). These studies propose a review and a revision of the data, both anthropological and archaeological or historical on Late Antiquity, and reveal a mosaic of political, social, and cultural landscapes singularly rich and complex. In doing so, they demonstrate that we can truly understand the cultural and social structures of ancient communities and their potential transformations, based on the study of funerary practices

Recherches récentes sur le site de la place de l'Egalité (Sainte-Colombe, Rhône). Une fenêtre ouverte sur les pratiques funéraires de l'Antiquité tardive en Gaule

URL : http://socio-anthropologie.revues.orgArticle de valorisation publié dans la revue Socio-anthropologie, 2008 vol.22.Le site de la Place de l'Égalité dans son contexte L'interprétation d'une nécropole de l'Antiquité tardive, une approche nécessairement pluridisciplinaire Population et rites funéraires observés Place de l'Égalité Une révision des idées reçues

Looking ahead and behind : quelles évolutions des usages sociaux et des configurations des ensembles funéraires urbains durant l’Antiquité tardive ?

De nombreuses évolutions interviennent dans la fabrique de la ville à partir du IIIe siècle de n. è., qui font suite à des changements tant administratifs que politiques au sein de l’Empire, prenant eux-mêmes racine bien antérieurement dans le Haut-Empire. La configuration de nombreux centre urbains s’en voit profondément changée, et de là se développent des manières différentes de vivre la ville. Il parait a priori évident que la sphère funéraire intègre également ces modifications. Mais dans quelle mesure ? A travers plusieurs exemples, nous verrons que les ensembles funéraires des IIIe-IVe siècles reflètent des pratiques sociales et symboliques qui conservent un héritage fort des pratiques antérieures tout autant qu’ils intègrent de nouvelles pratiques. Pour beaucoup, ces ensembles rompent avec la topographie du Haut-Empire et sont nouvellement créés dans des espaces autrefois utilisés à des fins d’habitat, de commerce voire de lieux publics. Outre le changement de topographie qui s’inscrit au sein de la nouvelle trame urbaine, la question de l’évolution légale, juridique, du statut des parcelles se pose nécessairement dans ce contexte. Ces évolutions des pratiques sociales et symboliques s’accompagnent encore de pratiques techniques inédites, qui voient par exemple l’optimisation des espaces désaffectés du Haut-Empire. Tout cela est intimement lié et transcrit une façon de penser la ville et les espaces qui y sont accessibles ou dédiés aux morts qui s’adapte, à la fois de manière pragmatique et de façon à faire respecter les règles symboliques et les usages sociaux fondamentaux. Cette façon de penser le monde des morts et celui des vivants dans le cadre urbain nous laisse à voir des paysages suburbains mosaïques, où au-delà de la frontière nette imposée par le pomœrium, une mixité s’impose, avec des délimitations fluctuantes, laissées au soin de la multitude des groupes funéraires présents

Recherches récentes sur le site de la place de l’égalité (Sainte-Colombe, Rhône)

L’Anthropologie funéraire associe des données et des problématiques biologiques et culturelles dans un contexte archéologique. L’étude biologique d’une série ostéologique peut permettre d’appréhender le mode de recrutement d’une population dans une optique paléodémographique (sexe et âge des individus) et d’évaluer l’état sanitaire des sujets. Ces données anthropologiques sont complémentaires de celles issues de l’étude stratigraphique du site, du dépouillement des archives historiques (pour ..